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基于生物信息学分析探索PCDHGB4在肺鳞癌发生中的作用

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中国肺癌杂志 2024年第3期27卷 199-215页

作者：鲁瑞娇谢伊代·阿不都海力力李玉霞宁杰冯阳春新疆医科大学第三临床医学院(附属肿瘤医院)医学检验中心乌鲁木齐830011

背景与目的肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的亚型之一。有报道原钙黏蛋白γ家族的成员能通过抑制Wnt信号通路来调节肿瘤细胞的生长,原钙黏蛋白γ B4 (protocadheri... 详细信息

背景与目的肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的亚型之一。有报道原钙黏蛋白γ家族的成员能通过抑制Wnt信号通路来调节肿瘤细胞的生长,原钙黏蛋白γ B4 (protocadherin-gamma subfamily B4,PCDHGB4)作为家族成员在LUSC中的研究少有报道,本研究旨在通过生物信息学方法探究PCDHGB4在LUSC发生发展中的作用及潜在的预后价值。方法应用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、cBioPortal和UALCAN等数据库,对PCDHGB4在LUSC中的表达与预后、临床病理特征、免疫细胞浸润、免疫调节基因、免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)和甲基转移酶等进行分析。单细胞水平的研究对细胞亚型的聚类结果和PCDHGB4在不同免疫细胞亚群中的表达情况进行了分析。此外,我们还比较了LUSC组织与正常组织中PCDHGB4的启动子甲基化水平,并对其进行了蛋白质-蛋白质相互作用和突变分析。最后基于差异表达基因进行富集分析。结果生信分析结果显示PCDHGB4在LUSC组织的表达水平低于正常组织。生存分析显示,PCDHGB4表达增加与患者较差的预后有关。单细胞分析显示,PCDHGB4主要在T细胞、单核细胞或巨噬细胞以及树突状细胞中表达,进一步发现PCDHGB4在肿瘤免疫中发挥着不可忽视的作用,并证实了PCDHGB4与免疫检查点途径基因、免疫调节基因和甲基转移酶有一定的相关性。此外,通过富集分析发现PCDHGB4参与了癌症相关的多条通路。结论PCDHGB4在LUSC中低表达,PCDHGB4与患者预后不良有关,并且PCDHGB4与肿瘤免疫细胞浸润和通路密切相关。PCDHGB4可能是LUSC潜在的预后标志物和免疫治疗新靶点。

关键词： PCDHGB4 肺肿瘤预后

基于年龄-时期-队列模型的中国哮喘发病和死亡分析

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中国呼吸与危重监护杂志 2024年第8期 546-551页

作者：张超王利泽尹思嘉郑晓桐孙惠昕哈尔滨医科大学附属第一医院重症医学科哈尔滨医科大学肿瘤防治研究所

目的分析1990—2019年中国哮喘的发病和死亡情况，并探讨年龄、时期和队列对哮喘发病和死亡的影响。方法利用全球疾病负担（Global Burden of Disease,GBD）2019数据库，分析1990至2019年中国哮喘发病和死亡情况，应用Joinpoint软件... 详细信息

目的分析1990—2019年中国哮喘的发病和死亡情况，并探讨年龄、时期和队列对哮喘发病和死亡的影响。方法利用全球疾病负担（Global Burden of Disease,GBD）2019数据库，分析1990至2019年中国哮喘发病和死亡情况，应用Joinpoint软件分析标化发病率和标化死亡率的时间变化趋势，计算平均年度变化百分比。构建年龄-时期-队列模型，分析年龄、时期和出生队列对哮喘发病及死亡趋势变化的影响。结果 2019年，中国哮喘发病率为264.44/10万，死亡率为1.74/10万，其中男性发病率（300.94/10万）和死亡率（1.99/10万）均高于女性（226.51/10万和1.49/10万）。1990—2019年，中国哮喘标化发病率有下降趋势，但是趋势无统计学意义（P>0.05），标化死亡率有降低趋势，平均每年下降4.90%，趋势有统计学意义（P所升高。时期效应结果显示，哮喘发病风险呈下降趋势，然后在2015—2019年呈升高趋势，哮喘死亡风险趋势呈下降趋势。队列效应结果显示，出生越晚的人，哮喘的发病和死亡风险越低。哮喘死亡归因于行为风险、高体重指数和烟草有升高趋势，职业风险有降低趋势。结论 1990—2019年，中国哮喘的发病率和死亡率有降低趋势，男性的发病率和死亡率高于女性，哮喘死亡归因于行为风险、高体重指数和烟草的危险因素仍呈升高趋势，应采取相应措施针对重点人群进行早期筛查、早期发现和早期治疗。

