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低龄儿童龋患者唾液微生物群落研究及预测模型构建

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口腔医学研究 2024年第9期40卷 778-784页

作者：林秀燕赵彩云石宏河北医科大学口腔医学院·口腔医院儿童口腔科河北省口腔医学重点实验室河北省口腔疾病临床医学研究中心河北石家庄050011

目的:对不同患龋儿童唾液进行高通量测序并分析低龄儿童龋(early childhood caries,ECC)的影响因素,为探究ECC与菌群的相关性及ECC综合诊断模型的建立提供依据。方法:对儿童口腔检查,根据结果分为无龋(caries free,CF)组、ECC组和重度... 详细信息

目的:对不同患龋儿童唾液进行高通量测序并分析低龄儿童龋(early childhood caries,ECC)的影响因素,为探究ECC与菌群的相关性及ECC综合诊断模型的建立提供依据。方法:对儿童口腔检查,根据结果分为无龋(caries free,CF)组、ECC组和重度低龄儿童龋(severe early childhood caries,SECC)组,采取问卷调查方法探究ECC的影响因素;同时对儿童唾液进行高通量测序,并拟采用受试者工作曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)建立基于以上结果的疾病诊断模型。结果:不同患龋儿童的微生物群落组成存在显著统计学差异(P诊断价值。

关键词：低龄儿童龋微生物群落预测模型高通量测序

卷积神经网络在辅助肝细粒棘球蚴病超声分型诊断的应用

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2024年第4期42卷 454-460,474页

作者：任艳宋涛尚丰吴淼王正业王晓荣新疆医科大学第一附属医院腹部超声诊断科省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学医学工程技术学院新疆乌鲁木齐830000 新疆生产建设兵团疾病预防控制中心新疆乌鲁木齐830000

目的探讨卷积神经网络(VGG19)模型在辅助肝细粒棘球蚴病(HCE)超声分型诊断的应用价值。方法回顾性收集2012年1月至2022年12月在新疆医科大学第一附属医院就诊的肝细粒棘球蚴病(HCE,含CE1~CE5分型)患者及非棘球蚴病性肝局灶性病变(NHFLL... 详细信息

目的探讨卷积神经网络(VGG19)模型在辅助肝细粒棘球蚴病(HCE)超声分型诊断的应用价值。方法回顾性收集2012年1月至2022年12月在新疆医科大学第一附属医院就诊的肝细粒棘球蚴病(HCE,含CE1~CE5分型)患者及非棘球蚴病性肝局灶性病变(NHFLL)患者的超声图像,使用VGG19模型对超声图像进行6个类型肝局灶性占位病变(CE1~CE5、NHFLL)的诊断判定,比较各类型的判定百分比。当VGG19误判HCE与NHFLL时,比较患者的一般人口学信息和相关临床资料。将超声图片按照各分型占比基本一致的原则随机均分为两组,2名低年资超声医师和2名高年资超声医师各随机选择1组进行人工分类汇总,对比低、高年资超声医师与模型诊断正确率。采用混淆矩阵、精确率、召回率、特异度和F1分数评估VGG19的诊断性能。用构成比对计数资料进行描述性分析,使用卡方检验、Fisher确切概率法、配对卡方检验进行差异比较分析。结果871例HCE中包括203例CE1、227例CE2、110例CE3、159例CE4、172例CE5;600例NHFLL中包括300例肝囊肿、150例肝钙化灶、150例肝实性占位病变(100例肝血管瘤、25例肝癌、25例肝脓肿)。VGG19模型整体精准率为82.0%,召回率为87.9%,F1分数为84.3%。VGG19模型整体正确率为86.2%(1268/1471),各类型正确率由高到低依次为CE5(95.3%,164/172)、CE4(91.2%,145/159)、CE3(89.1%,98/110)、CE1(84.7%,172/203)、CE2(84.6%,192/227)、NHFLL(82.8%,497/600)。共有203例误诊,误诊率为13.8%(203/1471),其中100例为HCE分型间的误诊,包括31例CE1、35例CE2、12例CE3、15例CE4、8例CE5;103例为NHFLL被误诊为HCE,包括68例肝囊肿、17例肝钙化灶、17例肝血管瘤、1例肝脓肿,无肝癌病例被误诊。VGG19误诊的HCE患者和NHFLL患者的年龄、住址类别、有无犬类接触史、文化程度、省份差异有统计学意义(χ^(2)=55.116、24.197、35.834、14.069、11.918,均P0.05)。VGG19模型诊断整体正确率(86.2%,1268/1471)高于低年资医师(81.2%,1195/1471)(P诊断正确率低于高年资超声医师,但高于低年资超声医师,有望推广到基层医院,联合临床信息后可辅助修正超声诊断。

