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探讨自噬相关基因介导乳腺癌预后及免疫浸润的潜在机制及干预中药预测

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中草药 2024年第13期55卷 4463-4477页

作者：钟悦王志宇杨博文王能广州中医药大学基础医学院广东广州510006 广东省中医证候临床研究重点实验室广东广州510120 粤港澳中医药与免疫疾病研究联合实验室广东广州510120 省部共建中医湿证国家重点实验室(广州中医药大学第二附属医院) 广东广州510120

目的利用生物信息学研究乳腺癌自噬相关分子模式和肿瘤微环境免疫细胞浸润特征,同时预测具有潜在治疗作用的中药。方法从TCGA和GEO数据库下载乳腺癌数据,从UCSC Xena数据库获得乳腺癌拷贝数相关数据。使用R语言和Perl分析乳腺癌自噬相... 详细信息

目的利用生物信息学研究乳腺癌自噬相关分子模式和肿瘤微环境免疫细胞浸润特征,同时预测具有潜在治疗作用的中药。方法从TCGA和GEO数据库下载乳腺癌数据,从UCSC Xena数据库获得乳腺癌拷贝数相关数据。使用R语言和Perl分析乳腺癌自噬相关基因在肿瘤组织和癌旁组织表达以及自噬相关基因的拷贝数情况。通过单因素Cox分析、Kaplan-Meier生存分析、最小绝对收缩和选择算子(logistic least absolute shrinkage and selection operator,Lasso)分析、受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)、列线图构建自噬相关预后模型并评估其预后价值。利用基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)、京都百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)和CIBERSORT算法,探索其在乳腺癌中的潜在生物学功能和免疫细胞浸润情况。在此基础上,将关键基因导入SymMap数据库获取相关中药,采用Cytocaspe构建“中药-成分-靶点”网络图,并通过体外实验验证代表性自噬相关中药对乳腺癌细胞增殖及侵袭的影响。结果大部分自噬相关基因在乳腺癌肿瘤组织和癌旁组织中有表达差异和拷贝数变异,其中肿瘤蛋白P53(tumor protein P53,TP53)的突变频率最高。构建的自噬相关预后模型提示高风险乳腺癌患者预后更差。通过ssGSEA、ESTIMATE和CIBERSORT进一步表明,所建立的模型可能对免疫细胞丰度、免疫细胞类型等产生影响。此外,预测结果提示调控乳腺癌自噬的中药功效以清热解毒、活血化瘀、补阳类为主,药性以辛、苦、甘、寒为主,主要归肝、肺、胃经。实验验证进一步表明,清热解毒药白花蛇舌草、活血化瘀药郁金、补阳药肉苁蓉/淫羊藿可通过调控自噬活性抑制乳腺癌发展。结论自噬指示乳腺癌不良预后,并与肿瘤免疫浸润密切相关。调控乳腺癌自噬的中药以清热解毒、活血化瘀、补阳类为主,为乳腺癌的免疫和中医药治疗提供新的方向。

关键词：生物信息学自噬调控乳腺癌预后肿瘤微环境白花蛇舌草郁金肉苁蓉淫羊藿

仙芪青龙方治疗咳嗽变异性哮喘肺肾两虚、风盛挛急证的随机、阳性对照、非劣效性临床试验

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中医杂志 2024年第20期 2109-2115页

作者：陈晓纯杨建雅肖晶旻范斐婷周明娟吴蕾林琳陈远彬广州中医药大学第二临床医学院/省部共建中医湿证国家重点实验室河南中医药大学第一附属医院广东省中医院广东省中医证候临床研究重点实验室

目的评价仙芪青龙方治疗咳嗽变异性哮喘肺肾两虚、风盛挛急证患者的临床疗效和安全性。方法采用随机、阳性对照、非劣效临床试验设计，将102例咳嗽变异性哮喘肺肾两虚、风盛挛急证患者随机分为治疗组52例和对照组各50例。治疗组给予... 详细信息

