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兴义矮脚鸡肠道微生物与其体质量的关联性

南方农业学报 2024年第2期55卷 311-322页

作者：龙小霞杨永鲜吕玉新吴古荣张欢杨金春汪潘杨胜宏王忠贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 兴义市农业农村局贵州兴义562400 贵州老黑泥农牧有限公司贵州兴义562400

【目的】探究不同体质量分组兴义矮脚鸡肠道菌群及其网络结构特征,鉴定出与鸡体质量相关的潜在生物标志物,为养鸡业促生长益生菌的发掘提供理论依据。【方法】从同批次的110羽兴义矮脚母鸡群体(16周龄)中选取体质量最高的20羽组成HWC组(... 详细信息

【目的】探究不同体质量分组兴义矮脚鸡肠道菌群及其网络结构特征,鉴定出与鸡体质量相关的潜在生物标志物,为养鸡业促生长益生菌的发掘提供理论依据。【方法】从同批次的110羽兴义矮脚母鸡群体(16周龄)中选取体质量最高的20羽组成HWC组(1.12±0.05 kg),体质量最低的20羽组成LWC组(0.74±0.05 kg),采集肛门粪便样品检测16SrRNA序列V3~V4可变区,利用Mothur进行肠道菌群Alpha多样性,采用基于未加权UniFrac距离的主坐标分析(PCoA)评估肠道菌群Beta多样性,通过SparCC算法构建肠道菌群互作网络,并应用LEfSe分析鉴定与兴义矮脚鸡体质量相关的肠道微生物。【结果】从40份兴义矮脚鸡粪便样品中共获得3145511条Clean reads,经DADA2聚类分析得到22297个扩增子序列变异体(ASVs)。在门分类水平上,兴义矮脚鸡肠道菌群中相对丰度排名前5的菌门包括厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和热脱硫杆菌门,对应的相对丰度分别为67.54%、12.24%、11.28%、2.39%和1.26%;在属分类水平上,相对丰度排名前5的菌属分别为乳酸杆菌属、罗斯氏菌属、利吉拉杆菌属、拟杆菌属和志贺杆菌属,对应的相对丰度分别为23.35%、14.86%、5.44%、4.63%和2.77%。LWC组兴义矮脚鸡肠道菌群稳定性指数为3.95%,HWC组的为12.22%,且LWC组的网络复杂性(5.57%)也低于HWC组(7.70%),推测低体质量兴义矮脚鸡肠道菌群复杂性和稳定性的下降与其体质量较低有关。兴义矮脚鸡肠道菌群互作网络中重要性评分排名前5的枢纽菌群分别是植物乳杆菌、乳球菌、瘤胃球菌属扭链群、粪杆菌属和理研菌科_RC9_菌群。LEfSe分析发现,有18个ASVs的相对丰度在HWC组和LWC组间呈显著差异(LDA>2,P<0.05),其中,12个ASVs表现为在LWC组的相对丰度高于HWC组,6个ASVs表现为在HWC组的相对丰度高于LWC组。【结论】肠杆菌科、支原体属等有害菌相对丰度的上升会降低鸡肠道菌群互作网络稳定性和复杂性,且与兴义矮脚鸡的低体质量有关。乳酸杆菌、理研菌科_RC9_菌群、梭状芽孢杆菌等是影响兴义矮脚鸡体质量的潜在关键菌群,可作为兴义矮脚鸡体质量关联的候选生物标志物。

关键词：兴义矮脚鸡肠道菌群体质量互作网络 16S rRNA

菌酶添加对喀斯特地区全株青贮玉米发酵品质和有氧稳定性的影响

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饲料工业 2024年第3期45卷 95-101页

作者：陆龙超莫本田周文章秦杨邓似辰王清峰徐龙鑫武俊达贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州省农业科学院畜牧兽医研究所贵州贵阳550005 贵州惠众畜牧科技发展有限公司贵州黔西551500

