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新冠疫情大流行期间广州市H3N2流感病毒分子流行特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第3期58卷 351-357页

作者：曹蓝周腾飞陈艺韵马蒙蒙夏丹刘艳慧李魁彪狄飚秦鹏哲张周斌广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 广州市疾病预防控制中心传染病预防控制部广州510440 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰... 详细信息

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰(阳性率为52.23%),流行强度和持续时间均高于2019年H3N2流感流行期。2022年流行株HA基因和NA基因均属于3C.2a1b.2a.1a.1分支,与2019年冬季的H3N2流行株进化分支(Group-3 毒株3C.2a1b.1a)不同。2022年流行株抗原位点变异主要发生在C区I48T位,HA蛋白受体结合位点与疫苗株一致。大部分流行株在HA蛋白上带有13个糖基化位点,一起暴发疫情分离株发生24-NST处糖基化位点的缺失。综上,新冠疫情大流行期间,引起广州市2022年H3N2流感流行的病毒株属于新衍生进化分支,进化起源上并非由2019年广州市毒株直接传播进化而来。

关键词： H3N2流感病毒分子变异遗传特征新型冠状病毒监测

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感染性腹泻流行趋势的研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 274-280页

作者：孙振璐刘国胜赵丽丽高巧王雪岩烟台市疾病预防控制中心烟台264003 莱州市疾病预防控制中心莱州261400

感染性腹泻是由多种病原体引起,广泛存在于世界各地的胃肠道感染性疾病。也是当今全球最重要的公共卫生问题之一,是引起全球5岁以下儿童死亡的第二大原因。感染性腹泻的病原体包含病毒性腹泻病原体、细菌性腹泻病原体和寄生虫相关病原... 详细信息

感染性腹泻是由多种病原体引起,广泛存在于世界各地的胃肠道感染性疾病。也是当今全球最重要的公共卫生问题之一,是引起全球5岁以下儿童死亡的第二大原因。感染性腹泻的病原体包含病毒性腹泻病原体、细菌性腹泻病原体和寄生虫相关病原体。而与病毒性腹泻相关的病原体是最主要的诱因,主要有诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、札如病毒等。诱发细菌性腹泻的主要病原体有致泻性大肠埃希菌、沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌、弯曲菌等。本文针对感染性腹泻的流行趋势、病原谱变化进行综述,目的是掌握我国感染性腹泻的分布及流行特征,为制定防控策略、减轻疾病负担提供参考。

关键词：病原体感染性腹泻病原谱流行特征

重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件溯源调查和病原分析

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中国食品卫生杂志 2024年第5期36卷 595-600页

作者：王文斟聂术君李志峰王红段刚廖春艳王玲雷小念重庆市疾病预防控制中心重庆400042 重庆市巴南区疾病预防控制中心重庆401320

目的对重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件进行实验室病原学分析。方法按照食品安全国家标准(GB 4789.4—2016)对11株沙门菌分离株进行生化和血清型鉴定;使用微量肉汤稀释法进行药敏测试;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)... 详细信息

目的对重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件进行实验室病原学分析。方法按照食品安全国家标准(GB 4789.4—2016)对11株沙门菌分离株进行生化和血清型鉴定;使用微量肉汤稀释法进行药敏测试;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和全基因测序(WGS)进行分子分型、毒力和耐药基因分析。结果11株沙门菌全部为鼠伤寒沙门菌;在测试的15种抗生素中,所有菌株仅对四环素耐药;所有菌株的PFGE带型一致;WGS鉴定与血清学表型实验结果一致,所有菌株均携带2个四环素类耐药基因和10个毒力岛;溯源分析结果显示所有菌株的ST型相同,wgSNP进化树显示所有菌株可聚为一簇。结论11株鼠伤寒沙门菌序列高度同源,说明患者、环境和食品分离株来源相同,结合流行病学调查结果判定此次食源性疾病暴发事件是由食品加工人员使用器皿生熟不分引起食品污染所致。

关键词：鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳全基因组测序毒力岛耐药基因

极端高温天气与宜昌市居民非意外死亡关系时间分层病例交叉分析

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中国公共卫生 2024年第10期 1169-1175页

作者：明小燕韩阳杨忠诚王早霞谢曙光范传刚宜昌市疾病预防控制中心赤壁市疾病预防控制中心湖北省疾病预防控制中心

目的分析极端高温天气与湖北省宜昌市居民非意外死亡的关系,为降低居民非意外死亡的风险提供参考依据。方法收集宜昌市疾病预防控制中心死因系统记录的宜昌市城区2014年1月1日—2022年12月31日46 170例非意外死亡者的相关数据以及同... 详细信息