目的评价仙芪青龙方治疗咳嗽变异性哮喘肺肾两虚、风盛挛急证患者的临床疗效和安全性。方法采用随机、阳性对照、非劣效临床试验设计，将102例咳嗽变异性哮喘肺肾两虚、风盛挛急证患者随机分为治疗组52例和对照组各50例。治疗组给予仙芪青龙方颗粒口服，每日1剂，每次2袋（9.25 g/袋），每日2次，早晚餐后服用；对照组给予口服仙芪青龙方颗粒安慰剂联合吸入丙酸氟替卡松吸入气雾剂（每次125μg，每日2次）。两组均治疗12周，随访12周，共24周。主要结局指标为两组患者咳嗽症状评分（包括日间评分、夜间评分和总分），于治疗前（入组时）、治疗中（入组第6周后）、治疗结束（入组第12周后）、随访结束（入组第24周后）各评价1次，采用单侧95%可信区间下限（LCL）进行非劣效性判定。次要结局指标包括咳嗽缓解和消失情况、中医证候积分、咳嗽视觉模拟量表（VAS）评分、莱切斯特咳嗽问卷（LCQ）评分和肺功能指标[第1秒用力呼气容积（FEV1）、第1秒用力呼气容积占预计值百分比（FEV1%pred）、用力肺活量（FVC）、呼气峰值流量（PEF）]。治疗前后检测血常规和肝肾功能，并详细记录不良事件发生情况。结果 101例患者纳入全分析集（FAS）分析，治疗组52例，对照组49例。与本组治疗前比较，两组患者治疗中、治疗结束及随访结束时日间咳嗽症状评分、夜间咳嗽症状评分及咳嗽症状总分均下降（P-0.6)。两组患者各时间点咳嗽缓解率、咳嗽消失率、咳嗽缓解天数及咳嗽消失天数的组间比较，差异均无统计学意义（P>0.05）。与本组治疗前比较，两组患者治疗中、治疗结束以及随访结束时的中医证候积分、咳嗽VAS评分均下降，LCQ评分均上升（P0.05）。两组患者各时间点中医证候积分、咳嗽VAS评分、LCQ评分、FEV1、FEV1%、FVC、PEF组间比较，差异均无统计学意义（P>0.05）。治疗前后两组患者肝肾功能均未发现具有临床意义的异常检验结果。结论仙芪青龙方治疗咳嗽变异性哮喘肺肾两虚、风盛挛急证患者的临床疗效非劣效于丙酸氟替卡松吸入气雾剂，可有效缓解咳嗽症状、降低咳嗽评分、减少咳嗽发作天数，提高生存质量，且安全性较好。

关键词：咳嗽变异性哮喘肺肾两虚风盛挛急仙芪青龙方吸入性糖皮质激素非劣效性试验

中医药相关核心结局指标集研究的文献质量评价

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中国循证医学杂志 2024年第2期24卷 192-201页

作者：邱幸莹唐淇曹文聪刘冰清温泽淮李庚广州中医药大学第二临床医学院广州510405 省部共建中医湿证国家重点实验室(广州中医药大学第二附属医院) 广州510120 广东省中医院广州510120 广州中医药大学科技创新中心广州510405 广东省中医证侯临床研究重点实验室广州510120

目的评价中医药相关核心结局指标集(COS-TCM)研究发表的方案及结果的文献质量,为提高COS-TCM研究报告水平和方法学质量提供参考。方法计算机检索中、英文数据库,搜集从建库至2023年4月18日收录的COS-TCM研究方案或研究结果,按照纳入、... 详细信息

目的评价中医药相关核心结局指标集(COS-TCM)研究发表的方案及结果的文献质量,为提高COS-TCM研究报告水平和方法学质量提供参考。方法计算机检索中、英文数据库,搜集从建库至2023年4月18日收录的COS-TCM研究方案或研究结果,按照纳入、排除标准筛选后采用《核心指标集研制规范》(COSSTAD)、《核心指标集报告规范》(COS-STAR)和《核心指标集研究方案报告规范》(COS-STAP)进行质量评价。此外,对发表了研究方案和研究结果的同一个研究进行一致性评价。结果共纳入14篇研究方案和14篇研究结果报告,涉及23项COS-TCM研究。研究方案采用COS-STAP进行评价,发现报告率相对较低的两个条目为“利益相关者”和“缺失数据”。基于COS-STAD对COS-TCM结果进行评价发现,条目“COS涵盖的人群”(35.7%)和“关注结局指标清单的语言描述”(28.6%)的报告率较低;而基于COS-STAR,报告率较低的条目为“方案偏离”(7.1%)、“参与者”(21.4%)和“利益冲突”(28.6%)。此外,一致性评价发现,研究方案与研究结果之间存在不一致的情况,包括系统评价纳入的研究类型、定性研究的方法及共识会议的举办方式、评分方法等,且仅有1项研究报告了方案偏离及其原因。结论COS-TCM研究仍需提高其方法学质量和报告透明度,在遵循国际规范的基础上,需结合中医特色。未来有必要研制适合COS-TCM研究的质量评价指南和报告规范。

