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尼罗罗非鱼Smoothened的鉴定、表达模式及在精巢中的作用

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水产学报 2023年第3期47卷 39-48页

作者：黄琴张泽明白孝明赵长乐代向燕陶文静周林燕王德寿魏静西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室

为探究Smoothened (Smo)信号在精巢不同细胞增殖与存活中的作用，实验分离鉴定了尼罗罗非鱼smo (命名为Onsmo)，检测了其在不同组织中的表达分布及在精巢中的细胞表达模式，在尼罗罗非鱼精巢组织的体外培养体系中，用Smo特异性激动剂SA... 详细信息

为探究Smoothened (Smo)信号在精巢不同细胞增殖与存活中的作用，实验分离鉴定了尼罗罗非鱼smo (命名为Onsmo)，检测了其在不同组织中的表达分布及在精巢中的细胞表达模式，在尼罗罗非鱼精巢组织的体外培养体系中，用Smo特异性激动剂SAG或抑制剂环巴胺分别进行处理，EdU掺入法及TUNEL法检测了处理后生殖细胞(Vasa+)、Sertoli细胞(Amh+)与Leydig细胞(Cyp17a1+)增殖或凋亡情况。结果显示，Onsmo开放阅读框全长2 478 bp，编码825个氨基酸，含有7次跨膜结构域，与人SMO氨基酸一致性达77%;Onsmo表达于包括精巢在内的多个组织；在精巢中，Onsmo在多种不同类型细胞表达，包括精原细胞、精母细胞、Sertoli细胞以及Leydig细胞；在精巢组织的体外培养体系中，SAG处理对精原细胞增殖具有显著促进作用，而环巴胺处理对Sertoli细胞、Leydig细胞凋亡具有显著促进作用。研究表明，On Smo信号在尼罗罗非鱼精巢精原细胞增殖与体细胞存活中具有重要作用。该研究首次证实了Smo信号在鱼类精巢不同细胞增殖与存活中的作用，为进一步研究其作用机制奠定了重要基础。

关键词：尼罗罗非鱼 Smoothened 精巢 EdU掺入法 TUNEL法增殖存活

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4种鲇基因组中Tc1/Mariner转座子的鉴定与演化

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水产学报 2020年第4期44卷 539-550页

作者：赵连鹏邵峰胡竞文张耀光彭作刚西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室

为了探讨Tc1/Mariner转座子在4种鲇(沟鲇、黑斑原、鲇和南方鲇)中的特征及在演化过程中的作用,实验使用de novo预测和同源预测两种方法鉴定了4种鲇基因组中的Tc1/Mariner转座子并进行演化分析。通过对所获得序列的统计及分类,结果显... 详细信息

为了探讨Tc1/Mariner转座子在4种鲇(沟鲇、黑斑原、鲇和南方鲇)中的特征及在演化过程中的作用,实验使用de novo预测和同源预测两种方法鉴定了4种鲇基因组中的Tc1/Mariner转座子并进行演化分析。通过对所获得序列的统计及分类,结果显示,4种鲇基因组中Tc1/Mariner转座子的含量分别为9.46%、2.70%、7.83%和8.54%,并且分别被分为38、20、43和55个家族。基于转座酶催化区域的结构和系统发育分析的结果,4种鲇的Tc1/Mariner转座子总共可以分为5个不同的亚类群:DD34E(Tc1)、DD35E、DD36E、DD37E和DD35D(pogo)。系统发育分析表明,多数支系中鲇和南方鲇的转座子聚为姐妹群。插入时间分析表明,Tc1/Mariner转座子的插入时间主要分布在0～5百万年前。大多数Tc1/Mariner转座子在0～1百万年前或2～3百万年前有一个突然的扩增。另外,4种鲇的Tc1/Mariner转座子大部分插入到基因的内含子中。本实验通过对4种鲇中Tc1/Mariner转座子的鉴定、比较与演化分析,为Tc1/Mariner转座子的深入研究奠定了基础。

关键词：鲇基因组转座子 Tc1/Mariner 演化分析

TGF-β信号通路在鱼类性别决定与分化中的作用

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水产学报 2020年第1期44卷 166-177页

作者：龙娟郑树清王晓双张帅王德寿西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室

脊椎动物性别分化和性腺发育的分子机制保守,但不同类群的最上游的性别决定基因却大不相同,尤其是鱼类,其性别决定基因表现出明显的多样性。性别决定包括环境性别决定和遗传性别决定,环境性别决定主要受温度、光照、激素和pH等的影响,... 详细信息