关键词：哮喘中国年龄-时期-队列模型发病率死亡率

吉西他滨长疗程维持化疗有助于中国晚期乳腺癌患者生存获益的多中心真实世界研究

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中华肿瘤杂志 2024年第3期46卷 249-255页

作者：岳健宋国红李惠平孙涛宋丽华佟仲生张莉莉宋振川欧阳取长杨谨潘跃银袁芃国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院特需医疗部北京100021 北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所乳腺肿瘤内科、恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室北京100142 中国医科大学附属肿瘤医院、辽宁省肿瘤医院乳腺内科沈阳110042 山东省肿瘤防治研究院、山东省肿瘤医院肿瘤内科、山东第一医科大学山东省医学科学院济南250117 天津医科大学肿瘤医院乳腺内科、国家肿瘤临床医学研究中心、乳腺癌防治教育部重点实验室、天津市肿瘤防治重点实验室、天津市恶性肿瘤临床医学研究中心天津300060 江苏省肿瘤医院、江苏省肿瘤防治研究所、南京医科大学附属肿瘤医院内科南京210009 河北医科大学第四医院乳腺疾病诊疗中心石家庄050011 湖南省肿瘤医院乳腺内科长沙410006 西安交通大学第一附属医院肿瘤内科西安710049 安徽医科大学附属省立医院肿瘤内科合肥230001

目的探讨吉西他滨为主的维持治疗对晚期乳腺癌治疗疗效的影响及影响治疗持续时间的主要原因。方法研究为前瞻性多中心研究,2017年1月至2019年1月期间从10家医疗中心选取接受含吉西他滨单药或联合其他化疗或靶向治疗的晚期乳腺癌患者,收... 详细信息

目的探讨吉西他滨为主的维持治疗对晚期乳腺癌治疗疗效的影响及影响治疗持续时间的主要原因。方法研究为前瞻性多中心研究,2017年1月至2019年1月期间从10家医疗中心选取接受含吉西他滨单药或联合其他化疗或靶向治疗的晚期乳腺癌患者,收集吉西他滨为主方案的治疗线数、剂量、周期数、不良反应、停药原因以及疗效等数据,生存分析采用Kaplan-Meier方法,预后影响因素的单因素分析采用log rank检验,多因素分析采用Cox回归模型。结果研究共筛选全国10家医院共239例晚期乳腺癌患者,最终纳入224例患者进行分析。全组患者中位年龄52岁(26~77岁),其中Luminal型83例,三阴性97例,人表皮生长因子受体2阳性型44例。55.4%(124/224)为绝经后患者。完全缓解(CR)5例,部分缓解(PR)77例,疾病稳定(SD)112例,疾病进展(PD)27例。客观有效率为36.6%(82/224)。Ⅲ级及以上不良反应主要包括白细胞下降(9例)、中性粒细胞下降(49例)、血小板下降(15例)、转氨酶升高(2例)。中位随访时间41个月(26~61个月),中位无进展生存时间(PFS)为5.6个月。引起治疗结束的主要原因包括疾病进展90例、患者个人原因终止治疗51例、严重不良反应不耐受18例、医师评估后治疗结束65例。治疗周期>6个周期较≤6个周期患者在PFS有明显的延长(8.2和5.4个月,HR=2.474,95%CI:1.730~3.538,P<0.001)。结论吉西他滨为主的治疗方案在中国人群中有较好的疗效和耐受性,长程维持治疗有利于改善生存。

关键词：乳腺肿瘤晚期吉西他滨治疗周期生存

三阴性乳腺癌的化疗疗效与肿瘤微环境相关性的研究进展

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中国肿瘤临床 2024年第15期51卷 785-789页

作者：黄愉棉李红玉孙刚新疆医科大学附属肿瘤医院乳腺甲状腺外科乌鲁木齐市830011 新疆肿瘤学重点实验室新疆医科大学附属肿瘤医院乳腺内科新疆维吾尔自治区人民医院乳腺甲状腺外科

三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)明显的肿瘤异质性和多样的肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)特征加大了其研究和治疗的难度。化疗是TNBC治疗的重要手段之一,治疗后疗效预测及化疗耐药仍是临床亟待解决的难题,... 详细信息

