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凡纳对虾parkin共调基因和parkin在抗白斑综合征病毒中的表达分析和SNP开发

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渔业科学进展 2025年第1期46卷 194-209页

作者：薛倩李旭鹏李洋栾生罗坤孔杰邢群孟宪红浙江海洋大学水产学院浙江舟山316021 海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所山东青岛266071 青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266237 邦普种业科技有限公司山东潍坊261311

本实验室前期研究中基于全基因组关联分析(GWAS)方法筛选到抗白斑综合征病毒(WSSV)候选基因:parkin共调基因(PACRG)。PACRG与帕金森病相关基因parkin共用一个双向启动子,二者共同参与细胞自噬过程,从而在细胞保护方面发挥作用。本研究... 详细信息

本实验室前期研究中基于全基因组关联分析(GWAS)方法筛选到抗白斑综合征病毒(WSSV)候选基因:parkin共调基因(PACRG)。PACRG与帕金森病相关基因parkin共用一个双向启动子,二者共同参与细胞自噬过程,从而在细胞保护方面发挥作用。本研究对凡纳对虾(Penaeus vannamei)PACRG和parkin在抗WSSV中的功能进行探讨,对其mRNA和氨基酸序列进行特征分析,利用real-timePCR技术检测对虾感染WSSV后不同时间、不同组织中PACRG和parkin的表达水平。通过荧光原位杂交技术(FISH)进行空间定位。利用PCR和Sanger测序技术获得单核苷酸多态性位点(SNP)并进行抗WSSV的关联分析。结果显示,PACRG开放阅读框(ORF)全长600bp,编码199个氨基酸,预测包含一个ParcG结构域。parkinORF序列全长1653bp,编码550个氨基酸,预测包含UBQ、IBR结构域和一个信号肽结构。与多物种进行同源序列比对发现,凡纳对虾PACRG氨基酸序列与日本对虾(Penaeus japonicus)的同源性高达89.70%;凡纳对虾parkin氨基酸序列与中国对虾(Penaeus chinensis)和斑节对虾(Penaeus monodon)的同源性高达93.45%。PACRG和parkin蛋白的保守性较高。感染WSSV后,PACRG和parkin在对虾肝胰腺、鳃、肌肉和眼柄中的表达水平发生显著变化,其中,眼柄中PACRG和parkin表现出极相似的组织表达模式。在肌肉中,PACRGmRNA和WSSV在空间位置上呈现高度重叠状态。结合上述结果,推测PACRG和parkin在凡纳对虾与WSSV的互作中发挥功能。在PACRG中筛选到2个SNP位点,在parkin中筛选到15个SNP位点,其中位于parkin非翻译区(UTR)的5个SNP位点与抗WSSV性状显著相关。本文为研究凡纳对虾抗WSSV的分子机制和抗病分子育种提供了理论依据和参考数据。

关键词：凡纳对虾白斑综合征病毒(WSSV) parkin共调基因(PACRG) parkin基因 SNP

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刺参TRAF7基因克隆及其响应高温胁迫下的表达特征分析

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渔业科学进展 2025年第1期46卷 149-160页

作者：赵岩峰廖梅杰葛建龙王锦锦王印庚荣小军李彬谭颜廷上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业与可持续发展重点实验室山东青岛266071 青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266071

肿瘤坏死因子受体相关因子7(tumor necrosis factor receptor associated factor 7,TRAF7)作为一种细胞内蛋白,参与信号转导,并介导宿主应激防御调控过程。为研究TRAF7在刺参(Apostichopus japonicus)高温胁迫中的作用,本研究利用cDNA... 详细信息

肿瘤坏死因子受体相关因子7(tumor necrosis factor receptor associated factor 7,TRAF7)作为一种细胞内蛋白,参与信号转导,并介导宿主应激防御调控过程。为研究TRAF7在刺参(Apostichopus japonicus)高温胁迫中的作用,本研究利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR),克隆了刺参TRAF7(AjTRAF7)全长cDNA序列,分析了其结构特征和在基因组中的分布,并检测了该基因在刺参不同组织和高温胁迫过程中体壁组织中的表达变化情况。结果显示,AjTRAF7全长2576 bp,开放阅读框(ORF)长1770 bp,5´UTR长345 bp,3´UTR长461 bp,编码589个氨基酸,预测蛋白分子量为65.6 kDa,理论等电点(pI)为7.52。蛋白序列包含1个RING finger结构域、1个Coiled coil结构域和6个WD40结构域,N端包含1个螺旋区域。该基因预测蛋白包含41个丝氨酸磷酸化位点、20个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点,蛋白N端具有3个天冬酰胺糖基化位点。刺参基因组中比对到2个AjTRAF7基因拷贝,第一个拷贝包含18个外显子和15个内含子,第二个拷贝包含17个外显子和14个内含子。系统进化学分析表明,刺参TRAF7氨基酸序列与蝠海星(Patiria miniata)和紫色球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)相似性较高,分别为40.58%和38.37%,刺参与蝠海星和紫色球海胆聚在一支。RT-qPCR结果显示,AjTRAF7在健康刺参各组织中均有表达,其在雌性性腺中表达量最高,体腔细胞中表达量次之,在呼吸树、体壁、肠道、雄性性腺和纵肌中表达量依次降低,各组织间表达量差异显著(P<0.05)。在响应高温胁迫的过程中,与对照组相比,体壁组织中AjTRAF7基因表达量在第2天和第4天显著上升(P<0.05),第6天基因表达开始下降。综上,AjTRAF7基因可能参与刺参应对高温胁迫的表达调控过程,相关结果将为解析刺参应对高温胁迫的分子机制提供科学依据。

