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管氏肿腿蜂密度对其寄生及繁衍能力的影响

环境昆虫学报 2023年第2期45卷 496-506页

作者：牛国霜李莉唐明贵州师范大学生命科学学院贵阳550025 贵州师范大学西南喀斯特山地生物多样性保护国家林草局重点实验室贵阳550025

本研究以管氏肿腿蜂Sclerodermus guani雌成蜂为研究对象,拟探明寄生蜂密度对其寄生及繁衍能力的影响,为该寄生蜂行为生物学研究提供科学依据。本研究以松墨天牛Monochamus alternatus幼虫(0.350~0.450 g)为寄主,设置8种不同雌蜂密度(1~... 详细信息

本研究以管氏肿腿蜂Sclerodermus guani雌成蜂为研究对象,拟探明寄生蜂密度对其寄生及繁衍能力的影响,为该寄生蜂行为生物学研究提供科学依据。本研究以松墨天牛Monochamus alternatus幼虫(0.350~0.450 g)为寄主,设置8种不同雌蜂密度(1~8头/寄主),对比分析不同雌蜂密度下,管氏肿腿蜂的寄生行为和效能,以及雌蜂生殖力和子代适合度变化。结果表明,随雌蜂密度增加,管氏肿腿蜂蛰刺发生前历时、寄主麻痹历时及产卵前历时均缩短。基于Hassell-Varley数据模型分析(E=0.9023×P^(-0.9378)),雌蜂的寻找效应随自身密度增加而逐渐变小,雌蜂间的干扰降低了寄生效能。雌蜂生殖力随其密度增加而降低,单雌平均产卵量及产雌量明显下降,雌蜂密度为1头/寄主时,单雌产卵量分别是4头/寄主和8头/寄主处理下的1.4倍和2.4倍。子代适合度也随雌蜂密度增加而变化,子代发育历期明显缩短,低龄幼虫存活率和单雌体重均下降。雌蜂密度为1头/寄主时,其子代发育历期最长,平均为26.7 d,8头/寄主时最短,平均为24.0 d。雌蜂密度为1头/寄主时低龄幼虫存活率和单雌体重分别是8头/寄主时的1.1倍和2.1倍。随雌蜂密度增加,子代雄性比呈小幅下降趋势,大多数处理子代雄性比低于15%。多头雌蜂寄生可提高克服寄主效率,缩短子代发育历期,增加子代数量,雌蜂密度为4头/寄主时可达到繁殖利益最大化。

关键词：管氏肿腿蜂雌蜂密度寄生效能生殖力子代适合度

根际益生菌挥发性有机物对拟南芥根部基因表达的影响分析

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基因组学与应用生物学 2020年第12期39卷 5549-5557页

作者：李菲李霞刘杰张习敏何小红乙引贵州师范大学生命科学学院国家林业局西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室贵州省植物生理与发育调控重点实验室贵州550025

细菌挥发性有机物影响植物生理过程的分子机理,是近年研究的热点。研究已经证明,*** GB03挥发性有机物影响拟南芥生长、发育调控和对逆境的响应等多个生理过程。但目前还没有对*** GB03挥发性有机物对拟南芥根部基因表达影响的完整和系... 详细信息

细菌挥发性有机物影响植物生理过程的分子机理,是近年研究的热点。研究已经证明,*** GB03挥发性有机物影响拟南芥生长、发育调控和对逆境的响应等多个生理过程。但目前还没有对*** GB03挥发性有机物对拟南芥根部基因表达影响的完整和系统分析。本研究通过高通量转录组测序,筛选出受到根际促生细菌GB03挥发性有机物处理影响的拟南芥功能基因和通路,并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,获得GB03挥发性有机物影响拟南芥生理过程的分子调控网络。本研究对根际促生细菌挥发性有机物对拟南芥基因表达影响的RNAseq结果与分析进行了报道,此结果对揭示根际促生细菌调控植物生理过程的分子机理,有极大的促进作用。

关键词：根际益生菌挥发性有机物拟南芥转录组

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“云中仙境”——云台山

大众科学 2021年第8期 62-63页

作者：姚仁秀贵州师范大学西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室

施秉云岩喀斯特是全球唯一的白云岩喀斯特地貌,云台山有着丰富珍贵的物种基因库,具有重要的保护和研究价值。云台山风景区位于贵州省黔东南苗族侗族自治州施秉县北部,是国家AAAA级景区、国家地质公园、国家名胜风景区,因其气候凉爽宜人... 详细信息

