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黄素蛋白单加氧酶在天然产物生物合成中的功能研究

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中国中药杂志 2025年第1期 71-77页

作者：程梦雅刘畅谭何新上海理工大学健康科学与工程学院海军军医大学药学院

黄素蛋白单加氧酶(flavoprotein monooxygenases, FPMOs)和细胞色素P450(cytochrome P450, CYP450)氧化酶是自然界中重要的单加氧酶，在多种生命活动中催化重要的氧化还原反应，并负责合成高度复杂的天然产物。P450氧化酶已经有较多的... 详细信息

黄素蛋白单加氧酶(flavoprotein monooxygenases, FPMOs)和细胞色素P450(cytochrome P450, CYP450)氧化酶是自然界中重要的单加氧酶，在多种生命活动中催化重要的氧化还原反应，并负责合成高度复杂的天然产物。P450氧化酶已经有较多的报道，在过去的研究中也发现多种FPMOs,但这些酶的分类、催化反应、催化机制等方面仍然未被系统分析。该文系统地总结了FPMOs的最新研究进展，首先根据序列相似性和特定的结构特征对FPMOs进行分类，并详细阐述了植物B类FPMOs在天然产物生物合成途经中的3种亚家族(FMO、BVMO、NMO)的催化特点。B类FPMOs包括2个典型的Rossmann折叠基序(FAD结合域GxGxxG和NADPH结合域GxGxxA),和1个位于中间的FMO识别基序FxGxxxHxxxF/Y/W。这些酶在多种代谢路径中扮演着关键角色，精确调控植物的生长发育。该文还总结了植物B类FPMOs的应用，并通过具体实例展示了其在生长素、靛蓝及氰苷等天然产物合成中的应用潜力等。这些分析，将会拓展和增强人们对FPMOs的认识，推动FPMOs从基础研究走向实际应用，通过FPMOs设计出更加优化的生物合成路径，以期为农业生产、植物保护、天然产物生物合成及合成生物学等领域提供新的策略和工具。

关键词：黄素蛋白单加氧酶单加氧酶生物合成

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基于最大影响力集合的主动学习方法

计算机科学 2025年第1期52卷 289-297页

作者：李雅和谢志鹏复旦大学计算机科学技术学院上海200438

随着深度学习技术的不断进步,其已经在许多领域广泛应用。但深度模型的训练需要消耗大量标注数据,时间与资源成本高,如何利用尽可能少的标注数据达到最佳模型效果成为一个重要的研究课题。主动学习的提出正是为了解决这一问题,其旨在选... 详细信息

随着深度学习技术的不断进步,其已经在许多领域广泛应用。但深度模型的训练需要消耗大量标注数据,时间与资源成本高,如何利用尽可能少的标注数据达到最佳模型效果成为一个重要的研究课题。主动学习的提出正是为了解决这一问题,其旨在选择最有价值的样本进行标注并用于模型训练。传统的主动学习策略通常关注不确定性或多样性,旨在查询最困难或最具代表性的样本。然而,在主动学习问题中,这些方法通常没有考虑标注样本和无标注样本之间的交互作用。另一类主动学习方法则使用辅助网络进行样本选择,但这些方法通常会增加计算复杂度。在上述背景下,提出一种新的主动学习算法,旨在通过考虑不同样本之间的相互作用,综合衡量候选样本对其他样本的影响力与不确定性,来最大限度地提高模型的整体性能增益。所提算法首先根据样本隐含层表征之间的距离估计样本相互之间的影响力,进一步根据候选样本的影响力与无标注样本的不确定性估计该样本能够带来的潜在增益,并迭代地选择全局增益最大的样本进行标注。进一步在一系列不同领域的多种任务上将该方法与其他主动学习策略进行了比较,实验结果表明,该方法在所有任务中的表现均显著优于所有基线方法。进一步的量化分析实验也证明该方法在不确定性和多样性之间取得了良好的权衡,并探究了主动学习不同阶段应该注重的因素。

关键词：主动学习深度学习不确定性

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白细胞计数与静脉血栓栓塞的关联：双向孟德尔随机化研究

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中国临床药理学与治疗学 2025年

作者：郭展立王媛张磊李嘉媛李若柠冬颖孙建军内蒙古医科大学药学院内蒙古医科大学附属医院药学部

目的：探讨中性粒细胞、单核细胞、嗜酸性细胞、嗜碱性细胞、淋巴细胞5种白细胞计数与静脉血栓栓塞（VTE）之间的因果关联。方法：利用孟德尔随机化（MR）分析方法，以5种白细胞相关的遗传变异基因作为工具变量，以VTE发生风险作为结局... 详细信息

