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加权共表达网络分析与机器学习识别类风湿关节炎滑膜中的关键基因

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中国组织工程研究 2025年第2期29卷 294-301页

作者：武英楷史高龙谢宗刚苏州大学附属第二医院江苏省苏州市215000 宁阳县第一人民医院山东省泰安市271000

背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物。目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并... 详细信息

背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物。目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并筛选类风湿关节炎患者滑膜中的关键基因,构建类风湿关节炎预测模型并进行验证。方法:从基因表达综合数据库中下载3个包含类风湿关节炎患者滑膜的数据集(GSE77298、GSE55235、GSE55457),GSE77298和GSE55235作为训练集,GSE55457作为测试集,共纳入66个样本,其中类风湿关节炎患者滑膜样本39个,正常滑膜样本27个。应用R语言筛选训练集中的差异基因,然后使用加权共表达网络将训练集中的基因模块化,选出关键模块中的特征基因,将差异表达基因和特征基因取交集,交集基因进入下一步机器学习。采用3种机器学习方法:最小绝对值收敛和选择算子算法、支持向量机-递归特征消除和随机森林算法对交集基因进一步分析获得枢纽基因,将枢纽基因再次相交即得到类风湿关节炎滑膜中的关键基因。以关键基因为变量构建预测类风湿关节炎的列线图模型,推测患者发生类风湿关节炎的危险程度,使用受试者工作特征曲线确定类风湿关节炎预测模型及其关键基因的诊断价值。结果与结论:①通过差异分析,训练集中共筛选出差异基因730个,加权共表达网络分析得到特征基因185个,两者交集基因159个;②最小绝对值收敛和选择算子发现枢纽基因4个,支持向量机-递归特征消除发现枢纽基因11个,随机森林发现枢纽基因5个,取交集后获得关键基因2个(TNS3、SDC1);③基于2个关键基因,在训练集及测试集种构建列线图,其校准预测曲线与标准曲线贴合较好,且预测类风湿关节炎发生的临床效能良好;④上述结果证实,基于生物信息及机器学习算法获得的TNS3和SDC1有可能成为类风湿关节炎诊断和治疗的关键靶点。

关键词：加权基因共表达网络机器学习算法类风湿关节炎关键基因预测模型

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茶叶主要功能性成分的营养健康作用循证研究

上海预防医学 2025年

作者：和智坚李毓萍卜凡崔佳毕馨文崔远捷郭智源李鸣四川大学华西公共卫生学院/华西第四医院华西第二医院临床营养科四川省人民医院临床营养科宜宾市第二人民医院临床营养科

茶叶作为我国传统的营养健康经济作物，在促进人体健康、预防和控制慢性疾病等方面具有一定意义。研究表明，茶叶营养健康功效的发挥得益于其含有丰富的功能性成分，主要包括茶多酚、茶色素、茶多糖、茶氨酸和生物碱等生物活性物质。目... 详细信息

茶叶作为我国传统的营养健康经济作物，在促进人体健康、预防和控制慢性疾病等方面具有一定意义。研究表明，茶叶营养健康功效的发挥得益于其含有丰富的功能性成分，主要包括茶多酚、茶色素、茶多糖、茶氨酸和生物碱等生物活性物质。目前，学界不断开展各种茶叶功能性成分健康作用的动物及人体试验，已经积累了丰富的研究数据和资料。基于此，本文回顾了有关茶叶主要功能性成分营养健康作用的文献，以此为主题采取循证研究的方法，筛选提取相关数据进行定性和定量meta分析，总结归纳茶多酚、茶色素、茶多糖、茶氨酸和生物碱5种茶叶功能性成分的营养健康作用。研究表明，茶多酚、茶色素、茶多糖、茶氨酸和生物碱具有不同的健康功效，在促进人体健康、预防和控制疾病方面有望发挥其独特作用。

关键词：茶功能性成分营养健康作用循证研究 Meta分析

过表达溶质载体家族1成员5和敲低慢病毒载体构建及稳定转染RAW264.7细胞株

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中国组织工程研究 2025年第7期29卷 1414-1421页

作者：郭大鑫范苏苏朱振东侯建红张旋云南省第三人民医院/大理大学第二附属医院云南省昆明市650011 昆明医科大学药学院暨云南省天然药物药理重点实验室/现代生物医药产业学院云南省昆明市650500