脊椎动物性别分化和性腺发育的分子机制保守,但不同类群的最上游的性别决定基因却大不相同,尤其是鱼类,其性别决定基因表现出明显的多样性。性别决定包括环境性别决定和遗传性别决定,环境性别决定主要受温度、光照、激素和pH等的影响,而遗传性别决定一般由位于性染色体上的性别决定基因决定。转化生长因子-β(transforming growth factorβ, TGF-β)信号通路参与介导了多种生物学过程,近年来很多研究表明,鱼类有多个性别决定基因都是TGF-β信号通路的成员,且该信号通路对于鱼类的性别分化也有重要的作用。本文总结了鱼类已报道的性别决定基因或候选基因,详细综述了TGF-β信号通路在鱼类性别决定与分化中的各种功能,并探讨了该信号通路参与鱼类性别决定的可能机制,这对认识TGF-β信号通路在鱼类性别决定、分化中的作用和性控育种有重要意义。

关键词：鱼类 TGF-β信号通路性别决定基因性控育种

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硬骨鱼类虹彩细胞的研究进展

水产学报 2024年第1期48卷 3-18页

作者：田浚杉唐雨馨王晨旭王德寿西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室

虹彩细胞是硬骨鱼中一类常见的色素细胞，含有大量的虹彩小体，其内含有由鸟嘌呤晶体构成的高折射率的反射小板，反射小板与低折射率的细胞质交替排列形成交替层的结构，光被交替层反射后通过多层薄膜干涉，使细胞呈现出彩虹般的颜色。... 详细信息

虹彩细胞是硬骨鱼中一类常见的色素细胞，含有大量的虹彩小体，其内含有由鸟嘌呤晶体构成的高折射率的反射小板，反射小板与低折射率的细胞质交替排列形成交替层的结构，光被交替层反射后通过多层薄膜干涉，使细胞呈现出彩虹般的颜色。虹彩细胞能在激素、交感神经系统或外界环境刺激的作用下通过改变反射小板的间距来实现颜色的变化。鸟嘌呤是虹彩细胞呈色和颜色变化的基础，其合成途径已被详细解析。虹彩细胞由多能的神经嵴细胞分化而来，从神经嵴细胞分化为成熟的虹彩细胞的谱系特化过程受到多个基因的调控，目前已在模式生物斑马鱼中发现了一些关键基因，并通过对这些基因间相互作用的研究初步解析了控制虹彩细胞特化的核心基因调控网络，同时也发现了其他影响虹彩细胞特化、分化及存活的基因和信号通路。本文综述了硬骨鱼类虹彩细胞呈色及颜色变化的机制、鸟嘌呤合成途径及调控基因以及影响虹彩细胞发育和存活的基因和信号通路的研究进展，并对未来的研究方向进行了展望，期望能对虹彩细胞有更深入的认识，并为研究虹彩细胞发育过程的基因调控提供参考。

关键词：硬骨鱼类模式鱼类虹彩细胞鸟嘌呤合成颜色变化谱系特化基因调控信号通路

InP/ZnS QDs对稀有鮈鲫子代软骨发育的影响

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中国环境科学 2023年第12期43卷 6732-6739页

作者：伍颖轶陈行谢威威金丽西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室水产科学重庆市重点实验室重庆400715

使用InP/ZnS QDs以雌性稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)为实验动物,通过腹腔注射染毒,设计了(200,400,800nmol/L)3个实验组,在量子点暴露4和7d时取卵受精.以胚胎受精率、存活率、仔鱼体长、全长为指标,对仔鱼进行阿利新蓝染色和HE(Hematoxy... 详细信息

使用InP/ZnS QDs以雌性稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)为实验动物,通过腹腔注射染毒,设计了(200,400,800nmol/L)3个实验组,在量子点暴露4和7d时取卵受精.以胚胎受精率、存活率、仔鱼体长、全长为指标,对仔鱼进行阿利新蓝染色和HE(Hematoxylin Eosin)染色,通过检测发育相关基因(bmp2b,sox9a,runx_(2)b)的相对表达量,研究InP/ZnS QDs对稀有鮈鲫子代软骨发育的影响.结果表明:高浓度组仔鱼的体长减少6.2%、全长减少5.9%;颅面PQ-Meckel角增加24.8%,下颌骨长度减小14.6%和15.2%、宽度减小10.0%和10.7%;颅面软骨细胞肿大、数量减少.并发现QDs在不同发育时间对相关基因的相对表达量影响不同.总之InP/ZnS QDs会对稀有鮈鲫子代软骨发育产生不良影响.