试验旨在研究添加菌酶对喀斯特地区全株青贮玉米发酵品质和有氧稳定性的影响,为新型青贮菌剂的应用提供参考。以真空袋法青贮全株玉米,设5个试验组和1个对照组,分别为添加等量纯化水(对照组)、植物乳杆菌(试验A组)、纤维素分解菌(试验B... 详细信息

试验旨在研究添加菌酶对喀斯特地区全株青贮玉米发酵品质和有氧稳定性的影响,为新型青贮菌剂的应用提供参考。以真空袋法青贮全株玉米,设5个试验组和1个对照组,分别为添加等量纯化水(对照组)、植物乳杆菌(试验A组)、纤维素分解菌(试验B组)、纤维素酶(试验C组)、植物乳杆菌+纤维素分解菌(试验AB组)、植物乳杆菌+纤维素酶(试验AC组)。其中植物乳杆菌添加1×10^(5) CFU/g;纤维素分解菌为黑曲霉∶枯草芽孢杆菌=2∶1,添加量为3.0×10^(5)、1.5×10^(5) CFU/g,纤维素酶按0.3%添加。发酵60 d后同时采样并测定全株玉米的发酵特性、乳酸菌数量、营养成分、有氧稳定性指标。结果表明:试验组均有微弱香味,对照组则气味较平淡,综合评分均到达一级;试验组pH均低于4.2,达到优质青贮料标准,C、AC组pH显著低于A、B、AB组(P0.05),丙酸(PA)和丁酸(BA)均未检测出;A、B、C、AB组氨态氮(NH3-N)含量显著高于对照组(PC组>AB组>B组>A组>对照组。说明AC、AB组可有效改善全株青贮玉米的青贮品质,提高有氧稳定性,以AC组效果最好;因此,纤维素分解菌可在一定程度上替代纤维素酶用于全株青贮玉米发酵。

关键词：植物乳杆菌纤维分解菌纤维素酶发酵特性有氧稳定性

基于SNP芯片分析贵州地方鸡品种(类群)的遗传多样性

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南方农业学报 2024年第5期55卷 1444-1453页

作者：周晓红陈大海吴胜田应平潘成勇张福平贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州大学科研鸡场贵州贵阳550027 凯里市凤凰苑畜禽养殖有限公司贵州黔东南556000

【目的】了解贵州地方鸡品种遗传多样性及确定品种间的遗传关系,为贵州地方鸡品种(类群)资源的保护和创新利用提供参考依据。【方法】采集香炉山鸡(SL)、瑶山鸡(YS)、黔东南小香鸡(XX)和威宁鸡(WN)共66份血液样本,基于京芯一号鸡55K SN... 详细信息

【目的】了解贵州地方鸡品种遗传多样性及确定品种间的遗传关系,为贵州地方鸡品种(类群)资源的保护和创新利用提供参考依据。【方法】采集香炉山鸡(SL)、瑶山鸡(YS)、黔东南小香鸡(XX)和威宁鸡(WN)共66份血液样本,基于京芯一号鸡55K SNP芯片对4个贵州地方鸡品种(类群)进行SNP位点检测,采用Plink v1.90、VCFtools v0.1.17和Admixture v1.3分别进行遗传多样性、群体结构及亲缘关系分析。【结果】4个贵州地方鸡品种(类群)的有效群体含量(Ne)介于3.1~3.2,且期望杂合度(He)均低于观察杂合度(Ho),多态信息含量(PIC)排序为威宁鸡(0.8583)>瑶山鸡(0.8350)>黔东南小香鸡(0.8123)>香炉山鸡(0.8001),均大于0.50,呈高度多态性,遗传多样性丰富。基于状态同源(IBS)遗传距离矩阵构建的系统发育进化树显示,香炉山鸡的分支最长、威宁鸡的分支最短。主成分分析(PCA)结果表明,4个贵州地方鸡品种(类群)间的界限分明,且各品种(类群)间无相互渗透现象;在Admixture祖代分析中,祖先集群数量(K)=2时,群体分群效果最佳,说明4个贵州地方鸡品种(类群)有2个共同的祖先。4个贵州地方鸡品种(类群)间的群体分化系数(Fst)接近0.05,说明群体间并未产生明显分化。4个贵州地方鸡品种(类群)的G矩阵亲缘关系分析结果和IBS遗传距离分析结果一致,香炉山鸡群个体间的亲缘关系和遗传距离最近,而威宁鸡群个体间的亲缘关系和遗传距离最远。【结论】4个贵州地方鸡品种(类群)遗传多样性较丰富,且品种(类群)间的界限明显,无相互渗透现象,但亲缘关系中有部分品种(类群)间存在近交风险,因此今后的育种工作应进一步改良香炉山鸡和黔东南小香鸡的配种方式,并适当增加群体数量及公母比例,以避免近交衰退。