施秉云岩喀斯特是全球唯一的白云岩喀斯特地貌,云台山有着丰富珍贵的物种基因库,具有重要的保护和研究价值。云台山风景区位于贵州省黔东南苗族侗族自治州施秉县北部,是国家AAAA级景区、国家地质公园、国家名胜风景区,因其气候凉爽宜人,风景优美如画被誉为"中国避暑名山"、贵州十大魅力景区。施秉云岩喀斯特是全球唯一的白云岩喀斯特地貌,被联合国教科文组织高度评价为"反映地球演化历史主要阶段的杰出典范,是中国南方喀斯特世界遗产的重要补充和完善,具有全球的普遍价值意义和突出的科学价值"。在大自然数亿年精雕细琢下,形成了峰林层叠,深幽峡谷的独特喀斯特景观,景区依托着喀斯特的奇特被逐渐掀开神秘的面纱,巍峨峥嵘峰林久经岁月风霜,在云海缭绕中却显得越发雄奇壮观。温暖湿润的气候为动植物的生存提供适宜的环境,森林植被茂密,生物种类丰富多样。明朝邓子龙亲身见证这别样美景后不禁题词赞美到"万山高处结云台,崔巍鼎立真奇哉。乘风步虚一搔首,白云散尽青天开。"

关键词：喀斯特地貌喀斯特景观物种基因库生物种类峰林邓子龙凉爽宜人云岩

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阿西里西韭菜坪

大众科学 2020年第1期 60-61页

作者：张子楠贵州师范大学西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室

景区风光绮丽独特,高原风光浓郁,登贵州屋脊小韭菜坪,可领略唐朝诗人杜甫的"一览众山小"之气概。韭菜坪的天,是一种独特的蓝。不同于青藏高原那般,它蓝得非常的纯净,令人肃然起敬的同时还让你有一种亲近的感觉。站在山顶,人的心似乎也... 详细信息

景区风光绮丽独特,高原风光浓郁,登贵州屋脊小韭菜坪,可领略唐朝诗人杜甫的"一览众山小"之气概。韭菜坪的天,是一种独特的蓝。不同于青藏高原那般,它蓝得非常的纯净,令人肃然起敬的同时还让你有一种亲近的感觉。站在山顶,人的心似乎也像这蓝天一般纯洁无暇,与山浑然一体。

关键词：韭菜坪一览众山小风光绮丽杜甫西里西浑然一体青藏高原

濒危植物短叶黄杉叶绿体全基因组特征及松科植物系统发育分析

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分子植物育种 2023年第12期21卷 3907-3918页

作者：董溪王晓双汤晓辛张潮贵州师范大学国家林业和草原局西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室贵州省植物生理与发育调控实验室贵阳550001 贵州师范大学生命科学学院贵阳550001

为确定短叶黄杉(Pseudotsuga brevifolia)叶绿体基因组结构大小、特征以及基因组成情况,明确其与同科物种叶绿体基因组差异性,并揭示松科植物潜在的变异序列,探究系统发育规律。本研究以二代测序为基础,对测序结果进行组装、注释,得到... 详细信息

