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类风湿关节炎相关多肽对临床诊断的价值

中华医学杂志 2009年第27期89卷 1889-1891页

作者：罗红杨光刘辉刘永娥大连医科大学临床免疫与微生物教研室 116044 大连医科大学第二临床学院检验科

目的评价利用噬菌体随机肽库，以抗角蛋白抗体（AKA）为配基筛选特异结合的抗原表位的临床诊断价值。方法将间接荧光法检测AKA阳性的类风湿关节炎（RA）患者混合血清，经33．3％饱和硫酸铵盐析纯化IgG，以此多克隆抗体为配基，对噬菌体... 详细信息

目的评价利用噬菌体随机肽库，以抗角蛋白抗体（AKA）为配基筛选特异结合的抗原表位的临床诊断价值。方法将间接荧光法检测AKA阳性的类风湿关节炎（RA）患者混合血清，经33．3％饱和硫酸铵盐析纯化IgG，以此多克隆抗体为配基，对噬菌体递呈的随机12肽库（预先经正常人血清吸收）进行淘筛，将筛选到的阳性噬菌体克隆包被酶标反应板，通过间接ELISA法检测临床RA患者、系统性红斑狼疮（SLE）患者、强直脊柱炎患者及正常人血清标本，评价诊断价值。结果筛选到一个模拟表位，对RA诊断的特异性为95．6％，敏感性为60％，约登诊断指数为155．6％，阳性预测值为90％，其氨基酸序列为QSESAGPTTSRR，与人的聚角蛋白微丝蛋白137—148位氨基酸相似。结论筛选到的多肽QSESAGPTTSRR为RA相关多肽，可能对RA具有一定的特异性诊断价值。

关键词：噬菌体随机肽库类风湿关节炎多肽

互联网+时代医学微生物学课程跨校学习的成效及影响因素

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微生物与感染 2022年第5期17卷 333-336页

作者：孙慎侠刘欣王云华张伟黄敏孙文长大连大学医学院病原生物学与免疫学教研室辽宁大连116622 大连医科大学微生物学教研室辽宁大连116044

大连医科大学作为建课方,利用超星平台录制了医学微生物学课程,大连大学作为使用方与大连医科大学合作跨校学习。迄今共有5届医学检验专业的345名学生注册使用。为了总结影响教学效果的因素并根据不足做好整改,本文向2016—2018级的227... 详细信息

大连医科大学作为建课方,利用超星平台录制了医学微生物学课程,大连大学作为使用方与大连医科大学合作跨校学习。迄今共有5届医学检验专业的345名学生注册使用。为了总结影响教学效果的因素并根据不足做好整改,本文向2016—2018级的227名学生发放相应问卷,共收回226份有效问卷,回收率为99.6%。跨校学习总体满意程度为79.7%,学生也对课程提出了更高的要求和意见,如及时沟通、加强互动等。通过调查,本文总结了经验,发现了不足,并在后续的教学过程中,持续地改进,同学们的满意度也升高了28.9%。基于互联网+的跨校学习模式,实现了两校间优质教学资源和师资的共享,有利于学生自主学习,这可能是今后高等院校课程教育的发展方向。

关键词：互联网医学微生物学跨校学习

FAK抑制剂PF-562271减轻老化血小板诱导的人脐静脉内皮细胞损伤

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南方医科大学学报 2024年第2期44卷 252-259页

作者：白钰婷刚保才张梦洁万子雨刘国权顾玮蚌埠医科大学癌症转化医学安徽省重点实验室安徽蚌埠233000 蚌埠医科大学检验医学院生物化学与分子生物学教研室安徽蚌埠233000

目的探究FAK抑制剂对老化血小板诱导的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)损伤的保护作用。方法实验分为空白对照组、脂多糖(LPS)组、造模组(LPS+Plt)和FAK抑制剂PF-562271组(LPS+Plt+PF-562271)。通过Western blot和免疫荧光检测FAK、pFAK和PECA... 详细信息