关键词：贵州地方鸡 SNP芯片群体结构遗传多样性亲缘关系

白羽王鸽CAPN11基因SNPs鉴定及其对屠宰性状的影响

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农业生物技术学报 2024年第10期 2381-2390页

作者：向进龙霞庞金兰成敏张依裕杨阿明贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室黔西市农业农村局贵州裕黔农业生物科技发展有限公司

白羽王鸽（Columba livia）是重要的经济禽类，探究其钙蛋白酶11 （calpain 11, CAPN11）基因多态性与屠宰性状的关系，对其屠宰性状的遗传改良和经济性状提升具有重要意义。本研究采用PCR直接测序法对白羽王鸽CAPN11基因SNP进行筛查，... 详细信息

白羽王鸽（Columba livia）是重要的经济禽类，探究其钙蛋白酶11 （calpain 11, CAPN11）基因多态性与屠宰性状的关系，对其屠宰性状的遗传改良和经济性状提升具有重要意义。本研究采用PCR直接测序法对白羽王鸽CAPN11基因SNP进行筛查，并分析SNP位点与白羽王鸽屠宰性状的关联性。通过鉴定白羽王鸽的CAPN11基因的SNPs发现，在外显子6区的第636和738位发现g.3641644 C>T和g.3641746 C>T 2个同义突变，均存在3种基因型，优势基因型和优势等位基因均为CT和C,0.252检验显示，2个SNPs位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）；连锁不平衡分析显示，2个SNPs位点之间不满足D'>0.80,r2>0.33，表明不存在强连锁不平衡效应；关联性分析显示，g.3641644 C>T位点对宰前活重的影响达到显著水平（PT位点对白羽王鸽的宰前活重、屠体重、全净膛重、胸肌重和腿肌重等屠宰性状的影响均达到了显著水平（P<0.05）；双倍型分析发现，2个SNPs位点在实验群体中共检测到4种单倍型和10种双倍型，双倍型H2H2 （CCTT）个体的宰前活重、屠体重、全净膛重和腿肌重均显著高于其他9种双倍型（P<0.05）；双倍型H2H2 （CCTT）个体的胸肌重显著高于除双倍型H3H3 （TTCC）和H3H4 （TTCT）外的其他双倍型个体（P<0.05）。通过分析单倍型m RNA二级结构发现，单倍型H1 （CC）、H2 （CT）、H3 （TC）均引起了CAPN11基因的mRNA二级结构变化，可能会影响转录和翻译效率，进而影响屠宰性能。综上，CAPN11基因能够作为潜在候选基因用于改善白羽王鸽屠宰性状，为加速白羽王鸽育种选育进程提供一定的理论依据，为提升品种屠宰性状的分子标记选育工作提供参考。

关键词：白羽王鸽钙蛋白酶11基因(CAPN11) SNPs 屠宰性状

萝卜SNP和InDel分子标记开发及与表型性状关联分析

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浙江农业学报 2024年第5期36卷 1055-1066页

作者：李亚东罗小波彭潇杨光乾金月月祖贵东田欢张万萍贵州大学农学院贵州贵阳550025 贵州大学蔬菜研究院贵州贵阳550025 贵州省农业科学研究院贵州贵阳550000 威宁县农业农村局贵州威宁553100 贵州省现代种业集团有限公司贵州贵阳550081

