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昆明市一起聚集性发热疫情中腺病毒3型Penton base、Hexon和Fiber基因遗传进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 241-248页

作者：刘艳艳古文鹏段忠文王钰龚娇茶琦雁吴林蔚侯敏昆明市疾病预防控制中心微生物检验科昆明650228 云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所昆明650022 昆明市呈贡区疾病预防控制中心检验科昆明650500 玉溪市疾病预防控制中心卫生监测检验科玉溪678400

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton bas... 详细信息

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton base、Hexon和Fiber三个重要基因全长序列扩增、测定和分型鉴定,构建系统进化树,开展分子变异、遗传进化等分析。结果共采集5份标本,均检出呼吸道腺病毒及流感嗜血杆菌。对腺病毒进行Nanopore三代基因测序最终均获得Penton base、Hexon和Fiber基因全长编码区核苷酸序列,5份标本之间3个基因核苷酸相似性依次为100.0%、99.9%~100.0%和100.0%,氨基酸同源性均为100.0%;与HAdV3原型株(AY599834)核苷酸相似性最高,分别为98.6%、98.7%和98.9%。系统发育分析表明,3个基因系统进化树分析结果基本一致,人腺病毒3型(HAdV3)原型株单独一支,本研究中HAdV3序列均划分在同一进化分支上,与较早年份国外及中国台湾毒株亲缘关系较远,与近年国内外毒株亲缘关系较近,与2019年日本株(LC703523)和中国广州株(MZ540961)高度同源。与原型株比较分析昆明HAdV3氨基酸突变位点,Penton base有5处变异;Hexon有10处变异;Fiber有11处变异。结论本起疫情中的腺病毒在Penton base、Hexon和Fiber基因全长序列中型别分型结果一致,为P3H3F3型,与包括原型株在内的国内外HAdV3毒株显示出非常小的遗传变异。与原型株相比发生了多处氨基酸位点突变,并且多数氨基酸位点变异发生在蛋白质的高变区或功能区,其中Hexon蛋白中M7L为昆明序列独有氨基酸突变位点。

关键词：人腺病毒3型五邻体基座蛋白六邻体蛋白纤维蛋白遗传进化

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感染性腹泻流行趋势的研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 274-280页

作者：孙振璐刘国胜赵丽丽高巧王雪岩烟台市疾病预防控制中心烟台264003 莱州市疾病预防控制中心莱州261400

感染性腹泻是由多种病原体引起,广泛存在于世界各地的胃肠道感染性疾病。也是当今全球最重要的公共卫生问题之一,是引起全球5岁以下儿童死亡的第二大原因。感染性腹泻的病原体包含病毒性腹泻病原体、细菌性腹泻病原体和寄生虫相关病原... 详细信息

感染性腹泻是由多种病原体引起,广泛存在于世界各地的胃肠道感染性疾病。也是当今全球最重要的公共卫生问题之一,是引起全球5岁以下儿童死亡的第二大原因。感染性腹泻的病原体包含病毒性腹泻病原体、细菌性腹泻病原体和寄生虫相关病原体。而与病毒性腹泻相关的病原体是最主要的诱因,主要有诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、札如病毒等。诱发细菌性腹泻的主要病原体有致泻性大肠埃希菌、沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌、弯曲菌等。本文针对感染性腹泻的流行趋势、病原谱变化进行综述,目的是掌握我国感染性腹泻的分布及流行特征,为制定防控策略、减轻疾病负担提供参考。

关键词：病原体感染性腹泻病原谱流行特征

基于主成分-TOPSIS的黄河流域山东段农村环境卫生综合评价

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 61-67页

作者：张晓杨绪廷高衍新杜英林江媛媛孙文石峰山东省疾病预防控制中心公共卫生监测评价所济南250014

目的基于2021年山东省农村环境卫生监测项目工作指标,对黄河流域山东段农村环境卫生进行综合评价,识别发展短板,探讨改善策略。方法基于主成分—逼近理想解排序(TOPSIS)分析法,根据山东省2021年农村环境卫生监测工作方案,在现有的农村... 详细信息