背景:溶质载体家族1成员5(solute carrier family 1 member 5,SLC1A5)在多种疾病中发挥了潜在作用,但确切作用机制尚不清楚。构建稳定的SLC1A5过表达和敲低细胞模型可为深入研究SLC1A5在疾病中的确切作用机制以及发现潜在治疗靶点提供... 详细信息

背景:溶质载体家族1成员5(solute carrier family 1 member 5,SLC1A5)在多种疾病中发挥了潜在作用,但确切作用机制尚不清楚。构建稳定的SLC1A5过表达和敲低细胞模型可为深入研究SLC1A5在疾病中的确切作用机制以及发现潜在治疗靶点提供有力的实验工具。目的:构建小鼠SLC1A5过表达和敲低的慢病毒载体,以建立稳定转染的RAW264.7细胞株,为深入探讨SLC1A5在炎症中的作用提供实验基础。方法:根据SLC1A5基因序列设计合成引物并使用聚合酶链反应扩增该基因片段。将目的基因定向接入经Age I/Nhe I酶切的载体质粒GV492中构建重组慢病毒质粒,对阳性克隆进一步筛选后测序比对结果;pHelper1.0质粒载体、pHelper2.0质粒载体、目的质粒载体与293T细胞共同培养并转染,获得慢病毒原液进行包装和滴度测定;在此基础上,通过体外培养RAW264.7细胞,确定嘌呤霉素工作质量浓度;不同滴度的慢病毒分别与RAW264.7细胞共同培养,根据荧光强度确定转染效率;用嘌呤霉素挑选出稳定转染细胞,实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白免疫印迹方法检测稳定转染细胞株的SLC1A5基因和蛋白表达水平。结果与结论:(1)测序序列与目的序列一致提示重组慢病毒载体构建成功;(2)过表达SLC1A5慢病毒的滴度为1×10~9 TU/mL,敲低SLC1A5慢病毒的滴度为3×10~9 TU/mL;(3)确定RAW264.7细胞嘌呤霉素工作质量浓度为3μg/mL;(4)过表达/敲低SLC1A5慢病毒转染RAW264.7细胞的最佳条件皆为HiTransG P转染增强液且感染复数值等于50;(5)过表达SLC1A5稳转细胞株中SLC1A5基因和蛋白的表达量明显上调,而敲低SLC1A5稳转细胞株中SLC1A5基因和蛋白的表达量显著下调。结果表明,成功构建了小鼠SLC1A5过表达和敲低的慢病毒载体并获得稳定转染的RAW264.7细胞株。

关键词：慢病毒载体溶质载体家族1成员5 SLC1A5 过表达敲低 RAW264.7细胞稳转细胞株

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皮肤结核23例临床、病理特征及治疗分析

中国皮肤性病学杂志 2025年第1期 69-77页

作者：陈霄霄赵小娇游霞龙剑何平李昕李爽董锡阳周权朱建建中南大学湘雅医学院附属常德医院(常德市第一人民医院)皮肤性病科中南大学湘雅医学院附属常德医院(常德市第一人民医院)感染科中南大学湘雅医学院附属常德医院(常德市第一人民医院)科教部

目的了解皮肤结核临床、病理特点及治疗情况，为皮肤结核的临床诊疗提供依据。方法纳入2022年3月—2023年9月期间本院皮肤结核共23例患者的临床资料，对患者流行病学、临床病理特征、抗结核治疗的疗效、不良反应以及治疗结束后随访情... 详细信息

目的了解皮肤结核临床、病理特点及治疗情况，为皮肤结核的临床诊疗提供依据。方法纳入2022年3月—2023年9月期间本院皮肤结核共23例患者的临床资料，对患者流行病学、临床病理特征、抗结核治疗的疗效、不良反应以及治疗结束后随访情况进行分析。结果 23例患者中以硬红斑及丘疹性坏死性结核疹多见；12例(52.17%)既往有结核密切接触史、系统结核史。皮肤结核临床表现多样，容易误诊及延迟诊断，其中丘疹性坏死性结核疹最容易误诊(100.00%)。结核相关筛查显示结核菌素试验全部阳性(100.00%)、结核杆菌γ干扰素释放试验阳性22例(95.65%)、肺部CT有19例影像学改变(82.61%),皮肤组织病理主要以上皮细胞肉芽肿形成及多核巨细胞、混合炎症细胞浸润为主，可出现中性粒细胞脓肿，坏死、嗜酸性粒细胞及血管炎改变；最后发现伴发6例肺结核、3例陈旧性肺结核。抗结核治疗方案以2HREZ+4HR及12HRE痊愈率高，疗程不够可出现皮疹及肺结核复发，药物不良反应主要是肝功能异常、皮疹、尿酸升高及白细胞减少。结论皮肤结核需要综合病史尤其是既往结核病史或接触史、皮损特征、组织病理检査、病原学检测和免疫学指标(包括抗酸染色、结核菌素试验、γ干扰素释放实验及结核杆菌聚合酶链反应等)进行确诊，早期识别诊断皮肤结核为结核病的防治起到重要作用，足量足疗程抗结核治疗有效，需要监测不良反应。

