柯萨奇病毒A组6型中国株的分子进化和时空传播分析

作     者：贾永涛 唐佳婕 王惠 董长征 JIA Yongtao;TANG Jiajie;WANG Hui;DONG Changzheng

作者机构：宁波大学医学部浙江宁波315211 浙江省病理生理学技术研究重点实验室浙江宁波315211 

出 版 物：《宁波大学学报（理工版）》 (Journal of Ningbo University：Natural Science and Engineering Edition)

年 卷 期：2024年第37卷第1期

页      面：84-92页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：浙江省基础公益研究计划(LGF18C060001) 宁波市公益类科技计划(2021S135) 

主　　题：柯萨奇病毒A组6型 肠道病毒 分子进化 时空传播分析 生物信息学 

摘      要：柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是手足口病的主要病原体,可引起非典型手足口病和中枢神经系统疾病,对儿童造成严重的疾病负担,尚无上市的疫苗和抗病毒药物.基于3288条CV-A6中国株VP1序列,利用Nextstrain平台的augur病原体生物信息分析包,构建了CV-A6的时间尺度分子进化树,确定了进化分支和分支突变,分析了分支突变与抗原表位之间的联系.进一步分析了CV-A6中国株各分支在中国七大地理区域的时空分布和优势分支,绘制了主要分支的时空传播路线.结果发现,CV-A6中国株主要分为B、C和D三个进化分支以及D2、D3a和D3b三个子分支,抗原表位处的突变形成了新的进化分支,促进了病毒的流行.华南和华东是CV-A6中国株的主要起源地,华南和华东相互输出、华东输出全国是中国株的主要传播模式.对CV-A6中国株的分子进化和时空传播分析,为CV-A6引起的手足口病等疫情的监测、预警和防控提供了重要支持.