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网络药理学在中医药防治呼吸系统疾病中的应用与创新

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山西大学学报(自然科学版) 2025年

作者：王珂欣游志业单晓茜刘雅陈晓红遆慧慧杨子峰广州国家实验室广东药科大学中药学院广州医科大学附属第一医院

以呼吸慢病和呼吸道病毒感染为主的呼吸系统疾病给医疗卫生系统带来巨大的个人和社会经济负担，且大多数呼吸系统疾病的治疗只能满足于暂时缓解症状，而不能提供有效的预防。中医药在呼吸系统疾病的防治中做出了重要而持久的贡献，但中... 详细信息

以呼吸慢病和呼吸道病毒感染为主的呼吸系统疾病给医疗卫生系统带来巨大的个人和社会经济负担，且大多数呼吸系统疾病的治疗只能满足于暂时缓解症状，而不能提供有效的预防。中医药在呼吸系统疾病的防治中做出了重要而持久的贡献，但中医药多成分多靶点多途径的作用模式阐明不准确或不及时等阻碍了其更广泛的应用。网络药理学在分析多成分多靶点药物以揭示中药在分子水平上的潜在治疗机制及效应成分方面显示出独特的效果，为从整体角度理解中医药提供了新的方法论视角。本文对网络药理学在中医药防治呼吸系统疾病研究中的应用及网络药理学研究中的新思路进行综述，为网络药理学技术在中医药防治呼吸系统疾病中的应用和发展提供参考。

关键词：网络药理学中医药呼吸慢病呼吸道病毒感染新思路

SLC22A8表达下调促进肾透明细胞癌代谢紊乱

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安徽医药 2025年第1期29卷 74-78,I0003,I0004,I0005页

作者：陈尚金钟双泽林汉胜何京伟广东医科大学第一临床医学院广东湛江524000 广东医科大学附属阳江人民医院泌尿外二科广东阳江529500

目的探索肾透明细胞癌(ccRCC)发生和进展的相关关键基因,研究其潜在的作用机制及预后价值。方法该研究于2022年11月始通过CEO2R在线分析工具对GEO数据库中的GSE6344和GSE53757进行差异表达基因(DEGs)的筛选并取交集得到共同差异表达基因... 详细信息

目的探索肾透明细胞癌(ccRCC)发生和进展的相关关键基因,研究其潜在的作用机制及预后价值。方法该研究于2022年11月始通过CEO2R在线分析工具对GEO数据库中的GSE6344和GSE53757进行差异表达基因(DEGs)的筛选并取交集得到共同差异表达基因,并在STRING数据库上构建蛋白质关系网络并应用Cytohubba插件取蛋白质作用关系程度TOP5的基因作为关键基因,之后通过生存分析得出与ccRCC预后相关的关键基因;应用cBioportal数据库进行基因改变分析得出显著突变的关键基因,DAVID数据库对显著突变关键基因进行功能富集与通路分析,UALCAN数据库和HPA数据库验证显著突变关键基因蛋白的差异表达,以上分析过程于2022年12月完成。结果GSE6344和GSE53757分别筛选出198个DEGs和183个DEGs并通过取交集获得63个共同差异表达基因(上调DEGs41个,下调DEGs22个);Cytohubba程序分析该63个基因的蛋白质关系网络得到五个关键基因:SMIM5、TMEM213、SLC12A3、SLC22A8、SLC13A3,均为下调基因;生存分析显示:SLC12A3、SLC22A8、SLC13A3、TMEM213与ccRCC预后相关;基因改变分析提示SLC22A8为显著突变的关键基因;富集分析主要与碳水化合物的代谢、线粒体功能以及过氧化物酶、氧化还原酶活性等多种调节过程相关。结论SLC22A8与肾透明细胞癌的预后密切相关,并通过代谢紊乱影响ccRCC的发生和进展,具有作为ccRCC治疗靶点的潜力。

关键词：肾肿瘤差异基因表达基因改变关键基因代谢紊乱 HPA数据库

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艾灸调节circ Pan3/mi R-667-5p/Ghrelin信号通路减轻膝骨关节炎大鼠的软骨病变

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中国组织工程研究 2025年第12期29卷 2475-2483页

