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凡纳滨对虾热休克蛋白70的原核高效表达

中国水产科学 2006年第2期13卷 305-309页

作者：吴任谢数涛孙勇完颜小青张其中暨南大学水生生物研究所暨南大学水生生物研究所广东广州510632

将凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)热休克蛋白70基因(heat shock protein 70,HSP70)克隆到原核表达载体pET-3c中,经酶切和DNA测序鉴定后,将重组质粒转入表达宿主BL21(DE3),在不同温度、时间下经IPTG诱导表达,收集菌液,进行SDS-PAGE和W... 详细信息

将凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)热休克蛋白70基因(heat shock protein 70,HSP70)克隆到原核表达载体pET-3c中,经酶切和DNA测序鉴定后,将重组质粒转入表达宿主BL21(DE3),在不同温度、时间下经IPTG诱导表达,收集菌液,进行SDS-PAGE和Western blot检测,并用软件Bandscan分析蛋白表达水平。结果表明,成功构建含凡纳滨对虾HSP70基因的重组表达载体pET-3c/HSP70,表达的目标蛋白相对分子量约为72 kD,并能与小鼠抗人HSP70抗体特异性结合。37℃诱导5 h目标蛋白表达量最高;但25℃诱导目标蛋白的可溶性比例达80%,目标蛋白占全菌总蛋白70%以上,均较37℃为高。

关键词：凡纳滨对虾热休克蛋白70 原核表达

龙须菜对邻苯二甲酸二甲酯(DMP)毒性的响应

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中山大学学报（自然科学版） 2007年第5期46卷 88-92页

作者：余江杨宇峰暨南大学水生生物研究所

在实验条件下,研究邻苯二甲酸二甲酯(DMP)暴露对龙须菜生理生化指标的影响。结果显示,在低质量浓度DMP(≤0.1 mg.L-1)下暴露时,叶绿素a(Chla)质量分数随暴露时间的延长呈明显上升趋势,暴露20 d时Chla质量分数(以鲜质量计)为0.193 mg.g-1... 详细信息

在实验条件下,研究邻苯二甲酸二甲酯(DMP)暴露对龙须菜生理生化指标的影响。结果显示,在低质量浓度DMP(≤0.1 mg.L-1)下暴露时,叶绿素a(Chla)质量分数随暴露时间的延长呈明显上升趋势,暴露20 d时Chla质量分数(以鲜质量计)为0.193 mg.g-1,较之对照组上升了27.81%,短时间内(≤5 d)DMP可促进可溶性蛋白质量分数增加(最大值为1.516%),诱导过氧化氢酶(CAT)活性(以鲜质量计)上升(最大值为205.822μ.g-1.m in-1)和丙二醛(MDA)含量下降(最小值为16.54μmol.g-1),促进龙须菜生长;当DMP质量浓度≥0.3 mg.L-1时,Chla质量分数随着DMP质量浓度的升高和暴露时间的延长呈明显下降趋势,高质量浓度DMP组暴露20 d时,Chla质量分数降至0.118 mg.g-1,较之对照组下降了21.85%,DMP引起可溶性蛋白质量分数逐渐降低,抑制CAT活性,并使MDA明显增加,抑制龙须菜生长。DMP暴露20 d内,过氧化物酶(POD)活性随DMP质量浓度的升高和暴露时间的延长持续受到抑制,而谷胱甘肽氧化酶(GSH-PX)活性与暴露时间呈抛物线型时间-效应关系。

关键词：龙须菜邻苯二甲酸二甲酯过氧化氢酶抗氧化

无鱼和贫营养条件下盔形溞对浮游动物群落的影响

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水生态学杂志 2012年第2期33卷 76-84页

作者：程丹李惠明陈晓玲韩博平暨南大学水生生物研究所广东广州510632

为了解无鱼条件下贫营养水体中大型枝角类盔形溞(Daphnia galeata)的种群动态及其对浮游动物群落结构的影响,于2010年3月5日至4月18日在流溪河水库进行围隔试验,设置1个对照组和3个处理组,每个处理有3个重复。对照组(C)为用孔径约2 mm... 详细信息

