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E3连接酶在巨噬细胞介导的炎症中的作用(英文)

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生物化学与生物物理进展 2024年

作者：金加孛葛一栋金晓峰宁波大学医学部生物化学与分子生物学系浙江省病理生理学技术研究重点实验室

巨噬细胞几乎存在于人体的所有器官中，负责检测组织损伤、病原体和抗体，在宿主抵御各种入侵病原体引发炎症反应的过程中发挥着关键作用。不断有研究表明巨噬细胞介导的免疫反应受到泛素-蛋白酶体系统（ubiquitin-proteasomesystem，UP... 详细信息

巨噬细胞几乎存在于人体的所有器官中，负责检测组织损伤、病原体和抗体，在宿主抵御各种入侵病原体引发炎症反应的过程中发挥着关键作用。不断有研究表明巨噬细胞介导的免疫反应受到泛素-蛋白酶体系统（ubiquitin-proteasomesystem，UPS）的严格调控，其失调或异常激活可能是导致许多炎症的发病机制的关键原因。负责识别底物的E3连接酶是UPS中的关键酶，它包含多种亚家族蛋白，参与调控巨噬细胞介导的炎症中的一些常见信号通路，如核苷酸结合寡聚化结构域样受体（nucleotide-bindingoligomerizationdomain-likereceptors，NLRs）、维甲酸诱导基因I样受体家族（retinoicacid-induciblegene1-likereceptors，RLRs）和 Toll样受体（toll-likereceptors，TLRs）。在此，我们回顾了巨噬细胞介导的炎症相关E3连接酶的最新研究进展，并讨论了E3 与其底物结合导致异常激活或失活的一些潜在机制。此外，我们还探讨了针对E3连接酶在巨噬细胞介导的炎症中相关的抑制剂和激动剂，展望了针对巨噬细胞介导的炎症中异常E3连接酶的靶向疗法的未来前景。

关键词： E3连接酶巨噬细胞 NLRs/RLRs/TLRs 靶向治疗

BMI1基因下调使宫颈癌和子宫内膜癌对紫杉醇敏感

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生物化学与生物物理进展 2024年第4期51卷 924-943页

作者：赵奕婷林燕杨玮丽陈俊宁波大学附属人民医院肿瘤放化疗科宁波315000 宁波大学附属人民医院妇科宁波315000 宁波大学医学部生物化学与分子生物学系浙江省病理生理学重点实验室宁波315000

目的研究B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒插入位点1(BMI1)基因对宫颈癌及子宫内膜癌增殖浸润及紫杉醇耐受的影响及其机制。方法首先利用Cbioportal、TCGA和CPTAC数据库分析BMI1基因在宫颈癌和子宫内膜癌中的突变及表达情况。接着对人宫... 详细信息

目的研究B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒插入位点1(BMI1)基因对宫颈癌及子宫内膜癌增殖浸润及紫杉醇耐受的影响及其机制。方法首先利用Cbioportal、TCGA和CPTAC数据库分析BMI1基因在宫颈癌和子宫内膜癌中的突变及表达情况。接着对人宫颈癌组织样本和人子宫内膜癌组织样本中BMI1的蛋白质表达水平进行免疫组化分析。采用蛋白质印迹法(Western blot)检测BMI1敲低后宫颈癌及子宫内膜癌细胞中BMI1下游调控因子的蛋白质水平变化。此外,通过细胞功能实验研究了BMI1在宫颈癌HeLa及子宫内膜癌HEC-1-A细胞中的功能。最后,通过实验评估si BMI1联合紫杉醇治疗的协同抗生长作用。结果数据库分析结果显示,BMI1在1.5%的子宫颈癌患者及1.9%的子宫内膜癌的患者中存在不同程度的扩增、错义及剪接突变。此外,高mRNA水平的BMI1与宫颈癌的病理类型相关,且高蛋白质水平的BMI1与子宫内膜癌的病理类型和肿瘤分级及较低的生存率相关。进一步的免疫组化分析发现,与正常组织相比,宫颈癌和子宫内膜癌组织中BMI1蛋白水平表达升高,且与肿瘤的病理分化及浸润深度相关。药物敏感性实验显示,BMI1过表达导致HeLa及HEC-1-A细胞对多种抗癌药物的敏感性下降,其中包括紫杉醇。为了进一步分析BMI1与紫杉醇耐受的关系,通过Western blot检测BMI1敲除后HeLa及HEC-1-A细胞中BMI1下游因子的蛋白质水平变化。结果显示,抗凋亡相关蛋白Bcl-2随着BMI1的敲低而表达水平下降,而促凋亡相关蛋白BAX则显著升高。此外,细胞功能实验结果显示,体外过表达BMI1可促进HeLa及HEC-1-A细胞的增殖和迁移,且BMI1低表达的HeLa及HEC-1-A细胞对紫杉醇更敏感。结论BMI1在宫颈癌和子宫内膜癌患者的肿瘤组织中过表达,BMI1的下调通过调控凋亡通路使CC和EC细胞对紫杉醇更加敏感。