作者：廖晴曾静陈峻袁立霞刘刚南方医科大学中医药学院广东省广州市510000 南方科技大学医院广东省深圳市518000 南方医科大学南方医院康复科广东省广州市510000

背景:既往研究表明艾灸能减轻膝骨关节炎软骨病变,延缓膝骨关节炎进展;课题组前期研究中发现调控circPan3/miR-667-5p/Ghrelin信号通路可增强软骨细胞自噬水平,从而在膝骨关节炎中发挥软骨保护作用。目的:基于circPan3/miR-667-5p/Ghre... 详细信息

背景:既往研究表明艾灸能减轻膝骨关节炎软骨病变,延缓膝骨关节炎进展;课题组前期研究中发现调控circPan3/miR-667-5p/Ghrelin信号通路可增强软骨细胞自噬水平,从而在膝骨关节炎中发挥软骨保护作用。目的:基于circPan3/miR-667-5p/Ghrelin信号通路探究艾灸对大鼠膝骨关节炎软骨的影响。方法:SD大鼠随机分为假手术组、模型组和艾灸组(n=10),对后2组大鼠行右后肢膝关节前交叉韧带横断和内侧半月板部分切除术建立膝骨关节炎大鼠模型;假手术组大鼠仅接受关节囊切开术。6周后,艾灸组大鼠每日艾灸“足三里”“肾俞”穴区20 min,持续4周,其余2组不予以特殊处理。4周后通过组织病理学染色观察膝关节滑膜病变和软骨损伤程度,通过酶联免疫吸附实验检测血清中炎症因子白细胞介素6和肿瘤坏死因子α的变化。此外,取上述3组大鼠右侧膝关节软骨细胞分为:正常对照组、模型组和艾灸组,通过Western blot和qRT-PCR检测各组细胞中软骨基质合成代谢分子(Ⅱ型胶原蛋白和Sox9)、基质降解分子(基质金属蛋白酶13和ADAMTS5)、自噬标志物(ATG5、Beclin-1、微管相关蛋白1轻链3)、Ghrelin、CircPan3以及miR-667-5P的表达水平。结果与结论:①治疗4周后,相对于假手术组,模型组大鼠滑膜显著增厚,炎症细胞浸润显著,关节间隙狭窄,软骨表面粗糙不平,变薄,软骨细胞数量减少,滑膜炎和OARSI评分显著升高,白细胞介素6和肿瘤坏死因子α水平明显上调(P<0.0001);与模型组相比,艾灸组滑膜增厚减轻,炎症细胞浸润减少,关节间隙增宽,软骨更光滑完整、变厚,软骨细胞数量增多,滑膜炎和OARSI评分降低,白细胞介素6和肿瘤坏死因子α水平显著降低(P<0.0001)。②体外实验结果表明,与正常对照组相比,模型组软骨细胞基质金属蛋白酶13、ADAMTS5和miR-667-5P表达增多,Ⅱ型胶原蛋白、Sox9、自噬标志物、Ghrelin和Circpan3表达减少(P<0.01);与模型组相比,艾灸可逆转上述指标改变(P<0.01)。③结果说明艾灸可能通过调节circPan3/miR-667-5p/Ghrelin信号通路增强软骨细胞自噬,抑制膝骨关节炎炎症和软骨破坏,对软骨发挥保护作用。

关键词：膝骨关节炎艾灸 ghrelin 软骨自噬大鼠信号通路

果蔬中天冬酰胺和谷氨酰胺含量检测方法及尿素循环障碍患者食用分析

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食品科学 2025年第3期46卷 212-221页

作者：叶新玉李子樱唐淑军孙丽萍赵云霞肖伟敏顾亚萍匡慧颖陈欣杨国武黄雅丽广州中医药大学基础医学院广东广州510006 深圳市计量质量检测研究院广东深圳518055 深圳市质量安全检验检测研究院广东深圳518055 贵州医科大学医学检验学院贵州贵阳550025 深圳深检集团医学检验实验室广东深圳518000

本研究基于酶解结合超高效液相色谱-串联质谱(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)技术,开发了一种测定蔬菜和水果中天冬酰胺和谷氨酰胺含量的方法。利用灰色链霉菌蛋白酶酶解样品,并... 详细信息