目的：探讨中性粒细胞、单核细胞、嗜酸性细胞、嗜碱性细胞、淋巴细胞5种白细胞计数与静脉血栓栓塞（VTE）之间的因果关联。方法：利用孟德尔随机化（MR）分析方法，以5种白细胞相关的遗传变异基因作为工具变量，以VTE发生风险作为结局变量，采用逆方差加权法（IVW）为主要分析方法，MR-Egger回归法、加权中位数（WME）、简单模型及加权模式法作为补充，对5种白细胞计数与VTE之间的因果关联进行分析，再进行反向MR分析。结果：中性粒细胞和淋巴细胞计数对VTE发生风险具有因果关联，其中中性粒细胞计数IVW（OR=0.867，95%CI：0.761-0.981，P=0.031），MR-Egger（OR=0.754，95%CI：0.571-0.996，P=0.048），加权中位数法（OR=0.846，95%CI：0.729-0.981，P=0.027），加权模型（OR=0.748，95%CI：0.595-0.942，P=0.014）；淋巴细胞计数IVW（OR=0.838，95%CI：0.741-0.949，P=0.005），加权中位数法（OR=0.024，95%CI：0.718-0.977，P=0.024）。反向MR分析表明VTE发生风险对中性粒细胞计数有因果关联，其中IVW（OR=0.989，95%CI：0.980-0.999，P=0.024）。结论：中性粒细胞与淋巴细胞计数对VTE发生风险有因果关联，中性粒细胞与淋巴细胞数量降低可能会增加VTE的发生风险；VTE发生风险对中性粒细胞计数有因果关联，VTE发生风险降低可能会增加中性粒细胞数量。需进一步研究来了解这种因果关系背后的潜在生物学机制。

关键词：静脉血栓栓塞血栓栓塞疾病白细胞计数孟德尔随机化

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基于符号知识的选项发现方法

计算机科学 2025年第1期52卷 277-288页

作者：王麒迪沈立炜吴天一复旦大学计算机科学技术学院上海200438

基于选项(Option)的层次化策略学习是分层强化学习领域的一种主要实现方式。其中,选项表示特定动作的时序抽象,一组选项以多层次组合的方式可解决复杂的强化学习任务。针对选项发现这一目标,已有的研究工作使用监督或无监督方式从非结... 详细信息

基于选项(Option)的层次化策略学习是分层强化学习领域的一种主要实现方式。其中,选项表示特定动作的时序抽象,一组选项以多层次组合的方式可解决复杂的强化学习任务。针对选项发现这一目标,已有的研究工作使用监督或无监督方式从非结构化演示轨迹中自动发现有意义的选项。然而,基于监督的选项发现过程需要人为分解任务问题并定义选项策略,带来了大量的额外负担;无监督方式发现的选项则难以包含丰富语义,限制了后续选项的重用。为此,提出一种基于符号知识的选项发现方法,只需对环境符号建模,所得知识可指导环境中多种任务的选项发现,并为发现的选项赋予符号语义,从而在新任务执行时被重复使用。将选项发现过程分解为轨迹切割和行为克隆两阶段步骤:轨迹切割旨在从演示轨迹提取具备语义的轨迹片段,为此训练一个面向演示轨迹的切割模型,引入符号知识定义强化学习奖励评价切割的准确性;行为克隆根据切割得到的数据监督训练选项,旨在使选项模仿轨迹行为。使用所提方法在多个包括离散和连续空间的领域环境中分别进行了选项发现和选项重用实验。选项发现中轨迹切割部分的实验结果显示,所提方法在离散和连续空间环境中的切割准确率均高出基线方法数个百分点,并在复杂环境任务的切割中提高到20%。另外,选项重用实验的结果证明,相较于基线方法,赋予符号语义增强的选项在新任务重用上拥有更快的训练速度,并在基线方法无法完成的复杂任务中仍然得到良好收敛。

