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皮肤黑色素瘤差异表达基因的生物信息学分析及调控中药预测

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中草药 2024年第2期55卷 551-562页

作者：王梓霞黄羽欣谢锦楠王沐瑶王文辉广州中医药大学第二临床医学院广东广州510006 广州中医药大学第一临床医学院广东广州510499 广州中医药大学东莞医院广东东莞523000

目的通过生物信息学技术分析皮肤黑色素瘤患者皮肤组织与非癌皮肤组织的基因表达微阵列数据,筛选出皮肤黑色素瘤的差异表达基因,预测可用于诊断和治疗皮肤黑色素瘤的生物标志物及潜在中药。方法从基因表达数据库(Gene Expression Omni... 详细信息

目的通过生物信息学技术分析皮肤黑色素瘤患者皮肤组织与非癌皮肤组织的基因表达微阵列数据,筛选出皮肤黑色素瘤的差异表达基因,预测可用于诊断和治疗皮肤黑色素瘤的生物标志物及潜在中药。方法从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)提取GSE3189、GSE114445、GSE46517基因芯片,使用GEO2R工具筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。利用DAVID数据库对DEGs进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析;使用String数据库构蛋白-蛋白互作网络,应用Cytoscape软件及其插件筛选PPI网络中关键基因,应用GSCA数据库进行关键基因的突变分析。通过Gepia 2.0数据库结合癌症基因组图谱数据集(Cancer Genome Atlas,TCGA)对关键基因进行生存分析。根据度(degree)值和生存分析结果综合筛选出核心基因(集),应用GSCA数据库对核心基因(集)进行泛癌分析和免疫浸润分析,并使用TIMER 2.0数据库对核心基因分别进行免疫浸润分析。使用Coremine Medical数据库预测作用于关键基因的潜在中药。结果共筛选出DEGs 114个,其中上调基因36个,下调基因78个。上调DEGs主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号等通路,下调DEGs主要富集在细胞黏附、细胞增殖的正调控等方面。15个关键基因为EGFR、KPNA2、GATA3、AURKA、TYMS、PKP1、SPP1、MMP1、KLF4、EPCAM、KIF23、DTL、CLDN1、LCP2、FGFR2,其中共3个基因KPNA2、AURKA、DTL被视为核心基因(集)。潜在治疗中药有丹参、人参、构皮、高良姜、甘草、蓖麻子、油桐叶等。结论皮肤黑色素瘤中关键基因的突变以FGFR2的错义突变为主,突变方式多为胞嘧啶(C)向胸腺嘧啶(T)的转换。EGFR、KPNA2、GATA3、AURKA、PKP1、DTL、LCP2对皮肤黑色素瘤的生存预后存在显著影响。核心基因集在多种癌症中显著上调,并与自然调节性T细胞(natural regulatory T-cells,nTreg)细胞、树突状细胞、单核细胞等免疫细胞的浸润有关。潜在调控中药包括补虚药、清热解毒药、拔毒生肌药、消肿拔毒药、温里药、健脾利湿药、利水渗湿药、活血化瘀药、安神药9类,在相关古籍中存在对应的中医内外治经验记载,其中药活性成分亦被证明对皮肤黑色素瘤存在一定的调控和抑制作用。

关键词：皮肤黑色素瘤差异表达基因核心基因中药预测生物信息学丹参人参构皮高良姜甘草蓖麻子油桐叶

电针通过调控ILC2功能和白色脂肪棕色化治疗肥胖大鼠的作用机制

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World Journal of Acupuncture-Moxibustion 2024年第2期34卷 138-146页

作者：陈剑坤吴苑李文珍黄梦芬黄彬谢长才李际强卢月陈裕中医湿证国家重点实验室广州中医药大学第二附属医院广州511400 广州中医药大学第二临床医学院广州511400 广州中医药大学针灸康复临床医学院广州511400 广州中医药大学广州511400