本研究基于酶解结合超高效液相色谱-串联质谱(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)技术,开发了一种测定蔬菜和水果中天冬酰胺和谷氨酰胺含量的方法。利用灰色链霉菌蛋白酶酶解样品,并加入抗氧化剂丁基羟基苯甲醚,再取上清液进行UPLC-MS/MS分析;以甲醇-0.02%甲酸溶液作为流动相进行梯度洗脱,经Phenomenex kinetex F5色谱柱分离,用电喷雾电离源正离子扫描和多反应检测模式进行检测,并通过内标法定量。天冬酰胺和谷氨酰胺在10~1 000 ng/mL范围内线性关系良好(R^(2)>0.999)。方法检出限为1.5 mg/100 g,定量限为5.0 mg/100 g,回收率在80.0%~112.8%,相对标准偏差为1.2%~9.1%。对市场常见的49种蔬菜和50种水果进行检测,结果表明在蔬菜中天冬酰胺、谷氨酰胺的总含量均值从高到低排序为豆类、薯芋类、葱蒜类、菌类、瓜类、茄果类、白菜类、绿叶菜类,其中豆类的天冬酰胺、谷氨酰胺总含量均极显著高于绿叶菜类(P研究结果提示尿素循环障碍患者在日常膳食中可以更多地摄入绿叶菜类、壳果类等天冬酰胺、谷氨酰胺含量少的果蔬,特别是支链氨基酸与(天冬酰胺+谷氨酰胺)含量比值较高的小白菜、木耳、大葱、椰汁、桂圆、柚子等果蔬。另外,应减少对土豆、南瓜、长豆角、香瓜、红李、黄桃等比值较低果蔬的摄入。

关键词：天冬酰胺谷氨酰胺蔬菜水果尿素循环障碍日常膳食

苦参总黄酮改善非酒精性脂肪肝的作用机制及斑马鱼实验验证

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中国组织工程研究 2025年第14期29卷 2969-2978页

作者：古玉凤邓丙英李倪仁曾译萱鲁思凡朱晨陈磊刘怡南方医科大学中医药学院广东省广州市510510 广州中医药大学第二附属医院药学部广东省广州市510120 广东药科大学中药学院广东省广州市510006 广东省中药制剂重点实验室广东省广州市510515 广东省中西医结合防治情志病基础研究卓越中心广东省广州市510515

背景:苦参总黄酮具有抗炎、调节免疫、抗氧化、抗肝损伤等多种药理作用,其对非酒精性脂肪肝的治疗效果和作用机制尚不明确。目的:利用生物信息学、网络药理学方法及斑马鱼实验验证苦参总黄酮治疗非酒精性脂肪肝的作用机制。方法:构建非... 详细信息

背景:苦参总黄酮具有抗炎、调节免疫、抗氧化、抗肝损伤等多种药理作用,其对非酒精性脂肪肝的治疗效果和作用机制尚不明确。目的:利用生物信息学、网络药理学方法及斑马鱼实验验证苦参总黄酮治疗非酒精性脂肪肝的作用机制。方法:构建非酒精性脂肪肝斑马鱼模型,观察苦参总黄酮治疗后斑马鱼肝脏脂质累积情况、病理形态改变,以及脂质累积、炎症基因的表达变化。通过TCMSP、Swiss Target Prediction、Bat-man数据库获取苦参总黄酮活性成分与非酒精性脂肪肝相关靶点;利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,GO功能富集和KEGG通路富集分析。基于GSE33814数据集,筛选出“苦参总黄酮-非酒精性脂肪肝”交集靶点的差异表达基因并运用R4.3.2软件进行相关性分析、受试者操作特征曲线分析,通过验证集GSE89632验证核心基因;RT-qPCR和Western blot实验验证核心通路相关基因和蛋白表达。结果与结论:①苦参总黄酮能够改善非酒精性脂肪肝斑马鱼肝脏脂质累积,显著抑制斑马鱼脂质和转氨酶水平的升高(P<0.05);调节炎症和脂代谢相关基因的表达;②网络药理学中获得168个共同靶点,Cytoscape拓扑分析综合筛选出排名前10的核心基因分别为HSP90AA1、STAT3、PIK3R1、MAPK1、AKT1、RXRA、PIK3CA、EGFR、JAK2、ESR1;GO和KEGG分析通路主要集中在胰岛素抵抗、脂质与动脉粥样硬化方面;生物信息分析共获得59个“苦参总黄酮-非酒精性脂肪肝”差异表达基因,受试者操作特征曲线分析及验证集验证得到6个核心靶点在健康人与非酒精性脂肪肝患者间有显著差异(P<0.01);③RT-qPCR和Western blot实验结果表明苦参总黄酮能够抑制非酒精性脂肪肝斑马鱼JAK2/STAT3信号通路的激活。以上结果表明,苦参总黄酮通过调节JAK2/STAT3信号通路减轻炎性反应,抑制脂质累积从而改善非酒精性脂肪肝。