关键词：刺参 TRAF7 高温胁迫基因克隆表达特征

贻贝肽对厚壳贻贝稚贝生长发育及微生物群落结构的影响

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渔业科学进展 2025年第1期46卷 115-126页

作者：林倩李政杨金龙马蕃梁箫上海海洋大学水产与生命学院科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 上海市水产动物良种创制与绿色养殖协同创新中心上海201306 中国-葡萄牙星海“一带一路”联合实验室上海200120

为探究海洋生物活性肽对厚壳贻贝(Mytilus coruscus)生长发育的影响,本研究以厚壳贻贝稚贝为实验对象,通过投喂不同浓度的贻贝肽(0、7、9、10、70和90 mg/L),测定壳长、壳高、湿重等指标,以确定最适贻贝肽浓度,并对投喂前后的稚贝微生... 详细信息

为探究海洋生物活性肽对厚壳贻贝(Mytilus coruscus)生长发育的影响,本研究以厚壳贻贝稚贝为实验对象,通过投喂不同浓度的贻贝肽(0、7、9、10、70和90 mg/L),测定壳长、壳高、湿重等指标,以确定最适贻贝肽浓度,并对投喂前后的稚贝微生物群落进行分析,实验周期为56 d。结果显示,相较于未投喂贻贝肽的对照组,投喂9 mg/L的贻贝肽显著促进稚贝生长,且壳长、壳高和湿重分别提升了27.37%、32.35%和115.49%;同时发现,高浓度贻贝肽(70 mg/L和90 mg/L)对厚壳贻贝稚贝产生了致死效应。通过16S rRNA基因扩增和测序对比分析了28 d和56 d贻贝肽投喂组与未投喂组的厚壳贻贝稚贝微生物组群落结构变化。研究结果显示,投喂9 mg/L贻贝肽改变了稚贝微生物群落结构组成,提高了拟杆菌门(Bacteroidota)和变形菌门(Proteobacteria)的丰度,降低了放线菌门(Actinobacteriota)的丰度;同时,属水平分析发现,贻贝肽投喂组有效增加了鲁杰氏菌属(Ruegeria)、黏着杆菌属(Tenacibaculum)、居海杆菌属(Maribacter)、栖砂杆菌属(Arenibacter)、十八碳杆菌属(Octadecabacter)和希瓦氏菌属(Shewanella)等有益菌的物种丰度,显著减少了红球菌属(Rhodococcus)、气单胞菌属(Aeromonas)等潜在致病菌的丰度。综上,贻贝肽能有效促进厚壳贻贝的稚贝生长发育,并且可以优化厚壳贻贝微生物群落结构,研究成果将为后续开展贻贝肽等海洋生物活性肽对贝类稚贝中间培育以及海水贝类养殖可持续发展提供基础和数据支撑。

关键词：厚壳贻贝生长微生物群落结构贻贝肽

电晕休眠对卵形鲳鲹的生理应激和保活运输中主要营养成分的影响

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渔业科学进展 2025年第1期46卷 210-221页

作者：刘思炜钟家美范秀萍秦小明沈建徐文其广东海洋大学食品科技学院广东省水产品加工与安全重点实验室广东省海洋食品工程技术研究中心水产品深加工广东普通高等学校重点实验室广东湛江524088 海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心大连工业大学辽宁大连116034 中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所上海200092

探究电晕休眠对卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)的生理应激指标的影响以及在保活运输过程中主要营养成分的变化,研发绿色、安全、高效的水产品保活运输诱导休眠新技术。采用脉冲直流电对卵形鲳鲹进行电击,以休眠率、休眠时间和72 h存活率... 详细信息