关键词：肝细粒棘球蚴病超声卷积神经网络肝脏局灶性病变

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骨髓间充质干细胞对骨关节炎大鼠软骨损伤的影响及机制研究

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成都医学院学报 2024年第05期 774-778页

作者：张锤张坤娟刘冰尹乃宁孙飞虎郝康河北医科大学第二医院骨科河北意和医学检验实验室

目的探讨骨髓间充质干细胞（BMSCs）对骨关节炎（OA）大鼠软骨损伤的影响及其机制。方法大鼠膝关节腔内注射木瓜蛋白酶构建OA模型,将构建成功的20只OA大鼠按照随机数字表法分为OA组和治疗组,每组10只;同时将膝关节腔内注射等量生理盐水... 详细信息

目的探讨骨髓间充质干细胞（BMSCs）对骨关节炎（OA）大鼠软骨损伤的影响及其机制。方法大鼠膝关节腔内注射木瓜蛋白酶构建OA模型,将构建成功的20只OA大鼠按照随机数字表法分为OA组和治疗组,每组10只;同时将膝关节腔内注射等量生理盐水的10只大鼠作为对照组。HE染色观察大鼠膝关节软骨损伤,Mankin's评分法评估膝关节软骨病理损伤程度,缚线法检测大鼠膝关节肿胀度,医用测角尺检测大鼠膝关节被动活动度,流式细胞仪检测大鼠脾脏辅助性T细胞17（Th17）和调节性T细胞（Treg）比例,生化试剂盒检测大鼠血清中白细胞介素-17（IL-17）含量和软骨组织中丙二醛（MDA）、Fe2+含量,蛋白质印迹法检测软骨组织中乳酸脱氢酶A（LDHA）、己糖激酶2（HK2）、M2型丙酮酸激酶（PKM2）、长链脂酰辅酶A合成酶4（ACSL4）、谷胱甘肽过氧化物酶4（GPX4）蛋白表达水平。结果与对照组比较,OA组和治疗组大鼠膝关节软骨组织Mankin's评分、膝关节肿胀度、Th17细胞比例、Th17/Treg比值、血清IL-17含量和软骨组织中Fe2+含量、MDA含量及LDHA、HK2、PKM2、ACSL4蛋白表达水平均明显升高（P<0.05）;膝关节被动活动度、Treg细胞比例和软骨组织中GPX4蛋白表达水平明显降低（P<0.05）;与OA组比较,治疗组大鼠膝关节软骨组织Mankin's评分、膝关节肿胀度、Th17细胞比例、Th17/Treg比值、血清IL-17含量和软骨组织中Fe2+含量、MDA含量及LDHA、HK2、PKM2、ACSL4蛋白表达水平均明显降低（P<0.05）;膝关节被动活动度、Treg细胞比例和软骨组织中GPX4蛋白表达水平均明显升高（P<0.05）。结论BMSCs治疗可明显改善OA大鼠软骨损伤,其作用机制可能与改善Th17/Treg细胞平衡和软骨糖酵解、铁死亡有关。

关键词：骨关节炎骨髓间充质干细胞软骨损伤

外周血NLRP3炎性小体-Caspase-1-IL-1β信号轴与肺癌相关性分析

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南京医科大学学报（自然科学版） 2024年第8期44卷 1134-1139页