目的探究FAK抑制剂对老化血小板诱导的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)损伤的保护作用。方法实验分为空白对照组、脂多糖(LPS)组、造模组(LPS+Plt)和FAK抑制剂PF-562271组(LPS+Plt+PF-562271)。通过Western blot和免疫荧光检测FAK、pFAK和PECAM-1的蛋白表达。流式细胞术检测HUVEC活性氧(ROS)含量。细胞通透性和跨内皮细胞电阻实验,检测HUVEC屏障功能的变化。RT-qPCR检测炎性因子mRNA表达,酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测细胞上清液中,炎性因子的分泌情况。免疫荧光检测加入ROS抑制剂维生素C(Vit.C)后,PECAM-1的表达。结果脂多糖和老化血小板处理后,FAK、pFAK和PECAM-1的蛋白表达增高,加入PF-562271后,FAK、pFAK和PECAM-1的蛋白表达降低(P<0.05,P<0.01)。流式细胞术结果显示,脂多糖和老化血小板可促进ROS的释放,而加入PF-562271后,ROS释放减少(P<0.001)。脂多糖和老化血小板导致内皮细胞屏障受损,PF-562271可缓解内皮细胞屏障功能的损伤(P<0.01)。脂多糖和老化血小板促进内皮细胞炎症因子TNF-α、IL-6、IL-8的表达,PF-562271可降低炎症因子的表达(P<0.05)。加入维生素C后,PECAM-1蛋白表达降低(P<0.01)。结论FAK抑制剂PF-562271可通过改善氧化应激水平和降低炎症反应,缓解脂多糖和老化血小板诱导的内皮细胞损伤。

关键词： TRALI PF-562271 FAK PECAM-1 老化的血小板人脐静脉内皮细胞

间充质干细胞对系统性红斑狼疮T淋巴细胞的免疫调节作用

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免疫学杂志 2016年第8期32卷 681-686页

作者：罗利梅骆辑周晓泉蒋红梅陈琨安宇匡颖骆姝琳聂瑛洁刘泽星贵州省遵义市第一人民医院检验科 563002 贵州大学药学院贵阳550002 贵州省血液中心办公室贵阳550002 贵州医科大学检验系临床微生物学和免疫学教研室贵阳550000 贵州省人民医院中心实验室贵阳550000 贵州省人民医院中国际交流合作部贵阳550000 香港大学医学院内科 008000

目的研究正常健康捐献者骨髓来源的间充质干细胞(MSC)对系统性红斑狼疮(SLE)患者来源的T淋巴细胞的免疫调节作用。方法共培养MSC与正常对照或SLE患者来源的T淋巴细胞,检测MSC对T细胞的作用,包含T细胞增殖能力,细胞表型及其产生的细胞因... 详细信息

目的研究正常健康捐献者骨髓来源的间充质干细胞(MSC)对系统性红斑狼疮(SLE)患者来源的T淋巴细胞的免疫调节作用。方法共培养MSC与正常对照或SLE患者来源的T淋巴细胞,检测MSC对T细胞的作用,包含T细胞增殖能力,细胞表型及其产生的细胞因子等。实验分为健康对照组(C组)与SLE组(S组)。每一大组又分为T细胞组(C1组、S1组)、T细胞+植物血凝素组(C2组、S2组)、T细胞+植物血凝素+MSC组(C3组、S3组)。结果 MSC能抑制SLE患者来源的T淋巴细胞增殖[S2:(2 615.7±582.3)cpm;S3:(784.7±417.5)cpm;P免疫耐受,有望成为治疗SLE的细胞疗法。

关键词：自身免疫性疾病系统性红斑狼疮间充质干细胞调节性T细胞

人巨细胞病毒无症状性感染者UL144基因多态性研究

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病毒学报 2016年第5期32卷 610-618页

作者：郭刚强谢尙丹叶思思张良孙祥威李宝青张丽芳薛向阳温州医科大学微生物学和免疫学教研室温州325035 温州医科大学第二临床医学院温州325035 温州医科大学附属第一医院胃肠外科温州325035 温州医科大学附属第二医院检验科温州325000

为探究人巨细胞病毒（HCMV）无症状性感染者UL144基因多态性,本研究采用聚合酶链反应扩增HCMVDNA阳性无症状性感染者尿沉渣标本UL144基因开放读码框（ORF）,阳性结果进行双向DNA测序,通过生物信息学工具BioEdit、DNAstar、Mega5.0、Gene... 详细信息