Objective:To observe the effects of electroacupuncture(EA)on type 2 innate lymphoid cell(ILC2)function in white adipose tissue(WAT)of high-fat diet(HFD)-induced obese rats to reveal the mechanism underlying weight ***:Male Winstar rats(n=15)were randomly divided into control,HFD,and HFD+EA groups,with five rats in each *** obesity model was established by feeding rats with a ***(2 Hz,1 mA)was applied to"Zhongwan(CV12)"bilateral"Tianshu(ST25)""Zusanli(ST36)"and"Sanyinjiao(SP6)"for15 min,7 days a week,for a total of 5 *** EA treatment,the HFD group was fed a HFD,whereas rats in the control group were maintained on a normal *** was no intervention in either the control or the HFD *** weight was measured ***-field adipocyte morphology,adipocyte volume,and the number of abdominal WAT were observed under a microscope after sectioning and hematoxylin and eosin *** levels of IL-5(interleukin-5),IL-13(interleukin-13),IL-33(interleukin-33),and ST2(growth stimulating gene 2 protein)in the WAT were assayed using enzymelinked immunosorbent assay and reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR).The expression levels of browning markers including PGClα(peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha),PPARγ(peroxisome proliferator-activated receptor gamma),PRDM16(histone-lysine Nmethyltransferase),and UCP1(uncoupling protein 1 in WAT were detected by western blot analysis and ***:After a 7-week induction period,rats in both the HFD and HFD+EA groups were 20%heavier than their initial weights before modeling(P<0.01,P<0.001).Following a 5-week EA intervention,the body mass and Lee index of obese rats were significantly reduced(P<0.05).The HE results showed that adipocytes in the HFD group displayed a significant increase in diameter and a decrease in number compared to the control ***,in the HFD+EA group,white adipocytes exhibited reduced diameter and appeared more regular i

关键词： Obesity Type 2 innate lymphoid cells Browning Adiposetissue Electroacupuncture

miR-140-5p/BCL2L1在HFOB1.19凋亡、自噬中的作用及补肾健脾活血方的影响

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中国中药杂志 2024年

作者：陈桐莹付赛李小韵刘树华杨贻富杨东升曾韵杰李扬博罗丹黄宏兴万雷广州中医药大学广州中医药大学岭南医学研究中心中医骨伤科学实验室广州中医药大学第二附属医院广州中医药大学第三附属医院

骨质疏松症(osteoporosis，OP)是一种骨重建与骨形成失衡的老年性骨病，补肾健脾活血方针对肾虚脾虚血瘀的病机，以补肾健脾活血为法，对治疗OP有显著效果，微核糖核酸（microRNA，miRNA)、B细胞淋巴瘤-2样蛋白1（B-cell lymphoma-2-lik... 详细信息

骨质疏松症(osteoporosis，OP)是一种骨重建与骨形成失衡的老年性骨病，补肾健脾活血方针对肾虚脾虚血瘀的病机，以补肾健脾活血为法，对治疗OP有显著效果，微核糖核酸（microRNA，miRNA)、B细胞淋巴瘤-2样蛋白1（B-cell lymphoma-2-like protein 1，BCL2L1）与骨细胞代谢密切相关，故该研究采用双荧光素酶法、聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）法检测miR-140-5p与BCL2L1的结合情况；沉默或过表达miR-140-5p后，流式检测、蛋白免疫印迹（Western blot）观察人胎成骨细胞（human fetal osteoblast cell line1.19，HFOB1.19）凋亡与自噬的发生与成骨功能；大鼠灌胃补肾健脾活血方后制备含药血清，采用不同浓度的补肾健脾活血方含药血清分别干预含或不含miR-140-5p micmi的HFOB1.19，观察各组细胞的成骨蛋白表达，研究miR-140-5p/BCL2L1在HFOB1.19凋亡、自噬中的作用，并观察补肾健脾活血方对其的影响。研究发现，双荧光素酶检测显示miR-140-5p与BCL2L1结合；流式检测、Western blot检测结果显示miR-140-5p促进HFOB1.19细胞凋亡且miR-140-5p抑制HFOB1.19细胞自噬；高、中、低剂量补肾健脾活血方含药血清干预HFOB1.19后，与miR-140-5p NC组对比，miR-140-5p micmic组的成骨蛋白骨钙蛋白（osteocalcin，OCN）、骨桥蛋白（osteopontin，OPN）、Runt相关转录因子2(Runt-related transcription factor 2，RUNX2)、转化生长因子β1（transforming growth factor beta 1，TGF-β1）表达下降，而高剂量干预下的micmic组骨形成蛋白2（bone morphogenetic protein 2，BMP2）表达无明显差别。故miR-140-5p/BCL2L1可促进HFOB1.19凋亡与抑制自噬的发生，补肾健脾活血方可通过BMP2影响miR-140-5p的抑成骨作用。

