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三带双锯鱼（Amphiprion ocellaris）乙酰胆碱受体基因克隆及生物信息学分析

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基因组学与应用生物学 2024年

作者：张文哲范瑜轩吴勇罗素兰广西特色生物医药重点实验室广西大学医学院

鱼类的许多生理过程都受到烟碱型乙酰胆碱受体（nicotinic acetylcholine receptors）调节，如神经肌肉信号和副交感神经传递。在海洋环境中，三带双锯鱼（Amphiprion ocellaris）被芋螺（Conus）捕食与烟碱型乙酰胆碱受体密切相关。本... 详细信息

鱼类的许多生理过程都受到烟碱型乙酰胆碱受体（nicotinic acetylcholine receptors）调节，如神经肌肉信号和副交感神经传递。在海洋环境中，三带双锯鱼（Amphiprion ocellaris）被芋螺（Conus）捕食与烟碱型乙酰胆碱受体密切相关。本研究以三带双锯鱼各组织的cDNA作为模板，克隆三带双锯鱼烟碱型乙酰胆碱受体不同亚基的基因，在此基础上进行生物信息学分析，同时构建系统进化树。研究结果表明，从三带双锯鱼肌肉组织中克隆得到了肌肉型烟碱乙酰胆碱受体α1（cholinergic receptor nicotinic alpha1 subunit， chrnα1）和乙酰胆碱受体ε （cholinergic receptor nicotinic epsilon subunit， chrne）基因序列；从脑组织中克隆获得神经性烟碱乙酰胆碱受体α10（cholinergic receptor nicotinic alpha10 subunit， chrnα10）基因序列。将得到的基因序列利用Colabfold软件对其编码蛋白的3D结构进行预测，结果与已经解析的烟碱型乙酰胆碱受体的结构高度相似。采用荧光定量PCR技术对chrna、chrne、chrna10基因在三带双锯鱼肌肉、脑、肠组织中的表达水平进行检测，结果显示，肌肉组织中chrna、chrne基因表达量非常高，而chrna10基因在脑组织中的表达量较低，在肌肉、肠道中均没有表达。进化树结果表明不同物种间乙酰胆碱受体序列高度保守，与模式生物斑马鱼（Danio rerio）几乎同源。

关键词：三带双锯鱼基因克隆烟碱型乙酰胆碱受体

卡马西平对三叉神经痛大鼠三叉神经节及血清中BDNF表达变化的影响

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中南大学学报（医学版） 2024年第1期49卷 11-20页

作者：宋玉丰周敏熊嘉文黄若瑜沈文浩占婷谢玉婷高云熊伟南昌大学附属口腔医院预防保健科江西省口腔生物医学重点实验室江西省口腔疾病临床医学研究中心南昌330006 南昌大学基础医学院生理教研室南昌330006

目的:三叉神经痛(trigeminal neuralgia,TN)是一种严重的慢性神经病理性疼痛,主要影响三叉神经分布区域,临床治疗效果不佳。TN的治疗方法众多,但目前临床上主要是通过服用卡马西平(carbamazepine,CBZ)来抑制疼痛。脑源性神经营养因子(br... 详细信息

