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昆明市一起聚集性发热疫情中腺病毒3型Penton base、Hexon和Fiber基因遗传进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 241-248页

作者：刘艳艳古文鹏段忠文王钰龚娇茶琦雁吴林蔚侯敏昆明市疾病预防控制中心微生物检验科昆明650228 云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所昆明650022 昆明市呈贡区疾病预防控制中心检验科昆明650500 玉溪市疾病预防控制中心卫生监测检验科玉溪678400

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton bas... 详细信息

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton base、Hexon和Fiber三个重要基因全长序列扩增、测定和分型鉴定,构建系统进化树,开展分子变异、遗传进化等分析。结果共采集5份标本,均检出呼吸道腺病毒及流感嗜血杆菌。对腺病毒进行Nanopore三代基因测序最终均获得Penton base、Hexon和Fiber基因全长编码区核苷酸序列,5份标本之间3个基因核苷酸相似性依次为100.0%、99.9%~100.0%和100.0%,氨基酸同源性均为100.0%;与HAdV3原型株(AY599834)核苷酸相似性最高,分别为98.6%、98.7%和98.9%。系统发育分析表明,3个基因系统进化树分析结果基本一致,人腺病毒3型(HAdV3)原型株单独一支,本研究中HAdV3序列均划分在同一进化分支上,与较早年份国外及中国台湾毒株亲缘关系较远,与近年国内外毒株亲缘关系较近,与2019年日本株(LC703523)和中国广州株(MZ540961)高度同源。与原型株比较分析昆明HAdV3氨基酸突变位点,Penton base有5处变异;Hexon有10处变异;Fiber有11处变异。结论本起疫情中的腺病毒在Penton base、Hexon和Fiber基因全长序列中型别分型结果一致,为P3H3F3型,与包括原型株在内的国内外HAdV3毒株显示出非常小的遗传变异。与原型株相比发生了多处氨基酸位点突变,并且多数氨基酸位点变异发生在蛋白质的高变区或功能区,其中Hexon蛋白中M7L为昆明序列独有氨基酸突变位点。

关键词：人腺病毒3型五邻体基座蛋白六邻体蛋白纤维蛋白遗传进化

基于主成分-TOPSIS的黄河流域山东段农村环境卫生综合评价

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 61-67页

作者：张晓杨绪廷高衍新杜英林江媛媛孙文石峰山东省疾病预防控制中心公共卫生监测评价所济南250014

目的基于2021年山东省农村环境卫生监测项目工作指标,对黄河流域山东段农村环境卫生进行综合评价,识别发展短板,探讨改善策略。方法基于主成分—逼近理想解排序(TOPSIS)分析法,根据山东省2021年农村环境卫生监测工作方案,在现有的农村... 详细信息

目的基于2021年山东省农村环境卫生监测项目工作指标,对黄河流域山东段农村环境卫生进行综合评价,识别发展短板,探讨改善策略。方法基于主成分—逼近理想解排序(TOPSIS)分析法,根据山东省2021年农村环境卫生监测工作方案,在现有的农村环境卫生监测体系中,选择13个沿黄河流域区县作为研究对象,同时以其他12个非沿黄河流域区县为对照,选择9个正向高优指标拟合评价模型,采用单个评价指标与最优理想解的标准化距离对黄河流域山东段农村环境卫生进行综合评价。结果从监测指标中筛选出9个核心指标用于主成分分析,分别为全县农民人均年纯收入(万元)、年度农村人均纯收入(万元)、县级农村环境卫生投入(万元)、农村环境卫生综合整治项目创建率(%)、环境卫生管理制度建设率(%)、卫生厕所普及率(%)、集中式供水覆盖率(%)、农村生活垃圾转运率(%)、农村生活污水转运率(%);经主成分分析,农村环境卫生监测项目评价指标可以用3个主成分表示,分别为经济状况、卫生管理、基础卫生设施,其特征值λ分别为2.109、2.076和1.349,累计贡献率为61.486%。利用TOPSIS欧式距离计算各区县综合评价指数,综合评价指数前5位的区县为黄河流域的桓台县和寿光市(0.705,0.665),非黄河流域的荣成市、兖州市、高密市(0.758,0.687,0.662)。变异系数最大的为黄河流域区县经济状况评价指数(0.481),最小的为黄河流域农村环境卫生管理评价指数(0.114)。结论黄河流域区县的优势在于其较好的农村环境卫生管理和基础卫生设施建设,但黄河流域区县经济状况对其综合评价指数的贡献低于非黄河流域区县。

关键词：农村环境卫生主成分-逼近理想解排序分析法黄河流域综合评价

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感染性腹泻流行趋势的研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 274-280页