关键词：骨质疏松症补肾健脾活血方 miR-140-5p BCL2L1 凋亡自噬

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阶梯整群随机试验的统计分析方法介绍

中国循证医学杂志 2024年第3期24卷 355-363页

作者：董昱黄闪闪赵梦娇张侨曾婧纯陆丽明广州中医药大学针灸康复临床医学院广州510000 广州中医药大学华南针灸研究中心临床研究与大数据实验室广州510000 广州中医药大学第一附属医院康复中心广州510405

阶梯整群随机试验(SW-CRT)是近年来出现的、主要应用于公共卫生政策领域的一种整群随机对照试验方法,逐渐引起卫生领域工作者的关注。而目前在国内外,这一试验方法的应用尚不广泛,样本量估算和统计学分析存在多种方式。本文介绍阶梯整... 详细信息

阶梯整群随机试验(SW-CRT)是近年来出现的、主要应用于公共卫生政策领域的一种整群随机对照试验方法,逐渐引起卫生领域工作者的关注。而目前在国内外,这一试验方法的应用尚不广泛,样本量估算和统计学分析存在多种方式。本文介绍阶梯整群随机试验原理、类别、与传统随机对照试验的差异,概述样本量估算及统计分析方法。总体而言,SW-CRT以群组、交叉设计、多个时间点的结果测量为特点;在样本量估算方面,需区分群组大小相同及不同的情况,常用的样本量估算程序可在Stata、R、SAS软件及固定的在线网站中实现,包括“Steppedwedge”程序、“swCRTdesign”程序、“Swdpwr”程序、“CRTpowerdist”程序、“Shiny CRT Calculator”工具等;依据SW-CRT的设计特点,在统计分析中,研究者还应该考虑时间效应、重复测量的混杂因素,常以广义线性混合模型(GLMM)和广义估计方程(GEE)分析方法为主。然而以上模型多数基于横断面研究提出,目前还缺少针对队列设计及存在过渡期的SW-CRT的统计方法,未来仍需开展更为全面的方法学探索。

关键词：阶梯整群随机试验 SW-CRT 交叉设计样本量计算统计分析

基于多元数据挖掘分析彭胜权治疗岭南地区慢性乙型病毒性肝炎的用药规律

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时珍国医国药 2024年第5期35卷 1235-1240页

作者：刘兴华林禧方梦冰林长峰林兴栋广州中医药大学第三附属医院广东广州510378 广州中医药大学第三临床医学院广东广州510000 广州中医药大学第二临床医学院广东广州510000 广州中医药大学温病学教研室广东广州510405

目的基于多元数据挖掘技术探讨彭胜权教授治疗慢性乙型病毒性肝炎的用药规律,以传承其治疗该病的临床经验和学术思想。方法收集并整理彭胜权教授治疗慢性乙型病毒性肝炎的医案处方,运用中医传承辅助平台系统(V2.5)、IBM SPSS Statistics... 详细信息

目的基于多元数据挖掘技术探讨彭胜权教授治疗慢性乙型病毒性肝炎的用药规律,以传承其治疗该病的临床经验和学术思想。方法收集并整理彭胜权教授治疗慢性乙型病毒性肝炎的医案处方,运用中医传承辅助平台系统(V2.5)、IBM SPSS Statistics 24.0、IBM SPSS Modeler 18.0、Cytoscape 3.8.0、Rstudio R 4.2.3等软件,采用多元数据挖掘方法统计分析。结果分析纳入的273首处方得出药物210种,性味以苦、寒为主,入肝经为最,包括甘草、柴胡、白芍、茯苓、枳实等高频次中药,关联规则分析显示,白芍-甘草、柴胡-甘草为常用药对,并衍生出9首潜在新方,聚类分析得到药组6个,因子分析共提取出10个公因子,可分为五类,分别为疏肝理气类、活血化瘀类、滋阴清热类、益气健脾类和通络止痛类。结论彭胜权教授治疗慢性乙型病毒性肝炎有规律可循,以四逆散为基础方加减变化,多用入肝经之苦寒药,采用疏肝理气、清热解毒、活血化瘀治法的同时不忘健脾化痰,虚实兼顾,标本同治。