关键词：苦参总黄酮非酒精性脂肪肝斑马鱼网络药理学生物信息学 JAK2 STAT3

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海洋中药治疗骨质疏松的用药规律及作用机制

中国组织工程研究 2025年第17期29卷 3713-3723页

作者：赖越林轩徐淼刘欢沈剑粦黄文华广东医科大学第一临床医学院广东省湛江市524023 莆田学院环境与生物工程学院福建省莆田市351100 福建医科大学基础医学院福建省福州市350100 西南医科大学附属中医医院骨科四川省泸州市646000 莆田学院附属医院中心实验室福建省莆田市351100 南方医科大学基础医学院人体解剖学国家重点学科广东省数字医学与生物力学重点实验室广东省医学3D打印应用转化工程技术研究中心广东省广州市510515

背景:海洋中药为治疗骨质疏松提供了一种潜在有效且不易产生不良反应的方法。目的:应用数据挖掘和网络药理学方法分析并探讨中医临床治疗骨质疏松的用药规律及作用机制。方法:采用数据挖掘和网络药理学方法,对国家知识产权局批准的治疗... 详细信息

背景:海洋中药为治疗骨质疏松提供了一种潜在有效且不易产生不良反应的方法。目的:应用数据挖掘和网络药理学方法分析并探讨中医临床治疗骨质疏松的用药规律及作用机制。方法:采用数据挖掘和网络药理学方法,对国家知识产权局批准的治疗骨质疏松的海洋中药专利处方进行用药模式和作用机制研究,并特别关注这些处方中的核心中药成分,利用超高效液相色谱串联质谱对牡蛎-续断-淫羊藿组成的复方药组核心成分进行全面的鉴定分析。结果与结论:①从国家知识产权局(SIPO)网站建立到2024-04-01,检索发现381项骨质疏松治疗的授权专利,共鉴定出48首含有海洋中药的中成药处方,这些处方包含183味中药,其中13种海洋中药用药频次共574次,单首专利组方中用药味数2-41种不等;②牡蛎是最常用的海洋中药,续断、淫羊藿、地黄、杜仲是最常用的非海洋中药;关联规则分析确定了牡蛎、续断和淫羊藿为核心药物群;网络药理学分析显示该核心药组治疗骨质疏松的核心靶点包括ALB、AKT1、TP53、PPARG和SRC;核心药组发挥疗效的核心成分为谷甾醇、甘草素、臭山羊碱、木犀草素、山奈酚;③GO与KEGG富集分析显示,Rap1/丝裂原活化蛋白激酶信号通路在核心药物组的骨质疏松作用机制中起着重要作用;④分子对接结果显示核心成分与核心靶点之间存在良好的相互作用;⑤超高效液相色谱串联质谱检测复方药组核心成分为木犀草素、谷甾醇、山奈酚等,与网络药理学鉴定的药物成分相符合;对复方药组成分进行定量分析得出,黄酮类化合物、萜类化合物以及生物碱这3类物质在药物成分占比中较大。

关键词：骨质疏松海洋中药数据挖掘网络药理学分子对接

脐带间充质干细胞对2型糖尿病的免疫调节作用

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中国组织工程研究 2025年第23期29卷 5031-5040页