关键词：宫颈癌子宫内膜癌 BMI1 Bcl-2 紫杉醇

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miR-124在抑郁症中的作用机制

生物化学与生物物理进展 2024年第6期51卷 1316-1326页

作者：薛燕李德珠谢慧莹蒋传邈张俊芳宁波大学医学部浙江省病理生理学技术研究重点实验室宁波315211 宁波大学附属康宁医院宁波315201

抑郁症是世界范围内最常见的精神疾病之一,发病机制复杂,研究仍处于探索阶段。微RNA(miRNA)作为表观遗传机制的重要调控因子,在抑郁症的发生发展中起着重要作用。miR-124是神经系统中表达最丰富的miRNA之一,参与了神经元分化、小胶质细... 详细信息

抑郁症是世界范围内最常见的精神疾病之一,发病机制复杂,研究仍处于探索阶段。微RNA(miRNA)作为表观遗传机制的重要调控因子,在抑郁症的发生发展中起着重要作用。miR-124是神经系统中表达最丰富的miRNA之一,参与了神经元分化、小胶质细胞激活等生物事件。近年研究表明,miR-124在抑郁症患者和动物模型中表达异常,并参与了病理生理机制。然而,miR-124的表达异常情况及其相关机制的研究结果是较复杂的、甚至矛盾的。故本文对此进行梳理,总结了miR-124在抑郁症中的研究进展。

关键词：抑郁症 miR-124 海马糖皮质激素受体神经发生神经炎症

微RNA在恶性胸膜间皮瘤发生发展中的作用机制研究进展

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基因组学与应用生物学 2024年第6期 967-975页

作者：赵丹普元倩熊伟大理大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室云南省高校临床生物化学检验重点实验室云南省昆虫生物医药研发重点实验室

微RNA(microRNA, miRNA)是近年来发现的最短的内源性非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNA)之一，普遍认为其通过调节信使RNA(messenger RNA, mRNA)表达水平来发挥作用，主要功能体现在参与调节生物个体发育、细胞增殖与分化、肿瘤的发生... 详细信息

微RNA(microRNA, miRNA)是近年来发现的最短的内源性非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNA)之一，普遍认为其通过调节信使RNA(messenger RNA, mRNA)表达水平来发挥作用，主要功能体现在参与调节生物个体发育、细胞增殖与分化、肿瘤的发生发展等多种病理和生理过程中。miRNA在调控癌基因、抑癌基因的表达和信号通路的活性过程中以及在恶性胸膜间皮瘤(malignant pleural mesothelioma, MPM)发生和发展中发挥着重要的作用。本综述对miRNA的生成和miRNA的功能及在MPM发生发展过程中发挥促癌作用和肿瘤抑制作用的相关miRNA进行总结和归纳，以期为MPM的临床诊断以及治疗提供理论参考。

关键词：微RNA 恶性胸膜间皮瘤促癌基因抑癌基因

微小RNA（microRNA）在恶性胸膜间皮瘤发生发展中的作用机制研究进展

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基因组学与应用生物学 2024年

作者：赵丹普元倩熊伟云南省高校临床生物化学检验重点实验室云南省昆虫生物医药研发重点实验室大理大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室