作者：徐兆云王蕾李世宝徐州医科大学医学技术学院江苏徐州221000 连云港市赣榆区人民医院输血科江苏连云港222000 南京医科大学连云港临床医学院(连云港市第一人民医院)中心实验室江苏连云港222000

目的:分析外周血核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(nucleotide binding oligomerization domain like receptor protein 3,NLRP3)-半胱氨酸蛋白酶1(cysteine-aspartic acid protease 1,Caspase-1)-白细胞介素(interleukin,IL)-1β信号轴与肺癌的相关性。方法:选取2021年6月—2023年8月江苏省连云港市赣榆区人民医院收治的肺癌住院患者72例初诊患者(肺癌组)和72例健康体检者(健康对照组)。比较两组外周血单核细胞、NLRP3、Caspase-1、IL-1β水平及肺功能[1秒用力呼气量(forced expiratory volume in one second,FEV_(1))、用力肺活量(forced vital capacity,FVC)、FEV_(1)/FVC],并分析肺癌组外周血中NLRP3、IL-1β水平与FEV_(1)、FVC、FEV_(1)/FVC的相关性。结果:肺癌组患者FEV_(1)、FVC、FEV_(1)/FVC水平均显著低于健康对照组,差异有统计学意义(P均诊断具有潜在的参考价值。

关键词： NLRP3炎性小体半胱氨酸蛋白酶1 白细胞介素1β 肺癌相关性分析

SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤1例报告并文献复习

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中国实用妇科与产科杂志 2024年第8期40卷 845-848页

作者：卢碧燕朱莹禤文婷罗海波黄素然李仲均东莞职业技术学院基础医学教研室广东东莞523808 南方医科大学第十附属医院广东东莞523059 东莞市妇产科重大疾病重点实验室广东东莞523000

目的探讨SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤的临床病理特点、诊断、治疗及预后。方法回顾分析南方医科大学第十附属医院2023年11月20日收治的1例SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤的临床病理资料,系统检索PubMed、Medline、中国知网、中国生物... 详细信息

目的探讨SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤的临床病理特点、诊断、治疗及预后。方法回顾分析南方医科大学第十附属医院2023年11月20日收治的1例SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤的临床病理资料,系统检索PubMed、Medline、中国知网、中国生物医学文献数据库,对相关文献进行分析和总结。结果患者30岁,因发现子宫肿物3个月余入院,行全子宫+双侧输卵管切除术,术后病理证实为SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤。经文献检索,目前国内外仅有35例SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤报道。患者年龄范围24~70(43.03±11.97)岁,临床症状多表现为阴道流血。23例可查阅到治疗方式,以全子宫+双侧附件切除为主。15例有随访资料,其中11例死亡,中位生存时间仅6个月。结论 SMARCA4缺失性未分化子宫肉瘤是一种新近认识的子宫恶性间叶源性肿瘤亚型,恶性程度较高,临床上应予以重视。

关键词： SMARCA4缺失子宫肉瘤临床病理特征治疗预后

不同种类全瓷冠对龈沟液IL-1β、MMP-8的影响

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牙体牙髓牙周病学杂志 2024年第3期29卷 147-150,155页

作者：王璐崔玉兰吴洁张钊河北医科大学口腔医学院河北医科大学河北省口腔医学重点实验室河北省口腔疾病临床医学研究中心河北石家庄050017 唐山职业技术学院附属医院口腔科河北唐山063000 河北医科大学口腔医学院·口腔医院修复科河北石家庄050017

目的:探究二硅酸锂玻璃陶瓷冠(铸瓷冠)及氧化锆全瓷冠(全锆冠)修复前后龈沟液内标志物白细胞介素(IL)-1β、基质金属蛋白酶(MMP)-8的差异。方法:选取行全冠修复的24名患者共30个牙齿为研究对象,依全冠材料分为铸瓷冠组和全锆冠组,每组... 详细信息

