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基于免疫蛋白质组学的单增李斯特菌强免疫原性蛋白挖掘

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现代食品科技 2024年第3期40卷 301-308页

作者：张颖吴诗古其会叶青华张菊梅陈谋通吴清平华南农业大学食品学院广东广州510642 广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省微生物安全与健康重点实验室农业农村部农业微生物组学与精准应用重点实验室广东广州510070

该研究采用高毒力持留基因型单增李斯特菌819-2菌株全菌蛋白免疫SPF级Balb/C小鼠制备抗血清,利用免疫蛋白质组学对菌株胞外蛋白质组进行分析,旨在挖掘筛选单增李斯特菌强免疫原性蛋白作为特异性抗体制备的候选抗原。超声法提取819-2菌... 详细信息

该研究采用高毒力持留基因型单增李斯特菌819-2菌株全菌蛋白免疫SPF级Balb/C小鼠制备抗血清,利用免疫蛋白质组学对菌株胞外蛋白质组进行分析,旨在挖掘筛选单增李斯特菌强免疫原性蛋白作为特异性抗体制备的候选抗原。超声法提取819-2菌株全菌蛋白免疫SPF级Balb/C小鼠制备抗血清,四次免疫后经间接ELISA测定效价达1:512000。脱氧胆酸钠(DOC)-10%(m/V)TCA沉淀法提取单增李斯特菌819-2菌株胞外蛋白,利用免疫蛋白质组学和LC-MS/MS技术挖掘并鉴定具有强免疫反应的蛋白点,结果表明双向电泳图谱成功获得85个蛋白点,并成功鉴定了P60、InlC、MltG、Enolase和假定蛋白YxeA family protein等5个强免疫原性蛋白,研究结果为基于强免疫原性蛋白制备特异性抗体用于食品及其加工环境中单增李斯特菌富集及快速检测技术研制提供了数据基础。

关键词：单增李斯特菌免疫蛋白质组学抗血清免疫印迹

重症监护病房多重耐药菌感染分布情况及影响因素分析

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中国医药科学 2024年第11期14卷 186-190页

作者：曾祥泰张庆英逄楠李艳操许晓佳汕头大学医学院第一附属医院感染管理科广东汕头515041 汕头大学医学院预防医学系公共卫生与预防医学教研室广东汕头515041

目的分析重症监护病房(ICU)患者多重耐药菌(MDRO)感染的分布情况及其危险因素,并提出相关的预防和控制措施。方法本研究以2021年7月至2022年12月汕头市某三级甲等医院ICU收治的1407例患者为对象,回顾性收集其住院期间是否发生MDRO感染,... 详细信息

目的分析重症监护病房(ICU)患者多重耐药菌(MDRO)感染的分布情况及其危险因素,并提出相关的预防和控制措施。方法本研究以2021年7月至2022年12月汕头市某三级甲等医院ICU收治的1407例患者为对象,回顾性收集其住院期间是否发生MDRO感染,分析MDRO感染发生率和分布情况,并分为MDRO感染组和非MDRO感染组进行比较,采用多因素logistic回归筛选MDRO感染的相关危险因素。结果ICU共有1407例住院患者均接受细菌培养及耐药菌株检测,其中男性患者为880例,女性患者为527例;MDRO感染发生率为18.69%(263/1407)。ICU中MDRO感染菌株主要涉及大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯菌等。多因素分析结果显示,合并心血管病(OR=1.453,95%CI 1.006~2.079)、广谱抗生素使用时长≥1周(OR=1.900,95%CI 1.377~2.620)、使用≥2联抗生素(OR=1.913,95%CI 1.378~2.655)、留置血管内导管(OR=2.456,95%CI 1.416~3.241)与MDRO感染风险增高有关(P<0.05)。结论ICU患者中MDRO的感染发生率相对其他普通病区仍处于较高水平,应针对MDRO感染的特点和相关的高危因素及时采取预防和控制措施,有效降低MDRO的感染发生率。

关键词：重症监护病房多重耐药菌感染影响因素

基于结构信息的MHET降解酶挖掘及温和温度下的酶级联塑料降解

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生物工程学报 2024年第3期40卷 773-785页

作者：刘欣悦耿文超孙瑨原陈泽华崔颖璐吴边中国科学技术大学生命科学与医学部安徽合肥230027 中国科学院微生物研究所、微生物资源前期开发国家重点实验室、中国科学院微生物生理与代谢工程重点实验室北京100101 南开大学化学学院天津300071 中国科学院天津工业生物技术研究所、中国科学院系统微生物工程重点实验室天津300308