为确定短叶黄杉(Pseudotsuga brevifolia)叶绿体基因组结构大小、特征以及基因组成情况,明确其与同科物种叶绿体基因组差异性,并揭示松科植物潜在的变异序列,探究系统发育规律。本研究以二代测序为基础,对测序结果进行组装、注释,得到短叶黄杉叶绿体全基因组,分析了其基本结构、基因组成、SSR位点等数据,并与其他松科植物叶绿体基因组进行比对分析、IR扩张收缩分析与系统发育分析。结果表明:短叶黄杉叶绿体基因组全长122348 bp,呈典型的四分体结构,LSC区长度为66627 bp,SSC区长54863 bp,IR区长度仅为858 bp,一共注释到114个基因,其中有73个蛋白编码基因,37个tRNA基因和4个rRNA基因,5个基因具有2~3个拷贝且都为tRNA基因,且含有内含子的基因共有7个。SSR位点中,单核苷酸重复共有15个,占所有SSR的52%,2~5核苷酸重复分别为6、4、3和1个,主要为AT类型重复。叶绿体基因组序列比对发现,短叶黄杉与黄杉的相似度最高,多数物种在IR区、tRNA和rRNA基因区域的一致度相对较高,最为保守;包括短叶黄杉在内的其他9个物种中,非编码区的遗传变异比编码区更为普遍。IR边界扩张与收缩分析结果表明:9个物种LSC/IRb边界处均为rpl23基因,IR区均发生了明显的收缩,因此基因分布较少且单一。云杉属的两种植物IRb区没有基因分布,云南松IRb区分布有两个基因,其IR区较其他物种发生了扩张。短叶黄杉IR区内分布的基因为trnM,其余物种IR区内的基因均为trnI,且云杉属两个物种的IR/SC边界与松科其他物种差异较大。构建叶绿体全基因组NJ系统发育树显示,松科10个属16个物种主要被分为3大类,欧洲落叶松(Larix decidua)与黄杉属亲缘关系最近。本研究首次报道了短叶黄杉的叶绿体基因组结构与特征,阐明了松科不同属物种间叶绿体基因组的结构差异,明确了短叶黄杉的分类位置,为濒危植物短叶黄杉的遗传育种、分类保护以及松科植物的物种鉴定、种间进化研究和系统发育重建提供了数据基础与参考依据。

关键词：短叶黄杉叶绿体基因组濒危植物系统发育

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旋蒴苣苔CDPK基因家族鉴定与特征分析

分子植物育种 2022年第18期20卷 6015-6023页

作者：石天龙李欲柯洪鲲龚纪熠李菲贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控重点实验室贵阳550025 国家林业和草原局西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室贵阳550025

钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶。CDPK在介导植物生长发育和逆境信号转导中具有重要作用。大多数高等植物无法耐受极度脱水状态,然而旋蒴苣苔进化出独特的耐脱水机制,能够耐受体内水分丧失90%以上,且复... 详细信息

钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶。CDPK在介导植物生长发育和逆境信号转导中具有重要作用。大多数高等植物无法耐受极度脱水状态,然而旋蒴苣苔进化出独特的耐脱水机制,能够耐受体内水分丧失90%以上,且复水后迅速恢复生活状态。为揭示旋蒴苣苔CDPK基因在生长发育与抗旱防御机制中的作用,本研究基于旋蒴苣苔基因组数据,在全基因组水平利用生物信息学工具对CDPK基因家族成员进行鉴定,并对其系统进化、基因结构、染色体定位等进行分析并对部分基因进行功能预测。本研究鉴定了旋蒴苣苔CDPK基因家族,并对其进行相关分析,为在基因组范围内研究CDPK基因在旋蒴苣苔抗旱逆境响应中的功能提供了理论基础。

关键词：旋蒴苣苔 CDPK 生物信息学

茂兰喀斯特森林地上生物量林层格局及驱动因子

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森林与环境学报 2023年第2期43卷 169-176页

作者：邓伟车俭毛艳娇肖梓波金毅汤晓辛贵州师范大学生命科学学院贵州贵阳550025 西南喀斯特山地生物多样性保护国家林草局重点实验室贵州贵阳550025 贵州省植物生理与发育调控重点实验室贵州贵阳550025

以茂兰国家级自然保护区内喀斯特森林作为研究对象,建立森林样地并使用异速生长方程计算森林木本植物的地上生物量,采用配对t检验和线性混合效应模型等统计方法,分析森林地上生物量的林层(上木层和下木层)分布格局及驱动因子(非生物因... 详细信息

以茂兰国家级自然保护区内喀斯特森林作为研究对象,建立森林样地并使用异速生长方程计算森林木本植物的地上生物量,采用配对t检验和线性混合效应模型等统计方法,分析森林地上生物量的林层(上木层和下木层)分布格局及驱动因子(非生物因子和生物因子)。研究发现茂兰喀斯特森林地上生物量主要分布在上木层。非生物因子中,仅岩石裸露率对森林总体地上生物量产生了负向作用,分为不同林层后,进一步发现岩石裸露率仅对上木层地上生物量产生负向作用,而对下木层则无作用;还发现地形生境的重要作用,表现为山腰上木层地上生物量大于山顶的,而山顶下木层地上生物量则大于山腰的。生物因子中,仅植株密度对上木层和下木层地上生物量产生正向作用。结果表明:茂兰喀斯特森林地上生物量受到非生物和生物因子的共同调控;若仅分析森林总体地上生物量,则难以发现不同林层地上生物量分布格局及驱动因子的差异。本研究提示对喀斯特森林地上生物量及驱动因子进行分层分析的必要性,同时也为茂兰喀斯特森林后续的经营管理提供了一定的理论基础。