目的:三叉神经痛(trigeminal neuralgia,TN)是一种严重的慢性神经病理性疼痛,主要影响三叉神经分布区域,临床治疗效果不佳。TN的治疗方法众多,但目前临床上主要是通过服用卡马西平(carbamazepine,CBZ)来抑制疼痛。脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)和慢性痛密切相关。本研究通过慢性压迫性损伤眶下神经(chronic constriction injury of the infraorbital nerve,ION-CCI)大鼠模型观察CBZ处理对TN大鼠三叉神经节(trigeminal ganglion,TG)和血清中BDNF表达的影响。方法:建立雄性SD大鼠ION-CCI模型,并将其随机分为假手术(sham)组、TN组、TN+低剂量(20 mg/kg)CBZ处理组、TN+中剂量(40 mg/kg)CBZ处理组、TN+高剂量(80 mg/kg)CBZ处理组。在手术前后定时测量各组大鼠的面部机械痛阈(mechanical pain threshold)。使用实时聚合酶链反应技术测定各组大鼠TG中BDNF及酪氨酸激酶受体B(tyrosine kinase receptor B,TrkB)的mRNA含量,免疫荧光技术观察各组大鼠TG中BDNF蛋白质在神经元上的表达情况,蛋白质印迹法检测各组大鼠TG中BDNF、TrkB、细胞外调节蛋白激酶(extracellular regulated protein kinases,ERK)及磷酸化的细胞外调节蛋白激酶(phospho-extracellular regulated protein kinases,p-ERK)的蛋白质表达变化,酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测各组大鼠血清中BDNF的表达变化。结果:行为学检测结果表明:手术前,各组大鼠右侧面部感觉区域的机械痛阈差异均无统计学意义(均P>0.05);术后第3天开始,TN组大鼠机械痛阈与sham组相比均明显降低(均P神经元特异性核蛋白(neuron-specific nuclear protein,NeuN)主要共表达在神经元上,与sham组比较BDNF和NeuN水平升高(P<0.05),TN+20 mg/kg CBZ处理组、TN+40 mg/kg CBZ处理组、TN+80 mg/kg CBZ处理组与TN组大鼠比较二者表达均降低(均P<0.05)。ELISA检测结果显示:TN组大鼠血清中BDNF的水平较sham组显著升高(P<0.05),TN+20 mg/kg CBZ处理组、TN+40 mg/kg CBZ处理组、TN+80 mg/kg CBZ处理组均较TN组大鼠降低(均P<0.05)。Spearman相关分析显示血清中BDNF水平与机械痛阈呈负相关(r=−0.650,P<0.01)。结论:CBZ处理可以抑制TN大鼠TG中BDNF及其受体TrkB的表达,降低TN大鼠血清中BDNF水平及ERK信号通路磷酸化水平,进而抑制TN。可以考虑将血清中BDNF水平作为诊断TN和评估预后的指标。

关键词：三叉神经痛三叉神经节脑源性神经营养因子酪氨酸激酶受体B 卡马西平

模式生物果蝇在中医药现代研究中的优势与应用前景

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中国中药杂志 2024年

作者：何丽张永宣李泊潼秦玉洁吴依凡刘永琦修明慧和建政甘肃中医药大学公共卫生学院甘肃中医药大学基础医学院敦煌医学与转化教育部重点实验室

中医药具有多种活性成分，生物活性多样，毒副作用小且不宜耐药，被广泛应用于防治各种疾病。经典模式生物黑腹果蝇以其生命周期短、生理结构简单、培养成本低及操作简便等优势，借助转基因和基因定点敲除等基因调控技术在中医药现代研... 详细信息

中医药具有多种活性成分，生物活性多样，毒副作用小且不宜耐药，被广泛应用于防治各种疾病。经典模式生物黑腹果蝇以其生命周期短、生理结构简单、培养成本低及操作简便等优势，借助转基因和基因定点敲除等基因调控技术在中医药现代研究中得到了广泛应用。该文以炎症性肠病、衰老、肿瘤、神经退行性疾病、睡眠障碍等疾病为例概述果蝇在中医药现代研究中的研究进展，以期为模式生物果蝇在中医药领域的研究应用提供新的方法和技术。

关键词：黑腹果蝇中医药现代研究炎症性肠病衰老肿瘤神经退行性疾病睡眠障碍

基于空间域与频域特征自适应融合和类间边界区域增强的三维海马分割

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解剖学报 2024年第1期55卷 73-81页

作者：白贺滕野冯蕾孟海伟汤煜春刘树伟山东大学基础医学院解剖学与神经生物学系断层解剖学与数字人研究院济南250012 山东大学脑与类脑科学研究院济南250012

目的海马萎缩是诊断阿尔茨海默病等诸多精神疾病的临床重要标志,因此准确分割海马是一个重要的科学问题。随着深度学习的发展,人们提出了大量先进的自动分割方法。然而,由于MRI中各种噪声的影响以及海马不同类别之间不清晰的边界,三维... 详细信息