聚对苯二甲酸乙二醇酯(polyethylene terephthalate,PET)的不规范使用和处置造成了严重的生态污染。酶法降解是一种环境友好的解决PET污染的方法。对苯二甲酸单(2-羟乙基)酯[mono(2-hydroxyethyl)terephthalate,MHET]是PET降解过程中的... 详细信息

聚对苯二甲酸乙二醇酯(polyethylene terephthalate,PET)的不规范使用和处置造成了严重的生态污染。酶法降解是一种环境友好的解决PET污染的方法。对苯二甲酸单(2-羟乙基)酯[mono(2-hydroxyethyl)terephthalate,MHET]是PET降解过程中的具有竞争性抑制效果的中间产物,可由MHET降解酶催化水解。本研究采用生物信息学方法,结合序列和结构信息,发现了一种MHET水解酶,BurkMHETase。酶学性质研究表明该酶的最适pH和最适温度分别为7.5和40℃,在pH 7.5−10.0、30−45℃条件下相对稳定;以MHET为底物测定动力学参数kcat为(24.2±0.5)s^(-1),Km为(1.8±0.2)μmol/L,具有与目前最高效的IsMHETase相似的kcat值和更高的底物亲和力。BurkMHETase与PET降解酶IsPETase联用能够改善PET薄膜的降解效果。结构分析和突变实验表明,BurkMHETase可能已经进化出特定的结构特征来催化MHET的水解。对于MHET降解酶,在495位为芳香族氨基酸以及活性部位或远端氨基酸间的协同相互作用对于MHET水解活性似乎是必需的。因此,BurkMHETase有潜力应用于PET双酶降解系统,而所使用的生物信息学方法可以用来高效挖掘新的MHET降解酶。

关键词：聚对苯二甲酸乙二醇酯塑料生物降解酶挖掘丝氨酸水解酶

基因工程改造促进大肠杆菌发酵纤维素水解液合成1,2,4-丁三醇

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化工进展 2024年第2期43卷 1063-1068页

作者：佘丹王舒婷陆信曜宗红诸葛斌江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室工业微生物研究中心江苏无锡214122

1,2,4-丁三醇(BT)是广泛应用于各领域的高附加值化合物之一,利用纤维素水解液发酵生产BT需要一株能够耐受其中抑制物的菌株。在水解液中常见抑制因子糠醛存在下,大肠杆菌的发酵严重受限。本研究首先在含有BT合成途径的大肠杆菌中过表达... 详细信息

1,2,4-丁三醇(BT)是广泛应用于各领域的高附加值化合物之一,利用纤维素水解液发酵生产BT需要一株能够耐受其中抑制物的菌株。在水解液中常见抑制因子糠醛存在下,大肠杆菌的发酵严重受限。本研究首先在含有BT合成途径的大肠杆菌中过表达四种糠醛耐受相关的基因:yghA、thyA、mdtJI和pntAB。在0.4g/L糠醛压力下,所有改造菌株的生长均有不同程度的提升,其中过表达pntAB基因的菌株生长最好,同时有助于BT合成酶的酶活力或转录水平的提高,BT产量达到11.0g/L。当以玉米芯纤维素水解液为底物时,过表达yghA、thyA和pntAB均明显促进了大肠杆菌的生长与BT产量的提高,其中yghA基因表现最好,在摇瓶中获得了3.36g/L的BT,在5L发酵罐中BT产量达到15.3g/L,转化率为63.8%。该策略为玉米芯纤维素水解液发酵生产BT提供了借鉴。

关键词：大肠杆菌玉米芯纤维素水解液糠醛耐受 1 2 4-丁三醇

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外泌体参与新冠病毒感染的机制及其应用的研究进展

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病毒学报 2024年第1期40卷 160-168页

作者：鲁丹方一泰罗德炎王慧军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全全国重点实验室北京100072 安徽医科大学基础医学院合肥230032