关键词：核心结局指标集中医药文献质量评价

基于单细胞转录组探讨新型冠状病毒感染后慢性疲劳综合征与炎症反应、氧化应激、细胞凋亡之间分子机制及其潜在干预中药预测

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中草药 2024年第11期55卷 3774-3788页

作者：黎祖鸣封杰妮陈雪如卢月黄涛亮李际强杨荣源陈剑坤刘云涛广州中医药大学第二临床医学院广东广州510405 广州中医药大学第二附属医院(广东省中医院) 广东广州510120 中医证候全国重点实验室广东广州510120 广东省中医急症研究重点实验室广东广州510120

目的通过分析新型冠状病毒感染后(简称“新冠后”)慢性疲劳综合征(chronic fatigue syndrome,CFS)患者与正常受试者的单细胞转录组数据,探讨新冠后CFS与炎症反应、氧化应激和细胞凋亡之间的分子机制,并预测调控关键基因的潜在中药,为治... 详细信息

目的通过分析新型冠状病毒感染后(简称“新冠后”)慢性疲劳综合征(chronic fatigue syndrome,CFS)患者与正常受试者的单细胞转录组数据,探讨新冠后CFS与炎症反应、氧化应激和细胞凋亡之间的分子机制,并预测调控关键基因的潜在中药,为治疗新冠后CFS提供理论支持。方法使用R语言4.2.1中的“Seurat”包处理新冠后CFS患者与正常受试者的外周血单细胞测序数据,“CellChat”包进行细胞通讯分析,“scMetabolism”包评估细胞代谢特征,综合5种算法(AddModuleScore、AUCell、UCell、singscore和ssGSEA)计算新冠后CFS患者与正常受试者中5种免疫细胞炎症反应、氧化应激和细胞凋亡评分,并比较两者间的差异。使用“scCODE”包鉴定各类免疫细胞在正常受试者与新冠后CFS患者之间的差异表达(differential expression,DE)基因。Upset图分析得到新冠后CFS炎症反应相关基因(inflammatory response related genes,IRGs)、氧化应激相关基因(oxidative stress related genes,OSRGs)和细胞凋亡相关基因(apoptosis related genes,ARGs)。使用“ClusterProfiler”包分别对IRGs、OSRGs、ARGs进行基因本体生物学过程(gene ontology biological process,GOBP)富集分析。基于STRING数据库及Cytoscape软件构建“IRGs-OSRGs-ARGs”分子交互复杂网络,使用cytoHubba插件筛选关键基因。利用COREMINE数据库预测调控关键基因的中药,并通过古今医案云平台统计中药的性味归经、药物功效分类。结果共鉴定出5种免疫细胞,分别为B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、NK细胞和单核细胞。相比于正常受试者,新冠后CFS患者的细胞通讯更为丰富且强度更大,两者之间并无明显差异的细胞代谢特征。新冠后CFS患者中各类免疫细胞的炎症反应、氧化应激和细胞凋亡评分普遍高于正常受试者。共得到33个IRGs、17个OSRGs和54个ARGs。“IRGs-OSRGs-ARGs”分子交互网络显示,IRGs、OSRGs和ARGs之间存在密切联系,最后鉴定出8个关键基因。干预中药药性以寒为主,温、平次之;药味以苦、辛、甘为主;归经以肝、脾、肺为主;功效分类以补虚药(甘草、人参等)、清热药(黄芩、鱼腥草等)、活血化瘀药(郁金、丹参等)为主。结论新冠后CFS患者存在异常的炎症反应、氧化应激和细胞凋亡状态,且三者之间密切关联。8个关键基因(TNF、BCL2、CTNNB1、CXCL8、IFNG、HIF1A、MCL1、CYCS)可能是新冠后CFS的潜在治疗靶标。临床治疗新冠后CFS应注重补虚药、清热药及活血化瘀等药物的配伍使用。