关键词： InP/ZnS Quantum Dots 稀有鮈鲫毒性软骨发育

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玫瑰高原鳅肠道微生物多样性研究

水生生物学报 2021年第1期45卷 118-124页

作者：刘妮彭作刚西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室重庆400715

研究旨在分析玫瑰高原鳅(Triplophysa rosa)肠道微生物的结构组成和多样性,探索其肠道微生物的潜在功能。提取了5尾玫瑰高原鳅的肠道总DNA,运用Illumina Miseq平台对肠道微生物16S rRNA的V3—V4区进行了测序,统计样品肠道微生物的操作... 详细信息

研究旨在分析玫瑰高原鳅(Triplophysa rosa)肠道微生物的结构组成和多样性,探索其肠道微生物的潜在功能。提取了5尾玫瑰高原鳅的肠道总DNA,运用Illumina Miseq平台对肠道微生物16S rRNA的V3—V4区进行了测序,统计样品肠道微生物的操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)数量,分析物种组成、丰度及Alpha多样性,并预测肠道微生物的功能。结果显示,玫瑰高原鳅的肠道微生物有19门、31纲、87目、146科、253属、320种,451个OTUs。在门水平上,优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes);在属水平上,优势菌群为气单胞菌属(Aeromonas)、爱德华菌属(Edwardsiella)、邻单胞菌属(Plesiomonas)和希瓦氏菌属(Shewanella)。功能预测表明,肠道微生物编码的大多数基因与新陈代谢相关,其中“碳水化合物运输和代谢”和“氨基酸转运与代谢”功能类群的相对丰度较高。玫瑰高原鳅肠道内微生物组成复杂,其功能分析有助于理解肠道微生物对玫瑰高原鳅摄食的影响,为进一步研究玫瑰高原鳅的食性提供了理论基础。

关键词：玫瑰高原鳅肠道微生物 16S rRNA 多样性功能

游泳加速模式对团头鲂和南方鲇的最大游泳速度及运动代谢的影响

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水生生物学报 2020年第3期44卷 603-611页

作者：张敬敬朱峰磊龙静闫玉莲谢小军西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室重庆400715

为了探讨游泳加速模式对不同生态习性鱼类游泳性能及运动代谢的影响,评估团头鲂(Megalobrama amblycephala)和南方鲇(Silurus meridionalis)的临界游泳速度(Ucrit)、爆发游泳速度(Uburst)和最大代谢率(MMR)的适宜测定方法,在4种加速模... 详细信息

为了探讨游泳加速模式对不同生态习性鱼类游泳性能及运动代谢的影响,评估团头鲂(Megalobrama amblycephala)和南方鲇(Silurus meridionalis)的临界游泳速度(Ucrit)、爆发游泳速度(Uburst)和最大代谢率(MMR)的适宜测定方法,在4种加速模式条件下,检测了实验鱼的最大游泳速度(Vmax),以及鱼体在运动过程中及其力竭后代谢恢复期的耗氧率(MO2)。结果显示:在速度增量(ΔV)为20 cm/s,加速持续时间(Δt)为2min的加速模式条件下,团头鲂和南方鲇的Vmax及游泳过程的无氧代谢占比均分别显著高于其他3种加速模式(P0.05);其中团头鲂在这3种加速模式下的Vmax之间无显著性差异(P>0.05);而南方鲇在ΔV为10 cm/s、Δt为20min条件下的Vmax显著高于另2种加速模式的测定值(P<0.05)。两种鱼的MO2在各加速模式下均随着游泳速度的升高而增加;但在爆发游泳过程中,两种鱼的MO2随游泳速度的增加呈现不同的变化趋势,团头鲂的MO2随速度的变化曲线在接近100 cm/s的时候出现拐点,此后MO2随速度的增幅变小;而南方鲇的该曲线在速度为20 cm/s时就出现拐点, MO2的变化进入"平台期"。在所有加速模式下,两种鱼在运动过程中的最大耗氧率(AMO2)均显著高于力竭后代谢恢复期的最大值(DMO2, P<0.05)。用Ucrit法测得团头鲂的AMO2高于Uburst法的测得值,而南方鲇则相反。由研究结果得出,测定团头鲂的Ucrit采用ΔV为10 cm/s、Δt在20-60min的加速模式是适宜的,测定南方鲇Ucrit的适宜加速模式是ΔV为10 cm/s、Δt为20min。两种鱼均应采用在运动阶段测得的最大MO2作为MMR;测定团头鲂的MMR适用于Ucrit法,测定南方鲇的MMR适用于Uburst法。团头鲂持续游泳的能力较强,爆发游泳的加速能力相对较弱;而南方鲇则表现出相反的趋势,该差异反映了物种适应其生态习性的权衡效应。