目的海马萎缩是诊断阿尔茨海默病等诸多精神疾病的临床重要标志,因此准确分割海马是一个重要的科学问题。随着深度学习的发展,人们提出了大量先进的自动分割方法。然而,由于MRI中各种噪声的影响以及海马不同类别之间不清晰的边界,三维海马分割仍然具有挑战性。因此本文旨在提出新的自动分割方法来更精确地分割海马头、体、尾。方法为了克服这些挑战,本文提出了两个策略。一种是空间域与频域特征自适应融合策略,通过快速傅立叶变换和卷积自动选择合适的频率组合,减少噪声对特征提取的影响。另一种是类间边界区域增强策略,它允许网络通过加权每个类之间边界区域的损失函数来增强对边界区域的学习,以达到精确定位边界和调节海马头、体、尾大小的目的。结果在50例青少年大脑MRI数据集上进行的实验表明,我们的方法实现了较先进的海马分割,海马头、体、尾相较于现有的方法都取得了一定的提升。消融实验证明我们提出的两种策略有效,我们还在260例Task04_Hippocampus数据集上验证了网络具有强大的泛化能力,说明本文提出的方法可用于更多的海马分割场景。结论我们提出的方法可以帮助临床医生更清楚地观测海马萎缩,并完成更精确的病情诊断和追踪。

关键词：空间域与频域特征自适应融合类间边界区域增强医学图像分割海马分割人

正常和帕金森病患者基底神经节的转录差异分析

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解剖学报 2024年第4期55卷 482-492页

作者：俎高钰李凤娇咸伟伟郭旸洋赵百成李文生尤琳雅复旦大学基础医学院人体解剖学与组织学胚胎学系上海200032 上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室上海200032

目的分析人基底神经节各核团的分子标志物以及不同核团间、不同性别、疾病相关的差异表达,探讨差异表达基因的生物学功能。方法针对来源于10具人尸脑45个基底神经节核团样本,按是否有神经疾病分为对照组和帕金森病组,对照组按性别分为... 详细信息

目的分析人基底神经节各核团的分子标志物以及不同核团间、不同性别、疾病相关的差异表达,探讨差异表达基因的生物学功能。方法针对来源于10具人尸脑45个基底神经节核团样本,按是否有神经疾病分为对照组和帕金森病组,对照组按性别分为女性和男性组,提取各样本RNA进行高通量转录组测序。生物信息学分析鉴定对照组各核团的分子标志物、不同核团间、不同性别以及帕金森病相关的差异表达基因,并对差异表达基因进行基因富集分析和功能注释。结果测序分析发现,top差异表达基因包含尾状核的DRD1、FOXG1、FAM183A;黑质的SLC6A3、EN1、SLC18A2、TH;苍白球的MEPE、FGF10;底丘脑的SLC17A6、PMCH、SHOX2等。其中,壳核top差异表达基因与尾状核存在部分重叠,如DRD1、FOXG1等。对照组不同核团间鉴定出大量差异表达基因,尾状核与苍白球间存在数量最多的差异表达基因(9321),其次是壳核与苍白球间(6341),尾状核与黑质间(6054)。黑质与底丘脑间存在数量最少的差异表达基因(44)。基因富集分析发现,尾状核与苍白球间下调基因显著富集在神经元髓鞘形成、细胞迁移调节等;壳核与苍白球上调基因富集在化学突触传递、膜电位调节、金属离子转运、神经递质转运等,而下调基因富集在神经元髓鞘形成、细胞黏附等;尾状核与黑质上调基因富集在化学突触传递、轴突传导等,而下调基因富集在神经元髓鞘形成等。另外,尾状核、壳核、黑质、苍白球和底丘脑分别鉴定到性别差异上调基因468、548、1402、333和341个,以及下调基因756、988、2532、444和1372个。基因富集分析发现,上调基因大多富集在免疫反应相关通路,下调基因富集在化学突触传递等。最后,尾状核、壳核、黑质、苍白球和底丘脑分别鉴定出帕金森病特异上调基因709、852、276、507和416个,以及下调基因830、2014、1218、836和1730个。基因富集分析发现,上调基因大多富集在凋亡信号调节,下调基因大多富集在化学突触传递、动作电位调节等。结论我们发现并分析了人基底神经节不同核团的分子标志物、核团间差异、性别差异和帕金森病的相关差异。

关键词：基底神经节帕金森病高通量转录组测序差异表达分析人

心脏弥漫大B细胞淋巴瘤11例临床病理特征、疗效、预后和突变分析

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白血病．淋巴瘤 2024年第2期33卷 97-103页

作者：赵娜施晴程澍王黎许彭鹏赵维莅上海交通大学医学院附属瑞金医院血液科医学基因组学国家重点实验室上海血液学研究所上海200025 上海市浦东医院复旦大学附属浦东医院血液科上海201399

目的探讨心脏弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的临床病理特征、突变情况、疗效及预后影响因素。方法回顾性病例系列研究。回顾性分析2016年1月至2020年10月上海交通大学医学院附属瑞金医院收治的11例心脏DLBCL患者的临床资料。采用NovaSe... 详细信息

