多种标志物在人群结核病分子流行病学研究中的应用

作     者：J.T.Rhee M.M.Tanaka M.A.Beh C.B.Agasino E.A.Paz P.C.Hopewell P.M.Small 吴雪琼 

作者机构：Division of Epidemiology Department of Health Research and Policy Stanford University School of Medicine Stanford California Department of Biological Sciences Stanford University Stanford California Division of Infectious Diseases and Microbiology Montreal General Hospital. Montreal Canada Division of Infectious Diseases and Geographic Medicine. Department of Medicine Stanford University School of Medicine Department of Public Health Division of Tuberculosis Control City and county of San Francisco California Francis J. Curry National Tuberculosis Center San Francisco California Division of Pulmonary and Critical Care Medicine San Francisco General Hospital Medical Center and the Department of Medicine University of California at San Francisco San Francisco California USA 

出 版 物：《国际结核病与肺部疾病杂志》 (The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease)

年 卷 期：2001年第2期

页      面：80-87页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

主　　题：结核病 分子流行病学 IS6110 PGRS 

摘      要：背景:目前世界正在开展很多结核病流行病学研究。对IS6110杂交带少于6条的菌株应用一个二级标志物指纹分析增强了菌株的追踪,但它对人群结论的影响尚未很好地研究。 目的:对低拷贝结核分支杆菌菌株应用多态性富含GC重复序列(PGRS)进行二级基因分型。探讨其对以人群为研究背景的流行病学研究结论的影响。 设计:对1991—1996年旧金山结核病例,通过单用IS6110及联合采用PGRS/IS6110定义菌株成簇,以便1)估计近期的传播;2)评价细菌群体参数在理论上对这些估计的影响;3)评价近期传播的危险因素。 结果:对低拷贝菌株(所有菌株的20.3％)进行二级分型,使近期传播的估算值由29.1％下降到25.3％(P=0.03)。补充基因分型造成不同估算值的最主要的影响参数是低拷贝菌株的比例和成簇的数量。对于上述两种分析方法而言。导致近期传播的危险因素是一样的。 结论:结核分支杆菌二级基因分型的统计和推论似乎取决于人群中低拷贝菌株的比例。该比例低时,或没有多少二级特型匹配时,补充基因分型在人群水平研究中的作用可能就很小。