关键词：皮肤结核硬红斑临床特征组织病理治疗分析

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血清YKL-40、SOCS3对非小细胞肺癌术后细菌性肺部感染的诊断价值

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中国病原生物学杂志 2025年第1期 25-28+33页

作者：邢静黄志伟中国医科大学附属盛京医院第二胸外科沈阳市第六人民医院消化内一手足外科

目的探究血清几丁质酶-3样蛋白1(YKL-40)、细胞因子信号传导抑制因子3(SOCS3)表达及其对非小细胞肺癌患者术后细菌性肺部感染的诊断价值。方法以本院收治的87例非小细胞肺癌患者为研究对象，根据是否发生细菌性肺部感染分为感染组(n=4... 详细信息

目的探究血清几丁质酶-3样蛋白1(YKL-40)、细胞因子信号传导抑制因子3(SOCS3)表达及其对非小细胞肺癌患者术后细菌性肺部感染的诊断价值。方法以本院收治的87例非小细胞肺癌患者为研究对象，根据是否发生细菌性肺部感染分为感染组(n=42),非感染组(n=45)。采用酶联免疫吸附法测定患者血清YKL-40、SOCS3表达水平；采用Spearman法分析YKL-40、SOCS3与患者CPIS和APACHEⅡ评分的相关性；采用logistic回归分析患者术后发生细菌性肺部感染的影响因素；采用受试者工作特征曲线(ROC)分析YKL-40、SOCS3对非小细胞肺癌患者术后细菌性肺部感染的诊断价值。结果非感染组、感染组患者的CPIS评分、APACHEⅡ评分具有显著差异(P二者联合诊断的曲线下面积为0.962,显著大于YKL-40(Z=1.969,P=0.049)、SOCS3(Z=2.144,P=0.032)单独诊断的曲线下面积。结论非小细胞肺癌术后细菌性肺部感染患者血清YKL-40升高，SOCS3降低，二者联合具有较高的非小细胞肺癌术后细菌性肺部感染诊断价值。

关键词：非小细胞肺癌细菌性肺部感染几丁质酶-3样蛋白1(YKL-40) 细胞因子信号传导抑制因子3(SOCS3)

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改良结扎法用于脊髓损伤造模的优势分析

中国组织工程研究 2025年第2期29卷 379-384页

作者：李道辉徐晓霜李郑涛田新鹏毕航川刘源戴永文陈凌强昆明医科大学第一附属医院骨科云南省昆明市650032 昆明医科大学公共卫生学院云南省昆明市650500 西昌市人民医院四川省凉山彝族自治州615000

背景:目前根据脊髓损伤的损伤方式不同衍生出不同的模型构建方法,传统物理损伤造模方法都有各自的优缺点,尚缺乏较为有效和稳定的脊髓损伤动物模型。目的:建立一种可复制、可调控、创伤小、死亡率低、模型更稳定、适用范围广、术后护理... 详细信息

背景:目前根据脊髓损伤的损伤方式不同衍生出不同的模型构建方法,传统物理损伤造模方法都有各自的优缺点,尚缺乏较为有效和稳定的脊髓损伤动物模型。目的:建立一种可复制、可调控、创伤小、死亡率低、模型更稳定、适用范围广、术后护理时间短的脊髓损伤大鼠模型。方法:将体质量和鼠龄相似的40只SD大鼠随机分为对照组和改良组,每组20只,对照组采用钳夹造模法构建脊髓损伤模型,改良组选用基于压迫法改良的结扎法,在开窗的基础上使用缝线结扎的方法进行脊髓损伤的造模。比较两组大鼠的排尿行为、血尿、脓尿(感染率)、死亡率、脊柱畸形率及术后1,3,5,7 d的BBB运动功能学评分。结果与结论:基于压迫法改良的结扎法建立的脊髓损伤大鼠模型比常规建模方法排尿行为恢复较快、血尿率低、感染率低、死亡率低、脊柱畸形率低,BBB评分结果更集中稳定(1周内均<2分),由此可证明基于压迫法改良的结扎法更适用于脊髓损伤大鼠模型的建立。