目的探讨心脏弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的临床病理特征、突变情况、疗效及预后影响因素。方法回顾性病例系列研究。回顾性分析2016年1月至2020年10月上海交通大学医学院附属瑞金医院收治的11例心脏DLBCL患者的临床资料。采用NovaSeq测序平台对5例患者基因突变进行检测,通过公共数据库对测序数据进行生物信息学分析,确定致病性基因突变位点。采用Kaplan-Meier法分析患者无进展生存(PFS)、总生存(OS),采用单因素Cox比例风险模型分析影响患者预后相关因素。结果11例心脏DLBCL患者中男性5例,女性6例;年龄[M(Q_(1),Q_(3))]61岁(45岁,70岁);均为非生发中心B细胞(non-GCB)型;原发性2例,继发性9例;Ann Arbor分期Ⅲ~Ⅳ期9例;乳酸脱氢酶(LDH)升高10例;国际预后指数(IPI)评分≥3分9例。11例患者中,9例接受了以R-CHOP(利妥昔单抗、环磷酰胺、表柔比星/盐酸多柔比星脂质体、长春新碱、泼尼松)为基础的一线治疗方案,其中8例获得完全缓解(CR),1例疾病稳定(SD);1例接受了IR2(伊布替尼、利妥昔单抗、来那度胺)方案治疗,疗效为SD;1例患者仅接受支持治疗,疗效为疾病进展。随访39.9个月(25.6个月,57.3个月),11例患者3年PFS率为54.5%,3年OS率为77.9%。单因素Cox回归分析显示,性别、B症状、Ann Arbor分期、LDH水平、结外病变数、IPI评分与患者的PFS和OS均无相关性(均P>0.05)。5例行基因检测患者中,KMT2D和PIM1突变各2例,且KMT2D突变仅出现在继发性心脏DLBCL患者中(2/3),PIM1突变仅出现在原发性心脏DLBCL患者中(2/2)。结论心脏DLBCL患者多为non-GCB型,患者临床分期较高,可获益于R-CHOP方案。PIM1和KMT2D是心脏DLBCL的常见突变基因。

关键词：淋巴瘤,大B细胞,弥漫性心脏肿瘤治疗结果预后

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环二肽生物活性的研究进展

中国抗生素杂志 2024年第1期49卷 1-12页

作者：郑婷莉朱柯石兆丰谭俊王梁华焦炳华孙铭娟海军军医大学基础医学院学员五大队上海200433 海军军医大学基础医学院学员二大队上海200433 海军军医大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室上海200433

环二肽是两个氨基酸通过肽键缩合而成的化合物。环二肽具有独特的结构赋予其两个氢供体与氢受体的特征,它与不同靶标物质结合后能产生诸多效应,从而表现出多种生物活性。环二肽来源广泛,随着现代科技的发展,可以从真菌和细菌中提取分离... 详细信息

环二肽是两个氨基酸通过肽键缩合而成的化合物。环二肽具有独特的结构赋予其两个氢供体与氢受体的特征,它与不同靶标物质结合后能产生诸多效应,从而表现出多种生物活性。环二肽来源广泛,随着现代科技的发展,可以从真菌和细菌中提取分离出环二肽,也可以通过生物或化学方法合成环二肽。除了在抗生素、抗肿瘤药物研发、抗氧化、降血糖等方面具有巨大的潜力外,在调节能量代谢、调控食欲、改善神经系统和降低心脏传导速率等方面也有很广阔的前景。因此,本文对近5年来发现的环二肽进行综述,主要介绍了环二肽的来源、结构与理化性质,并对其生物活性展开重点阐述,并提出了建议和展望。

关键词：环二肽生物活性抗肿瘤抑菌研究进展

孤独症儿童血浆中缬氨酸水平变化及其与发育商的关系

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北京大学学报(医学版) 2024年

作者：徐新杰蔡小娥孟凡超龙波尤欣张嵘中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院医学科学研究中心北京市海淀医院康复医学科首都医科大学附属北京安定医院国家精神心理疾病临床医学研究中心精神疾病诊断与治疗北京市重点实验室中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院免疫内科北京大学神经科学研究所北京大学基础医学院神经生物学系神经科学教育部重点实验室卫生部神经科学重点实验室北京大学医学部孤独症研究中心