为了解无鱼条件下贫营养水体中大型枝角类盔形溞(Daphnia galeata)的种群动态及其对浮游动物群落结构的影响,于2010年3月5日至4月18日在流溪河水库进行围隔试验,设置1个对照组和3个处理组,每个处理有3个重复。对照组(C)为用孔径约2 mm的网过滤后的水库水抽入围隔,试验组抽入过滤后的水库水后添加高、中、低密度(H,M,L)的盔形溞,对照组和试验组添加的盔形溞密度梯度分别为0、0.3、0.6、1.0个/L。无鱼条件下盔形溞种群快速形成高峰,但随后由于食物限制又快速下降。盔形溞高密度种群的建立对轮虫种群产生了显著影响,试验开始后轮虫受到盔形溞抑制而密度下降。在试验后期,食物数量下降,盔形溞密度下降并维持在较低的密度,而大型桡足类中的舌状叶镖水蚤(Pyllodiaptomus tunguidus)密度增加,显示了竞争优势。由于大型围隔试验对浮游动物操作的可重复性较差,个别围隔中出现了透明薄皮溞(Leptodora kindti),也对盔形溞种群及浮游动物群落结构产生了影响。

关键词：盔形溞浮游动物群落围隔贫营养

时间分辨荧光免疫一步法检测微囊藻毒素的研究

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环境科学 2007年第4期28卷 872-875页

作者：雷腊梅韩博平宋立荣暨南大学水生生物研究中心广州510632 中国科学院水生生物研究所武汉430072

利用稀土元素Eu^3＋标记微囊藻毒素偶联物MCLR—BSA，在固相包被二抗的微孔板上建立了微囊藻毒素的直接竞争时间分辨荧光免疫法．条件优化后Eu^3＋标记物的稀释度为1：50，微囊藻毒素单抗的合适浓度为100ng／mL．该法对微囊藻毒素检测... 详细信息

利用稀土元素Eu^3＋标记微囊藻毒素偶联物MCLR—BSA，在固相包被二抗的微孔板上建立了微囊藻毒素的直接竞争时间分辨荧光免疫法．条件优化后Eu^3＋标记物的稀释度为1：50，微囊藻毒素单抗的合适浓度为100ng／mL．该法对微囊藻毒素检测的灵敏度为0．02ng／mL，试剂的测量范围是0．05～10ng／mL，回收率达到94％以上．

关键词：微囊藻毒素时间分辨荧光免疫分析检测

珠海地区小型抽水型与非抽水型水库的浮游植物群落结构变化

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热带亚热带植物学报 2009年第1期17卷 54-61页

作者：刘蕾雷腊梅韩博平暨南大学水生生物研究所广州510632

2006年4月、8月、12月对珠海3座抽水型水库和3座非抽水型水库的水质和浮游植物进行采样和测定。抽水型水库和非抽水型水库的浮游植物分别有67种和56种。蓝藻门的假鱼腥藻(Pseudanabaena sp.)、湖丝藻(Limnothrix redekei)和拟柱孢藻(Cyl... 详细信息

2006年4月、8月、12月对珠海3座抽水型水库和3座非抽水型水库的水质和浮游植物进行采样和测定。抽水型水库和非抽水型水库的浮游植物分别有67种和56种。蓝藻门的假鱼腥藻(Pseudanabaena sp.)、湖丝藻(Limnothrix redekei)和拟柱孢藻(Cylindrospermopsis rackiborskii)仅在抽水型水库中检到,而绿藻门的鼓藻(Cosmarium sp.)仅在非抽水型水库中检到。抽水型水库浮游植物种类的季节变化比非抽水型水库明显,且浮游植物的丰度和生物量均高于非抽水型水库。抽水型水库浮游植物丰度在1.25×105～4.38×106c ells L-1之间,以蓝藻和小型绿藻为主;非抽水型水库浮游植物丰度在7.1×104～4.61×106 cells L-1之间,以绿藻门的鼓藻为主。抽水型水库浮游植物的生物量在2.3～8.8mg L-1之间,非抽水型水库浮游植物的生物量在1.3～5.6mg L-1之间。抽水型水库浮游植物的生物量在冬春季高于夏季,而非抽水型水库浮游植物的生物量动态相反。抽水型水库浮游植物的优势种具有明显的季节变化。非抽水型水库浮游植物具有相对稳定的群落季节变化,其优势种的组成较为稳定。对于抽水型水库而言,咸潮前期集中调水入库,不仅改变了水库的营养盐负荷,也改变了水库水动力学的季节动态,这也是导致抽水型与非抽水型水库在浮游植物群落结构与动态上存在明显差别的关键因素。

