三带双锯鱼（Amphiprion ocellaris）乙酰胆碱受体基因克隆及生物信息学分析

作     者：张文哲 范瑜轩 吴勇 罗素兰 

作者机构：广西特色生物医药重点实验室广西大学医学院 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2024年

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金((32170534)资助 

主　　题：三带双锯鱼 基因克隆 烟碱型乙酰胆碱受体 

摘      要：鱼类的许多生理过程都受到烟碱型乙酰胆碱受体（nicotinic acetylcholine receptors）调节，如神经肌肉信号和副交感神经传递。在海洋环境中，三带双锯鱼（Amphiprion ocellaris）被芋螺（Conus）捕食与烟碱型乙酰胆碱受体密切相关。本研究以三带双锯鱼各组织的cDNA作为模板，克隆三带双锯鱼烟碱型乙酰胆碱受体不同亚基的基因，在此基础上进行生物信息学分析，同时构建系统进化树。研究结果表明，从三带双锯鱼肌肉组织中克隆得到了肌肉型烟碱乙酰胆碱受体α1（cholinergic receptor nicotinic alpha1 subunit， chrnα1）和乙酰胆碱受体ε （cholinergic receptor nicotinic epsilon subunit， chrne）基因序列；从脑组织中克隆获得神经性烟碱乙酰胆碱受体α10（cholinergic receptor nicotinic alpha10 subunit， chrnα10）基因序列。将得到的基因序列利用Colabfold软件 对其编码蛋白的3D结构进行预测，结果与已经解析的烟碱型乙酰胆碱受体的结构高度相似。采用荧光定量PCR技术对chrna、chrne、chrna10基因在三带双锯鱼肌肉、脑、肠组织中的表达水平进行检测，结果显示，肌肉组织中chrna、chrne基因表达量非常高，而chrna10基因在脑组织中的表达量较低，在肌肉、肠道中均没有表达。进化树结果表明不同物种间乙酰胆碱受体序列高度保守，与模式生物斑马鱼（Danio rerio）几乎同源。