关键词：改良脊髓损伤模型钳夹造模法结扎法排尿反射排尿行为脊柱畸形 BBB评分

光谱CT不同单能量图像在头部CT检查患者的应用及对比

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中国实用神经疾病杂志 2025年第1期28卷 73-77页

作者：司武杰何韬陈萍张家奎合肥市第二人民医院安徽合肥230011 安徽医科大学第一附属医院安徽合肥230022

目的探讨光谱CT不同单能量图像在头部CT检查患者的应用并进行效果对比。方法选取2023-06—2024-01因头晕、晕厥、头痛等临床症状就诊的98例患者,所有患者均接受光谱CT头部检查。根据CT检查方法分为单能量组(n=51)和混合能量组(n=47)。... 详细信息

目的探讨光谱CT不同单能量图像在头部CT检查患者的应用并进行效果对比。方法选取2023-06—2024-01因头晕、晕厥、头痛等临床症状就诊的98例患者,所有患者均接受光谱CT头部检查。根据CT检查方法分为单能量组(n=51)和混合能量组(n=47)。单能量组采用单能量图像(40~120keV),根据编入不同的管电压情况,以5 keV为间隔增量,重建为17组不同单能量图像,混合能量组采用常规混合能量图像。比较单能量组和混合能量组脑血管CT值(Willis环、大脑前动脉、大脑中动脉、大脑后动脉)、不同解剖平面下的噪声(胼胝体干部、四叠体池层面、鞍上池层面、垂体层面)、图像硬化伪影区域[CT值、标准差(SD)、信噪比(SNR)、噪声比(CNR)],以及不同单能量图像的图像硬化伪影区域参数。结果单能量组关于Willis环、大脑前动脉、大脑中动脉、大脑后动脉参数值均高于混合能量组(P<0.05)。单能量组关于胼胝体干部、四叠体池层面、鞍上池层面、垂体层面解剖平面下的噪声参数值均低于混合能量组(P<0.05)。单能量组关于硬化伪影区域CT值高于混合能量组,SD、SNR和CNR值低于混合能量组(P<0.05)。在40~120 keV单能量图像中,120 keV图像硬化伪影区域的CT值高于40 keV,SD、SNR、CNR参数值低于40 keV。结论光谱CT可提高头部CT检查患者图像脑血管CT值,降低图像噪声,尤以120 keV图像质量最佳。

关键词：光谱CT 单能量图像混合能量图像头部 CT值图像噪声

马尾神经冗余在腰椎管狭窄症中的临床意义:系统的文献回顾和Meta分析

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颈腰痛杂志 2025年 1067-1078页

作者：邢可刘怡张梦瑶余世林郭庆功南阳市中心医院南阳市第二人民医院洛阳正骨医院信阳市中心医院河南大学第一附属医院

目的评估马尾神经根冗余（RNR）对腰椎管狭窄症（LSS）患者临床评分和康复的影响。方法 2022年3月,在PubMed、Embase、cochrane及知网、万方、维普数据库进行了系统的文献检索。选择前瞻性和回顾性队列研究来评估LSS患者在有RNR证据和... 详细信息

目的评估马尾神经根冗余（RNR）对腰椎管狭窄症（LSS）患者临床评分和康复的影响。方法 2022年3月,在PubMed、Embase、cochrane及知网、万方、维普数据库进行了系统的文献检索。选择前瞻性和回顾性队列研究来评估LSS患者在有RNR证据和没有RNR证据时的临床结果差异。连续型变量计算加权平均差异（WMD）)、二分类变量计算比值比（OR）。结果该研究共纳入了17项研究,2 721例LSS患者。MRI上有RNR证据的LSS患者与RNR-的LSS患者比较,其男、女发生RNR的概率并无差异（P=0.97,OR=1.00,95%CI=[0.85,1.19]）。RNR+的LSS患者年龄较大（P<0.001,MD=4.53,95%CI=2.87,6.19]）、最狭窄处横截面积较小（P<0.001,MD=-20.79,95%CI=-25.48,-16.11]）且上腰段（L1-L4）比例较RNR-的LSS患者高（P=0.002,OR=5.59,95%CI=[1.85,16.95]）、术中出血量较多（P <0.00001,MID=75.45,95%CI=[64.40,86.50]）、术后临床评分（CS）较低（P<0.00001,MD=-3.50,95%CI=[-4.17,-2.83]）、术后恢复率较低（P=0.0001,MD=-9.74,95%CI=[-14.75,-4.74]）;CSA小于100 mm2的狭窄节段数比例较RNR-的LSS患者高（P=0.02,OR=1.51,95%CI=[1.07,2.14]）,症状持续时间更长（P=0.03,MD=13.65,95%CI=1.31,25.99]）。RNR+患者术前腰背部疼痛程度更严重（VAS评分更高）(P=0.08,MD=1.03,95%CI=[-0.11,2.17])、术前ODI评分更高（P=0.07,MD=2.13,95%CI=-0.15,4.41]）,手术时间更长（P=0.05,MD=20.75,95%CI=-0.17,41.67]）,但差异无明显统计学意义。结论与RNR-的LSS患者相比,RNR+的LSS患者年龄较大、最狭窄处狭窄程度更高且上腰段狭窄比例高、术中出血量较多、术后CS评分较低、术后恢复率较低、CSA小于100 mm2的狭窄节段数比例高,症状持续时间更长。因此,马尾神经冗余征现象的出现可以作为LSS患者预后较差的指标。