关键词：浮游植物群落结构抽水型水库华南地区

中华倒刺鲃线粒体细胞色素b基因的遗传多样性分析

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广东农业科学 2011年第24期38卷 1-4页

作者：黄小彧章群马奔司从利暨南大学水生生物研究所广东广州510632

测定了长江支流贵定与干流合江和宜都3个群体57尾中华倒刺鲃细胞色素b基因5＇端971 bp序列以分析其遗传多样性和种群结构。结果发现21个变异位点和13个简约信息位点,检测到14种单倍型,平均单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（Pi）分别为... 详细信息

测定了长江支流贵定与干流合江和宜都3个群体57尾中华倒刺鲃细胞色素b基因5＇端971 bp序列以分析其遗传多样性和种群结构。结果发现21个变异位点和13个简约信息位点,检测到14种单倍型,平均单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（Pi）分别为0.7820和0.0025,表现出较低的遗传多样性。合江群体核苷酸多样性最高（0.0036）,宜都其次,贵定最低。在NJ系统树上没有出现明显的谱系结构和地理聚群,AMOVA分析显示遗传变异主要集中在群体内的个体间（61.16%）。宜都和合江群体间的Fst和Nm值分别为0.0974和4.6329,但贵定群体与合江和宜都群体间的Fst值分别为0.4549、0.4875,Nm值分别为0.5991、0.5256,表明长江干流2个地理群体间遗传分化程度低,可视为一个大的随机交配群体;而支流群体没有遗传变异,且与长江干流群体间出现高度分化,可能是由贵定特殊地理条件使基因交流受阻所致。中性检测表明,宜都群体在约为7.6万-3.0万年前的更新世晚期发生过种群的快速扩张。

关键词：中华倒刺鲃细胞色素b 遗传多样性

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中国秀体溞属常见种类记述

生态科学 2011年第3期30卷 223-228页

作者：陈花林秋奇徐磊韩博平暨南大学水生生物研究所广州510632

秀体溞是枝角类中重要的属,其分类一直存在较大分歧。目前我国秀体溞属有10个种,即短尾秀体溞Diaphanosomabrachyurum Lievin,1848、兴凯秀体溞D.chankensis Ueno,1939、奥氏秀体溞D.orghidani Negrea,1982、模糊秀体溞D.dubiumManujlova,1964、杜蒙特秀体溞D.dumonti Korovchinsky,1996、镰角秀体溞D.excisum Sars,1885、蒙古秀体溞D.mongolianumUeno,1938、多刺秀体溞D.sarsi Richard,1894、大眼秀体溞D.macrophtalma Korovchinsky&Mirabdullaev,1995、热带秀体溞D.tropicum Korovchinsky,1998。在综合现有文献和研究模式标本的基础上,建立了上述10个种的分类检索表,并对我国最为常见的4个种:短尾秀体溞D.brachyurum Lievin,1848、奥氏秀体溞D.orghidani Negrea,1982、模糊秀体溞D.dubium Manujlova,1964、镰角秀体溞D.excisum Sars,1885的形态特征和地理分布进行了详细描述。分析了目前我国与国际在秀体溞分类上的一些异同,讨论了我国秀体溞分类中存在的同名异种或同种异名的问题。

关键词：秀体溞属中国分类形态

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中华鳖线粒体遗传变异的细胞色素b序列分析

广东农业科学 2011年第2期38卷 5-7页

作者：余帆洋章群唐优良周佳怡暨南大学水生生物研究所广东广州510632

测定并分析了长江水系14尾中华鳖(Pelodiscus sinensis)的线粒体细胞色素b基因1 140 bp序列,结合GenBank中下载的3个序列,发现了243个变异位点,61个简约信息位点;A+T含量(60.6%)明显高于G+C含量(39.4%);17个中华鳖序列中共存在10个单倍... 详细信息