关键词：分层强化学习演示学习选项发现马尔可夫决策过程

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堆叠场景下的物体优先级感知抓取网络

复旦学报(自然科学版) 2025年

作者：周家康任煜轩殳峰复旦大学工程与应用技术研究院复旦大学脑科学转化研究院悉尼大学电气与计算机工程学院

针对堆叠场景中机械臂抓取顺序紊乱导致环境结构稳定性被破坏的问题，本文提出了一种基于物体优先级分类的新型抓取神经网络模型。首先，利用横纵卷积和折半卷积的组合模块，对彩色深度(Red Green Blue-Depth，RGB-D)图像进行特征提取... 详细信息

针对堆叠场景中机械臂抓取顺序紊乱导致环境结构稳定性被破坏的问题，本文提出了一种基于物体优先级分类的新型抓取神经网络模型。首先，利用横纵卷积和折半卷积的组合模块，对彩色深度(Red Green Blue-Depth，RGB-D)图像进行特征提取；接着，利用多尺度池化方法对物体特征信息进行深层次提取，增强模型在面对不同尺度物体时的鲁棒性；最后，引入独特的物体优先级分类预测模块，提升了模型对物体的感知能力。分析结果表明：本文模型在堆叠场景中的表现优于现有的其他抓取检测模型，准确率达到了74.1%，模型能够准确解析物体间的堆叠关系，确保机械臂按物体优先级顺序进行抓取，避免抓取顺序紊乱的问题。此外，在单目标场景中的高性能以及在真实环境中的泛化能力和鲁棒性也得到了验证。

关键词：深度学习神经网络平面抓取检测物体优先级

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新质生产力的理论框架、体制机制与未来图景

新疆师范大学学报(哲学社会科学版) 2025年第1期 78-88页

作者：周文何雨晴复旦大学马克思主义研究院复旦大学马克思主义经济学中国化研究中心

新质生产力本质上是一种先进生产力，新质生产力的理论框架是在生产力理论发展演进中形成的。古典政治经济学家对生产力理论的早期探索为马克思主义生产力理论的建立提供了有益借鉴，马克思对生产力理论的系统阐述为新质生产力的提出奠... 详细信息

新质生产力本质上是一种先进生产力，新质生产力的理论框架是在生产力理论发展演进中形成的。古典政治经济学家对生产力理论的早期探索为马克思主义生产力理论的建立提供了有益借鉴，马克思对生产力理论的系统阐述为新质生产力的提出奠定了坚实的理论基础。新质生产力是马克思主义生产力理论中国化时代化的最新成果。新质生产力的运行只有在与之相适应的新型生产关系中才能实现，必须进一步全面深化改革，形成与之相适应的新型生产关系。一是更好实现市场和政府有机结合，激发新质生产力的创新活力；二是健全完善新型举国体制，为加快培育发展新质生产力提供体制保障；三是扩大高水平对外开放，为新质生产力营造良好的国际环境。产业是新质生产力的载体，新质生产力的未来图景必然在现代化产业体系中展现。因此，要促进数实融合，推动传统产业深度转型；要引领产业变革新浪潮，持续壮大战略性新兴产业；要积极开辟发展新赛道，推动未来产业蓬勃发展。

关键词：新质生产力马克思主义生产力理论全面深化改革新型举国体制现代化产业体系

提升天气预报能力:数据同化中初始条件敏感性与误差动态的问题

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中国科学:地球科学 2025年

作者：符伟伟复旦大学大气与海洋科学系复旦大学极地海冰气系统与天气气候教育部重点实验室复旦大学极端天气气候与健康风险互联和治理国际卓越中心

在现代的数值预报中,数据同化(data assimilation)是不可或缺的过程(Kalnay, 2002).研究表明,通过将实时的观测数据整合到预报模型中,无论是短期天气预报(Bauer等, 2015; Bannister, 2017)还是长期气候预测(Karspeck等, 2013; Mochizuki...

在现代的数值预报中,数据同化(data assimilation)是不可或缺的过程(Kalnay, 2002).研究表明,通过将实时的观测数据整合到预报模型中,无论是短期天气预报(Bauer等, 2015; Bannister, 2017)还是长期气候预测(Karspeck等, 2013; Mochizuki等, 2016)的精度都能得到显著提高.