为了挖掘与萝卜表型性状显著相关的分子标记,对60份萝卜的14个表型数据进行鉴定,筛选出具有多态性的分子标记29个(其中12个SNP标记和17个InDel标记)进行遗传多样性分析,并利用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode, GLM)对... 详细信息

为了挖掘与萝卜表型性状显著相关的分子标记,对60份萝卜的14个表型数据进行鉴定,筛选出具有多态性的分子标记29个(其中12个SNP标记和17个InDel标记)进行遗传多样性分析,并利用TASSEL5.0软件的广义线性模型(general linear mode, GLM)对萝卜的14个表型数据进行关联分析。研究结果表明,29个分子标记的等位基因(Na)数范围在2~3个,平均为2.14个;主等位基因频率(MAF)为0.53~0.94个,平均为0.68个;每个标记的期望杂合度(He)范围为0.12~0.93,平均为0.63。每个位点的多态性信息含量(PIC)值范围在0.11~0.37,平均为0.32;在12个表型性状中关联到17个显著相关的分子标记位点(其中7个SNP标记和10个InDel标记)(P≤0.01),贡献率在7.24%~23.25%。

关键词：萝卜 SNP InDel 聚类分析关联分析

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不同贮存和解冻温度对猪肉蒸煮损失和剪切力的影响

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今日养猪业 2024年第3期 7-10页

作者：彭昱豪张才在苟昌勇陈滇黔杨振清敖政高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州大学动物科学学院贵州贵阳550025 贵州一鸣农业科技有限公司贵州铜仁554300 安顺市同正畜牧科技有限公司贵州安顺561000

【目的】研究不同贮存和解冻温度对猪肉蒸煮损失和剪切力的影响。【方法】按不同的贮存温度将猪肉分为4个处理:-80℃、-40℃、-20℃、4℃,所有猪肉密闭包装储存3 d。将所有处理组的猪肉在常温(25℃)和4℃条件下解冻,并测定猪肉的蒸煮损... 详细信息

【目的】研究不同贮存和解冻温度对猪肉蒸煮损失和剪切力的影响。【方法】按不同的贮存温度将猪肉分为4个处理:-80℃、-40℃、-20℃、4℃,所有猪肉密闭包装储存3 d。将所有处理组的猪肉在常温(25℃)和4℃条件下解冻,并测定猪肉的蒸煮损失和剪切力。【结果】在相同解冻温度下,零下温度贮存猪肉蒸煮损失显著低于4℃贮存猪肉(P<0.05);-20℃和-40℃贮存猪肉在25℃解冻温度的剪切力显著高于4℃解冻猪肉(P<0.05);-20℃和-40℃贮存猪肉在4℃解冻温度下的剪切力显著低于4℃贮存猪肉。【结论】猪肉的适宜贮存温度在-20℃,且在4℃解冻更有利于保持猪肉品质。

关键词：贮存温度解冻温度蒸煮损失剪切力猪肉品质

全程补饲可溶性碳水化合物对窝产3羔湖羊羔羊生长性能与血液生化指标的影响

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饲料工业 2024年第14期45卷 110-115页

作者：宋昕宇杨艺吴文旋张平齐淑新贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室动物科学学院动物营养与饲料科学研究所贵州贵阳550025 贵州大学新农村发展研究院贵州省山地畜禽养殖污染控制与资源化技术工程实验室贵州贵阳550025 黔东南州岑巩县农业农村局贵州岑巩557800 贵州申安湖羊产业发展有限公司贵州岑巩557800

文章旨在探究湖羊在全程补饲可溶性碳水化合物对窝产3羔羔羊生长性能与血液生化指标的影响。试验动物为18窝54只窝产3羔湖羊羔羊,分为3组:对照组、处理1组、处理2组,对照组、处理1组、处理2组羔羊正常吮乳,分别补饲70%精料颗粒料+30%花... 详细信息