目的分析极端高温天气与湖北省宜昌市居民非意外死亡的关系,为降低居民非意外死亡的风险提供参考依据。方法收集宜昌市疾病预防控制中心死因系统记录的宜昌市城区2014年1月1日—2022年12月31日46 170例非意外死亡者的相关数据以及同期宜昌市城区5个国控环境空气质量自动监测站每日的污染物监测数据和城区气象数据,采用时间分层病例交叉设计通过条件logistic回归模型分析温度不低于研究期间平均温度的P92.5且持续1 d(P92.5-1d)、温度不低于研究期间平均温度的P92.5且持续2 d(P92.5-2 d)、温度不低于研究期间平均温度的P92.5且持续3 d(P92.5-3 d)、温度不低于研究期间平均温度的P95.0且持续1d(P95.0-1 d)、温度不低于研究期间平均温度的P95.0且持续2 d(P95.0-2 d)、温度不低于研究期间平均温度的P95.0且持续3 d(P95.0-3 d)、温度不低于研究期间平均温度的P97.5且持续1 d(P97.5-1 d)、温度不低于研究期间平均温度的P97.5且持续2 d(P97.5-2 d)和温度不低于研究期间平均温度的P97.5且持续3 d(P97.5-3 d)共9种极端高温事件对宜昌市居民非意外死亡风险的影响。结果湖北省宜昌市46 170例非意外死亡者的病例天数为46 170 d,匹配的对照天数为157 134 d;宜昌市46 170例非意外死亡者中,P92.5-1d死亡3 371例（7.30%）,P92.5-2d死亡3 041例（6.59%）,P92.5-3 d死亡2 597例（5.62%）,P95.0-1 d死亡2 436例（5.28%）,P95.0-2d死亡2 205例（4.78%）,P95.0-3 d死亡1 960例（4.25%）,P97.5-1 d死亡1 343例（2.91%）,P97.5-2 d死亡1 148例（2.49%）,P97.5-3 d死亡882例（1.91%）;在排除了湿度（RH）、细颗粒物(PM2.5)、可吸入颗粒物(PM10)、二氧化硫（SO2）、二氧化氮（NO2）、臭氧（O3）、一氧化碳（CO）以及死亡者性别、年龄等因素的影响后,时间分层病例交叉分析结果显示,P92.5-1 d、P92.5-2 d、P92.5-3 d、P95.0-1 d、P95.0-2 d、P95.0-3 d、P97.5-1 d、P97.5-2 d和P97.5-3 d等9种极端高温事件均与宜昌市居民非意外死亡风险呈正相关且关联具有滞后性,除P92.5-2 d和P92.5-3 d极端高温事件的作用持续到Lag3 d外,其他7种极端高温事件的作用均持续到Lag1 d,9种极端高温事件均以Lag0 d的效应值为最大,分别为P92.5-1 d（OR=1.09,95%CI=1.04～1.14）、P92.5-2 d（OR=1.08,95%CI=1.03～1.14）、P92.5-3 d（OR=1.11,95%CI=1.05～1.16）、P95.0-1 d（OR=1.15,95%CI=1.09～1.22）、P95.0-2 d（OR=1.17,95%CI=1.10～1.24）、P95.0-3 d（OR=1.17,95%CI=1.10～1.25）、P97.5-1 d（OR=1.23,95%CI=1.15～1.32）、P97.5-2d（OR=1.27,95%CI=1.18～1.38）和P97.5-3 d（OR=1.31,95%CI=1.19～1.43）;分层分析结果显示,极端高温事件对宜昌市居民非意外死亡的影响在性别亚组和年龄亚组中依然存在,男性和女性居民均以P97.5-3 d的Lag0 d效应值为最大,分别为男性（OR=1.36,95%CI=1.21～1.54）和女性（OR=1.24,95%CI=1.08～1.43）,高年龄组居民对极端高温事件更为敏感,P92.5-1 d、P92.5-2 d和P92.5-3 d极端高温事件仅对70～79岁和≥80岁年龄组居民非意外死亡有显著影响,P92.5-1 d在Lag0 d的效应值分别为70～79岁（OR=1.17,95%CI=1.06～1.29）和≥80岁（OR=1.19,95%CI=1.10～1.29）,P92.5-2 d在Lag0 d的效应值分别为70～79岁（OR=1.15,95%CI=1.05～1.28）和≥80岁（OR=1.22,95%CI=1.12～1.32）,P92.5-3 d在Lag0 d的效应值分别为70～79岁（OR=1.15,95%CI=1.04～1.29）和≥80岁（OR=1.23,95%CI=1.13～1.34）。结论极端高温天气可增加宜昌市居民非意外死亡的风险。