目的基于2021年山东省农村环境卫生监测项目工作指标,对黄河流域山东段农村环境卫生进行综合评价,识别发展短板,探讨改善策略。方法基于主成分—逼近理想解排序(TOPSIS)分析法,根据山东省2021年农村环境卫生监测工作方案,在现有的农村环境卫生监测体系中,选择13个沿黄河流域区县作为研究对象,同时以其他12个非沿黄河流域区县为对照,选择9个正向高优指标拟合评价模型,采用单个评价指标与最优理想解的标准化距离对黄河流域山东段农村环境卫生进行综合评价。结果从监测指标中筛选出9个核心指标用于主成分分析,分别为全县农民人均年纯收入(万元)、年度农村人均纯收入(万元)、县级农村环境卫生投入(万元)、农村环境卫生综合整治项目创建率(%)、环境卫生管理制度建设率(%)、卫生厕所普及率(%)、集中式供水覆盖率(%)、农村生活垃圾转运率(%)、农村生活污水转运率(%);经主成分分析,农村环境卫生监测项目评价指标可以用3个主成分表示,分别为经济状况、卫生管理、基础卫生设施,其特征值λ分别为2.109、2.076和1.349,累计贡献率为61.486%。利用TOPSIS欧式距离计算各区县综合评价指数,综合评价指数前5位的区县为黄河流域的桓台县和寿光市(0.705,0.665),非黄河流域的荣成市、兖州市、高密市(0.758,0.687,0.662)。变异系数最大的为黄河流域区县经济状况评价指数(0.481),最小的为黄河流域农村环境卫生管理评价指数(0.114)。结论黄河流域区县的优势在于其较好的农村环境卫生管理和基础卫生设施建设,但黄河流域区县经济状况对其综合评价指数的贡献低于非黄河流域区县。

关键词：农村环境卫生主成分-逼近理想解排序分析法黄河流域综合评价

重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件溯源调查和病原分析

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中国食品卫生杂志 2024年第5期36卷 595-600页

作者：王文斟聂术君李志峰王红段刚廖春艳王玲雷小念重庆市疾病预防控制中心重庆400042 重庆市巴南区疾病预防控制中心重庆401320

目的对重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件进行实验室病原学分析。方法按照食品安全国家标准(GB 4789.4—2016)对11株沙门菌分离株进行生化和血清型鉴定;使用微量肉汤稀释法进行药敏测试;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)... 详细信息

目的对重庆市某高校一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件进行实验室病原学分析。方法按照食品安全国家标准(GB 4789.4—2016)对11株沙门菌分离株进行生化和血清型鉴定;使用微量肉汤稀释法进行药敏测试;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和全基因测序(WGS)进行分子分型、毒力和耐药基因分析。结果11株沙门菌全部为鼠伤寒沙门菌;在测试的15种抗生素中,所有菌株仅对四环素耐药;所有菌株的PFGE带型一致;WGS鉴定与血清学表型实验结果一致,所有菌株均携带2个四环素类耐药基因和10个毒力岛;溯源分析结果显示所有菌株的ST型相同,wgSNP进化树显示所有菌株可聚为一簇。结论11株鼠伤寒沙门菌序列高度同源,说明患者、环境和食品分离株来源相同,结合流行病学调查结果判定此次食源性疾病暴发事件是由食品加工人员使用器皿生熟不分引起食品污染所致。

关键词：鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳全基因组测序毒力岛耐药基因

极端高温天气与宜昌市居民非意外死亡关系时间分层病例交叉分析

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中国公共卫生 2024年第10期 1169-1175页

作者：明小燕韩阳杨忠诚王早霞谢曙光范传刚宜昌市疾病预防控制中心赤壁市疾病预防控制中心湖北省疾病预防控制中心

目的分析极端高温天气与湖北省宜昌市居民非意外死亡的关系,为降低居民非意外死亡的风险提供参考依据。方法收集宜昌市疾病预防控制中心死因系统记录的宜昌市城区2014年1月1日—2022年12月31日46 170例非意外死亡者的相关数据以及同... 详细信息