探究电晕休眠对卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)的生理应激指标的影响以及在保活运输过程中主要营养成分的变化,研发绿色、安全、高效的水产品保活运输诱导休眠新技术。采用脉冲直流电对卵形鲳鲹进行电击,以休眠率、休眠时间和72 h存活率作为评价指标,优化脉冲直流电晕休眠的最佳处理条件,并测定其血清、脑组织、肌肉和肝脏生化、氧化应激及代谢指标。结果显示,在20℃水温,140V电压、4 s处理时间的条件下,鱼体休眠率与保活72 h存活率达可达100%,保活时间为(165.6±42.7)h。经电晕休眠处理后,鱼血清中谷草转氨酶(GOT)活性、葡萄糖(GLU)和皮质醇(COR)含量显著升高,在保活4~12h内恢复正常水平;肝脏、脑组织中的热休克蛋白70(Hsp70)含量与谷胱甘肽巯基转移酶(GST-S)活性,肝脏中过氧化氢酶(CAT)活性以及肝脏、肌肉乳酸(LD)含量显著提高,脑组织丙二醛(MDA)含量在保活4~72h内显著低于对照组水平,肝糖原(GLY)含量整体呈下降趋势;鱼肉中粗灰分、粗蛋白和粗脂肪在保活过程中整体呈下降趋势,其中,粗脂肪含量下降幅度最大,且与对照组相比,实验组下降占比减少。研究表明,适宜条件的脉冲直流电能诱导卵形鲳鲹休眠,提高Hsp70的释放和抗氧化酶的活性以减缓保活胁迫下鱼体应激响应,减少组织的损伤,且保活后鱼体能维持较低的代谢水平,可提升保活运输过程中的效率与品质。

关键词：卵形鲳鲹电晕休眠基本营养成分氧化应激

基于细胞色素b基因序列的鲌亚科鱼类系统发育研究

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淡水渔业 2009年第5期39卷 23-27页

作者：冯晓宇谢楠冯建彬许宝青赵金良杭州市农业科学研究院水产研究所杭州310024 杭州水产科技研发中心杭州310024 上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室上海201306

采用特异性引物PCR扩增获得了鲌亚科7属10种鱼类细胞色素b基因的全长序列,初步构建了鲌亚科鱼类的系统发育关系。NJ树和MP树一致表明,鲌亚科鱼类种内所有个体均单独聚群,支持率高;同一属内,除蒙古鲌(Culter mogolicus mongolicus)未能... 详细信息

采用特异性引物PCR扩增获得了鲌亚科7属10种鱼类细胞色素b基因的全长序列,初步构建了鲌亚科鱼类的系统发育关系。NJ树和MP树一致表明,鲌亚科鱼类种内所有个体均单独聚群,支持率高;同一属内,除蒙古鲌(Culter mogolicus mongolicus)未能与同属的翘嘴鲌(Culter alburnus)、青梢鲌(Culter dabryi dabryi)单独聚为一支外,团头鲂(Megalobrama amblycephala)与三角鲂(Megalobrama terminal)、翘嘴鲌与青梢鲌均为姐妹种。NJ、MP树显示鲌亚科鱼类属间关系的支持率都较低,鲂属(Megalobrama)与鳊属(Parabramis)间、鲌属(Culter)与原鲌属(Cultrichthys)间、细鳊属(Rasborinus)与半属(Hemiculterella)、属(Hemiculter)间有较近的亲缘关系,在系统演化关系上,细鳊属、半属、依氏鱼属(Ishikauia)较为原始,鲌属与原鲌属、鲂属与鳊属互为姐妹群,为较特化群。

关键词：鲌亚科鱼类细胞色素b序列系统发育

生物安保保障水产养殖绿色高质量发展:回顾与展望

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渔业科学进展 2025年第1期46卷 161-182页

作者：董宣黄倢海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室(中国水产科学研究院黄海水产研究所)青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室农业农村部海水养殖病害防治重点实验室青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室山东青岛266071

本文综述了生物安保在水产养殖业中的重要性及其对推动产业绿色高质量发展的作用。生物安保作为一种基于风险分析的战略性综合方法,其核心目标在于防控疫病风险,保障行业健康和可持续发展。文章首先阐述了生物安保的概念和发展历史,讨... 详细信息