目的：比较孤独症儿童与健康儿童血浆中缬氨酸水平的差异，并探究孤独症儿童血浆缬氨酸水平与其发育商评分的相关性。方法：共招募29例孤独症儿童作为病例组，同期招募30例同年龄段的正常儿童作为对照组。采用儿童孤独症评定量表（child... 详细信息

目的：比较孤独症儿童与健康儿童血浆中缬氨酸水平的差异，并探究孤独症儿童血浆缬氨酸水平与其发育商评分的相关性。方法：共招募29例孤独症儿童作为病例组，同期招募30例同年龄段的正常儿童作为对照组。采用儿童孤独症评定量表（childhood autism rating scale， CARS）对孤独症儿童的核心症状及其严重程度进行评估，采用Gesell发育量表（Gesell developmental schedules， GDS）评估儿童发育商，采用高效液相色谱-串联质谱法测定血浆缬氨酸水平，并比较两组间差异，分析病例组儿童血浆缬氨酸水平与其发育商评分间的相关性。结果：与对照组相比，孤独症组血浆缬氨酸水平显著偏低，差异有统计学意义（P学意义（P0.05）。根据CARS量表评分标准，将孤独症组儿童根据病情严重程度分为轻中度和重度两个亚组，在亚组之间进行比较发现，重度孤独症儿童在GDS量表适应性、精细运动、语言以及个人-社交方面的评分均显著低于轻中度孤独症儿童（P学意义（P>0.05）。结论：孤独症儿童血浆中缬氨酸水平偏低，且与其精细运动和个人-社交功能之间存在一定关联。

关键词：孤独症缬氨酸发育商

2PreS1重组蛋白的表达、纯化及疫苗效果评价

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中国病原生物学杂志 2024年第11期19卷 1300-1304,1311页

作者：胡明娜韩少伟张勇李飞新疆医科大学药学院新疆乌鲁木齐830011 桂林医学院附属医院广西肝脏损伤与修复分子医学重点实验室桂林医学院附属医院广西神经鞘脂代谢相关疾病基础研究重点实验室

目的本研究旨在通过原核表达系统表达和纯化乙型肝炎病毒(HBV)相关抗原PreS1的二聚体蛋白2PreS1,并评估其在小鼠体内的免疫效果。方法设计并构建pET28a-his-2PreS1载体及对照载体pET28a-his-PreS1,在大肠埃希菌原核表达系统分别表达重... 详细信息

目的本研究旨在通过原核表达系统表达和纯化乙型肝炎病毒(HBV)相关抗原PreS1的二聚体蛋白2PreS1,并评估其在小鼠体内的免疫效果。方法设计并构建pET28a-his-2PreS1载体及对照载体pET28a-his-PreS1,在大肠埃希菌原核表达系统分别表达重组蛋白2PreS1及PreS1。接着通过镍柱对目的蛋白纯化,利用考马斯亮蓝染色和Western blot技术对目标蛋白进行鉴定。随后,分别将纯化的2PreS1蛋白以及PreS1蛋白与弗式或CpG佐剂配制成疫苗,接种至8周龄的C57小鼠中,在初次免疫及两周后进行加强免疫。并于初次免疫后第21 d断尾采血,通过酶联免疫吸附实验(ELISA)技术测定小鼠血清中的PreS1抗体水平。结果在37℃220 rpm时用1 mmol/L IPTG持续诱导4 h为PreS1蛋白的最优表达条件,且在洗脱液中咪唑浓度为500 mmol/L时PreS1蛋白被洗脱;而2PreS1蛋白则在16℃200 rpm时用1 mmol/L IPTG低温过夜诱导表达得最为理想,且2PreS1蛋白在咪唑浓度为100 mmol/L被洗脱。通过ELISA分析,发现无论是采用弗式还是CpG作为佐剂,接种2PreS1疫苗的小鼠其血清中的PreS1抗体水平均显著高于仅接种PreS1疫苗的小鼠,且2PreS1与弗式佐剂配合使用时能诱导出比与CpG佐剂配合时更强烈的免疫反应。结论本研究不仅成功地表达和纯化了PreS1及其二聚体蛋白2PreS1,而且还通过在小鼠中的免疫应答实验证明了2PreS1相比单体PreS1蛋白具有更高的免疫原性,这表明了2PreS1作为疫苗成分的免疫效果更为优越。

关键词：乙型肝炎病毒(HBV) PreS1 2PreS1