基于荧光检测技术的青稞品种鉴定方法的建立

作     者：管俊娇 杨晓洪 张鹏 黄清梅 张建华 GUAN Jun-jiao;YANG Xiao-hong;ZHANG Peng;HUANG Qing-mei;ZHANG Jian-hua

作者机构：云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所昆明650205 云南省农业科学院粮食作物研究所昆明650205 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2021年第37卷第11期

页      面：293-302页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：云南省科技人才和平台计划(2017HB087) 云南省科技重大专项(2019ZG004) 

主　　题：青稞 SSR标记 核心引物 指纹图谱 品种鉴定 

摘      要：本研究通过筛选出一套SSR核心引物,建立青稞DNA指纹鉴定体系,为青稞品种选育、品种鉴定提供高通量检测技术方法。首先以形态差异大的24份种质为材料,对198对SSR引物进行初筛,筛选出42对多态性好、扩增稳定、条带清晰的SSR引物,并对之进行荧光标记。采用筛选出的42对引物对226份材料进行PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳检测,最终筛选出28对SSR荧光引物建立基于高通量荧光SSR标记的青稞品种鉴定体系。采用28对SSR引物构建的DNA指纹图谱进行226个青稞材料的鉴定。28对SSR引物共检测到252个等位基因,每对引物可检测到有效等位基因数为5-16个,平均等位基因数为9;基因多样性指数变异范围为0.48-0.86,平均为0.68;多态信息量(PIC)变幅为0.44-0.84,平均为0.65。226份材料的遗传距离为0-0.99,该套引物可以将大部分参试材料区分开。从28对SSR引物中选择了7对分布于不同染色体上、扩增和检测效果较好的引物(Bmag0211、Scssr07759、HVM62、EBmac0679、Scssr03907、Bmag0870、EBmac0827),构建青稞品种(系)DNA的指纹图谱库。为消除不同检测平台、不同试验批次等引起的误差,为7对SSR核心引物各主要等位变异选择相应的参照品种,作为普通聚丙烯酰胺凝胶电泳的读带依据。最终构建了在2个检测平台(毛细管电泳平台及聚丙烯酰胺凝胶电泳平台)通用的SSR分子标记青稞品种鉴定体系。