关键词：马尾神经冗余脊柱腰椎椎管狭窄神经源性跛行腰椎减压术队列研究不良事件 Meta分析

恩替卡韦单用及联合使用聚乙二醇干扰素治疗高病毒载量慢性乙型肝炎患者的疗效观察

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西南医科大学学报 2025年第01期 53-57页

作者：付吉伟徐清浪谢思陶学萍郭声史培祝文涛陶梦雨邬小萍南昌大学第一附属医院感染科北京清华长庚医院肝胆胰中心肝病科萍乡市第二人民医院感染科赣州市第五人民医院重症肝病科肝病研究所

目的观察恩替卡韦(entecavir, ETV)单用及联合使用聚乙二醇干扰素(peginterferon, Peg-IFN)治疗高病毒载量慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B, CHB)患者的疗效。方法该项前瞻性非随机队列研究纳入了2019年12月至2023年12月在南昌大学... 详细信息

目的观察恩替卡韦(entecavir, ETV)单用及联合使用聚乙二醇干扰素(peginterferon, Peg-IFN)治疗高病毒载量慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B, CHB)患者的疗效。方法该项前瞻性非随机队列研究纳入了2019年12月至2023年12月在南昌大学第一附属医院等4家医院接受治疗的152例高病毒载量CHB患者。根据治疗方案将患者分为ETV组102例及Peg-IFN与ETV联合治疗组50例。主要结局指标为48周时乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)表面抗原(hepatitis B virus s antigens, HBsAg)血清清除率。次要结局指标为48周HBsAg下降水平、HBV e抗原(hepatitis B virus e antigens, HBeAg)血清清除率、HBV-DNA阴转率及下降水平以及ALT下降水平。计量资料符合正态分布,两组间比较采用独立样本t检验,治疗前后组内比较采用重复测量方差分析。计数资料两组间比较采用卡方检验,治疗前后组内比较采用Cochran's Q检验多重比较进行统计分析。结果两组患者的ALT、HBV-DNA和HBsAg水平在整个48周治疗期间较治疗前均显著下降(P <0.001)。治疗48周时,ETV组丙氨酸氨基转移酶(30.82±9.86)U/L显著低于联合治疗组(37.57±19.84)U/L(P=0.027);ETV组HBV-DNA和HBsAg水平分别为(1.22±1.17)lg IU/mL和(3.65±0.85)lg IU/mL均显著高于联合治疗组(0.82±0.96)lg IU/mL和(2.62±1.45)lg IU/mL(P=0.034,P <0.001)。ETV组治疗48周时HBeAg和HBV-DNA清除率较治疗前均显著升高(P <0.001),而HBsAg清除率与治疗前差异无统计学意义(P=0.171)。联合治疗组治疗48周时HBsAg、HBeAg和HBV-DNA清除率较治疗前均显著升高(P <0.05)。治疗48周时,ETV组HBsAg和HBeAg血清清除率分别2.0%和13.7%均显著低于联合治疗组12.0%和38.0%(P=0.027,P=0.001);ETV组HBV-DNA清除率89.2%低于联合治疗组94.0%,差异无统计学意义(P=0.509)。结论 Peg-IFN联合ETV治疗方案可作为高病毒载量CHB患者的首选治疗方案。

关键词：慢性乙型肝炎聚乙二醇干扰素恩替卡韦高病毒载量联合治疗