三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)明显的肿瘤异质性和多样的肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)特征加大了其研究和治疗的难度。化疗是TNBC治疗的重要手段之一,治疗后疗效预测及化疗耐药仍是临床亟待解决的难题,其中TME的变化是一个主要的原因。了解肿瘤微环境在其中起到的促进作用对这一困境的突破至关重要。本文综合多组学研究的结论,探讨了TNBC临床疗效及化疗耐药与肿瘤微环境相关性的研究进展,为该问题的解决提供可能的方向。

关键词：三阴性乳腺癌肿瘤微环境化疗耐药多组学联合

miR⁃21⁃5p靶向BNC2调控食管癌的恶性生物行为的研究

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海南医学院学报 2024年第16期30卷 1236-1245页

作者：邓雨函阳梦吴振华李卉热则耶·麦麦提祖农孙晓宏新疆医科大学附属肿瘤医院新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学中心实验室新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830011

目的:探讨miR-21-5p靶向肌成纤维细胞的身份转录因子(BNC2)调控食管癌(esophageal cancer,ESCA)细胞增殖、迁移、侵袭机制。方法:应用实时定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)方法检测食管癌组织中miR-21-5P和BNC2的相对表达量并用统计学分析其是否存在表达差异。用miR-21-5p mimics和miR-21-5P inhibitor和阴性对照(NC包括mimcs NC、inhibitor NC)分别转染ECA109、KYSE30两个食管癌细胞系后,进行细胞功能试验CCK8,Transwell等实验方法观察当miR-21-5p过表达或敲低时细胞的增殖、迁移和侵袭能力是否受到影响。通过生物信息学方法预测分析miR-21-5P的靶基因并通过双荧光素酶实验、qRT-PCR和Western blot实验验证miR-21-5p与靶向基因的负向调控关系。结果:qRT-PCR结果显示,相对于癌旁组织,BNC2在食管癌组织中的表达量显著性降低,而miR-21-5P则显著性升高,CCK8、Transwell实验结果显示,当miR-21-5P过表达时,细胞的增殖、迁移和侵袭能力增强,反之细胞功能受到抑制。也就是说,miR-21-5P在食管恶性肿瘤中起着促癌基因的功能作用。通过生物信息学方法预测miR-21-5P的靶基因为BNC2,双荧光素酶实验结果表明miR-21-5P与野生型BNC2′-UTR靶向结合,qRT-PCR和WB实验结果表示在食管癌细胞中,当miR-21-5P过表达时,BNC2的表达量降低,当miR-21-5P被敲低时,BNC2的表达量升高。这些结果显示miR-21-5P与BNC2存在靶向关系。结论:在食管癌中,miR-21-5p直接靶向BNC2,其调节作用可能从而导致癌症的增殖迁移和侵袭作用。

关键词：食管癌 miR⁃21⁃5P BNC2 预后肿瘤微环境

妇科恶性肿瘤患者围术期症状群和核心症状的研究

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护理学杂志 2024年第8期39卷 33-38页

作者：崔秀云宿晶张佳袁菁张雪梅徐春艳新疆医科大学护理学院新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学附属肿瘤医院妇外三科

目的探讨妇科恶性肿瘤患者在围术期不同时间点症状群的构成及动态变化,构建症状网络,探索核心症状,为制定精准的症状管理方案提供参考。方法便利抽样法选取260例妇科恶性肿瘤(宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌)手术患者进行调查,采用一般资... 详细信息

目的探讨妇科恶性肿瘤患者在围术期不同时间点症状群的构成及动态变化,构建症状网络,探索核心症状,为制定精准的症状管理方案提供参考。方法便利抽样法选取260例妇科恶性肿瘤(宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌)手术患者进行调查,采用一般资料调查问卷和中文版安德森症状系列量表-妇科恶性肿瘤围手术期模块分别于手术前1 d(T1)、术后第3天(T2)和术后第7天(T3,即出院前)3个时间点对患者进行纵向调查。对3个时间点中发生率>20%的症状行探索性因子分析提取症状群,运用R语言构建症状网络,分析中心性指标。结果妇科恶性肿瘤患者围术期共提取4个症状群,分别是疲乏-疼痛-情绪症状群、消化道症状群、能量不足症状群和潮热-神经症状群。其中疲乏-疼痛-情绪症状群持续存在于T1~T3,且群内症状组成较稳定。潮热-神经症状群存在于T1~T3、消化道症状群存在于T2和T3、能量不足症状群仅存在于T2,且群内症状组成呈动态变化。症状网络中,悲伤和苦恼是围术期3个时间点的核心症状,其他中心性指标动态变化。T1除悲伤外,潮热的紧密中心性和中介中心性最大,T2恶心、T3疲乏的紧密中心性和中介中心性最大。结论医护人员应对稳定存在的症状群及核心症状进行全程干预,将症状群与网络中心性指标相结合,制定更为精准的管理方案,改善患者围术期生活质量。