关键词：非意外死亡极端高温关系时间分层病例交叉分析宜昌市

甘肃省2012-2022年肾综合征出血热自然疫源地特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第1期45卷 117-122页

作者：魏孔福刘新凤苟发香王旭霞姜中毅李治平张晓曙甘肃省疾病预防控制中心传染病预防控制所兰州730000

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在... 详细信息

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在0.05/10万~1.21/10万之间,病例主要分布于甘肃省东部的平凉市、东南部的天水市、南部的甘南藏族自治州(甘南州),以及中部以南的定西市;20~60岁年龄组居多,男女性别比为1.85∶1(564∶305),职业以农民(61.80%,537/869)、牧民(19.79%,172/869)和学生(6.33%,55/869)为主。野鼠型发病以每年11月至次年1月为高峰。啮齿类宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,汉滩病毒携带率分别为2.79%(21/754)、0.42%(5/1179)和0.31%(2/643)。甘肃省目前确定了3个疫源地,其中2个分别是平凉市和甘南州的新发疫源地,另1个为定西市的老疫源地。结论甘肃省南部、中部以南和东部地区是目前主要的HFRS疫源地,宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,病毒基因型为汉滩病毒。病例报告地区应加强疫情的监测,疫情重点地区应强化和落实各项预防和控制措施,以减少HFRS带来的危害。

关键词：肾综合征出血热疫源地特征

部分国家和地区重点病毒性呼吸道传染病监测情况概述

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中华流行病学杂志 2024年第2期45卷 300-304页

作者：胡婷彭质斌张彦平广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所广州511400 中国疾病预防控制中心传染病管理处北京102206

呼吸道病毒感染传播速度快,部分疾病甚至可引起全球性流行。为探索如何更好地开展病毒性呼吸道传染病监测,本文检索查阅美国、欧盟、中国等的重点病毒性呼吸道传染病监测情况,并针对性提出加强信息化建设、丰富监测手段、加强早期监测... 详细信息

呼吸道病毒感染传播速度快,部分疾病甚至可引起全球性流行。为探索如何更好地开展病毒性呼吸道传染病监测,本文检索查阅美国、欧盟、中国等的重点病毒性呼吸道传染病监测情况,并针对性提出加强信息化建设、丰富监测手段、加强早期监测预警机制等建议。

关键词：病毒呼吸道传染病监测描述性综述

2019—2022年河南省肾综合征出血热宿主动物监测情况分析

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中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 18-24页

作者：李东晓范威朱琳胡晓李懿马红霞王海峰叶莹苏佳黄学勇河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所郑州450016

目的分析2019—2022年河南省肾综合征出血热(HFRS)宿主动物分布及携带汉坦病毒(HV)情况。方法在河南省HFRS监测点开展宿主动物监测,采用实时荧光定量PCR法检测鼠肺HV,分析河南省鼠类动物携带HV型别,对阳性样本进行测序,分析核苷酸序列... 详细信息

目的分析2019—2022年河南省肾综合征出血热(HFRS)宿主动物分布及携带汉坦病毒(HV)情况。方法在河南省HFRS监测点开展宿主动物监测,采用实时荧光定量PCR法检测鼠肺HV,分析河南省鼠类动物携带HV型别,对阳性样本进行测序,分析核苷酸序列的同源性及变异情况。结果2019—2022年共捕鼠1308只,16份鼠肺HV核酸阳性,鼠HV阳性率为1.22%(16/1308)。按种类,黑线姬鼠HV阳性率最高(68.75%,11/16)。按分布地,野外鼠HV阳性率最高(2.50%,12/480),居民区鼠HV阳性率为0.53%(4/759)。16份阳性样本分型结果显示,所携带的病毒均属于Ⅰ型汉滩病毒。阳性样本测序后获得8条S基因片段(OQ681444~OQ681451)和6条M基因片段(OQ681438~OQ681443);S和M基因片段与陕西84FLi株、四川SN7株相似性较高。S和M基因片段系统进化分析显示,均为汉滩病毒H5基因亚型。氨基酸序列分析显示,与汉滩病毒疫苗株84FLi相比,8条S片段编码氨基酸第74位由天冬酰胺替换为丝氨酸;XC2022047株在Gn区第14位由色氨酸替换为甘氨酸,XC2022022和XC2022024第359位由异亮氨酸替换为丙氨酸。结论2019—2022年河南省宿主动物携带HV属于Ⅰ型汉滩病毒,黑线姬鼠仍然是汉滩病毒的优势宿主。同疫苗株比较,S和M基因片段的免疫表位区均有氨基酸位点替换。