文章旨在探究湖羊在全程补饲可溶性碳水化合物对窝产3羔羔羊生长性能与血液生化指标的影响。试验动物为18窝54只窝产3羔湖羊羔羊,分为3组:对照组、处理1组、处理2组,对照组、处理1组、处理2组羔羊正常吮乳,分别补饲70%精料颗粒料+30%花生秧草段、70%精料颗粒料+30%花生秧草段+0.1%复合益生菌、100%精料颗粒料。预试期15天,正试期30天。结果表明:①3组羔羊生长性能差异不显著(P>0.05),其中处理2组表现较好。具体表现为:全期处理2组干物质采食量(DMI)、平均净增重(ANG)、平均日增重(ADG)高出对照组、处理1组61.30%、59.66%,22.31%、27.21%,19.05%、25.00%。②处理2组羔羊血浆肌酐(Cr)水平显著低于对照组(P0.05)。综上所述,在试验条件下,对于窝产3羔湖羊羔羊,全程补饲可溶性碳水化合物,较补饲长干草饲草纤维具有更好的生长效果。

关键词：可溶性碳水化合物复合益生菌生长性能血液生化指标湖羊羔羊

基于GF-1 PMS的喀斯特城镇绿地提取研究

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江苏科技信息 2024年第12期41卷 137-140页

作者：王玮黄林任金铜安徽云图空间信息科技有限公司安徽合肥230022 贵州工程应用技术学院贵州毕节551700 贵州省典型高原湿地生态保护与修复重点实验室贵州毕节551700

绿地面积作为园林城市建设的重要指标,对于城市规划建设具有重要意义。文章基于面向对象分类算法,以位于喀斯特山区的贵州省毕节市海子街镇为研究区,利用高分一号(GF-1)PMS遥感影像进行城镇绿地提取。结果表明:绿地信息在GF-1 PMS影像... 详细信息

绿地面积作为园林城市建设的重要指标,对于城市规划建设具有重要意义。文章基于面向对象分类算法,以位于喀斯特山区的贵州省毕节市海子街镇为研究区,利用高分一号(GF-1)PMS遥感影像进行城镇绿地提取。结果表明:绿地信息在GF-1 PMS影像上具有明显的光谱、纹理特征,通过对影像对象特征的不同选择和组合,能够很好地提取城镇绿地信息;在面向对象分类算法中,基于规则的绿地信息提取总体分类精度为79.36%,Kappa系数为0.76;基于样本的绿地信息提取总体分类精度为89.79%,Kappa系数为0.85,其提取效果比基于规则的面向对象方法更好。

关键词：高分一号城镇绿地面向对象信息提取

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流域水污染事件环境应急防控与处置研究

皮革制作与环保科技 2024年第10期5卷 145-147页

作者：阳菲菲贵州楚天环境检测有限公司贵州贵阳550014

突发水污染事件是由于环境污染而造成的突发性水污染事故,常常会造成跨界污染,主要是因为进入水体中的污染物迁移扩散速度快、围堵拦截难。贵州地处云贵高原,喀斯特岩溶地貌发育典型,河流的山区性特征明显,多数河流上游河谷开阔,水流平... 详细信息

突发水污染事件是由于环境污染而造成的突发性水污染事故,常常会造成跨界污染,主要是因为进入水体中的污染物迁移扩散速度快、围堵拦截难。贵州地处云贵高原,喀斯特岩溶地貌发育典型,河流的山区性特征明显,多数河流上游河谷开阔,水流平缓;中游河谷束放相间,水流湍急;下游河谷深切狭窄,水量大,河流平面形态以限制性顺直或弯曲河流为主。本文结合工作实践,以环境应急空间与设施操作使用说明为导向,为贵州省流域突发水污染事件的应急处置和应急事后管理提出对策和建议,以期为相关部门提供参考与借鉴。

关键词：突发水污染事件环境应急空间与设施应急处置应急风险防控体系