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南京市男男性行为人群使用新型毒品亚硝酸酯类吸入剂rushpoppers情况调查

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中华流行病学杂志 2017年第2期38卷 189-193页

作者：朱正平张敏徐园园许文炯刘黎吴苏姝郭璐李昕南京市疾病预防控制中心艾滋病性病防制科 210003 南京市疾病预防控制中心微生物检验科 210003

目的了解南京市男男性行为人群使用新型毒品亚硝酸酯类吸入剂rush poppers情况。方法 2014年4-6月、10-12月和2015年4-6月，分别在南京市开展3轮横断面调查，招募男男性行为者，进行血清学检测和问卷调查。结果共计调查1 721名男男性... 详细信息

目的了解南京市男男性行为人群使用新型毒品亚硝酸酯类吸入剂rush poppers情况。方法 2014年4-6月、10-12月和2015年4-6月，分别在南京市开展3轮横断面调查，招募男男性行为者，进行血清学检测和问卷调查。结果共计调查1 721名男男性行为者，使用过rush poppers者为19.3%（332/1 721），3轮调查中使用rush poppers的比例分别为12.6%（86/681）、27.6%（121/439）、20.8%（125/601），呈上升趋势（线性χ2=14.879，P=0.000）。rush poppers使用者与HIV感染有关联（OR=1.676，95%CI：1.201~2.339，P=0.002）。与rush poppers未使用者相比，使用者的主要人口学特征是≤30岁、未婚、大专及以上文化程度、本地居住时间〈2年、通过网络寻找性伴和性取向为同性恋者的比例较高。多因素logistic回归分析结果显示，排除了潜在的混杂因素之后，〈30岁、大专及以下文化程度、本地居住时间〈2年、最近6个月性伴数≥2人、最近1年被诊断患过性病和吸过传统毒品等因素是使用rush poppers的危险因素。结论南京市男男性行为者使用rush poppers与HIV感染有关联。年轻人、文化程度较高、流动性大、多性伴、患过性病和吸过传统毒品的男男性行为者是使用rush poppers的重点人群。

关键词：男男性行为者亚硝酸酯类横断面调查

新冠病毒奥密克戎变异株感染者咽拭子样本全基因组测序分析

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中国公共卫生 2023年第1期39卷 113-116页

作者：刘赞赞解翠华江亚娟王小羽窦慧馨焦伯延济宁市疾病预防控制中心微生物检验科山东济宁272000

目的对一起新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)变异株引起的疫情感染者咽拭子样本进行全基因组测序分析,为新冠病毒感染疫情防控提供参考依据。方法利用高通量测序技术对2022年4月山东省某县级市4例SARS-CoV-2感染者咽拭子样本... 详细信息

目的对一起新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)变异株引起的疫情感染者咽拭子样本进行全基因组测序分析,为新冠病毒感染疫情防控提供参考依据。方法利用高通量测序技术对2022年4月山东省某县级市4例SARS-CoV-2感染者咽拭子样本进行全基因组测序,利用MEGA 7.0.14软件分析病毒同源性并构建进化树、分析变异位点等。结果4条SARS-CoV-2全基因组序列与参考株wuhan-hu-1相比同源性为99.76%~99.77%,在进化树上均位于奥密克戎BA.2进化分支;均发生多个基因位点变异和缺失,其中,A28271T变异致使N翻译起始区的-3位核苷酸由A变异为T;S蛋白LPP24-26缺失致使双色氨酸(WW)结构域的潜在结合基序PPAY25-28丢失。结论Omicron变异株出现大量变异位点,这些变异位点或与Omicron变异株传染性强、隐匿性高、引起临床严重程度低有一定关系。

关键词：新型冠状病毒奥密克戎变异株全基因组翻译起始区双色氨酸结构域

陕西省某三甲医院艰难梭菌分子流行特征及耐药情况分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2022年第9期42卷 676-682页

作者：栾阳弥鹏张文竹彭雁王媛媛韩锐郡马超锋吴媛西安市疾病预防控制中心微生物与生物检验科西安710054 陕西省人民医院检验科西安710068 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的了解陕西省某三甲医院住院腹泻患者中艰难梭菌(Clostridioides difficile,Cd)分子流行特点及耐药情况。方法收集2018年10月—2021年12月425份住院腹泻患者的粪便标本进行艰难梭菌分离鉴定,检测其毒素基因并进行多位点序列分型和E^(-... 详细信息