测定并分析了长江水系14尾中华鳖(Pelodiscus sinensis)的线粒体细胞色素b基因1 140 bp序列,结合GenBank中下载的3个序列,发现了243个变异位点,61个简约信息位点;A+T含量(60.6%)明显高于G+C含量(39.4%);17个中华鳖序列中共存在10个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.882,核苷酸多态性(Pi)为0.01002。在分子系统树上,17个样本共形成3个谱系,其中长江中下游出现遗传距离为0.023的2个谱系,谱系A由7个单倍型(共14尾)组成,谱系C由2个单倍型(共2尾)组成。韩国1尾单独为谱系B,与A、C谱系之间的遗传距离分别为0.030、0.031。推测3个谱系间分化时间约为5百万年,建议分别加以保护。长江中下游不同地理来源的个体混杂分布,没有形成明显的地理聚群,不同群体间的遗传变异大于群体内的遗传变异。中性检测Tajima’s D和Fu’s Fs均为显著负值,核苷酸不对称分布分析呈多峰型,表明中华鳖未经历过种群扩张。

关键词：中华鳖细胞色素b 遗传变异

基于线粒体COⅠ基因序列的DNA条形码在中国南海绯鲤属鱼类鉴定中的应用

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海洋渔业 2016年第2期38卷 113-119页

作者：宫亚运章群曹艳吕金磊杨喜书暨南大学水生生物研究中心广州510632

为探讨COⅠ基因作为DNA条形码对绯鲤属（Upeneus）鱼类鉴定的有效性,明确物种的分类地位,通过COⅠ基因5＇端652 bp序列研究中国南海绯鲤属的黑斑绯鲤（Upeneus tragula）、马六甲绯鲤（Upeneus moluccensis）、纵带绯鲤（Upeneus subvit... 详细信息

为探讨COⅠ基因作为DNA条形码对绯鲤属（Upeneus）鱼类鉴定的有效性,明确物种的分类地位,通过COⅠ基因5＇端652 bp序列研究中国南海绯鲤属的黑斑绯鲤（Upeneus tragula）、马六甲绯鲤（Upeneus moluccensis）、纵带绯鲤（Upeneus subvittatus）、黄带绯鲤（Upeneus sulphureus）、吕宋绯鲤（Upeneus luzonius）以及条尾绯鲤（Upeneus bensasi）6个种56 ind标本的标准DNA条形码序列的种内种间遗传距离,并构建分子系统树。研究表明：所测样品的碱基组成为T：29.2%,C：29.6%,A：21.4%,G：19.8%,A＋T含量（50.6%）略高于G＋C含量（49.4%）,转换/颠换率为3.08。6种绯鲤属鱼类组成5个自展支持率为100%的分支,其中黑斑绯鲤和马六甲绯鲤混杂分布于同一分支上,其余4种绯鲤独自成支;分支间平均遗传距离10.10%（8.60%~12.40%）,是分支内平均遗传距离0.18%（0.00%~0.30%）的56倍。纵带绯鲤、黄带绯鲤、吕宋绯鲤、条尾绯鲤种间平均遗传距离为10.70%（8.80%~12.40%）,约为这4个种种内平均遗传距离0.125%（0.00%~0.20%）的85倍,种间遗传距离大于种内遗传距离的10倍以上,确定了它们的物种有效性。黑斑绯鲤和马六甲绯鲤种内遗传距离分别为0.40%和0.20%,与其它4种绯鲤为同一水平;但种间遗传距离仅为0.30%,属于一般物种的种内遗传距离范围,因此推测二者或为同一物种,但还需从形态学和基因组序列分析等方面加以进一步确证,其是否受到种间杂交和近期辐射进化的影响也需要今后更多的研究。标准的DNA条形码虽然能够有效地区分中国南海绯鲤属鱼类中的纵带绯鲤、黄带绯鲤、吕宋绯鲤和条尾绯鲤,但DNA条形码对黑斑绯鲤和马六甲绯鲤的鉴定与形态学的鉴定结果不一致,表明在物种鉴定时,母系遗传的线粒体COⅠ基因有时需要结合其它核基因分子标记或生态调查资料加以辅助。

关键词：绯鲤属 DNA条形码 COⅠ基因中国南海