不同发育阶段牦牛睾丸组织miRNA的分析及鉴定

作     者：袁钰洁 周婧雯 殷实 杨柳青 秦文昌 李键 YUAN Yujie;ZHOU Jingwen;YIN Shi;YANG Liuqing;QIN Wenchang;LI Jian

作者机构：西南民族大学畜牧兽医学院四川成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川成都610041 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室四川成都610041 西南民族大学现代生物技术国家民委重点实验四川成都610041 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2022年第42卷第1期

页      面：165-174页

学科分类：0710[理学-生物学] 090601[农学-基础兽医学] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 071007[理学-遗传学] 0836[工学-生物工程] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：国家重点研发专项资助项目(2018YFD0502304) 四川省科技支撑计划资助项目(2017NZ0076) 牦牛遗传资源与保护创新团队资助项目(13CXTD01) 青藏高原生态畜牧业协同创新中心开放基金资助项目(QZGYXT05) 中央高校基本科研业务费专项基金资助项目(2020PTJS15003) 

主　　题：牦牛 睾丸发育 精子发生 miRNA 高通量测序 

摘      要：选取胎儿期(4~5月龄)、犊牛期(1岁)、性成熟期(3岁)的健康雄性牦牛各2头,分离其睾丸组织,利用Illumina平台对各样本miRNA进行测序,其中同一年龄段的2个样本被视为生物学重复;分析各阶段样本的miRNA数量、碱基偏好性和表达水平,对新miRNA进行预测,对显著差异表达的miRNA的靶基因进行gene ontology(GO)富集分析。结果显示,胎儿期miRNA占smallRNA(sRNA)的比例显著多于犊牛期和性成熟期(P0.05)。共发现新miRNA成熟体77个,新miRNA前体共80个,已知miRNA的首位具有尿嘧啶(U)碱基偏好性,新miRNA的首位具有胞嘧啶(C)碱基偏好性。差异表达分析发现胎儿期与犊牛期间显著差异表达miRNA共224个,犊牛期与性成熟期间显著差异表达miRNA共36个,胎儿期与性成熟期间显著差异表达miRNA共239个。GO分析发现显著差异表达的miRNA其靶基因的数目在生物学过程排首位的是代谢过程,并从显著差异表达的miRNA的靶基因中筛选出了与精子发生及与精子功能相关的靶基因20个。结果表明,牦牛睾丸发育过程中,胎儿期的miRNA的数量及部分miRNA的表达水平与胚后阶段相比有明显的差异;新miRNA与已知miRNA相比可能存在未知加工机制;不同发育阶段牦牛睾丸之间部分显著差异表达的miRNA可能通过调控其靶基因的表达进而参与精子发生。