目的:探究二硅酸锂玻璃陶瓷冠(铸瓷冠)及氧化锆全瓷冠(全锆冠)修复前后龈沟液内标志物白细胞介素(IL)-1β、基质金属蛋白酶(MMP)-8的差异。方法:选取行全冠修复的24名患者共30个牙齿为研究对象,依全冠材料分为铸瓷冠组和全锆冠组,每组各15例。在修复前、修复后1、3、6个月时,测量两组修复牙及对侧同名天然牙的牙周探诊深度,采集修复牙龈沟液,采用酶联免疫反应方法检测龈沟液中IL-1β、MMP-8浓度,并进行统计学分析。结果:铸瓷冠及全锆冠组修复前、后不同时间,牙周探诊深度及龈沟液中MMP-8无统计学差异(P>0.05)。全锆冠组修复前后龈沟液中IL-1β无显著变化(P>0.05);铸瓷冠组组内不同时间比较,龈沟液IL-1β在3个月时表达最高,显著高于修复后1个月(P<0.05)。全锆冠组与铸瓷冠组组间相比,在修复后3个月及6个月时,铸瓷冠组龈沟液中IL-1β显著高于全锆冠组(P<0.05)。结论:全锆冠修复后龈沟液中生物标志物变化不明显,铸瓷冠较全锆冠对牙周组织产生影响更大。

关键词：全锆冠铸瓷冠白细胞介素-1β 基质金属蛋白酶-8 龈沟液

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结合局部熵与梯度能量的双通道医学图像融合

计算机辅助设计与图形学学报 2024年第6期36卷 857-874页

作者：朱积成刘慧李珊珊李攀张彩明山东财经大学计算机科学与技术学院济南250014 山东省数字媒体技术重点实验室济南250014 重庆医科大学附属第二医院重庆400010 山东大学软件学院济南250101

多模态医学图像融合已成为有效结合正常组织结构和异常改变信息、提高医学诊断效率的强有力辅助技术.针对空域融合技术在处理图像细节丢失、光谱退化等方面的缺陷,提出一种在联合双边滤波器(JBF)域内实现图像结构与细节信息增强的双通... 详细信息

多模态医学图像融合已成为有效结合正常组织结构和异常改变信息、提高医学诊断效率的强有力辅助技术.针对空域融合技术在处理图像细节丢失、光谱退化等方面的缺陷,提出一种在联合双边滤波器(JBF)域内实现图像结构与细节信息增强的双通道频域多模态医学图像融合方法.该方法将源图像分解为结构和能量2个通道,分别处理图像纹理细节信息和边缘强度信息.在结构通道中,通过改进梯度能量得到局部梯度能量算子,进一步提升融合图像对小尺度细节信息的表达能力和对噪声的鲁棒性;在能量通道中,利用非下采样轮廓波变换提高模型的多方向多尺度特性,并提出一种局部熵细节增强算子和脉冲耦合神经网络结合的高频子带处理框架,达到增强能量通道中结构信息和细节信息的效果.在Atlas公开数据集上,与基于MST、稀疏表示、PCNN以及JBF的6种具有代表性的频域融合方法进行对比及消融实验的结果表明,所提方法的融合图像与源图像相似度提升35.0%,空间频率提升16.2%,边缘保持度提升12.5%,对比度提升11.2%;并在视觉方面有较好的效果,明显优于对比方法.

关键词：医学图像融合联合双边滤波器非下采样轮廓波变换脉冲耦合神经网络相位一致性

新型冠状病毒感染与2型糖尿病共病联系的生物信息学分析

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病毒学报 2024年第1期40卷 65-79页

作者：黄泰于琦穆俊芳刘格良薛丹阳陈浩然常敏静贺培风山西医科大学临床决策研究大数据山西省重点实验室晋中030600 山西医科大学基础医学院晋中030600 山西医科大学管理学院晋中030600

本文基于转录组数据研究了新型冠状病毒感染(Coronavirus disease 2019,COVID-19)和2型糖尿病(Type 2diabetes,T2D)的相互作用机制,寻找疾病的潜在功能模块,为其治疗提供新思路。本文收集了来自GEO(Gene expression omnibus)数据库的10... 详细信息