目的了解陕西省某三甲医院住院腹泻患者中艰难梭菌(Clostridioides difficile,Cd)分子流行特点及耐药情况。方法收集2018年10月—2021年12月425份住院腹泻患者的粪便标本进行艰难梭菌分离鉴定,检测其毒素基因并进行多位点序列分型和E^(-)test药敏试验。结果425份标本中分离到49株艰难梭菌,产毒艰难梭菌37株,占75.5%(37/49),≥65岁腹泻患者Cd检出率为14.0%(25/179),肾内科Cd检出率为36.4%(4/11),A^(-)B^(+)CDT^(-)有7株,占18.9%(7/37),A^(+)B^(+)CDT^(-)有29株,占78.4%(29/37),A^(+)B^(+)CDT^(+)有1株,占2.7%(1/37);共有24个ST型别,其中ST2、ST3和ST54为主要检出型别,各占比为12.2%(6/49)。所有菌株对甲硝唑和万古霉素均敏感,对环丙沙星耐药率较高为93.9%(46/49),对利福平和美罗培南耐药率较低,分别为12.2%(6/49)和10.2%(5/49)。结论产毒株以A^(+)B^(+)CDT^(-)为主要型别,ST2、ST3和ST54为主要型别,各ST型别分布分散,全部菌株对甲硝唑和万古霉素敏感,大部分菌株对环丙沙星耐药。

关键词：艰难梭菌毒力基因分子分型耐药

2021年云南省手足口病病例中柯萨奇病毒A2型的测序定型和基因特征分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第1期43卷 27-34页

作者：刘艳艳杨善蕊段忠文姜黎黎周晓芳寸建萍伏晓庆罗春蕊田炳均昆明市疾病预防控制中心微生物检验科昆明650228 德宏州疾病预防控制中心微生物检验室德宏678400 云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所昆明650022

目的对2021年云南省昆明市及曲靖市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中非肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EVA71)和非柯萨奇病毒A组16型(coxsackie-virus A16,CVA16)的其他肠道病毒进行VP4/VP2区及VP1区基因测序检测,并对检测到的CVA2 VP1区基因进行基因进化分析,为CVA2的预防及控制提供实验室证据。方法按《手足口病实验室手册(2018年版)》,对2021年昆明市和曲靖市送到云南省疾病预防控制中心HFMD实验室的标本进行前处理,提取病毒RNA后,先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒VP4/VP2结合区基因并测序,编辑后的序列在GenBank上搜索确定病毒型别,再用肠道病毒A组引物分两段扩增CVA2 VP1区基因完整序列并测序,通过肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping tool Version 0.1)进行病毒型别确认。按文献下载CVA2 VP1区基因型/亚型代表株序列,Mega5.2软件构建基因进化树,分析病毒基因特征。结果共检测749份非EVA71和非CVA16的肠道病毒标本,两地皆以A组肠道病毒为主,B组肠道病毒有少量报告,CVA16居病原谱第一位。其中CVA25份,检出率为0.67%(5/749),为HFMD的稀有病原。VP4/VP2和VP1两个基因片段的测序检测、定型结果一致。基因特征分析表明,昆明市3株为基因型A,曲靖市2株为基因型D。结论2021年云南省HFMD监测网络中昆明市和曲靖市CVA2的检出率为0.67%,CVA2在这两个市是HFMD的稀有病原。基因进化分析表明,两个基因型分别在昆明市和曲靖市传播但尚未引起流行。昆明市CVA2基因型A为国内首次报道。加强云南省CVA2的实验室监测特别是分子流行病学监测,对追踪和分析病毒传染来源具有重要意义。

关键词：手足口病柯萨奇病毒A组2型 VP4/VP2 VP1 基因特征分析

2017-2018年青岛地区儿童急性上呼吸道感染病毒谱与流行特征

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中华疾病控制杂志 2019年第6期23卷 694-699页

作者：张凤史晓燕赵丹杨雯孙睿苏志磊汪照国高汝钦青岛市疾病预防控制中心(青岛市预防医学研究院)微生物检验科

目的了解2017年3月-2018年3月青岛地区儿童急性上呼吸道感染病毒谱与流行特征。方法随机抽选青岛地区符合国家流感监测方案诊断标准的流感监测病例中的儿童流感样病例(influenza-like illness,ILI)作为研究对象,共检测359例。采集患儿... 详细信息

