P53对基于MRI的骨关节炎间隙狭窄程度影响的临床研究

作     者：张双 信瑞强 石逸杰 李艳翠 彭如臣 ZHANG Shuang;XIN Ruiqiang;SHI Yijie;LI Yancui;PENG Ruchen

作者机构：首都医科大学附属北京潞河医院放射科北京101149 

出 版 物：《磁共振成像》 (Chinese Journal of Magnetic Resonance Imaging)

年 卷 期：2022年第13卷第6期

页      面：122-126页

核心收录：

学科分类：0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 1002[医学-临床医学] 08[工学] 10[医学] 

主　　题：磁共振成像 骨关节炎 生物信息学 差异表达基因 富集分析 P53信号通路 

摘      要：目的利用生物信息学技术对骨关节炎(osteoarthritis,OA)差异表达基因进行识别和功能富集分析,并通过临床数据研究P53对基于MRI的OA间隙狭窄程度的影响。材料与方法下载微阵列数据(GSE55235),利用GEO2R鉴别OA患者与正常滑膜样本间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。利用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)对差异表达基因进行基因富集分析,进一步构建蛋白—蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,识别重要模块,鉴定核心基因。选取50例OA间隙狭窄患者,利用MRI检测其骨关节情况,分析其临床资料,运用Pearson卡方检验、Spearman相关性分析和多因素Logistic回归进行统计学分析。结果对照组与OA组滑膜组织之间存在差异。GSE55235的分析结果识别出91个差异表达基因。DEGs集富集分析全面概述了OA的一些主要病理生理机制:细胞对过氧化氢的反应、P53信号通路。鉴定出了4个关键基因:MMP1、CXCL8、VEGFA和JUN。与正常组对比,MMP1在OA组中高表达,CXCL8、VEGFA和JUN在OA组中低表达。Pearson卡方检验、Spearman相关性分析和多因素Logistic回归结果显示P53与OA间隙狭窄程度显著相关(OR=0.112,95%CI:0.025~0.495,P=0.004),而性别、年龄、MMP1、VEGFA、CXCL8与OA间隙狭窄程度无显著相关性(P值均大于0.05)。结论基于MRI结果的基础上,判断细胞对过氧化氢的反应、P53信号通路能为OA的诊断和治疗提供新的研究靶点。P53在OA患者中低表达,可能作为其潜在治疗靶点。MRI也有利于OA患者早期的诊断与治疗,降低OA发病率。