甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析

作     者：侯黔东 沈天娇 余欢欢 仇志浪 文壮 张惠敏 吴亚维 文晓鹏 HOU Qiandong;SHEN Tianjiao;YU Huanhuan;QIU Zhilang;WEN Zhuang;ZHANG Huimin;WU Yawei;WEN Xiaopeng

作者机构：贵州大学生命科学学院农业生物工程研究院山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心贵阳550025 贵州大学林学院贵州省森林资源与环境研究中心贵阳550025 贵州省农业科学院果树研究所贵阳550006 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2021年第48卷第12期

页      面：2360-2374页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：贵州省农业攻关项目[黔科合支撑(2016)2520] 贵州省高层次创新型人才培养项目[黔科合人才(2016)4010] 

主　　题：甜樱桃 IAA酰胺合成酶 基因家族 生长素响应 表达分析 

摘      要：以甜樱桃(Prunus avium L.)为材料,对IAA酰胺合成酶(Gretchen Hagen 3,GH3)基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析;同时,分析其在不同组织中的表达及对外源GA3、ABA、MeJA、IAA的响应。结果表明,甜樱桃基因组中共存在8个GH3基因,根据在染色体的位置依次命名为Pav GH3.1~PavGH3.8,编码区长度为1 683~1 851 bp,预测大多数基因定位在叶绿体中;PavGH3外显子数3或4,且有较多保守基序;除5号和7号染色体外,其他染色体均有分布;启动子存在ABA、MeJA等6种激素响应元件;PavGH3在进化上分为2组,且PavGH3.5和PavGH3.6与拟南芥GH3一些成员存在共线性。表达分析显示,PavGH3.2、PavGH3.6和PavGH3.7为3个主要表达基因。PavGH3.4和PavGH3.5在第2次生理落果中较第1次上调表达,与正常果实相比,第1次生理落果中PavGH3.5和PavGH3.7下调表达,PavGH3.4和PavGH3.6上调表达。PavGH3.2、PavGH3.3、PavGH3.6和PavGH3.7为主要响应激素的基因。推测PavGH3基因家族广泛参与甜樱桃的生长发育,且可能与落果关系密切。