北京黑猪DKK3和CCR1基因多态性检测及其与背膘厚的关联分析

作     者：田威龙 兰干球 张龙超 王立贤 梁晶 刘欣 TIAN Weilong;LAN Ganqiu;ZHANG Longchao;WANG Lixian;LIANG Jing;LIU Xin

作者机构：广西大学动物科学技术学院南宁530004 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2022年第53卷第7期

页      面：2083-2093页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家现代农业产业技术体系(nycytxgxcxtd-15-01) 中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS02) 国家生猪产业技术体系(CAAS-ZDRW202006-04)。 

主　　题：北京黑猪 DKK3 CCR1 背膘厚 

摘      要：旨在探讨DKK3和CCR1基因多态性及其对北京黑猪背膘厚的影响,以期能够筛选出可用于提高北京黑猪背膘厚性状的分子标记,为北京黑猪优良性状定向选育提供依据。本研究以413头健康的北京黑猪为试验材料,对其进行DNA提取、PCR扩增、基因测序筛选候选基因的SNPs,同时利用SAS 9.2软件对突变位点的不同基因型分别与北京黑猪的六七肋背膘厚和腰荐部背膘厚进行关联分析。结果显示,在北京黑猪DKK3基因的外显子区共检测到10个SNPs,包含1个可变剪切突变、1个错义突变和8个3′UTR突变,其中有4个3′UTR突变位点均与腰荐部背膘厚显著关联(PC、g.47444258 CT、g.47444912 GT和g.47445304 TC,其余位点与六七肋背膘厚和腰荐部背膘厚均不显著关联(P0.05)。在CCR1基因的外显子区共检测到3个SNPs,包含2个同义突变和1个错义突变,其中1个同义突变位点g.29229037 GA与六七肋背膘厚显著关联(PC和g.47443783 CT处于完全连锁状态(D’=1),g.47443783 CT和g.47443858 CT处于完全连锁状态(D’=1),g.47444258 CT和g.47444275 CT呈现高度连锁状态(D’=0.98)。综上所述,DKK3和CCR1基因的SNPs分别与北京黑猪的腰荐部背膘厚和六七肋背膘厚有显著关联性,可为北京黑猪背膘厚的早期分子选育提供参考。