关键词：新型冠状病毒感染慢性疲劳综合征单细胞转录组炎症反应氧化应激细胞凋亡甘草人参黄芩鱼腥草郁金丹参

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中医湿证流行病学调查指标集的构建

时珍国医国药 2024年第9期35卷 2295-2298页

作者：曾萍吴文珍徐嘉敏刘书君夏冰清薛玉玲李倩杨小波广州中医药大学第二临床医学院/省部共建中医湿证国家重点实验室广东广州510405 广州中医药大学第二附属医院/广东省中医院/省部共建中医湿证国家重点实验室/广东省中医证候临床研究重点实验室广东广州510120

目的构建中医湿证流行病学调查指标体系,为高质量的证候流行病学研究提供专属工具,为同类研究提供方法学借鉴。方法参考社会学研究方法中概念化-操作化的过程,通过核心小组专业分析、文献研究构建中医湿证流调指标集框架,以专家共识会... 详细信息

目的构建中医湿证流行病学调查指标体系,为高质量的证候流行病学研究提供专属工具,为同类研究提供方法学借鉴。方法参考社会学研究方法中概念化-操作化的过程,通过核心小组专业分析、文献研究构建中医湿证流调指标集框架,以专家共识会议确定湿证流调一二级类目,在此基础上以穷举法初拟湿证流调指标集。制订两轮德尔菲法专家咨询问卷,并对专家积极程度、权威程度、集中程度和协调程度进行统计分析,以专家意见趋于一致为准。结果经过专家共识会议确定湿证流调的5个一级类目、13个二级类目,两轮德尔菲法专家咨询确定湿证流调的77个指标,其中湿证发生学指标39个,湿证分布指标15个,湿证本体特征指标4个,发展演变指标15个,预后指标14个。结论中医湿证流调指标集研制过程中将湿证内涵和流调目标有机结合,运用德尔菲法获取并总结专家意见,受询专家积极性和权威性较高、意见协调性较好,研制过程兼具专业性和科学性,指标集既能体现中医证候专业内涵,又能揭示其流行病学特征。

关键词：湿证流行病学调查指标体系德尔菲法

基于网络药理学及实验验证探讨萆苓止带方治疗外阴阴道假丝酵母菌病的作用机制

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中草药 2024年第20期55卷 6995-7005页

作者：陈志霞陈思琪冯淑仪广州中医药大学第二临床医学院广东省中医院广东省中医证候临床研究重点实验室

目的采用网络药理学方法探究萆苓止带方治疗外阴阴道假丝酵母菌病(vulvovaginalcandidiasis,VVC)的作用机制,并进行体内实验验证。方法运用TCMSID数据库获取萆苓止带方中活性成分,并预测药物作用靶点;运用GEO、MelaCards和CTD数据库获... 详细信息

目的采用网络药理学方法探究萆苓止带方治疗外阴阴道假丝酵母菌病(vulvovaginalcandidiasis,VVC)的作用机制,并进行体内实验验证。方法运用TCMSID数据库获取萆苓止带方中活性成分,并预测药物作用靶点;运用GEO、MelaCards和CTD数据库获取VVC疾病基因,将萆苓止带方作用靶点与VVC疾病相关基因取交集。运用STRING在线工具构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络,使用Cytoscape软件进行可视化处理;使用WebGestalt工具进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;运用MCODE插件筛选关键基因,运用CB-DOCK2对关键靶点和成分进行分子对接。采用雌激素注射联合阴道接种白色念珠菌法制备VVC小鼠模型,给予萆苓止带方干预后,对阴道灌洗液进行涂片染色,观察阴道真菌载量;采用苏木素-伊红(hemato xylin-eo sin,HE)染色观察阴道组织病理观变化;采用免疫组化法检测阴道组织雄激素受体(androgen receptor,AR)表达。结果萆苓止带方与VVC疾病的共有靶点共43个,涉及代谢、炎症调节、激素等相关生物过程,富集于氮代谢、雌激素信号传导通路、卵巢类固醇生成、缺氧诱导因子-1 (hypoxia-induciblefactor-1,HIF-1)信号通路、内分泌抵抗等信号转导通路。共有靶点网络的核心基因为AR、基质金属蛋白酶1 (matrixmetallopeptidase 1,MMP1)、聚二磷酸腺苷-核糖聚合酶1 [poly (adenosine diphosphate-ribose)polymerase 1,PARP1]和一氧化氮合酶3 (nitric oxide synthase 3,NOS3),核心子网络共3个,均与多种卵巢类固醇激素相关蛋白及其合成代谢、细胞炎症调控等密切相关。动物实验结果显示,萆苓止带方能够有效降低VCC小鼠阴道灌洗液中真菌载量,改善阴道黏膜病理,并下调阴道组织AR表达(P<0.001)。结论萆苓止带方治疗VVC的机制是多靶点、多通路的复杂过程,其机制可能与调节氮代谢、雌激素和缺氧等通路密切相关,核心靶点可能是AR。