关键词：上木层下木层地形岩石裸露率茂兰国家级自然保护区

日本蛇根草转录组数据的功能注释及SSR标记开发

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分子植物育种 2021年第5期19卷 1614-1623页

作者：张子楠张潮唐汉青相孟达董溪汤晓辛贵州师范大学生命科学学院西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业局重点实验室贵阳550001 贵州师范大学贵州省植物生理与发育调控重点实验室贵阳550001

日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica)具有很好的观赏价值和药用价值,但基因组信息相对缺乏,导致其分子生物学和基因功能的研究受到限制。为了获得和挖掘日本蛇根草的基因数据和功能,本研究利用日本蛇根草RNA-seq转录组数据进行分析,总共产... 详细信息

日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica)具有很好的观赏价值和药用价值,但基因组信息相对缺乏,导致其分子生物学和基因功能的研究受到限制。为了获得和挖掘日本蛇根草的基因数据和功能,本研究利用日本蛇根草RNA-seq转录组数据进行分析,总共产生8.48 GB数据;对所有单基因在KEGG通路数据库进行分析,共有131913个单基因被分配给KO(KEGG orthology),并定位到20个二层通路129个不同的通路。Unigene功能注释,获得GO分类条目134644条Unigenes;获得COG注释Unigenes 67961条,其中通用预测Unigenes最多。在28483条单基因簇中获得37070个简单重复序列(SSR),出现频率为16.25%,发生频率为12.49%,其平均长度为20 bp。通过设计进行筛选获取20379对SSR引物,随机筛选50对引物进行验证证明SSR引物具备有效性,日本蛇根草SSR位点具有较高的多态性潜能,对遗传多样性的鉴定具有潜在的开发价值。综上所述,本研究提供了有价值的基因研究和分子研究的信息来源,将为功能基因的克隆、基因表达、分子标记开发和遗传多样性研究提供帮助。

关键词：日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica) 转录组 SSR 生物信息学功能注释

贵州部分洞穴裸灶螽的鉴定及其遗传多样性分析

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环境昆虫学报 2022年第1期44卷 106-117页

作者：吕小艳李斌强何诗远何小涛王野影贵州师范大学生命科学学院贵阳550025 贵州师范大学国家林业局西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室贵阳550025

贵州是中国具有丰富喀斯特洞穴生态系统的省份之一,裸灶螽作为洞穴中的优势物种又为生态环境指示种,其遗传多样性能够反应洞穴生物多样性。为评估洞穴开发对洞穴生物多样性的影响,本研究通过形态鉴定和分子辅助鉴定的方式对来自贵州省... 详细信息

贵州是中国具有丰富喀斯特洞穴生态系统的省份之一,裸灶螽作为洞穴中的优势物种又为生态环境指示种,其遗传多样性能够反应洞穴生物多样性。为评估洞穴开发对洞穴生物多样性的影响,本研究通过形态鉴定和分子辅助鉴定的方式对来自贵州省毕节、黔西南、铜仁和黔南4个地区8个洞穴97号裸灶螽标本进行鉴定,并对其遗传多样性进行分析。结果共鉴定出裸灶螽亚属Tachycines(Gymnaeta)的8个种和3个形态鉴定模棱两可的待定种,包括此次在贵州首次报道的伪裸灶螽Tachycines(Gymnaeta)fallax和洞穴裸灶螽Tachycines(Gymnaeta)cavernus;通过使用线粒体COI基因构建裸灶螽亚属的系统发育树,对待定种进行了辅助鉴定,认为洞穴裸灶螽Tachycines(Gymnaeta)cavernus、实心裸灶螽Tachycines(Gymnaeta)solidus和波氏裸灶螽Tachycines(Gymnaeta)borutzkyi之间可能存在复合种;洞穴空间小和相对湿度低或人为活动干扰和洞穴开发情况严重会减少裸灶螽的数量和降低其遗传多样性。因此,建议对洞穴空间较大,物种较丰富的洞穴建立洞穴物种基因库,做到科学开发旅游资源,力争向生态科技旅游推进。

关键词：贵州喀斯特洞穴裸灶螽亚属物种鉴定物种遗传多样性洞穴保护