水产品腐败希瓦氏菌双组分信号转导系统的全基因组鉴定与分析

作     者：李秋莹 张婧阳 徐瑾秀 孙彤 李学鹏 励建荣 Li Qiuying;Zhang Jingyang;Xu Jinxiu;Sun Tong;Li Xuepeng;Li Jianrong

作者机构：渤海大学食品科学与工程学院辽宁锦州121013 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心辽宁锦州121013 

出 版 物：《中国食品学报》 (Journal of Chinese Institute Of Food Science and Technology)

年 卷 期：2022年第22卷第6期

页      面：289-298页

核心收录：

学科分类：0832[工学-食品科学与工程（可授工学、农学学位）] 08[工学] 083204[工学-水产品加工及贮藏工程] 

基　　金：辽宁省教育厅青年科技人才“育苗”项目(LQ2020004) 

主　　题：水产品 腐败希瓦氏菌 双组份信号转导系统 生物信息学 

摘      要：腐败希瓦氏菌是水产品中的一种特定腐败菌,具有较强的低温适应性和致腐性。双组分信号转导系统(TCSs)是细菌中重要的调控系统之一,在细菌对复杂环境的感知和响应中起重要的作用。为探究TCSs在腐败希瓦氏菌中的分布及功能,本文采用全基因组鉴定、多序列比对、系统进化树分析、蛋白结构预测以及互作蛋白分析等多种生物信息学方法,系统分析水产品腐败希瓦氏菌中TCSs的分布、分类、结构与功能。结果表明:水产品腐败希瓦氏菌WS13菌株中存在31个组氨酸激酶(HKs)、36个反应调节蛋白(RRs)、3个成对TCSs、3个融合HKs。HKs共有16种结构域组成形式,其中15种均含有HATPase_c激酶催化结构域。RRs具有10种结构域组成,均含有REC结构域。多序列比对和进化分析表明:不同结构域的HKs和RRs具有不同的进化关系,可能存在功能的多样性。3对TCSs和3个融合HKs的生物学功能主要参与响应信号刺激,调控细胞内的各种代谢过程以及物质的运输等。3个融合HKs均与三甲胺生成相关。研究结果为进一步探究TCSs在水产品腐败希瓦氏菌中的功能提供理论参考。