关键词：萆苓止带方外阴阴道假丝酵母菌病网络药理学雄激素受体落新妇苷京尼平苷酸毛蕊花糖苷 23-乙酰泽泻醇B 23-乙酰泽泻醇C 芍药苷白术内酯Ⅰ 白术内酯Ⅱ 白术内酯Ⅲ 绿原酸槲皮苷

黄芩联合EGFR-TKIs对非小细胞肺癌的影响

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中国实验方剂学杂志 2024年

作者：余娅娅雷尘静肖真真磨琪马长菊丁丽娜陈亚栋朱燕娟张海波广州中医药大学第二临床医学院/第二附属医院广东省中医院广东省中医防治慢病重点实验室广东药科大学中药学院广东省中医证候临床研究重点实验室粤港澳中医药与免疫疾病研究联合实验室省部共建中医湿证国家重点实验室

目的：探讨黄芩联合表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂（epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitors， EGFR-TKIs）对非小细胞肺癌（Non-small cell lung cancer， NSCLC）细胞增殖、凋亡、肿瘤干细胞（cancer stem cells， CSCs）标记物表达和代谢的影响。方法：采用细胞活性检测试剂盒(Cell Counting Kit-8，CCK-8)、膜联蛋白 V-异硫氰酸荧光素(Annexin V-FITC)/碘化丙锭(PI)细胞凋亡双染法检测黄芩和EGFR-TKIs（吉非替尼或奥希替尼）在NSCLC细胞中的抗肿瘤作用；CellTiter-Glo?3D细胞活力法检测黄芩和EGFR-TKIs在NSCLC细胞三维（three-dimensional， 3D）培养中的活性影响；实时定量聚合酶链式反应（Quantitative real time polymerase chain reaction， qRT-PCR）和蛋白印迹（western blot，WB）方法分别检测CSCs标志物性别决定区Y-box 2 （Sex Determining Region Y Box Protein 2，SOX2）和醛脱氢酶1家族成员A1 （Aldehyde Dehydrogenase 1 Family， Member A1，ALDH1A1）mRNA和蛋白水平的表达；染色法检测细胞内活性氧（reactive oxygen species， ROS）水平的变化，飞秒激光标记自由成像（Femtosecond laser labeling free imaging，FLI）法检测氧化还原比。结果：在NSCLC细胞二维（two-dimensional， 2D）和3D培养条件中，与空白组和EGFR-TKI组比较，联合组细胞活性降低、细胞凋亡率升高，差异有统计学意义（P＜0.05）；与EGFR-TKI组比较，联合组CSCs标记物mRNA和蛋白水平降低，差异有统计学意义（P＜0.05）；与EGFR-TKI组比较，联合组氧化还原比升高，差异有统计学意义（P＜0.05），且联合组ROS水平升高。结论：在NSCLC细胞中，黄芩促进氧化还原比，上调ROS水平，进而抑制CSCs标记物表达来增强EGFR-TKIs的抗肿瘤作用，为黄芩增强靶向药物敏感性提供了一种新的分子机制。

关键词：非小细胞肺癌黄芩表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂癌症干细胞活性氧氧化还原比

肠易激综合征结肠类器官上皮屏障损伤模型的建立与评价

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中国病理生理杂志 2024年第8期40卷 1559-1568页

作者：饶珂寒徐泳茵蓝兆占凯郑欢秦书敏黄绍刚吴皓萌广州中医药大学第二附属医院省部共建中医湿证国家重点实验室中医证候全国重点实验室广东广州510120 广州中医药大学第一附属医院广东广州510400

目的:建立肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)结肠黏膜屏障损伤类器官模型,并对该模型进行评价。方法:取20~22 g雄性C57BL/6小鼠结肠段,分离并提取结肠隐窝,在基质胶中培养,使其增殖和分化成具有结肠上皮样结构的3D空腔球体,... 详细信息