关键词：

《医药导报》是青年人医药科研成长和学术发展的引路人

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医药导报 2025年第1期44卷 167-168页

作者：黄锐华中科技大学同济医学院药学院武汉430030

20年前,我还是一个刚刚毕业留校工作的科研“小白”,就在2004年,我学术生涯中的第一篇论文《湖北省中医药发展的思考》发表于《医药导报》2004年第12期第978-979页。论文题目好大呀,当年确实“胆子很大,野心也不小”,现在想来,真还有点... 详细信息

20年前,我还是一个刚刚毕业留校工作的科研“小白”,就在2004年,我学术生涯中的第一篇论文《湖北省中医药发展的思考》发表于《医药导报》2004年第12期第978-979页。论文题目好大呀,当年确实“胆子很大,野心也不小”,现在想来,真还有点汗颜。回忆起拿到刊载有我人生第一篇论文的《医药导报》时那种兴奋、激动和喜悦至今难忘。这篇论文现在看来虽然有些稚嫩,但却值得我永久珍藏!论文发表给予的鼓舞与信心是我在学术道路上继续前进的动力。回忆《医药导报》给我的帮助和引导,我非常感动。

关键词：医药科研成长/青年人医药科学研究学术发展

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探讨皮粘散调控Wnt4/β-catenin信号通路促进慢性皮肤溃疡小鼠创面愈合的作用机制

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北京中医药大学学报 2025年

作者：阙平鑫毅肖湘曾立赵显斌肖敏唐宋琪成都中医药大学药学院海南医科大学成都中医药大学

目的　探讨皮粘散调控Wnt4/β-catenin信号通路促进慢性皮肤溃疡小鼠创面愈合的作用机制。方法　BALB/c小鼠按随机数字表法分为空白组、模型组、皮粘散组、皮粘散去皮组、皮粘散皮部组、抑制剂组、皮粘散+抑制剂组，每组6只。除空白组... 详细信息

目的　探讨皮粘散调控Wnt4/β-catenin信号通路促进慢性皮肤溃疡小鼠创面愈合的作用机制。方法　BALB/c小鼠按随机数字表法分为空白组、模型组、皮粘散组、皮粘散去皮组、皮粘散皮部组、抑制剂组、皮粘散+抑制剂组，每组6只。除空白组外，其余各组采用埋置异物法制备慢性皮肤溃疡模型。造模术后，空白组不作处理，模型组以呋喃西林溶液清理创面，皮粘散组、皮粘散去皮组、皮粘散皮部组分别在小鼠皮肤创面涂抹对应药物0.1 g；抑制剂组腹腔注射3-（4-甲基苯基磺酰胺基）苯甲酸甲酯（MSAB）10 mg/kg；皮粘散+抑制剂组在小鼠皮肤创面涂抹皮粘散0.1g，并腹腔注射MSAB（10 mg/kg）。每日1次，连续14日。于给药的第1、3、7、14天观测创面愈合情况；HE染色法观察创面组织病理变化；免疫荧光法检测创面角蛋白10（CK10）、角蛋白14（CK14）、细胞增殖核抗原（Ki-67）、α-平滑肌肌动蛋白（α-SMA）和β-连环蛋白（β-catenin）表达；蛋白质印迹法检测无翅型MMTV整合位点家族成员4（Wnt4）及β-catenin蛋白表达情况。结果　与模型组比较，皮粘散组创面面积缩小，创面愈合率升高（P＜0.05）；CK10、CK14、Ki-67、α-SMA、β-catenin及Wnt4蛋白表达增加（P＜0.05）。与皮粘散组比较，皮粘散皮部组和皮粘散去皮组创面愈合率降低（P＜0.05）。皮粘散去皮组创面愈合率及CK10、CK14、Ki-67、α-SMA蛋白荧光表达均低于皮粘散皮部组（P＜0.05）。与皮粘散组比较，皮粘散+抑制剂组创面愈合率降低，CK10、CK14、Ki-67、α-SMA、β-catenin及Wnt4蛋白表达降低（P＜0.05）。结论　皮粘散可通过调节Wnt4/β-catenin信号通路促进小鼠慢性皮肤溃疡创面愈合，其中皮部药物（牛皮、桑白皮、地骨皮）在促进创面愈合的过程中发挥了关键作用，是中医学“以皮治皮”理论的具体应用。

关键词：慢性皮肤溃疡皮粘散创面愈合无翅型MMTV整合位点家族成员4/β-连环蛋白通路法象药理小鼠