作者：孙振璐刘国胜赵丽丽高巧王雪岩烟台市疾病预防控制中心烟台264003 莱州市疾病预防控制中心莱州261400

感染性腹泻是由多种病原体引起,广泛存在于世界各地的胃肠道感染性疾病。也是当今全球最重要的公共卫生问题之一,是引起全球5岁以下儿童死亡的第二大原因。感染性腹泻的病原体包含病毒性腹泻病原体、细菌性腹泻病原体和寄生虫相关病原... 详细信息

感染性腹泻是由多种病原体引起,广泛存在于世界各地的胃肠道感染性疾病。也是当今全球最重要的公共卫生问题之一,是引起全球5岁以下儿童死亡的第二大原因。感染性腹泻的病原体包含病毒性腹泻病原体、细菌性腹泻病原体和寄生虫相关病原体。而与病毒性腹泻相关的病原体是最主要的诱因,主要有诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、札如病毒等。诱发细菌性腹泻的主要病原体有致泻性大肠埃希菌、沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌、弯曲菌等。本文针对感染性腹泻的流行趋势、病原谱变化进行综述,目的是掌握我国感染性腹泻的分布及流行特征,为制定防控策略、减轻疾病负担提供参考。

关键词：病原体感染性腹泻病原谱流行特征

2023年江苏省扬州市医护人员丙型肝炎防治知识知晓率现状及影响因素研究

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疾病监测 2024年

作者：许纯李锦成杨文彬姜艳冯景文王晓宇邗江区疾病预防控制中心扬州市疾病预防控制中心宝应县疾病预防控制中心

目的了解江苏省扬州市各级医疗机构医护人员对丙型肝炎（丙肝）基本知识、诊断和治疗知识和相关政策知晓率。方法设计医护人员防治知识调查表，对扬州市各级医疗机构医护人员进行问卷调查，运用Excel2010、SPSS19.0软件对数据进行整... 详细信息

目的了解江苏省扬州市各级医疗机构医护人员对丙型肝炎（丙肝）基本知识、诊断和治疗知识和相关政策知晓率。方法设计医护人员防治知识调查表，对扬州市各级医疗机构医护人员进行问卷调查，运用Excel2010、SPSS19.0软件对数据进行整理和分析，采用单因素和多因素logistic回归分析影响丙肝认知状况的因素。结果本次调查共搜集有效问卷4 319份，总知晓率37.97%。丙肝基本知识知晓率67.47%，完全知晓率13.31%，回答正确率在32.53%～97.92%；丙肝诊断和治疗知识知晓率30.40%，完全知晓率0.30%，回答正确率在24.33%～97.99%；丙肝相关政策知晓率35.19%，完全知晓率8.43%，回答正确率在19.31%～92.43%。2261人（52.35%）最近1年接受过丙肝知识培训。多因素logistic回归分析结果显示：医院等级、医院类别、科室、文化程度和近一年是否接受丙肝知识培训是丙肝知识知晓率的影响因素（均P＜0.05）。不同科室、不同医院等级、不同医院类别医护人员，在丙肝基本知识、诊断和治疗知识、丙肝相关政策知晓率差异均有统计学意义（P＜0.05）。结论扬州市医护人员丙肝诊断、治疗知识和丙肝政策知晓率均不高，近一年接受丙肝知识培训的比例也较低，应该加强医护人员培训，提高其诊疗水平和发现疾病的能力。

关键词：丙型肝炎医护人员影响因素知晓率

CD4^(+)T淋巴细胞及身体成分与重庆市老年HIV感染者生理衰弱的关联分析

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中华预防医学杂志 2024年第2期58卷 235-240页

作者：陈晨徐杰江震吴国辉张裕强赵燕吴尊友中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心北京102206 重庆市疾病预防控制中心重庆400042 重庆市江津区疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制科重庆402260 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心治疗与关怀室北京102206

目的探索CD4^(+)T淋巴细胞(CD4细胞)计数水平与老年HIV感染者生理衰弱患病的关联关系及体成分指标对二者的修饰作用。方法2022年5—10月于重庆市江津区疾病预防控制中心辖区内7家抗病毒治疗点招募485例接受抗反转录病毒治疗(ART)的老年... 详细信息