目的了解2017年3月-2018年3月青岛地区儿童急性上呼吸道感染病毒谱与流行特征。方法随机抽选青岛地区符合国家流感监测方案诊断标准的流感监测病例中的儿童流感样病例(influenza-like illness,ILI)作为研究对象,共检测359例。采集患儿咽拭子,采用多重实时荧光逆转录-聚合酶链反应进行核酸检测的方法,对9种呼吸道病毒进行筛查。结果 359例标本中200例至少有1种病毒检测结果为阳性,阳性率为55.71%(200/359)。其中,阳性最多的是流感病毒B型(Influenza Virus B, IVB)Yamagata亚型29.50%(59/200),其次是肠道病毒(Human Enterovirus, HEV) 15.00%(30/200),呼吸道腺病毒(Adenovirus, AdV) 13.50%(27/200),呼吸道合胞病毒A型(Respiratory Syncytial Virus A, RSVA) 12.50%(25/200),流感病毒A型(Influenza Virus A, IVA) H1N1亚型10.00%(20/200)等。2例3种病毒混合感染,1例4种病毒混合感染。结论 2017年3月-2018年3月9种呼吸道病毒在青岛地区均有流行,IVB Yamagata亚型、HEV、AdV、RSVA亚型、IVA H1N1亚型为主要流行病毒。其中流感病毒、HEV、RSV、偏肺病毒(Human metapneumovirus, HMPV)具有明显的季节性分布。9种病毒在各病毒流行月份存在混合感染。

关键词：儿童急性上呼吸道感染呼吸道病毒流行特征

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副溶血性弧菌的毒力基因检测及分子分型研究

中华微生物学和免疫学杂志 2010年第8期30卷 727-729页

作者：王虹玲唐丽华王忠发罗芸舟山市疾病预防控制中心微生物检验科 316021 浙江省疾病预防控制中心微生物所

副溶血性弧菌（Vibrio parahaemolyticus，Vp）是一种革兰阴性、在海洋及盐湖环境中分布极为广泛的嗜盐性致病菌。在海产品中尤以贝壳类动物副溶血性弧菌污染程度较为严重，在贝类动物中副溶血性弧菌密度和粪大肠菌群比海水中要高10～10... 详细信息

副溶血性弧菌（Vibrio parahaemolyticus，Vp）是一种革兰阴性、在海洋及盐湖环境中分布极为广泛的嗜盐性致病菌。在海产品中尤以贝壳类动物副溶血性弧菌污染程度较为严重，在贝类动物中副溶血性弧菌密度和粪大肠菌群比海水中要高10～100倍。舟山市贝类资源丰富。近年来人们把生食或半生食贝类、甲壳类海产品作为一种时尚饮食习惯，

关键词：副溶血性弧菌分子分型基因检测甲壳类海产品毒力粪大肠菌群革兰阴性污染程度

烧伤病房铜绿假单胞菌β内酰胺类抗生素耐药基因分析

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中华烧伤杂志 2007年第3期23卷 212-215页

作者：宋启发林辉郑剑徐景野金春光李国军浙江省宁波市疾病预防控制中心微生物检验科 315010

目的了解烧伤病房铜绿假单胞菌β内酰胺类抗生素耐药基因携带情况及耐药性。方法采用K-B法检测来自烧伤创面和病房的铜绿假单胞菌对9种β内酰胺类抗生素的耐药谱。用PCR扩增法检出β内酰胺类抗生素耐药基因的阳性菌株,用他唑巴坦对哌拉... 详细信息

目的了解烧伤病房铜绿假单胞菌β内酰胺类抗生素耐药基因携带情况及耐药性。方法采用K-B法检测来自烧伤创面和病房的铜绿假单胞菌对9种β内酰胺类抗生素的耐药谱。用PCR扩增法检出β内酰胺类抗生素耐药基因的阳性菌株,用他唑巴坦对哌拉西林阻断实验判断上述阳性菌株是否产超广谱β内酰胺酶(ESBL)。结果12株检出β内酰胺类耐药基因的铜绿假单胞菌对所试的头孢菌素类抗生素和哌拉西林均耐药,其中7株对包括亚胺培南和氨曲南在内的9种抗生素耐药。他唑巴坦对哌拉西林耐药阻断实验提示,这7株耐药基因阳性菌株均产ESBL。本实验扩增出6种β内酰胺耐药基因,分别为VEB、IMP、PSE、FOX、OXA、VIM。结论烧伤病房铜绿假单胞菌β内酰胺类抗生素耐药基因携带率较高,与细菌多重耐药有密切关系。