COVID-19是一种广泛流行的烈性传染病,具有很高的病死率,给全球公共卫生系统造成了严重危机。外泌体是一种由活细胞分泌的纳米级囊泡,携带亲本细胞的脂质、蛋白质及遗传物质至受体细胞,参与机体的信号传递、信息交流。在SARS-CoV-2感染... 详细信息

COVID-19是一种广泛流行的烈性传染病,具有很高的病死率,给全球公共卫生系统造成了严重危机。外泌体是一种由活细胞分泌的纳米级囊泡,携带亲本细胞的脂质、蛋白质及遗传物质至受体细胞,参与机体的信号传递、信息交流。在SARS-CoV-2感染的病理过程中,外泌体通过内吞途径或在相关分子的作用下参与感染,进而调节机体的生理或病理状态。外泌体具有高稳定性、低免疫原性、高生物相容性以及能够顺利通过组织屏障等优点。作为“分子载体”,外泌体可以递送SARS-CoV-2病毒相关信息分子,用于COVID-19的疾病诊断;作为“递送载体”,外泌体能够携带脂质、核酸、蛋白及药物至体内。因此,外泌体常用于COVID-19治疗药物与疫苗的制备。现就外泌体如何参与SARS-CoV-2感染以及外泌体与COVID-19的诊断、治疗及预防作一综述。

关键词： SARS-CoV-2 外泌体诊断治疗预防

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吡咯喹啉醌合成及生产工艺研究进展

微生物学报 2024年第4期64卷 999-1018页

作者：刘东方黄建忠陶勇杨欣伟柯崇榕福建师范大学生命科学学院、工业微生物发酵技术国家地方联合工程研究中心、工业微生物教育部工程中心福建福州350108 中国科学院微生物研究所微生物生理与代谢工程重点实验室北京100101

吡咯喹啉醌(pyrroloquinoline quinone,PQQ)是继烟酰胺和核黄素之后发现的第三类氧化还原酶辅因子,普遍存在于生物体中参与呼吸链电子传递,具有促进线粒体产生、清除自由基、增强细胞代谢和预防心肌损伤等生理功能,在医药、食品和农业... 详细信息

吡咯喹啉醌(pyrroloquinoline quinone,PQQ)是继烟酰胺和核黄素之后发现的第三类氧化还原酶辅因子,普遍存在于生物体中参与呼吸链电子传递,具有促进线粒体产生、清除自由基、增强细胞代谢和预防心肌损伤等生理功能,在医药、食品和农业领域具有广泛的应用前景。微生物发酵法是PQQ生产的主要方式,解析PQQ生物合成途径及其调控机制,通过代谢工程选育短周期、高产量的生产菌是PQQ工业化的研究方向之一。本文综述了PQQ的合成途径、高产菌株选育以及微生物发酵生产与分离纯化的研发工作,为深入阐释PQQ的生物合成机制和工业化生产菌株的选育提供参考。

关键词：吡咯喹啉醌合成途径菌株选育代谢调控分离纯化

传统发酵酸肉中微生物的分离鉴定及其益生潜力评价

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食品科学 2024年第14期45卷 75-84页

作者：李雪菲潘琼罗慧婷徐宝才李沛军合肥工业大学食品与生物工程学院中国轻工业肉品微生物控制及利用重点实验室安徽合肥230009

为从中式传统发酵肉制品中筛选出益生特性优良的有益菌,以我国贵州部分地区苗族、侗族和布依族的传统发酵酸肉为对象,对其中的微生物进行分离鉴定及益生潜力评价。3种酸肉中共分离出62株细菌,经模拟胃液初筛后得到对胃环境耐受性能良好... 详细信息

为从中式传统发酵肉制品中筛选出益生特性优良的有益菌,以我国贵州部分地区苗族、侗族和布依族的传统发酵酸肉为对象,对其中的微生物进行分离鉴定及益生潜力评价。3种酸肉中共分离出62株细菌,经模拟胃液初筛后得到对胃环境耐受性能良好的12株菌,包括1株香肠伴生乳杆菌、5株植物乳植杆菌、3株腐生葡萄球菌和3株干酪葡萄球菌;其中,香肠伴生乳杆菌KLMM196、植物乳植杆菌KLMM198、腐生葡萄球菌KLMM253、干酪葡萄球菌KLMM307和KLMM313具有良好的消化道环境耐受能力、疏水性和自聚集能力,具有较强的益生潜力,且无溶血活性。