为探究人巨细胞病毒（HCMV）无症状性感染者UL144基因多态性,本研究采用聚合酶链反应扩增HCMVDNA阳性无症状性感染者尿沉渣标本UL144基因开放读码框（ORF）,阳性结果进行双向DNA测序,通过生物信息学工具BioEdit、DNAstar、Mega5.0、GeneDoc等软件进行序列特征分析。结果显示,在50例HCMV-DNA阳性无症状性感染者尿沉渣标本中,21例标本UL144基因扩增阳性,阳性率为42%,并完成测序。同源性比较显示核苷酸同源性为80.2%～100%,氨基酸同源性为77.8%～100%。种系进化树分析显示21例无症状性感染者DNA序列主要分为2个基因型,A型（10例,47.61%）和B型（11例,52.38%）,未见其他基因型。Expasy数据库预测分析UL144基因编码产物重要功能基团,结果显示ASN、PKC、TNFR、NCD3G等翻译后修饰位点高度保守。与UL144A型相比,UL144B型在1-16和30-96氨基酸残基之间各增加了一个PROKAR_LIPOPROTEIN位点和ZF_CTCHY位点。与Toledo标准病毒株比较,UL144A型的CRD1和CRD2区域高度保守,UL144B型的CRD1和CRD2功能区变异较大,但跨膜区（transmembrane domain）和胞浆区（cytoplasmic domain）在UL144A型和B型中均高度保守。UL144A型和B型碱基变异未对UL144蛋白的预测等电点和二级结构造成较大改变。总之与HCMV显性感染者不同,HCMV无症状性感染者UL144基因型为A型和B型。

关键词：人巨细胞病毒(HCMV) 无症状性感染 UL144 多态性

埃及伊蚊丝氨酸蛋白酶抑制蛋白基因家族的筛选和表达谱分析

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2017年第6期35卷 527-535页

作者：程金芝刘鉴翟慧吕清巧颜凤商正玲吴家红贵州医科大学基础医学院寄生虫学教研室现代病原生物学实验室贵阳550025 贵州医科大学微生物与生化药学工程中心贵阳550025 贵州医科大学基础医学院免疫学教研室贵阳550025

目的筛选并鉴定埃及伊蚊(Aedes aegypti)全基因组中的丝氨酸蛋白酶抑制蛋白(serine protease inhibitor,serpin)基因,分析其基因结构以及在不同发育时期和不同组织中的表达谱。方法运用生物信息学方法在埃及伊蚊全基因组数据库中筛选并... 详细信息

目的筛选并鉴定埃及伊蚊(Aedes aegypti)全基因组中的丝氨酸蛋白酶抑制蛋白(serine protease inhibitor,serpin)基因,分析其基因结构以及在不同发育时期和不同组织中的表达谱。方法运用生物信息学方法在埃及伊蚊全基因组数据库中筛选并鉴定埃及伊蚊serpin基因家族,利用Vector NTI11.0软件进行同源性比对、保守性分析,采用MEGA7.0软件构建系统进化树。实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测埃及伊蚊不同发育时期(卵、Ⅰ~Ⅳ龄幼虫、蛹、雄蚊和未吸血雌蚊),以及未吸血雌蚊不同组织(唾液腺、中肠、脂肪体和卵巢)的serpin基因表达变化。结果从埃及伊蚊全基因组中筛选出26条serpin基因序列。生物信息学分析结果显示,19条具有信号肽,16条推测具有抑制酶活性。进化分析表明,埃及伊蚊serpin基因家族被分为A、B和C分支,B分支分为4组,每分支均具有同源性,且不同成员间在进化上相对保守。qRT-PCR结果显示,Aa SRPN25在雌蚊中特异性表达,相对表达量为0.074±0.015(P<0.01);Aa SRPN19~22在雄蚊中丰富表达;Aa SRPN23在Ⅰ龄幼虫时期特异性高表达,而且在唾液腺中也特异性高表达,相对表达量分别为22.9±5.28和4.24±1.39(P<0.01);Aa SRPN25在唾液腺中特异性高表达,相对表达量为74.44±25.76(P<0.01),Aa SRPN6、Aa SRPN14在中肠中的表达量最高,相对表达量分别为1.80±0.33、0.703±0.501;Aa SRPN17、Aa SRPN20在脂肪体中的表达量最高,相对表达量分别为0.34±0.09、0.15±0.03。结论从埃及伊蚊全基因组中筛选出26条serpin基因序列,其中19条具有信号肽,16条推测具有抑制酶活性的作用。