微小RNA（microRNA，miRNA）是近年来发现的最短的内源性非编码RNA（non-coding RNAs， ncRNA）之一，普遍认为其通过调节mRNA表达水平来发挥作用，主要功能体现在参与调节生物个体发育、细胞增殖与分化、肿瘤的发生发展等多种病理和生... 详细信息

微小RNA（microRNA，miRNA）是近年来发现的最短的内源性非编码RNA（non-coding RNAs， ncRNA）之一，普遍认为其通过调节mRNA表达水平来发挥作用，主要功能体现在参与调节生物个体发育、细胞增殖与分化、肿瘤的发生发展等多种病理和生理过程中。miRNA 在调控癌基因、抑癌基因的表达及信号通路的活性过程中，以及在恶性胸膜间皮瘤（malignant pleural mesothelioma， MPM）发生和发展中发挥着重要的作用。本综述对miRNA的生成和miRNA的功能，及在MPM发生发展过程中发挥促癌作用和肿瘤抑制作用的相关miRNA进行总结和归纳，以期为MPM的临床诊断以及治疗提供理论参考。

关键词：微小RNA 恶性胸膜间皮瘤促癌基因抑癌基因

柯萨奇病毒A组6型中国株的分子进化和时空传播分析

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宁波大学学报（理工版） 2024年第1期37卷 84-92页

作者：贾永涛唐佳婕王惠董长征宁波大学医学部浙江宁波315211 浙江省病理生理学技术研究重点实验室浙江宁波315211

柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是手足口病的主要病原体,可引起非典型手足口病和中枢神经系统疾病,对儿童造成严重的疾病负担,尚无上市的疫苗和抗病毒药物.基于3288条CV-A6中国株VP1序列,利用Nextstrain平台的augur病原体... 详细信息

柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是手足口病的主要病原体,可引起非典型手足口病和中枢神经系统疾病,对儿童造成严重的疾病负担,尚无上市的疫苗和抗病毒药物.基于3288条CV-A6中国株VP1序列,利用Nextstrain平台的augur病原体生物信息分析包,构建了CV-A6的时间尺度分子进化树,确定了进化分支和分支突变,分析了分支突变与抗原表位之间的联系.进一步分析了CV-A6中国株各分支在中国七大地理区域的时空分布和优势分支,绘制了主要分支的时空传播路线.结果发现,CV-A6中国株主要分为B、C和D三个进化分支以及D2、D3a和D3b三个子分支,抗原表位处的突变形成了新的进化分支,促进了病毒的流行.华南和华东是CV-A6中国株的主要起源地,华南和华东相互输出、华东输出全国是中国株的主要传播模式.对CV-A6中国株的分子进化和时空传播分析,为CV-A6引起的手足口病等疫情的监测、预警和防控提供了重要支持.

关键词：柯萨奇病毒A组6型肠道病毒分子进化时空传播分析生物信息学

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嵌合RNA检测和验证技术

生物化学与生物物理进展 2024年第4期51卷 797-808页

作者：王广富丁咏伟唐悦秦付军郑州大学基础医学院微生物学与免疫学系郑州450001 郑州大学医学科学院医学表观遗传学中心郑州450052 郑州大学医学科学院分子病理中心郑州450052 郑州大学医学科学院转化医学平台郑州450052 郑州大学省部共建食管癌防治国家重点实验室郑州450052 郑州大学基础医学院病理与病理生理学系郑州450001

嵌合RNA(chimeric RNA)是由来自不同基因的外显子片段组成的融合转录本。传统的嵌合RNA检测方法有染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH)等,但这些技术的特异性、灵敏性和准确性较差。随着测序技术的发展,二代测序技术展现出强大的数据处... 详细信息