目的分析极端高温天气与湖北省宜昌市居民非意外死亡的关系,为降低居民非意外死亡的风险提供参考依据。方法收集宜昌市疾病预防控制中心死因系统记录的宜昌市城区2014年1月1日—2022年12月31日46 170例非意外死亡者的相关数据以及同期宜昌市城区5个国控环境空气质量自动监测站每日的污染物监测数据和城区气象数据,采用时间分层病例交叉设计通过条件logistic回归模型分析温度不低于研究期间平均温度的P92.5且持续1 d(P92.5-1d)、温度不低于研究期间平均温度的P92.5且持续2 d(P92.5-2 d)、温度不低于研究期间平均温度的P92.5且持续3 d(P92.5-3 d)、温度不低于研究期间平均温度的P95.0且持续1d(P95.0-1 d)、温度不低于研究期间平均温度的P95.0且持续2 d(P95.0-2 d)、温度不低于研究期间平均温度的P95.0且持续3 d(P95.0-3 d)、温度不低于研究期间平均温度的P97.5且持续1 d(P97.5-1 d)、温度不低于研究期间平均温度的P97.5且持续2 d(P97.5-2 d)和温度不低于研究期间平均温度的P97.5且持续3 d(P97.5-3 d)共9种极端高温事件对宜昌市居民非意外死亡风险的影响。结果湖北省宜昌市46 170例非意外死亡者的病例天数为46 170 d,匹配的对照天数为157 134 d;宜昌市46 170例非意外死亡者中,P92.5-1d死亡3 371例（7.30%）,P92.5-2d死亡3 041例（6.59%）,P92.5-3 d死亡2 597例（5.62%）,P95.0-1 d死亡2 436例（5.28%）,P95.0-2d死亡2 205例（4.78%）,P95.0-3 d死亡1 960例（4.25%）,P97.5-1 d死亡1 343例（2.91%）,P97.5-2 d死亡1 148例（2.49%）,P97.5-3 d死亡882例（1.91%）;在排除了湿度（RH）、细颗粒物(PM2.5)、可吸入颗粒物(PM10)、二氧化硫（SO2）、二氧化氮（NO2）、臭氧（O3）、一氧化碳（CO）以及死亡者性别、年龄等因素的影响后,时间分层病例交叉分析结果显示,P92.5-1 d、P92.5-2 d、P92.5-3 d、P95.0-1 d、P95.0-2 d、P95.0-3 d、P97.5-1 d、P97.5-2 d和P97.5-3 d等9种极端高温事件均与宜昌市居民非意外死亡风险呈正相关且关联具有滞后性,除P92.5-2 d和P92.5-3 d极端高温事件的作用持续到Lag3 d外,其他7种极端高温事件的作用均持续到Lag1 d,9种极端高温事件均以Lag0 d的效应值为最大,分别为P92.5-1 d（OR=1.09,95%CI=1.04～1.14）、P92.5-2 d（OR=1.08,95%CI=1.03～1.14）、P92.5-3 d（OR=1.11,95%CI=1.05～1.16）、P95.0-1 d（OR=1.15,95%CI=1.09～1.22）、P95.0-2 d（OR=1.17,95%CI=1.10～1.24）、P95.0-3 d（OR=1.17,95%CI=1.10～1.25）、P97.5-1 d（OR=1.23,95%CI=1.15～1.32）、P97.5-2d（OR=1.27,95%CI=1.18～1.38）和P97.5-3 d（OR=1.31,95%CI=1.19～1.43）;分层分析结果显示,极端高温事件对宜昌市居民非意外死亡的影响在性别亚组和年龄亚组中依然存在,男性和女性居民均以P97.5-3 d的Lag0 d效应值为最大,分别为男性（OR=1.36,95%CI=1.21～1.54）和女性（OR=1.24,95%CI=1.08～1.43）,高年龄组居民对极端高温事件更为敏感,P92.5-1 d、P92.5-2 d和P92.5-3 d极端高温事件仅对70～79岁和≥80岁年龄组居民非意外死亡有显著影响,P92.5-1 d在Lag0 d的效应值分别为70～79岁（OR=1.17,95%CI=1.06～1.29）和≥80岁（OR=1.19,95%CI=1.10～1.29）,P92.5-2 d在Lag0 d的效应值分别为70～79岁（OR=1.15,95%CI=1.05～1.28）和≥80岁（OR=1.22,95%CI=1.12～1.32）,P92.5-3 d在Lag0 d的效应值分别为70～79岁（OR=1.15,95%CI=1.04～1.29）和≥80岁（OR=1.23,95%CI=1.13～1.34）。结论极端高温天气可增加宜昌市居民非意外死亡的风险。