关键词：埃及伊蚊丝氨酸蛋白酶抑制剂实时荧光定量PCR 时空表达谱

抑制自噬增强盐酸阿霉素诱导的人结直肠癌细胞凋亡

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细胞与分子免疫学杂志 2022年第3期38卷 237-243页

作者：汤弘婷吴道秋杨瀚林杨娟张艺李梦醒刘虹麟李琴山贵州医科大学医学检验学院临床生物化学教研室贵州贵阳550004 贵州医科大学附属医院血液科贵州贵阳550004 北京中日友好医院临床医学研究所北京100000 贵州省产前诊断中心贵州贵阳550004

目的探讨盐酸阿霉素(DOX)抑制结直肠癌HT29、 HCT15细胞增殖的可能机制。方法 HT29、 HCT15细胞采用(0、 0.08、 0.16、 0.32、 0.64、 1.28)μmol/L DOX处理24、 48、 72 h,CCK-8法检测细胞增殖活性确定DOX最佳处理浓度和处理时间。将... 详细信息

目的探讨盐酸阿霉素(DOX)抑制结直肠癌HT29、 HCT15细胞增殖的可能机制。方法 HT29、 HCT15细胞采用(0、 0.08、 0.16、 0.32、 0.64、 1.28)μmol/L DOX处理24、 48、 72 h,CCK-8法检测细胞增殖活性确定DOX最佳处理浓度和处理时间。将HT29、 HCT15细胞分别设为对照组(只加DMSO处理)和(0.16、 0.32、 0.64、 1.28)μmol/LDOX处理组,Western blot法检测抑制自噬对凋亡的影响时添加3-甲基腺嘌呤(3-MA)组、 3-MA联合DOX组。集落形成实验检测结直肠癌细胞的集落形成能力,Western blot法检测细胞B细胞淋巴瘤因子2(Bcl2)、 Bcl2相关X蛋白(BAX)、 beclin 1、微管相关蛋白1轻链3(LC3)的蛋白表达。结果 DOX抑制结直肠癌细胞的增殖和集落形成,促进细胞发生凋亡,呈浓度依赖性;DOX促进细胞发生自噬,beclin 1和LC3Ⅱ表达增加,呈浓度依赖性;抑制自噬后可增加DOX对结直肠癌细胞的促凋亡作用。结论 DOX抑制结直肠癌细胞增殖并促进其凋亡且抑制自噬有促凋亡作用。

关键词：结直肠癌(CRC) 盐酸阿霉素(DOX) 细胞凋亡自噬

刚地弓形虫ME49虫株ROP16蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2023年第12期18卷 1401-1406页

作者：党甜甜殷荷李佳铭田婷婷周月赵志军宁夏医科大学总医院医学实验中心宁夏银川750004 宁夏医科大学检验学院宁夏临床病原微生物重点实验室

目的应用生物信息学方法分析弓形虫ME49虫株ROP16蛋白(ME49-ROP16)的理化性质、结构特点等,并预测其潜在的B、T细胞抗原表位及其互作蛋白,为弓形虫疫苗的研究提供理论基础。方法登录NCBI数据库下载ME49虫株ROP16蛋白的氨基酸序列,利用... 详细信息

目的应用生物信息学方法分析弓形虫ME49虫株ROP16蛋白(ME49-ROP16)的理化性质、结构特点等,并预测其潜在的B、T细胞抗原表位及其互作蛋白,为弓形虫疫苗的研究提供理论基础。方法登录NCBI数据库下载ME49虫株ROP16蛋白的氨基酸序列,利用在线软件ProtParam预测ROP16蛋白的理化性质;使用ProScale预测ROP16蛋白的亲水性、柔韧性、表面可及性及β-折叠;采用SignalP-4.1预测ROP16蛋白的信号肽;运用TMHMM-2.0预测ROP16蛋白的跨膜结构;利用SOMPA和Phyre2预测ROP16蛋白的二、三级结构;通过Netphos3.1、NetNGlyc1.0、YinOYang-1.2预测ROP16蛋白的磷酸化位点、N-糖基化位点和O-糖基化位点;运用Predicting Antigenic Peptides预测ROP16蛋白的抗原决定簇;使用IEDB预测ROP16蛋白的优势B细胞表位;运用SYFPEITHI预测ROP16蛋白的T细胞优势表位;采用STRING预测软件分析与其相互作用的蛋白。结果ME49-ROP16蛋白由707个氨基酸组成,分子式为C_(3338)H_(5350)N_(966)O_(1033)S_(21),相对分子质量76.21631×10^(3),其理论等电点是8.97,不稳定系数为59.30,为不稳定蛋白;脂溶性指数为79.25,总的平均亲水性为-0.320,为亲水性蛋白;其二级结构中α-螺旋占35.64%,延伸链占10.75%,β-转角占5.94%,无规卷曲占47.67%;该蛋白含有83个氨基酸磷酸化位点,14个N-糖基化位点,无O-糖基化位点。ME49-ROP16蛋白具有信号肽序列,无跨膜结构;其平均抗原倾向指数为1.0340,共有25个抗原决定簇区域,有7条B细胞优势表位,14条CTL细胞优势表位,14条Th细胞优势表位,与ACC1、ACC2、PKG、ROP18为互作蛋白。结论生物信息学分析ME49-ROP16蛋白为不稳定亲水性蛋白,含有多个B、T细胞优势表位,并与ACC1、ACC2、PKG、ROP18为互作蛋白,为以该蛋白为靶点的弓形虫疫苗研制奠定了基础。