目的:建立肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)结肠黏膜屏障损伤类器官模型,并对该模型进行评价。方法:取20~22 g雄性C57BL/6小鼠结肠段,分离并提取结肠隐窝,在基质胶中培养,使其增殖和分化成具有结肠上皮样结构的3D空腔球体,进而开展以下实验:(1)进行结肠类器官(colonoids)及小鼠结肠组织免疫荧光检测,鉴定结肠类器官。(2)异硫氰酸荧光素葡聚糖(fluorescein isothiocyanate dextran 4,FD4)评估结肠类器官上皮屏障功能。(3)探索不同浓度、不同时点干扰素γ(interferon-γ,IFN-γ)诱导下结肠类器官上皮屏障的变化,运用FD4和HE染色评价屏障功能,RT-qPCR检测结肠类器官类器官闭合蛋白(occludin)和闭锁小带蛋白1(zonula occludens-1,ZO-1)的mRNA表达水平,免疫荧光检测occludin和ZO-1蛋白的分布与定位。结果:(1)结肠类器官与小鼠结肠组织的5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(5-ethynyl-2'-deoxyuridine,EdU)增殖和肠上皮细胞谱系标记表达一致。(2)对照组未见FD4渗透进结肠类器官腔内,而乙二醇双(2-氨基乙基醚)四乙酸[ethylene glycol-bis(β-aminoethyl ether)-N,N,N',N'-tetraacetic acid,EGTA]诱导后FD4明显渗透进结肠类器官腔内(P研究提供了新的工具和方法。

关键词：结肠类器官肠易激综合征上皮屏障损伤干扰素γ 紧密连接

外周血单核细胞预测老年重症流感风险模型的建立及靶向中药预测

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中草药 2024年第10期55卷 3420-3432页

作者：黎祖鸣封杰妮符珊珊陈俊旭甘考卢月陈剑坤刘云涛杨荣源李际强黄涛亮广州中医药大学第二临床医学院广东广州510405 广州中医药大学第一临床医学院广东广州510405 广州中医药大学第二附属医院(广东省中医院) 广东广州510120 广东省中医急症研究重点实验室广东广州510120 中医证候全国重点实验室广东广州510120

目的综合分析老年流感单细胞转录组测序(single cell transcriptome sequencing,scRNA-seq)和转录组测序(transcriptome sequencing,RNA-seq)数据集,构建老年重症流感风险预测模型,并预测调控相关免疫细胞群的中药。通过统计分析中药的... 详细信息

目的综合分析老年流感单细胞转录组测序(single cell transcriptome sequencing,scRNA-seq)和转录组测序(transcriptome sequencing,RNA-seq)数据集,构建老年重症流感风险预测模型,并预测调控相关免疫细胞群的中药。通过统计分析中药的性味归经、药物分类,为中医药治疗老年流感提供理论支持。方法通过scRNA-seq和RNA-seq数据集得到具有较高预测能力的老年流感相关免疫细胞群及其关键基因。基因本体生物学过程(gene ontology biological process,GOBP)、标志性基因集(Hallmark gene set)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和Reactome生物通路知识库富集分析揭示关键基因参与的生物过程及通路。循环算法用于构建老年重症流感风险预测模型。CTD和COREMINE数据库查找对关键基因有调控作用的化学成分及中药,并通过古今医案云平台统计高频中药的性味归经、药物分类。结果单核细胞及其相关基因对于老年流感具有较高的预测能力。老年流感单核细胞相关基因显著富集在感染、代谢和炎症免疫等生物过程及信号通路。5个基因(BCL6、PLSCR1、FCGR1A、RETN、RPL9)的组合可较为准确预测老年重症流感。根据参考文献筛选出42种化学成分,得到高频中药石斛、灵芝、地骨皮、人参、桑叶等;药性以平、寒、温为主;药味以甘、苦、辛为主;归经以肝、脾、肺经居多;以补虚药、清热药、利水渗湿药、解表药、活血化瘀药、消食药、止咳平喘药为主。结论单核细胞可能在老年流感中发挥重要作用。BCL6、PLSCR1、FCGR1A、RETN、RPL9可能是老年重症流感的潜在诊断及治疗靶标。通过生物信息学分析得出老年流感单核细胞相关基因及对应的高频中药,为治疗老年流感的中药新药开发及临床应用提供了新思路。

关键词：老年重症流感单细胞转录组转录组风险预测模型单核细胞石斛灵芝地骨皮人参桑叶