目的探索CD4^(+)T淋巴细胞(CD4细胞)计数水平与老年HIV感染者生理衰弱患病的关联关系及体成分指标对二者的修饰作用。方法2022年5—10月于重庆市江津区疾病预防控制中心辖区内7家抗病毒治疗点招募485例接受抗反转录病毒治疗(ART)的老年HIV感染者。采用自制问卷通过面对面调查收集对象基本特征(年龄和性别)、生活习惯(吸烟和饮酒情况)和疾病史情况(包括代谢性疾病、心脑血管疾病、呼吸系统疾病和恶性肿瘤)等资料。采用Fried量表评估研究对象的生理衰弱情况。进行体质(步速、握力、身高和体重)和体成分(骨骼肌量、体脂肪量和基础代谢率)测量。由中国艾滋病综合防治数据信息管理系统获取对象抗反转录病毒治疗资料。计算老年感染者生理衰弱现患率,采用多因素logistic回归探索不同CD4水平对老年HIV感染者生理衰弱的影响,并对体成分指标进行亚组分析探索是否存在交互作用。结果485例对象年龄为(72±5)岁,其中>70岁者占48.2%(234例),男性占70.9%(344例),且已全部启动抗病毒治疗。老年HIV感染者生理衰弱率为7.4%(36/485)。多因素logistic回归模型分析显示:调整年龄、性别、吸烟、饮酒、体成分指标、ART时长、病毒载量和合并症数量等因素后,CD4细胞水平增加与老年HIV感染者生理衰弱患病风险下降相关;CD4细胞每增加5.0×10^(7)个/L,老年感染者生理衰弱患病风险下降12%[OR(95%CI):0.88(0.76~1.01)];与CD4细胞低水平组相比,CD4细胞正常水平组生理衰弱风险下降69%[OR(95%CI):0.31(0.10~0.92)]。体成分指标亚组分析显示:CD4细胞水平与生理衰弱的关联在高骨骼肌量和高基础代谢率感染者中更强(P交互值市老年HIV感染者生理衰弱率相对较低;CD4细胞水平、骨骼肌量和基础代谢率与生理衰弱有关联。

关键词： HIV 老年人 CD4^(+)T淋巴细胞身体成分生理衰弱

上海市普陀区儿童感染性腹泻病例病原谱及分子特征

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上海预防医学 2024年第6期36卷 543-550页

作者：顾文超张焕生唐海丰闫浩吴婷婷桂依琳李强李勇上海市普陀区疾病预防控制中心上海200333

【目的】了解2018—2023年上海市普陀区儿童感染性腹泻病的病原谱和分子特征,为儿童感染性腹泻防控提供科学依据。【方法】收集2018年1月—2023年12月上海市普陀区儿童腹泻病监测哨点医院就诊病例的粪便标本,通过分离培养11种细菌和实... 详细信息

【目的】了解2018—2023年上海市普陀区儿童感染性腹泻病的病原谱和分子特征,为儿童感染性腹泻防控提供科学依据。【方法】收集2018年1月—2023年12月上海市普陀区儿童腹泻病监测哨点医院就诊病例的粪便标本,通过分离培养11种细菌和实时荧光聚合酶链反应(PCR)检测5种病毒。使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)标准分型法分析部分阳性菌株的分子分型;采用逆转录PCR方法扩增部分诺如病毒阳性标本的聚合酶-衣壳蛋白连接区,基因测序后使用生物信息软件进行分析。采用χ^(2)检验或Fisher精确概率法比较2018—2019年和2020—2023年病原体阳性率。【结果】707例病例中,总阳性率为47.67%,单一细菌阳性率为16.27%,单一病毒阳性率为22.63%,混合阳性率为8.77%。优势病原体为轮状病毒(10.75%)、诺如病毒(10.33%)、肠致病性大肠杆菌(8.06%)、沙门菌(6.36%)、肠集聚性黏附大肠杆菌(5.52%)、弯曲菌(5.23%)。夏秋季以细菌感染为主,冬春季以病毒感染为主。2020—2023年的总阳性率较2018—2019年下降(χ^(2)=5.753,P市普陀区儿童感染性腹泻的优势病原体,病原谱呈现季节性流行特征,部分病原体的分子特征存在多样性。应在不同季节加强儿童感染性腹泻病原体的分子特征监测,为防控提供实验室依据。

关键词：儿童感染性腹泻病原谱脉冲场凝胶电泳基因型

重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件溯源调查和病原分析

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中国食品卫生杂志 2024年第5期36卷 595-600页

作者：王文斟聂术君李志峰王红段刚廖春艳王玲雷小念重庆市疾病预防控制中心重庆400042 重庆市巴南区疾病预防控制中心重庆401320

目的对重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件进行实验室病原学分析。方法按照食品安全国家标准(GB 4789.4—2016)对11株沙门菌分离株进行生化和血清型鉴定;使用微量肉汤稀释法进行药敏测试;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)... 详细信息

目的对重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件进行实验室病原学分析。方法按照食品安全国家标准(GB 4789.4—2016)对11株沙门菌分离株进行生化和血清型鉴定;使用微量肉汤稀释法进行药敏测试;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和全基因测序(WGS)进行分子分型、毒力和耐药基因分析。结果11株沙门菌全部为鼠伤寒沙门菌;在测试的15种抗生素中,所有菌株仅对四环素耐药;所有菌株的PFGE带型一致;WGS鉴定与血清学表型实验结果一致,所有菌株均携带2个四环素类耐药基因和10个毒力岛;溯源分析结果显示所有菌株的ST型相同,wgSNP进化树显示所有菌株可聚为一簇。结论11株鼠伤寒沙门菌序列高度同源,说明患者、环境和食品分离株来源相同,结合流行病学调查结果判定此次食源性疾病暴发事件是由食品加工人员使用器皿生熟不分引起食品污染所致。