关键词：非意外死亡极端高温关系时间分层病例交叉分析宜昌市

2013至2018年中国成人肥胖年均增长率及防控重点人群研究

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中华心血管病杂志 2024年第1期52卷 34-41页

作者：赵振平张梅李纯于梦婷张笑王丽敏周脉耕中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心慢病危险因素监测室北京100050 中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心北京100050

目的了解中国2013至2018年18岁及以上居民肥胖年均增长率和防控重点人群。方法本研究为横断面研究,选取2013和2018年中国慢性病及危险因素监测调查的对象,通过调查问卷、现场测量的方式,收集并分析中国31个省(自治区、直辖市)人群的肥... 详细信息

目的了解中国2013至2018年18岁及以上居民肥胖年均增长率和防控重点人群。方法本研究为横断面研究,选取2013和2018年中国慢性病及危险因素监测调查的对象,通过调查问卷、现场测量的方式,收集并分析中国31个省(自治区、直辖市)人群的肥胖流行率及增长率,以及肥胖控制措施及饮食、锻炼和药物控制措施占比情况。成人肥胖定义采用体重指数≥28.0 kg/m^(2)的标准。结果 2013年入选174 736人,男性74 704人(42.8%),年龄为(51.5±14.2)岁;2018年入选179 125人,男性79 337人(44.3%),年龄为(55.1±13.8)岁。2013至2018年中国18岁及以上居民肥胖年均增长率为3.2%[不确定区间(UI):2.7%~3.6%],男性肥胖年均增长率[5.2%(UI:4.6%~5.9%)]高于女性[0.9%(UI:0.5%~1.3%)]。18至29岁居民[7.4%(UI:6.9%~7.9%)]、大学(大专)及以上受教育水平[6.3%(UI:5.5%~7.1%)]、未婚人群[11.2%(UI:10.2%~12.1%)]的肥胖年均增长率高于其他亚组人群。2013至2018年,海南省肥胖年均增长率最高。除山西、湖南、甘肃和宁夏回族自治区外,其他省(自治区、直辖市)2013至2018年的成人肥胖率均在增长。肥胖人群中,采取体重控制措施的人群占比从2013年22.6%增加至2018年的32.7%。结论我国不同人群、区域肥胖增长特征差异明显,各地肥胖防控重点应各有侧重。

关键词：肥胖症流行率中国

一起由Omicron变异株BA.2进化分支引起的本土聚集性疫情流行病学特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 65-70页

作者：贺兆锴王哲考庆君程实冯爽赵婷婷陶焱炀于新芬孙昼杭州市疾病预防控制中心传染病防制所杭州310021 杭州市疾病预防控制中心卫生检验中心杭州310021 杭州市疾病预防控制中心健康危害因素监测所杭州310021

应用描述性流行病学方法,对2022年3月杭州市发生在余杭区物流园区的新型冠状病毒感染本土聚集性疫情的流行病学特点进行分析。此次聚集性疫情由1例发热门诊主动就诊的病例发现,疫情历时8 d,共发现病例58例,其中男性40例,女性18例;年龄为... 详细信息

应用描述性流行病学方法,对2022年3月杭州市发生在余杭区物流园区的新型冠状病毒感染本土聚集性疫情的流行病学特点进行分析。此次聚集性疫情由1例发热门诊主动就诊的病例发现,疫情历时8 d,共发现病例58例,其中男性40例,女性18例;年龄为(33.29±12.22)岁;工人53例,学生2例,农民、老师和待业人员各1例;主要分布在杭州市的余杭区(48例,82.77%)和上城区(7例,12.07%)。实时再生数最高是在3月10日为2.31,于3月15日降至0.37。指示病例测序结果与韩国2022年3月4日上传的1条序列100%同源。

关键词：新型冠状病毒聚集性疫情 Omicron变异株流行病学特征

2018—2022年中国内地老年人群食源性疾病主动监测结果分析

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中国食品卫生杂志 2024年第5期36卷 613-620页