关键词：妇科恶性肿瘤宫颈癌卵巢癌子宫内膜癌症状群核心症状症状网络症状管理

基于临床和PET/CT影像组学的机器学习模型预测Ⅲ期NSCLC患者同步放化疗预后价值

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中华肿瘤防治杂志 2024年第11期31卷 683-692页

作者：刘会岭劳咪刘广升崔永斌张亚琳尹勇王若峥滨州市人民医院肿瘤科新疆医科大学附属肿瘤医院放疗中心滨州市人民医院放疗科山东省肿瘤防治研究院(山东省肿瘤医院)放射物理技术科山东第一医科大学(山东省医学科学院)

目的探讨基于PET/CT图像的机器学习模型预测Ⅲ期非小细胞肺癌(NSCLC)患者同步放化疗(CCRT)预后的潜在价值。方法选取2019-01-01-2021-12-31山东省肿瘤医院诊治的100例Ⅲ期NSCLC患者为研究对象,按7:3比例随机分为训练集(70例)和验证集(30... 详细信息

目的探讨基于PET/CT图像的机器学习模型预测Ⅲ期非小细胞肺癌(NSCLC)患者同步放化疗(CCRT)预后的潜在价值。方法选取2019-01-01-2021-12-31山东省肿瘤医院诊治的100例Ⅲ期NSCLC患者为研究对象,按7:3比例随机分为训练集(70例)和验证集(30例),采用单因素和多因素Cox回归分析筛选临床特征,最小绝对收缩和选择算子(LASSO)算法筛选PET和CT影像组学特征,并构建临床模型、影像组学模型、联合模型以及列线图,采用受试者工作曲线、校准曲线、决策曲线分析以及Kaplan Meier曲线评价性能。结果训练集影像组学评分(RS)中位数为0.21,训练集生存曲线显示高风险组(RS≥0.21)与低风险组(RS<0.21)生存差异有统计学意义,χ^(2)=8.661,P=0.003;验证集高风险组(RS≥0.21)与低风险组(RS<0.21)生存差异有统计学意义,χ^(2)=5.833,P=0.016。多因素Cox回归分析结果显示吸烟史(HR=0.405,95%CI为0.205~0.800,P=0.009)、淋巴结分期(HR=1.717,95%CI为1.013~2.908,P=0.045)、免疫巩固治疗(HR=0.443,95%CI为0.223~0.877,P=0.019)是Ⅲ期NSCLC患者无进展生存期(PFS)的独立预后因素。采用筛选的3个临床特征构建临床模型,以免疫巩固治疗分层,单因素Cox回归分析显示肺免疫预后指数(LIPI)与Ⅲ期NSCLC序贯免疫巩固治疗患者PFS有关联(P=0.028)。临床模型、影像组学模型、联合模型在训练集中预测PFS的曲线下面积(AUC)分别为0.674、0.771和0.803;验证集中预测PFS的AUC分别为0.655、0.670和0.710。决策曲线分析表明联合模型对Ⅲ期NSCLC生存预测优于临床或影像组学模型。结论PET/CT影像组学较好地实现了Ⅲ期NSCLC患者放化疗后的生存预测,联合模型预测效能最佳,可视化的列线图可辅助临床决策。

关键词：非小细胞肺癌同步放化疗正电子发射计算机断层显像/计算机断层扫描影像组学无进展生存期

基于铜死亡相关长链非编码RNA的子宫颈癌预后模型构建及药物敏感性分析

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实用肿瘤杂志 2024年第2期39卷 111-123页

作者：张玉俊赵璇朱琳地力亚尔·吾斯曼江王岩新疆医科大学公共卫生学院新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830011 新疆医科大学附属肿瘤医院医务科新疆乌鲁木齐830000

目的基于铜死亡相关长链非编码RNA(cuproptosis-related long noncoding RNA,CRL)构建子宫颈癌预后模型并分析不同风险组间药物敏感性差异,为子宫颈癌患者预后预测及个体化治疗提供理论依据。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome ... 详细信息

