生物信息学预测与肝细胞肝癌患者预后相关的免疫相关基因

作     者：席子涵 田济铭 张玄 黄启超 陶开山 XI Zihan;TIAN Jiming;ZHANG Xuan;HUANG Qichao;TAO Kaishan

作者机构：空军军医大学第一附属医院肝胆外科陕西西安710032 兰州大学第一临床医学院妇产科甘肃兰州730000 空军军医大学基础医学院生理与病理生理学教研室陕西西安710032 

出 版 物：《细胞与分子免疫学杂志》 (Chinese Journal of Cellular and Molecular Immunology)

年 卷 期：2022年第38卷第9期

页      面：769-775页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100102[医学-免疫学] 100214[医学-肿瘤学] 100215[医学-康复医学与理疗学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(81970586 81972590)。 

主　　题：肝细胞肝癌 免疫相关基因 列线图 预后 

摘      要：目的通过生物信息学分析预测肝细胞肝癌(HCC)患者预后免疫相关基因并建立预后预测模型。方法通过差异分析鉴定HCC组织中的免疫相关基因,使用单因素、多因素比例风险回归模型(Cox)、套索算法(LASSO)建立风险预后预测模型。使用C指数、受试者工作特征(ROC)曲线、校准曲线和决策曲线评价预后模型的预测效能。此外,将风险评分用于患者分层进而评估不同风险水平患者的预后差异。结果通过生物信息学分析,发现HCC患者至少存在1403个免疫相关基因,主要集中在免疫反应、适应性免疫反应、免疫球蛋白产生等生物过程以及细胞因子相互作用、趋化因子信号通路和同种异体移植排斥等通路。单因素Cox分析发现,53个免疫相关基因与预后相关,进一步通过LASSO和多因素Cox回归分析筛选出8个预后免疫相关基因,包括长链非编码RNA AC125238.1、细胞色素P450氧化酶1A2(CYP1A2)、纤胶凝蛋白3(FCN3)、肝癌衍生生长因子样蛋白1(HDGFL1)、脂质运载蛋白2(LCN2)、线粒体编码的细胞色素C氧化酶Ⅱ假基因12(MTCO2P12)、肽基精氨酸脱亚氨酶3(PADI3)和G蛋白信号调节因子16(RGS16),同时建立了以风险评分为主的预后列线图。ROC曲线、校准曲线和决策曲线证实该模型具有良好的区分度、准确度和临床价值。此外,通过分层分析表明,风险评分较高的患者具有较差的预后。结论本研究建立了一个基于8个免疫相关基因的预后列线图,有望成为预测HCC患者预后的可靠工具。