关键词：团头鲂南方鲇游泳加速模式临界游泳速度爆发游泳速度运动代谢最大代谢率

CdSe/ZnS量子点对稀有鮈鲫胚胎发育的影响及其氧化应激作用

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环境科学学报 2014年第7期34卷 1884-1890页

作者：陈幕飞张耀光郑朝依辛苗苗金星星金丽西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室(西南大学) 重庆400715

本研究以稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)为对象,研究了不同浓度CdSe/ZnS量子点(QDs)暴露下,稀有鮈鲫胚胎发育过程中自主运动频率、内心率和体长的变化,以及利用体内超氧化物歧化酶(SOD)和丙二醛(MDA)作为毒性指标,反映CdSe/ZnS QDs暴露对... 详细信息

本研究以稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)为对象,研究了不同浓度CdSe/ZnS量子点(QDs)暴露下,稀有鮈鲫胚胎发育过程中自主运动频率、内心率和体长的变化,以及利用体内超氧化物歧化酶(SOD)和丙二醛(MDA)作为毒性指标,反映CdSe/ZnS QDs暴露对稀有鮈鲫胚胎发育的氧化应激作用.结果显示:CdSe/ZnS QDs对稀有鮈鲫胚胎72 hpf(hours post fertilization)的半致死浓度(LC50)为319.629 nmol·L-1,96 hpf的半致畸浓度(EC50)为203.312 nmol·***/ZnS QDs暴露不仅影响稀有鮈鲫胚胎死亡率、畸形率、自主运动频率、孵化时间和孵化率,而且使其内心率减缓、体长缩短,导致胚胎卵凝结,心包囊肿,出现脊椎弯曲等多种毒性现象.同时发现,CdSe/ZnS QDs暴露导致稀有鮈鲫体内MDA含量增加以及SOD活力的降低.这表明CdSe/ZnS QDs对稀有鮈鲫胚胎发育具有致畸、致死作用,而氧化应激可能是引起其胚胎致畸、致死的重要机制之一.

关键词： CdSe/ZnS量子点稀有鮈鲫胚胎发育毒性氧化应激作用

尼罗罗非鱼微阵列Fosmid基因组文库的构建及基因筛选

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水产学报 2011年第1期35卷 27-34页

作者：李明辉吴风瑞熊传奇曾圣杨世杰叶凯蒋汶洮孙运侣黄宝锋魏莹莹焦静顾源王德寿西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室

以pCC2FOS为载体构建尼罗罗非鱼Fosmid基因组文库,共挑选115 200个单菌落,保存在300块384孔样品板中,构建4 800个行池、7 200个列池、300个板池和25个超级池,形成微阵列,并对其进行复制备份。该文库插入片段平均长度约为40 kb,覆盖约罗... 详细信息

以pCC2FOS为载体构建尼罗罗非鱼Fosmid基因组文库,共挑选115 200个单菌落,保存在300块384孔样品板中,构建4 800个行池、7 200个列池、300个板池和25个超级池,形成微阵列,并对其进行复制备份。该文库插入片段平均长度约为40 kb,覆盖约罗非鱼基因组的3倍。连续传代实验研究表明,文库具有良好的稳定性。由于构建超级池-板池-行、列池三级池系统形成的微阵列,有助于快速、准确、有效地筛选目的基因,仅需77个PCR反应(超级池25+板池12+行池16+列池24)就能筛选到含有目的基因的一个单克隆,解决了普遍存在的文库筛选难题。通过文库尝试筛选18个与性别分化和生长相关基因,均获得2～5个阳性克隆,说明文库具有较好的实用性。

关键词：尼罗罗非鱼基因组文库微阵列基因筛选