本文综述了生物安保在水产养殖业中的重要性及其对推动产业绿色高质量发展的作用。生物安保作为一种基于风险分析的战略性综合方法,其核心目标在于防控疫病风险,保障行业健康和可持续发展。文章首先阐述了生物安保的概念和发展历史,讨论了这一概念与生物安全、疫病防控和健康养殖、动物卫生等概念的联系与差别,并提出生物安保、动物卫福和生态干预构成动物卫生三要素,探讨了生物安保体系构建的六大要素和生物安保计划的实施流程。随后,概述了生物安保概念所涉及的关键科学技术问题,介绍了国内外相关科技和政策领域的研究发展现状。接下来,文章讨论了全球和区域性组织在推动水产养殖生物安保战略中的作用,以及不同国家和地区在水产养殖生物安保法规体系构建方面的实践,特别介绍了联合国粮食及农业组织(FAO)和世界动物卫生组织(WOAH)等国际组织重视运用生物安保理念来推动水产养殖的可持续发展。文章进一步讨论了水产养殖企业生物安保分级及其技术内容,以无特定病原(SPF)虾苗培育为例介绍了国外企业生物安保的发展,描述了水产养殖企业生物安保体系构建方法和在对虾育苗场的实践。最后,文章重点指出了中国在水产养殖生物安保方面的挑战和机遇,展望了生物安保战略的发展方向,包括构建国家生物安保中长期发展战略的路线图、强化生物安保相关的研究与教育普及,优先发展种业生物安保,构建高标准生物安保水平上的种业体系,以保障中国水产养殖业的绿色高质量发展。

关键词：生物安保水产养殖疫病防控绿色发展

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二维流场可视化方法对比分析及综述

系统仿真学报 2014年第9期26卷 1875-1881,1888页

作者：王盛波潘志庚杭州师范大学数字媒体与人机交互研究中心杭州310013 吉林禹硕动漫游戏公司高科技研发中心长春130000

流场可视化是科学可视化一个非常热门的子领域,而对于二维流场可视化的研究是扩展到三维或者更高维流场的基础。根据不同作者对二维流体场可视化的不同分类结果,通过整合的方式归纳出直接法、纹理法、线形法、特征法四大类,在查阅近期... 详细信息

流场可视化是科学可视化一个非常热门的子领域,而对于二维流场可视化的研究是扩展到三维或者更高维流场的基础。根据不同作者对二维流体场可视化的不同分类结果,通过整合的方式归纳出直接法、纹理法、线形法、特征法四大类,在查阅近期文献的基础上,加入基于信息论的二维流场可视化新类型,并详细介绍了各个方法的进展情况以及尚存在的困难问题,对各类可视化方法的具体应用也做了介绍,从而形成二维流场可视化方法的综述。在此基础上,介绍几种典型的算法并将他们进行对比分析,并以图表的形式将结果进行说明。

关键词：二维流场信息论可视化对比分析

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钙螯合盐对酸乳饮料稳定性的影响

中国食品添加剂 2015年第9期26卷 130-134页

作者：田芬李罗飞欧凯高兴华金世合张佳佳王银娟吴伟都杭州娃哈哈科技有限公司研发中心杭州310018

选择4种钙螯合盐作为研究对象,采用检测游离钙、粒度分布和离心沉淀率研究其对酸乳饮料体系的影响。游离钙测试结果表明:螯合能力由强到弱顺序为:三聚磷酸钠>柠檬酸钠>六偏磷酸钠>磷酸氢二钠;这四种螯合盐在酸性条件下的螯合能力弱于中... 详细信息

选择4种钙螯合盐作为研究对象,采用检测游离钙、粒度分布和离心沉淀率研究其对酸乳饮料体系的影响。游离钙测试结果表明:螯合能力由强到弱顺序为:三聚磷酸钠>柠檬酸钠>六偏磷酸钠>磷酸氢二钠;这四种螯合盐在酸性条件下的螯合能力弱于中性条件下的螯合能力;粒度结果表明:螯合盐的加入使酸乳饮料的粒度减小,粒度减小趋势与其螯合能力趋势一致;离心沉淀率结果表明:钙螯合盐的加入使酸乳饮料的离心沉淀率显著减小,稳定效果趋势与其螯合能力趋势一致;综上所述:钙螯合能力强的盐使酸乳饮料粒度更小,显著降低了样品的离心沉淀率,提高了酸乳饮料的稳定性。

关键词：钙螯合盐游离钙粒度沉淀率

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无溶剂法合成蔗糖脂肪酸酯的工艺改进研究

食品科技 2002年第3期27卷 47-48页

作者：秦翠群陈永富史之谨袁长贵杭州瑞霖食用化学研发中心 311500

对蔗糖脂肪酸酯的无溶剂法合成工艺进行改进,通过小试得到了较为理想的工艺参数,并在小试中加入了一种新的催化剂。以该组工艺参数合成蔗糖脂肪酸酯可以使产品得率达到50%左右,单酯含量高达65%,各项质量指标均符合国家标准,并已经应用... 详细信息

对蔗糖脂肪酸酯的无溶剂法合成工艺进行改进,通过小试得到了较为理想的工艺参数,并在小试中加入了一种新的催化剂。以该组工艺参数合成蔗糖脂肪酸酯可以使产品得率达到50%左右,单酯含量高达65%,各项质量指标均符合国家标准,并已经应用于生产,取得了良好的效果。

关键词：表面治性剂无溶剂法合成蔗糖脂肪酸酯工艺改进