白羽王鸽CAPN11基因SNPs鉴定及其对屠宰性状的影响

作     者：向进 龙霞 庞金兰 成敏 张依裕 杨阿明 XIANG Jin;LONG Xia;PANG Jin-Lan;CHENG Min;ZHANG Yi-Yu;YANG A-Ming

作者机构：贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室 黔西市农业农村局 贵州裕黔农业生物科技发展有限公司 

出 版 物：《农业生物技术学报》 (Journal of Agricultural Biotechnology)

年 卷 期：2024年第32卷第10期

页      面：2381-2390页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑N2166号) 

主　　题：白羽王鸽 钙蛋白酶11基因(CAPN11) SNPs 屠宰性状 

摘      要：白羽王鸽（Columba livia）是重要的经济禽类，探究其钙蛋白酶11 （calpain 11, CAPN11）基因多态性与屠宰性状的关系，对其屠宰性状的遗传改良和经济性状提升具有重要意义。本研究采用PCR直接测序法对白羽王鸽CAPN11基因SNP进行筛查，并分析SNP位点与白羽王鸽屠宰性状的关联性。通过鉴定白羽王鸽的CAPN11基因的SNPs发现，在外显子6区的第636和738位发现g.3641644 CT和g.3641746 CT 2个同义突变，均存在3种基因型，优势基因型和优势等位基因均为CT和C,0.252检验显示，2个SNPs位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡状态（P0.05）；连锁不平衡分析显示，2个SNPs位点之间不满足D 0.80,r20.33，表明不存在强连锁不平衡效应；关联性分析显示，g.3641644 CT位点对宰前活重的影响达到显著水平（PT位点对白羽王鸽的宰前活重、屠体重、全净膛重、胸肌重和腿肌重等屠宰性状的影响均达到了显著水平（P0.05）；双倍型分析发现，2个SNPs位点在实验群体中共检测到4种单倍型和10种双倍型，双倍型H2H2 （CCTT）个体的宰前活重、屠体重、全净膛重和腿肌重均显著高于其他9种双倍型（P0.05）；双倍型H2H2 （CCTT）个体的胸肌重显著高于除双倍型H3H3 （TTCC）和H3H4 （TTCT）外的其他双倍型个体（P0.05）。通过分析单倍型m RNA二级结构发现，单倍型H1 （CC）、H2 （CT）、H3 （TC）均引起了CAPN11基因的mRNA二级结构变化，可能会影响转录和翻译效率，进而影响屠宰性能。综上，CAPN11基因能够作为潜在候选基因用于改善白羽王鸽屠宰性状，为加速白羽王鸽育种选育进程提供一定的理论依据，为提升品种屠宰性状的分子标记选育工作提供参考。