关键词：彭胜权岭南温病学派慢性乙型病毒性肝炎用药规律多元数据

基于HIF1A/EZH2/ANTXR2通路探讨罗氏内异方治疗子宫内膜异位症大鼠的作用机制

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中药新药与临床药理 2024年第7期35卷 993-1000页

作者：裴芳利贾金金陈晓鑫林树红林增娴吴李征曾诚广州中医药大学第一附属医院广东广州510405 广州中医药大学广东广州510006

目的基于缺氧诱导因子1A(HIF1A)/zeste增强子同源物2(EZH2)/炭疽热毒素受体2(ANTXR2)信号通路探讨罗氏内异方(又名益母调经化瘀合剂)对子宫内膜异位症(EMs)大鼠在位子宫内膜增殖及血管生成的干预作用及机制。方法将SD大鼠随机分为伪手... 详细信息

目的基于缺氧诱导因子1A(HIF1A)/zeste增强子同源物2(EZH2)/炭疽热毒素受体2(ANTXR2)信号通路探讨罗氏内异方(又名益母调经化瘀合剂)对子宫内膜异位症(EMs)大鼠在位子宫内膜增殖及血管生成的干预作用及机制。方法将SD大鼠随机分为伪手术组、模型组、达那唑组(4.2 g·kg^(-1))及罗氏内异方低、高剂量组(15.74、31.48 g·kg^(-1)),每组8只。采用自体子宫内膜移植联合多因素干预法复制气滞血瘀型EMs病证结合大鼠模型。灌胃给药,每天1次,连续28 d。采用HE染色法观察子宫内膜组织病理变化;免疫组化法检测子宫内膜组织中增殖细胞蛋白67(Ki67)和血小板内皮细胞黏附分子1(CD31)蛋白表达水平;qRT-PCR及Western Blot法检测子宫内膜组织中HIF1A、EZH2、ANTXR2 mRNA及蛋白表达水平;Western Blot法检测子宫内膜组织中Yes关联蛋白1(YAP1)、吞噬细胞糖蛋白1(CD44)、β-连环蛋白(β-catenin)蛋白表达水平。结果与伪手术组相比,模型组大鼠在位子宫内膜组织上皮细胞增厚,间质细胞排列紊乱,炎性细胞增多;子宫内膜组织中Ki67、CD31的表达水平均显著升高(P<0.01),HIF1A、ANTXR2 mRNA及蛋白表达水平均显著升高(P<0.01),而EZH2 mRNA及蛋白表达水平显著下降(P<0.01),YAP1、CD44及β-catenin蛋白表达水平均显著升高(P<0.01)。与模型组比较,各给药组大鼠在位子宫内膜组织上皮层变薄,间质部细胞紊乱和炎症浸润均有改善,子宫内膜组织中Ki67、CD31的表达水平均显著降低(P<0.01);达那唑组与罗氏内异方高剂量组大鼠子宫内膜组织中HIF1A、ANTXR2 mRNA及蛋白表达水平均明显降低(P<0.05,P<0.01),EZH2 mRNA及蛋白表达水平明显升高(P<0.05,P<0.01);各给药组大鼠子宫内膜组织中YAP1、CD44及β-catenin蛋白表达水平均显著降低(P<0.05,P<0.01)。结论罗氏内异方可通过抑制在位子宫内膜细胞的增殖及血管生成能力来发挥治疗EMs的作用,其机制可能与抑制HIF1A/EZH2/ANTXR2信号通路有关。

关键词：子宫内膜异位症罗氏内异方益母调经化瘀合剂在位子宫内膜细胞增殖血管生成 HIF1A/EZH2/ANTXR2信号通路大鼠

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中医时令运气主象病机钩玄

中华中医药杂志 2024年第6期39卷 2835-2839页

作者：江启煜孙晓生广州中医药大学广州510405

如何把握气血阴阳升降的趋势是辨证论治的思维本质。中医“天人相应”理论初步揭示了时令与人体气血阴阳相呼应的关系,文章从十二月建的时令节气、五行术数、六经阴阳的本源角度,探索各时令对应的主象病机及治法,并以此用于指导中医临... 详细信息

如何把握气血阴阳升降的趋势是辨证论治的思维本质。中医“天人相应”理论初步揭示了时令与人体气血阴阳相呼应的关系,文章从十二月建的时令节气、五行术数、六经阴阳的本源角度,探索各时令对应的主象病机及治法,并以此用于指导中医临床辨证用药及方剂筛选比较。本研究是对中医时间医学思维模型的发展和重塑,是中医时空辨证领域的创新,在一定程度上弥补了运气学说的不足。

