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中华倒刺鲃线粒体细胞色素b基因的遗传多样性分析

Genetic diversity of Spinibarbus sinensis based on mtDNA cytochrome b gene

作     者:黄小彧 章群 马奔 司从利 HUANG Xiao-yu;ZHANG Qun;MA Ben;SI Cong-li

作者机构:暨南大学水生生物研究所广东广州510632 

出 版 物:《广东农业科学》 (Guangdong Agricultural Sciences)

年 卷 期:2011年第38卷第24期

页      面:1-4页

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 071002[理学-动物学] 

基  金:国家自然科学基金(41071034) 暨南大学科研培育与创新基金(21611426) 

主  题:中华倒刺鲃 细胞色素b 遗传多样性 

摘      要:测定了长江支流贵定与干流合江和宜都3个群体57尾中华倒刺鲃细胞色素b基因5'端971 bp序列以分析其遗传多样性和种群结构。结果发现21个变异位点和13个简约信息位点,检测到14种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.7820和0.0025,表现出较低的遗传多样性。合江群体核苷酸多样性最高(0.0036),宜都其次,贵定最低。在NJ系统树上没有出现明显的谱系结构和地理聚群,AMOVA分析显示遗传变异主要集中在群体内的个体间(61.16%)。宜都和合江群体间的Fst和Nm值分别为0.0974和4.6329,但贵定群体与合江和宜都群体间的Fst值分别为0.4549、0.4875,Nm值分别为0.5991、0.5256,表明长江干流2个地理群体间遗传分化程度低,可视为一个大的随机交配群体;而支流群体没有遗传变异,且与长江干流群体间出现高度分化,可能是由贵定特殊地理条件使基因交流受阻所致。中性检测表明,宜都群体在约为7.6万-3.0万年前的更新世晚期发生过种群的快速扩张。

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