作者：陈春兰叶美仪潘雨薇袁佳周朋君广东药科大学药学院药理系广东省广州市510006 广州医科大学附属中医医院治未病科广东省广州市510130 广东省中西医结合医院康复科广东省佛山市528200 暨南大学生科院生物医药基地广东省广州市510632

背景:脐带间充质干细胞具有免疫调节功能和多向分化潜能,能够积极改善2型糖尿病的慢性低度炎症状态,对阻止2型糖尿病疾病进展具有重要意义。目的:综述脐带间充质干细胞通过免疫调节作用治疗2型糖尿病的研究进展。方法:以“脐带间充质干... 详细信息

背景:脐带间充质干细胞具有免疫调节功能和多向分化潜能,能够积极改善2型糖尿病的慢性低度炎症状态,对阻止2型糖尿病疾病进展具有重要意义。目的:综述脐带间充质干细胞通过免疫调节作用治疗2型糖尿病的研究进展。方法:以“脐带间充质干细胞,间充质干细胞,2型糖尿病,免疫,胰岛素抵抗,炎症”等为中文检索词,以“umbilical cord mesenchymal stem cells,UC-MSCs,mesenchymal stem cells,MSCs,type 2 diabetes mellitus,T2DM,immunity,insulin resistance,inflammation”等为英文检索词,在中国知网、Web of Science和PubMed数据库筛选相关的综述、研究型论文和论著,根据纳入标准和排除标准整理出88篇论文进行归纳总结。结果与结论:脐带间充质干细胞可通过免疫调节作用降低机体炎症反应、诱导巨噬细胞向M2型极化,增加靶器官对胰岛素敏感性,改善胰岛素抵抗,缓解胰岛β细胞功能障碍等,进而有效延缓2型糖尿病发生发展。但在脐带间充质干细胞移植成为常规治疗手段之前,还需要进行大规模的基础与应用基础研究以确定其最佳治疗方案及疗效。

关键词：脐带间充质干细胞 2型糖尿病免疫胰岛素抵抗炎症巨噬细胞

电针下调组蛋白脱乙酰酶3改善阿尔茨海默病小鼠突触可塑性及认知功能障碍

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针刺研究 2025年

作者：赖岚枫李馨李虹竹黎志敏刘恋张誉莹杨晗罗冰宜易玮许能贵赵家莹广州中医药大学针灸康复临床医学院广州医科大学附属市八医院佛山复星禅诚医院广州中医药大学华南针灸研究中心

目的：观察电针对阿尔茨海默病（AD）小鼠海马内组蛋白脱乙酰酶3(HDAC3)、突触可塑性及N-甲基-D-天冬氨酸（NMDA）相关蛋白的影响，探讨电针治疗AD可能的作用机制。方法：将5XFAD小鼠随机分为电针组、模型组及假针组，其中电针组及模型... 详细信息

目的：观察电针对阿尔茨海默病（AD）小鼠海马内组蛋白脱乙酰酶3(HDAC3)、突触可塑性及N-甲基-D-天冬氨酸（NMDA）相关蛋白的影响，探讨电针治疗AD可能的作用机制。方法：将5XFAD小鼠随机分为电针组、模型组及假针组，其中电针组及模型组各13只，假针组7只；取同窝WT小鼠13只作为正常对照组。电针组电针“百会”“大椎”，假针组将针刺入橡皮泥中，并将橡皮泥与针放置对应的穴位上，每次15min,1次/d，一周6次，共治疗4周。新物体识别、Y迷宫及水迷宫实验观察各组小鼠认知功能变化；膜片钳实验检测海马长时程增强（LTP）观察突触可塑性情况；Western blot法检测海马组织HDAC3及NMDA受体相关蛋白（NMDAR1、NMDAR2A、NMDAR2B）的蛋白表达水平。结果：与正常对照组相比，模型组小鼠新物体偏好指数下降（P<0.01），准确自发进臂次数百分比（AAR）下降（P<0.05），逃逸潜伏期延长（P<0.01），穿越平台次数、在目标象限的时间和路程减少（P<0.01）；海马区经HFS刺激后30、60 min场兴奋性突触后电位（fEPSP）斜率降低（P<0.05）；海马区NMDAR2B、NMDAR2A、NMDAR1蛋白表达水平下降（P<0.05）,HDAC3蛋白表达水平上升（P<0.05）。与模型组相比，电针组小鼠新物体偏好指数上升（P<0.01）,AAR上升（P<0.05），逃逸潜伏期缩短（P<0.05），穿越平台次数、在目标象限的时间和路程增多（P<0.01）；海马区LTP回升（P<0.05）；海马区NMDAR2B、NMDAR2A、NMDAR1蛋白表达水平升高（P<0.05）,HDAC3蛋白表达水平降低（P<0.01）。结论：电针“百会”“大椎”可能是通过下调5XFAD小鼠海马中的HDAC3含量，提高了海马中NMDA受体相关蛋白的表达，从而恢复受损的长时程增强，改善突触可塑性，进而改善认知障碍。