目的基于铜死亡相关长链非编码RNA(cuproptosis-related long noncoding RNA,CRL)构建子宫颈癌预后模型并分析不同风险组间药物敏感性差异,为子宫颈癌患者预后预测及个体化治疗提供理论依据。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载304例子宫颈癌患者的基因表达谱、突变数据和临床数据,使用随机抽样的方法将患者分为训练集(n=152例)和测试集(n=152)。采用Pearson相关性分析鉴定CRL。应用单因素Cox、LASSO和多因素Cox回归分析在训练集中构建CRL风险评分模型,在测试集和整个队列中进行验证,并根据风险评分中位数将训练集和测试集患者分为高风险组(训练集76例和测试集83例)和低风险组(训练集76例和测试集69例)。使用Kaplan-Meier(K-M)生存分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、单因素与多因素Cox回归和主成分分析(principal component analysis,PCA)评估CRL风险评分模型,并构建结合临床病理特征和CRL风险评分模型的列线图和校准曲线。通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探索该模型的潜在分子机制。使用Spearman相关分析探讨免疫细胞浸润与风险评分之间的相关性。绘制子宫颈癌患者基因突变图谱,分析CRL风险评分模型与体细胞变异之间的相关性。分析免疫治疗药物的敏感性和20种化疗药物在不同风险群体中的半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)值差异。结果共获得704个CRL,经单因素Cox、LASSO和多因素Cox回归分析最终构建包含6个CRL(AC103591.4、AC021851.1、MNX1-AS1、FAM27E3、AL603832.1和AC097505.1)的风险评分预测模型。K-M生存曲线、ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)和PCA分析均验证该模型具有良好的预测能力。多因素Cox回归显示,CRL风险评分可作为独立预后因子(P0,均P肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)比较,差异无统计学意义(P>0.05)。药物敏感性分析结果显示,免疫治疗药物细胞毒T淋巴细胞相关抗原4对低风险组患者疗效较好,阿卡地新、二甲基草酰甘氨酸、多柔比星、索拉非尼和阿糖胞苷5种药物的IC50值在高低风险组间比较,差异均具有统计学意义(均P<0.05)。结论 6个CRL的风险评分特征可独立预测子宫颈癌患者的预后,有助于阐明子宫颈癌中CRL的机制,并为患者临床个体化治疗提供理论指导。

关键词：子宫颈癌铜死亡长链非编码RNA 药物敏感性

基于UPLC-QE-Orbitrap-MS/MS和网络药理学探讨肉苁蓉水提物治疗糖尿病肾病的作用机制

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天然产物研究与开发 2024年第7期36卷 1242-1256,1141页

作者：刘天华耿若愚赵耀王百才马冲杨建华胡君萍新疆医科大学药学院乌鲁木齐830017 新疆医科大学第一附属医院乌鲁木齐830054

探究肉苁蓉水提物(the aqueous extract of Cistanche tubulosa,AECT)化学成分和AECT治疗糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的作用机制。利用UPLC-MS/MS对化合物进行分析鉴定;借助PubChem、GeneCards、OMIM、DAVID等数据库预测有效成分防治DN的作用靶点及通路,对核心基因进行GO、KEGG富集分析,并使用Cytoscape软件构建“成分-靶点-通路”可视化网络图。MTT法测定AECT的抗DN活性;生化试剂盒检测过氧化指标超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性和谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxide,GSH-Px)含量水平;ELISA法检测炎症因子白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor-α,TNF-α)和转化生长因子(transforming growth factor-β,TGF-β)水平;Annexin V-FITC/PI法检测细胞凋亡率;Western blot检测相关蛋白的表达。从AECT中共鉴定出84个化学成分,并推测出15个化合物可能的裂解途径;筛选出AECT治疗DN的70个潜在靶点和多个信号通路。体外实验发现AECT能够增加高糖高脂环境中的HK-2细胞存活率抑制细胞凋亡;并上调SOD活性和GSH-Px含量,抑制炎症因子IL-1β、TNF-α和TGF-β表达水平;Western blot结果证明AECT影响PI3K-AKT信号通路。本研究初步探明了AECT中的主要有效成分及其治疗DN的潜在靶点与作用机制,为AECT治疗DN后续的深入研究提供思路。

关键词：肉苁蓉 UPLC-QE-Orbtrap-MS/MS 化学成分分析网络药理学实验验证