作者：范鹏辉章荣华霍翔林黎蒋玉艳马晓晨刘弘刘志涛褚遵华梁进军胡晴文刘继开韩海红李薇薇国家食品安全风险评估中心北京100022 浙江省疾病预防控制中心浙江杭州310051 江苏省疾病预防控制中心江苏南京210009 四川省疾病预防控制中心四川成都610041 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西南宁530028 北京市疾病预防控制中心北京100013 上海市疾病预防控制中心上海200336 云南省疾病预防控制中心云南昆明650022 山东省疾病预防控制中心山东济南250014 湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410005

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧... 详细信息

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌和诺如病毒的检测,进行流行病学特征分析。结果老年人群急性胃肠炎病例粪便标本总体检出率为9.15%(7218/78904,95%CI:8.95%,9.35%),以沙门菌最高(3860/78699,4.90%,95%CI:4.75%,5.06%),其次为诺如病毒(1517/73173,2.07%,95%CI:1.97%,2.18%)、致泻大肠埃希菌(1.39%,1015/72763,95%CI:1.31%,1.48%)、副溶血性弧菌(1.00%,782/78386,95%CI:0.93%,1.07%)和志贺菌(0.19%,147/78611,95%CI:0.16%,0.22%)。老年人群男性沙门菌检出率高于女性,而女性副溶血性弧菌检出率高于男性,且年龄越大,检出率越低。老年人群各监测病原检出率具有明显季节性,沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌检出率在7、8月达到高峰,诺如病毒则在2、3月达到高峰,各地区监测病原检出率有所不同,差异具有统计学意义(χ^(2)=546.85,P监测病原流行病学特征有所不同,应根据对应特征分布制定针对性措施预防老年人食源性疾病发生。

关键词：食源性疾病急性胃肠炎主动监测老年人沙门菌诺如病毒副溶血性弧菌致泻大肠埃希菌志贺菌

江苏省滨海县3~5月龄婴儿接种吸附无细胞百白破联合疫苗后局部不良反应主动监测分析

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中国公共卫生 2024年第2期40卷 139-142页

作者：张鹏梅茂冬于佳魏明伟王小山潘红星吴中区疾病预防控制中心苏州215000 滨海县疾病预防控制中心盐城224500 江苏省疾病预防控制中心南京210000

目的通过对婴儿接种吸附无细胞百白破联合疫苗(diphtheria,tetanus and acellular pertussis combined vaccine,DTaP)后局部不良反应的主动监测,评价婴儿接种DTaP的安全性。方法于2020年7月—2021年3月,对在江苏省滨海县东坎镇、陈涛... 详细信息

目的通过对婴儿接种吸附无细胞百白破联合疫苗(diphtheria,tetanus and acellular pertussis combined vaccine,DTaP)后局部不良反应的主动监测,评价婴儿接种DTaP的安全性。方法于2020年7月—2021年3月,对在江苏省滨海县东坎镇、陈涛镇、界牌镇、滨海现代农业产业园4个乡镇卫生院接种DTaP的3~5月龄婴儿局部不良反应进行主动监测,并按照《预防用疫苗临床试验研究不良事件分级标准指导原则》(2019年第102号)对发生的局部不良反应进行分级,用描述流行病学方法进行局部不良反应分析。结果共有2 490人次纳入至本次DTaP接种后局部不良反应主动监测分析中。DTaP接种后,局部不良反应1 009例次,总发生率为40.52%,其中局部硬结和红晕发生率最高,分别为14.4%和17.0%。1级局部不良反应发生率为35.9%(893/2 490),其中硬结和红晕占比最高,分别占38.18%(341/893)和42.89%(383/893);2级局部不良反应发生率为4.66%(116/2 490),其中红晕和触痛占比最高,分别占34.48%(40/116)和26.72%(31/116);未见3级及以上局部不良反应。局部不良反应多发生在DTaP接种后3d内,占总发生率的98.0%(988/1 009)。硬结和红晕的发生率在3个不同厂家(A、B、C厂家)DTaP受种儿间差异有统计学意义(P 0.05)。结论硬结、红晕和肿胀为3~5月龄婴儿DTaP接种后发生的主要局部不良反应。

关键词：吸附无细胞百白破联合疫苗不良反应主动监测婴儿