嵌合RNA(chimeric RNA)是由来自不同基因的外显子片段组成的融合转录本。传统的嵌合RNA检测方法有染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH)等,但这些技术的特异性、灵敏性和准确性较差。随着测序技术的发展,二代测序技术展现出强大的数据处理能力,可以通过高通量序列分析来检测嵌合RNA,目前基于高通量测序的检测方法有FusionCatcher、SOAPfuse、EricScript等。目前较为常用的对检测到的嵌合RNA的验证方法有聚合酶链反应(PCR)、核糖核酸酶保护实验(RPA)、琼脂糖凝胶电泳、Sanger测序等。多种检测技术的开发使得越来越多的嵌合RNA被发现,但现有的检测技术各有优劣,主要体现于检测成本、假阳性率、检测时间等方面的差异。本文对嵌合RNA的检测方法、验证方法及各方法的优劣性进行阐述。

关键词：嵌合RNA 检测技术验证技术 RNA-Seq 生物信息学

酶抑制剂及其构效优化在阿尔茨海默病中的应用

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生物化学与生物物理进展 2024年

作者：储超扬肖彪单江晖陈是燏张楚霞周钰愉方甜园林志成谢凯徐淑君李丽萍宁波大学医学部生理与病理学科宁波大学附属第一医院康复科

阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease，AD）是一种以进行性认知功能障碍和行为损害为特征的中枢神经系统退行性病变，而临床上缺乏有效治疗AD的药物。近些年来研究发现，多种酶抑制剂如胆碱酯酶抑制剂、单胺氧化酶抑制剂、分泌酶抑制剂... 详细信息

阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease，AD）是一种以进行性认知功能障碍和行为损害为特征的中枢神经系统退行性病变，而临床上缺乏有效治疗AD的药物。近些年来研究发现，多种酶抑制剂如胆碱酯酶抑制剂、单胺氧化酶抑制剂、分泌酶抑制剂等改善胆碱能系统的障碍、Aβ的产生和沉积、Tau蛋白的过度磷酸化、氧化应激损伤、突触可塑性下降等AD发生发展的不同环节，从而改善AD症状和认知功能。本文综述了近年来酶抑制剂或抑制剂构效优化靶向调节胆碱酯酶、单胺氧化酶、分泌酶等在AD治疗中的研究进展，以期为AD的治疗和药物研发提供新思路。

关键词：阿尔茨海默病乙酰胆碱酯酶抑制剂单胺氧化酶抑制剂 β-分泌酶抑制剂 γ-分泌酶抑制剂糖原合成激酶抑制剂抑制剂构效优化

急性髓系白血病新型预后分子标志物NKX2-3的发现

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中山大学学报（医学科学版） 2024年第1期45卷 63-68页

作者：王婉頔常桃江思远侯琪金真伊吴秀丽暨南大学基础医学与公共卫生学院血液学研究所广东广州510632 暨南大学基础医学与公共卫生学院生物化学与分子生物学系广东广州510632 暨南大学基础医学与公共卫生学院病理学系广东广州510632

【目的】通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病(AML)患者的预后的分子标志物的表达,为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。【方法】从癌症基因组图谱(TCGA)生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基... 详细信息

【目的】通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病(AML)患者的预后的分子标志物的表达,为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。【方法】从癌症基因组图谱(TCGA)生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析;利用基因表达集锦(GEO)数据库中的GSE13159数据集的74例健康人(HI)骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析,检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性;收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本,同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照,采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平。【结果】生物信息数据分析显示,根据R语言计算出的NK2转录因子相关基因位点3(NKX2-3)的最佳截断值0.051进行生存分析,发现与低表达NKX2-3的AML初发患者相比,高表达NKX2-3的AML初发患者总体生存率较差(P=0.0036);与HI相比,NKX2-3在AML初发组患者中显著高表达(P<0.001);实时荧光定量PCR的验证结果也证实NKX2-3-1和NKX2-3-2在AML初发组患者中高表达,且与健康人组相比有显著相关性(P=0.000,P=0.000)。【结论】NKX2-3在AML初发组患者中高表达,且高表达NKX2-3的AML患者总体生存较差;NKX2-3可能与AML临床转归与预后密切相关。

关键词：急性髓系白血病 NKX2-3 生物信息学预后基因表达相关性