关键词：鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳全基因组测序毒力岛耐药基因

2018—2022年中国内地老年人群食源性疾病主动监测结果分析

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中国食品卫生杂志 2024年第5期36卷 613-620页

作者：范鹏辉章荣华霍翔林黎蒋玉艳马晓晨刘弘刘志涛褚遵华梁进军胡晴文刘继开韩海红李薇薇国家食品安全风险评估中心北京100022 浙江省疾病预防控制中心浙江杭州310051 江苏省疾病预防控制中心江苏南京210009 四川省疾病预防控制中心四川成都610041 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西南宁530028 北京市疾病预防控制中心北京100013 上海市疾病预防控制中心上海200336 云南省疾病预防控制中心云南昆明650022 山东省疾病预防控制中心山东济南250014 湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410005

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧... 详细信息

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌和诺如病毒的检测,进行流行病学特征分析。结果老年人群急性胃肠炎病例粪便标本总体检出率为9.15%(7218/78904,95%CI:8.95%,9.35%),以沙门菌最高(3860/78699,4.90%,95%CI:4.75%,5.06%),其次为诺如病毒(1517/73173,2.07%,95%CI:1.97%,2.18%)、致泻大肠埃希菌(1.39%,1015/72763,95%CI:1.31%,1.48%)、副溶血性弧菌(1.00%,782/78386,95%CI:0.93%,1.07%)和志贺菌(0.19%,147/78611,95%CI:0.16%,0.22%)。老年人群男性沙门菌检出率高于女性,而女性副溶血性弧菌检出率高于男性,且年龄越大,检出率越低。老年人群各监测病原检出率具有明显季节性,沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌检出率在7、8月达到高峰,诺如病毒则在2、3月达到高峰,各地区监测病原检出率有所不同,差异具有统计学意义(χ^(2)=546.85,P区监测病原流行病学特征有所不同,应根据对应特征分布制定针对性措施预防老年人食源性疾病发生。

关键词：食源性疾病急性胃肠炎主动监测老年人沙门菌诺如病毒副溶血性弧菌致泻大肠埃希菌志贺菌

2013至2018年中国成人肥胖年均增长率及防控重点人群研究

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中华心血管病杂志 2024年第1期52卷 34-41页

作者：赵振平张梅李纯于梦婷张笑王丽敏周脉耕中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心慢病危险因素监测室北京100050 中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心北京100050

目的了解中国2013至2018年18岁及以上居民肥胖年均增长率和防控重点人群。方法本研究为横断面研究,选取2013和2018年中国慢性病及危险因素监测调查的对象,通过调查问卷、现场测量的方式,收集并分析中国31个省(自治区、直辖市)人群的肥... 详细信息

目的了解中国2013至2018年18岁及以上居民肥胖年均增长率和防控重点人群。方法本研究为横断面研究,选取2013和2018年中国慢性病及危险因素监测调查的对象,通过调查问卷、现场测量的方式,收集并分析中国31个省(自治区、直辖市)人群的肥胖流行率及增长率,以及肥胖控制措施及饮食、锻炼和药物控制措施占比情况。成人肥胖定义采用体重指数≥28.0 kg/m^(2)的标准。结果 2013年入选174 736人,男性74 704人(42.8%),年龄为(51.5±14.2)岁;2018年入选179 125人,男性79 337人(44.3%),年龄为(55.1±13.8)岁。2013至2018年中国18岁及以上居民肥胖年均增长率为3.2%[不确定区间(UI):2.7%~3.6%],男性肥胖年均增长率[5.2%(UI:4.6%~5.9%)]高于女性[0.9%(UI:0.5%~1.3%)]。18至29岁居民[7.4%(UI:6.9%~7.9%)]、大学(大专)及以上受教育水平[6.3%(UI:5.5%~7.1%)]、未婚人群[11.2%(UI:10.2%~12.1%)]的肥胖年均增长率高于其他亚组人群。2013至2018年,海南省肥胖年均增长率最高。除山西、湖南、甘肃和宁夏回族自治区外,其他省(自治区、直辖市)2013至2018年的成人肥胖率均在增长。肥胖人群中,采取体重控制措施的人群占比从2013年22.6%增加至2018年的32.7%。结论我国不同人群、区域肥胖增长特征差异明显,各地肥胖防控重点应各有侧重。

关键词：肥胖症流行率中国