关键词：阿尔茨海默病电针学习记忆长时程增强组蛋白脱乙酰酶3 N-甲基-D-天冬氨酸受体相关蛋白

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转录组测序分析黄连总碱抗脑缺血的作用机制

中国组织工程研究 2025年第19期29卷 4161-4171页

作者：田良良周瑞曹光昭张晶晶中国中医科学院中药研究所北京市100700 广东药科大学中医药研究院广东省广州市510006 广州中医药大学中药学院广东省广州市510006 北京脑科学与类脑研究中心北京市102206

背景:黄连清热燥湿、泻火解毒,黄连及其成分对脑缺血有显著的保护作用,基于网络药理学和转录组测序探究黄连总碱抗脑缺血的作用机制。目的:在明确黄连总碱对脑缺血大鼠保护作用的基础上,基于网络药理学和转录组测序技术探讨黄连总碱干... 详细信息

背景:黄连清热燥湿、泻火解毒,黄连及其成分对脑缺血有显著的保护作用,基于网络药理学和转录组测序探究黄连总碱抗脑缺血的作用机制。目的:在明确黄连总碱对脑缺血大鼠保护作用的基础上,基于网络药理学和转录组测序技术探讨黄连总碱干预脑缺血的作用机制。方法:将SD大鼠随机分为假手术组、缺血再灌注组、阳性药物组和黄连总碱组,后3组采用改良线栓法制备大脑中动脉阻塞的缺血再灌注模型,假手术组不插入线栓,其余手术操作相同。通过TTC染色、Longa 5神经功能缺损评分、苏木精-伊红染色、尼氏染色评价黄连总碱对脑缺血再灌注模型大鼠的脑保护作用。对假手术组、缺血再灌注组、黄连总碱组大鼠脑组织进行转录组测序,通过差异表达基因筛选、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析以及转录组学与网络药理学关联分析,阐明黄连总碱干预脑缺血的作用特点,最后通过ELISA检测及免疫荧光染色对黄连总碱干预脑缺血的关键靶点进行验证。结果与结论:①黄连总碱可降低缺血再灌注模型大鼠Longa 5神经功能缺损评分及脑梗死面积,增加神经元、尼氏小体数目;②黄连总碱治疗后差异表达基因的基因本体论功能富集分析包括炎症反应、分裂原活化蛋白激酶级联的正调控等生物学过程;京都基因与基因组百科全书通路富集分析主要涉及白细胞介素17信号通路、神经活性配体-受体相互作用、环磷腺苷信号通路等通路;③转录组分析发现黄连总碱主要调控的基因有前列腺素内过氧化物合酶2、脑源性神经营养因子、瞬间受体电位A1等;④采用网络药理学分析发现,黄连总碱中9个成分可能通过87个成分靶点关联到过氧化物合酶2、脑源性神经营养因子及瞬间受体电位A1而发挥作用;⑤ELISA检测及免疫荧光染色结果进一步证实,黄连总碱调控脑缺血再灌注模型大鼠过氧化物合酶2、脑源性神经营养因子和瞬间受体电位A1的表达;⑥提示黄连总碱能明显改善脑缺血再灌注模型大鼠损伤,可能通过调控过氧化物合酶2、脑源性神经营养因子和瞬间受体电位A1而发挥作用。

关键词：黄连总碱脑缺血转录组测序过氧化物合酶2 脑源性神经营养因子瞬间受体电位A1