关键词：时间医学运气学说病机三阴三阳治则治法

从糖脂代谢的“物质-能量-信息流”认识“脾气散精”输布过程

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中华中医药杂志 2024年第2期39卷 571-575页

作者：林传权陈姗姗李伟豪许舒婷黄嘉雯高永史亚飞潘华峰广州中医药大学广州510405

《黄帝内经》认为“脾气散精”是精微物质代谢的关键环节,但对其输布过程认识尚不明确,缺乏具象化和系统化的深入理解,中医脾藏象理论研究成果转化受限。生命是物质、能量和信息的统一,糖脂代谢过程离不开“物质-能量-信息流”的有机序... 详细信息

《黄帝内经》认为“脾气散精”是精微物质代谢的关键环节,但对其输布过程认识尚不明确,缺乏具象化和系统化的深入理解,中医脾藏象理论研究成果转化受限。生命是物质、能量和信息的统一,糖脂代谢过程离不开“物质-能量-信息流”的有机序贯协调,“脾气散精”输布过程与糖脂代谢“物质-能量-信息流”的内涵相契合。为此,在糖脂代谢的“物质-能量-信息流”视域下,笔者探寻并再认识了“脾气散精”输布过程的科学内涵,更系统、具体地描绘了“脾气散精”输布过程的物质代谢、能量转化和信息调整的生理特征。结果提示调节“脾气散精”的“物质-能量-信息流”治疗糖脂代谢紊乱具备良好的可行性,有利于推动中医脾藏象理论研究连片化、系统化和实用化。

关键词：脾气散精糖脂代谢物质流能量流信息流输布脾藏象理论

胫骨平台下低密度区骨量及体积对下肢力线影响的有限元分析

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中国修复重建外科杂志 2024年第6期38卷 734-741页

作者：韩龙飞林天烨何敏聪何晓铭詹芝玮陆舜曾子俊林锟田佳庆侯文渊魏腾飞魏秋实广州中医药大学第三临床医学院广州510405 广东省中医骨伤研究院广州510378 广州中医药大学第三附属医院关节中心广州510378 中医证候全国重点实验室/骨科广州中医药大学第三附属医院广州510378

目的采用有限元分析胫骨平台下低密度区骨量及体积对下肢力线的影响,为临床上胫骨平台下骨量减少的膝关节骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)患者预防下肢力线内移合并膝关节内翻提供力学证据。方法选取1名健康成人为研究对象,获取其X... 详细信息

目的采用有限元分析胫骨平台下低密度区骨量及体积对下肢力线的影响,为临床上胫骨平台下骨量减少的膝关节骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)患者预防下肢力线内移合并膝关节内翻提供力学证据。方法选取1名健康成人为研究对象,获取其X线片和CT影像数据并导入Mimics 21.0软件,重建完整膝关节模型及3个体积相等、形态不同的胫骨平台下低密度区模型,导入Solidworks 2023软件中进行模型装配、验证。分别构建胫骨平台下低密度区骨量减少22%、33%、44%、55%、66%的5个KOA有限元模型及骨量减少66%的低密度区模型等比例缩放81%、90%、100%、110%、121%的5个KOA有限元模型。根据生理状态下人体下肢负荷情况,胫、腓骨远端设置完全固定,在股骨头表面主要负重区施加沿下肢力线方向、大小为1860 N的轴向压强载荷,利用有限元分析软件Abaqus 2022计算分析胫骨平台内侧最大应力及胫骨皮质骨、松质骨最大位移,进而预测下肢力线改变趋势。结果构建的KOA模型符合下肢正常解剖结构。在相同边界条件、相同载荷情况下,随着胫骨平台下低密度区骨量逐渐减少,以及胫骨平台下低密度区体积逐渐增大,胫骨内侧平台最大应力及胫骨皮质骨、松质骨最大位移均随之增大,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论胫骨平台下出现低密度区提示膝内翻及下肢力线内移可能性增加,且低密度区体积和骨量减少程度是关键促发因素,可指导临床医生提前预防,避免膝内翻发生。

关键词：膝关节骨关节炎下肢力线低密度区膝内翻有限元分析