本文基于转录组数据研究了新型冠状病毒感染(Coronavirus disease 2019,COVID-19)和2型糖尿病(Type 2diabetes,T2D)的相互作用机制,寻找疾病的潜在功能模块,为其治疗提供新思路。本文收集了来自GEO(Gene expression omnibus)数据库的10个COVID-19和T2D基因表达谱数据集,并按照4:6的比例分为训练集和验证集,并进行差异表达基因(Differential expression genes,DEGs)的富集分析和构建蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络进行模块化分析,找到了与COVID-19和T2D最紧密相关的关键基因和蛋白质特征模块。基于各组织的DEGs交集结果,本文发现43个共有DEGs,并确定了5个关键基因(HSP90AA1、SRC、EGFR、MAPK3、CDK1),其中CDK1表现出最高的网络连接性。通过XGBoost等6种机器学习算法进行性能检验显示了关键基因对诊断COVID-19和T2D的潜在价值,并通过qPCR实验证实了关键基因在COVID-19患者和正常对照组PBMC中的表达差异。此外,本文基于模块划分算法得到了PPI网络的6个潜在功能模块,这些模块主要与糖类、脂类代谢和细胞复制相关联。最后,本文建立了miRNA-TF-mRNA调控网络,并筛选出TP53和NFIC作为调节共有基因转录的枢纽转录因子(Transcription factor,TF)。总之,本文分析了COVID-19和T2D之间共有的表达特征、生物学通路和调控因子,并探索了基因在转录和翻译中的复杂相互作用,为未来COVID-19和T2D的治疗提供了新思路。

关键词：生物信息学新冠疫情二型糖尿病基因表达谱炎症

基于机器学习算法的深静脉血栓代谢标志物的分析策略

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分析化学 2024年第7期52卷 1039-1054页

作者：刘明锋吴妍娟周世栋党丽虹李健杜艳孙俊红曹洁山西医科大学法医学院上海市法医学重点实验室司法部司法鉴定重点实验室(司法鉴定科学研究院)

深静脉血栓形成（DVT）是临床常见的周围血管病，具有发病隐匿和病因复杂等特征。由于缺乏准确有效的早期诊断方法，DVT易被漏诊或误诊，筛选可靠的生物标志物是目前亟需解决的关键问题。本研究采用基于气相色谱-质谱联用（GC-MS）的代... 详细信息

深静脉血栓形成（DVT）是临床常见的周围血管病，具有发病隐匿和病因复杂等特征。由于缺乏准确有效的早期诊断方法，DVT易被漏诊或误诊，筛选可靠的生物标志物是目前亟需解决的关键问题。本研究采用基于气相色谱-质谱联用（GC-MS）的代谢组学技术考察DVT大鼠尿液中的内源性代谢物变化规律，结合多元统计分析和多种特征选择算法筛选特征代谢物，构建了DVT机器学习诊断模型。建立了下腔静脉结扎大鼠模型，在代谢笼中收集血栓形成期（48～72 h）尿液，采用GC-MS技术采集DVT及对照组尿液代谢谱。经FiehnLib气相色谱-质谱数据库比对，在大鼠尿液中共鉴定出176种内源性代谢物；使用正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）结合Mann-Whitney U检验，筛选出26种DVT差异代谢物；联合多种特征选择算法进一步筛选获得13种与DVT发生密切相关的关键代谢物。构建了高斯朴素贝叶斯（GNB）、支持向量机（SVM）、逻辑回归（LR）和线性判别分析（LDA）机器学习模型并用于DVT诊断。对各模型的性能进行评估比较发现，使用13种关键代谢物构建的诊断模型准确率高、稳定性好，其预测性能优于使用176种代谢物及26种差异代谢物构建的诊断模型。研究结果表明，联合多种特征选择算法分析DVT大鼠尿液的代谢物信息，可有效筛选出可靠的DVT潜在标志物，构建的机器学习模型可为DVT的自动化诊断提供新的技术手段。

关键词：深静脉血栓形成机器学习代谢组学气相色谱-质谱联用特征选择

来源：博看期刊