关键词：刚地弓形虫 ROP16蛋白生物信息学免疫原性

晚期非小细胞肺癌胸部放疗长期生存患者的临床特征及Nomogram预测模型构建

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中华放射医学与防护杂志 2023年第3期43卷 189-197页

作者：姜炜马筑李青松耿一超罗大先杨文刚陈霞霞欧阳伟炜胡银祥苏胜发卢冰贵州医科大学附属医院贵州医科大学附属肿瘤医院胸部肿瘤科贵州医科大学临床医学院肿瘤学教研室贵阳550000

目的分析晚期非小细胞肺癌(NSCLC)化疗联合原发肿瘤放疗长期生存患者的临床特征,并建立Nomogram预测模型,为晚期NSCLC治疗决策的制定提供一定的参考依据。方法回顾性分析2003年1月至2012年5月参加两项前瞻性临床研究的260例NSCLC患者作... 详细信息

目的分析晚期非小细胞肺癌(NSCLC)化疗联合原发肿瘤放疗长期生存患者的临床特征,并建立Nomogram预测模型,为晚期NSCLC治疗决策的制定提供一定的参考依据。方法回顾性分析2003年1月至2012年5月参加两项前瞻性临床研究的260例NSCLC患者作为训练集,2014年1月至2020年8月贵州省医科大学附属肿瘤医院收治的138例NSCLC患者作为验证集。总生存时间(OS)≥18个月定义为长期生存(LTS),比较LTS患者与非LTS患者的临床特征,组间临床特征及治疗相关参数的比较采用χ^(2)检验,logistic回归进行多因素分析,应用RStudio构建列线图模型。结果训练集患者的中位OS为13.4个月(95%CI:11.9~14.9),1、2和3年的OS率分别为55.4%、19.1%和11.9%。LTS组87例,非LTS组173例。单因素分析显示,KPS评分、T状态、转移器官数、转移病灶数、脑转移、骨转移、化疗周期数、原发肿瘤生物等效剂量(BED)、血红蛋白水平、血小板计数、血浆D-二聚体、纤维蛋白原水平、乳酸脱氢酶及肺免疫预后指数(LIPI)是影响LTS的预测因素(χ^(2)=4.72~12.63,P<0.05)。多因素分析显示,化疗周期数≥4、BED≥70 Gy、血小板≤220×10^(9)/L、D-二聚体定量≤0.5 mg/L及良好LIPI评分是LTS的独立预测因素(P=0.002、0.036、0.005、0.008、0.002)。将多因素分析有意义的参数构建列线图模型,训练队列及验证队列一致性指数(C-index,C指数)分别为0.750和0.727。校正曲线分析结果显示,Nomogram模型预测晚期NSCLC胸部放疗长期生存的概率与实际长期生存概率的吻合度高,受试者工作特征曲线(ROC)分析及决策曲线(DCA)分析显示,复合预测模型的效益比单一预测模型的效益更好。结论化疗周期数、BED、血小板计数、化疗前D-二聚体及LIPI评分是影响晚期NSCLC胸部放疗患者长期生存的独立预测因素,基于这些预后因素构建的Nomogram模型为筛选胸部放疗受益患者提供了便捷、直观且个性化的预测模型。

关键词：晚期非小细胞肺癌放射治疗 Nomogram模型