关键词：肾综合征出血热监测汉坦病毒黑线姬鼠汉滩病毒

2018—2022年中国内地老年人群食源性疾病主动监测结果分析

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中国食品卫生杂志 2024年第5期36卷 613-620页

作者：范鹏辉章荣华霍翔林黎蒋玉艳马晓晨刘弘刘志涛褚遵华梁进军胡晴文刘继开韩海红李薇薇国家食品安全风险评估中心北京100022 浙江省疾病预防控制中心浙江杭州310051 江苏省疾病预防控制中心江苏南京210009 四川省疾病预防控制中心四川成都610041 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西南宁530028 北京市疾病预防控制中心北京100013 上海市疾病预防控制中心上海200336 云南省疾病预防控制中心云南昆明650022 山东省疾病预防控制中心山东济南250014 湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410005

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧... 详细信息

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌和诺如病毒的检测,进行流行病学特征分析。结果老年人群急性胃肠炎病例粪便标本总体检出率为9.15%(7218/78904,95%CI:8.95%,9.35%),以沙门菌最高(3860/78699,4.90%,95%CI:4.75%,5.06%),其次为诺如病毒(1517/73173,2.07%,95%CI:1.97%,2.18%)、致泻大肠埃希菌(1.39%,1015/72763,95%CI:1.31%,1.48%)、副溶血性弧菌(1.00%,782/78386,95%CI:0.93%,1.07%)和志贺菌(0.19%,147/78611,95%CI:0.16%,0.22%)。老年人群男性沙门菌检出率高于女性,而女性副溶血性弧菌检出率高于男性,且年龄越大,检出率越低。老年人群各监测病原检出率具有明显季节性,沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌检出率在7、8月达到高峰,诺如病毒则在2、3月达到高峰,各地区监测病原检出率有所不同,差异具有统计学意义(χ^(2)=546.85,P预防老年人食源性疾病发生。

关键词：食源性疾病急性胃肠炎主动监测老年人沙门菌诺如病毒副溶血性弧菌致泻大肠埃希菌志贺菌

2015—2020年天津市严重急性呼吸道感染病例人呼吸道合胞病毒的流行特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第8期58卷 1124-1128页

作者：苏承杨杰严方喆李琳彭质斌张颖天津市疾病预防控制中心传染病预防控制所天津120011 中国疾病预防控制中心传染病管理处北京102206

目的了解2015—2020年天津市严重急性呼吸道感染病例中人呼吸道合胞病毒的流行特征。方法研究资料来源于2015—2020年天津市哨点医院第三中心医院的SARI病例监测数据,有1597例SARI病例纳入研究。研究对象的临床标本进行了呼吸道多病原检... 详细信息

目的了解2015—2020年天津市严重急性呼吸道感染病例中人呼吸道合胞病毒的流行特征。方法研究资料来源于2015—2020年天津市哨点医院第三中心医院的SARI病例监测数据,有1597例SARI病例纳入研究。研究对象的临床标本进行了呼吸道多病原检测,并对HRSV阳性标本进行分型,分析不同年龄组、不同时段病例的HRSV检出率差异以及混合感染情况。结果共收集鼻咽拭子样本1597份,HRSV检出率为4.20%。67份HRSV阳性标本中单纯HRSV-A核酸阳性19份,单纯HRSV-B核酸阳性19份,HRSV-A和HRSV-B同时核酸检出阳性29份。不同年龄组HRSV检出率的差异具有统计学意义(P市HRSV流行高峰为冬季,2016至2020年天津市HRSV感染率呈上升趋势,5岁以下儿童是HRSV感染的高发人群。

关键词：人呼吸道合胞病毒严重急性呼吸道感染流行特征