关键词：烧伤病房假单胞菌,铜绿 β内酰胺抗药性基因

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2019年濮阳市登革热疫情与病原分子溯源

中华预防医学杂志 2021年第8期55卷 978-982页

作者：徐国锋张清杰张玉华孟晓飞李广康郭永豪谢为民夏胜利濮阳市疾病预防控制中心微生物检验科 457000 濮阳市疾病预防控制中心 457000 河南省疾病预防控制中心免疫规划所郑州450016 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所郑州450016

目的分析河南省濮阳市2019年8月份的一起登革热暴发疫情。方法利用胶体金法检测登革病毒IgM/IgG抗体和NS1抗原,利用PCR方法扩增E基因,并进行基因测序,利用MegaX软件进行E基因编码蛋白序列的比对分析,构建进化树。结果经过临床确诊和实... 详细信息

目的分析河南省濮阳市2019年8月份的一起登革热暴发疫情。方法利用胶体金法检测登革病毒IgM/IgG抗体和NS1抗原,利用PCR方法扩增E基因,并进行基因测序,利用MegaX软件进行E基因编码蛋白序列的比对分析,构建进化树。结果经过临床确诊和实验室确诊,共有81例登革热病例,其中17例为当地农民到柬埔寨和泰国务工的输入性病例,64例为本土病例。E基因编码的蛋白序列比对分析结果表明,该起疫情的病原为登革热病毒1型,与越南株高度同源。本土疫情发生后,登革病毒E基因发生了核苷酸位点突变,突变位点可稳定传播。结论濮阳本起登革热暴发疫情系与国外输入病例相关联的一起由登革1型病毒引起的本地暴发,基因测序显示输入性病原在本地流行后发生了较为稳定且可传播的核苷酸突变。

关键词：登革热病毒基因型诊断分子溯源

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深圳市登革热暴发疫情的分子病毒学分析

中华传染病杂志 2012年第7期30卷 429-434页

作者：阳帆张仁利陈思敏熊鹰刘涛黄达娜武伟华李明深圳市疾病预防控制中心微生物检验科 518055

目的分析深圳市2010年登革热暴发疫情的病因，从分子水平探讨流行毒株的生物学特征，追踪其地域来源。方法采用ELISA、胶体金免疫层析法和荧光PCR检测疑似登革热患者血清中的特异性IgM、IgG抗体和病毒核酸，并用C6／36和BHK-21细胞对早... 详细信息

目的分析深圳市2010年登革热暴发疫情的病因，从分子水平探讨流行毒株的生物学特征，追踪其地域来源。方法采用ELISA、胶体金免疫层析法和荧光PCR检测疑似登革热患者血清中的特异性IgM、IgG抗体和病毒核酸，并用C6／36和BHK-21细胞对早期病例血清进行病毒分离，采用反转录一半套式PCR和荧光PCR方法对其进行型别鉴定。同时扩增病毒E基因后进行序列测定，并与不同国家和地区的登革病毒株进行同源性比较和进化树分析。结果从疑似登革热患者血清中检测到登革病毒IgM、IgG抗体及登革1型病毒核酸。深圳市登革1型病毒分离株SZ1029与登草1型国际标准株HAWAII45株、我国福建省Fj23I／04株及广东省1997、1999年登革1型病毒流行株GD14／97、GD05／99在E基因上的核苷酸同源性分别为94．8％、99．6％、97．7％和98．5％。基因进化树显示，深圳市登革病毒分离株与马来西亚分离株D1／Malaysia／36000／05、新加坡分离株SG（EHI）DED142808和Fj23I／04株亲缘关系最近，在进化树的同一分支上，与GZ／80、Taiwan87同属基因I亚型。所有患者发病前1个月在深圳市某工地居住，无输血史、无外出史。结论该次疫情的病因为登革1型病毒感染，该毒株有可能来源于东南亚一带，推测深圳可能存在登革1型病毒的疫源地。

关键词：登革热登革热病毒病毒蛋白质类基因病毒序列分析流行病学分子