关键词：酸肉分离鉴定乳酸菌凝固酶阴性葡萄球菌益生潜力

高效噬菌体防控食品源单增李斯特菌的研究进展

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现代食品科技 2024年第1期40卷 304-311页

作者：梁馨文刘振杰张菊梅陈谋通吴清平华南农业大学食品学院广东广州510642 广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省微生物安全与健康重点实验室农业农村部农业微生物组学与精准应用重点实验室广东广州510070

单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,简称单增李斯特菌)是一种重要的食源性致病菌,因其具有耐高盐度、宽pH值和宽温度等特点,对食品安全构成了重大威胁。近年来,由于细菌的耐药进化速度惊人,检测与控制食品中的单增李斯特菌... 详细信息

单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,简称单增李斯特菌)是一种重要的食源性致病菌,因其具有耐高盐度、宽pH值和宽温度等特点,对食品安全构成了重大威胁。近年来,由于细菌的耐药进化速度惊人,检测与控制食品中的单增李斯特菌是食品行业和公共卫生部门面临的一项重要挑战。而噬菌体(Bacteriophage,Phage)因其特异性强、安全性好、繁殖速度快等特点,在食品有害微生物防控应用中显示出巨大的潜力。大量的研究报道表明噬菌体作为一种天然、绿色的杀菌剂,在不同种类食品致病微生物防控中具有很好的前景。尽管噬菌体生物防治仍存在宿主谱窄及宿主易产生抗性菌等挑战,但其作为一种安全有效的方法,将在防控食品中的单增李斯特菌发挥重要作用。本文综述了食品中单增李斯特菌噬菌体分离、快速检测与高效防控方面的研究现状,为开发基于噬菌体的高效防控新技术提供参考。

关键词：单增李斯特菌噬菌体食品安全防控检测

一株拮抗单增李斯特菌的蒙氏肠球菌A9-1A筛选及其细菌素抗菌活性分析

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微生物学通报 2024年

作者：叶庆磊张颖刘子豪冯瑞珍蔡佳怡蔡佳张菊梅吴清平陈谋通广东海洋大学水产学院广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省微生物安全与健康重点实验室国家卫健委微生物食品营养与安全科技创新平台

【背景】单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)，简称单增李斯特菌，是一种重要的食源性致病菌，易感人群感染后致死率可达20%-30%。【目的】筛选高效拮抗单增李斯特菌的乳酸菌(Lactobacillus)菌株，并探究其细菌素的理化特性... 详细信息

【背景】单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)，简称单增李斯特菌，是一种重要的食源性致病菌，易感人群感染后致死率可达20%-30%。【目的】筛选高效拮抗单增李斯特菌的乳酸菌(Lactobacillus)菌株，并探究其细菌素的理化特性及对单增李斯特菌的杀伤作用。【方法】采用牛津杯法筛选高效拮抗单增李斯特菌的产细菌素乳酸菌菌株；通过形态特征、16S rRNA基因序列分析及平均核苷酸一致性分析进行菌株分类学鉴定；并进一步分析其细菌素的理化特性；利用激光共聚焦显微镜和扫描电子显微镜表征细菌素粗提物对单增李斯特菌的拮抗作用。【结果】筛选获得一株高效拮抗单增李斯特菌的菌株A9-1A，其抑菌圈大小为37.56 mm，仅对李斯特菌属和粪肠球菌具有拮抗作用，经形态特征、16S rRNA基因和平均核苷酸一致性分析鉴定为蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii)；其产生的细菌素粗提物能够耐受强酸强碱(pH 2.0-11.0)、高温(37-121 ℃)环境，对淀粉酶和脂肪酶不敏感，但对蛋白酶类敏感，最低抑菌浓度为16 μg/mL，激光共聚焦显微镜和扫描电子显微镜结果表明细菌素粗提物通过损伤细胞细胞膜并形成孔洞，造成细胞内容物泄漏，从而杀死单增李斯特菌。【结论】分离筛选到一株高效拮抗单增李斯特菌的产细菌素蒙氏肠球菌A9-1A菌株，其细菌素粗提物具有耐受强酸强碱和高温特性，具有在食品生产过程中高效防控单增李斯特菌污染的潜在应用前景。

关键词：单增李斯特菌蒙氏肠球菌细菌素拮抗机制