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大豆炭疽病病原物种类及其发生研究进展

微生物学通报 2021年

作者：刘勇曾华兰孙小芳何炼华丽霞蒋秋平何晓敏王明娟张敏四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所

大豆炭疽病是重要的世界性植物病害，造成大豆品质变劣、产量损失严重。本文综述了国内外大豆炭疽病的发生情况、炭疽菌种类及其特征，为了解该病流行病学和科学防治提供理论依据。

关键词：大豆炭疽病病原菌分生孢子

基于大豆基因组重测序的InDel标记开发及应用

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植物遗传资源学报 2021年第3期22卷 815-833页

作者：陈正杰宛永璐钟文娟陈四维周永航石盛佳蒋理戢沛城杨泽湖毛正轩牟方生四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所成都610300

大豆是我国重要的粮油作物,其中菜用大豆是营养丰富的蔬菜作物。然而,大豆中便于应用的分子标记较少。本研究选取18份大豆种质资源进行全基因组重测序分析,以此数据挖掘InDel位点,根据这些InDel位点开发分子标记,并验证这些InDel标记的... 详细信息

大豆是我国重要的粮油作物,其中菜用大豆是营养丰富的蔬菜作物。然而,大豆中便于应用的分子标记较少。本研究选取18份大豆种质资源进行全基因组重测序分析,以此数据挖掘InDel位点,根据这些InDel位点开发分子标记,并验证这些InDel标记的有效性和应用价值。经过严格筛选,获得17,977个插入/缺失为13~50 bp适合琼脂糖凝胶电泳检测的高多态性InDel位点,每条染色体上分布505~1355个,平均分布密度为12.60~35.76个/Mb。随机挑选73个InDel标记在18份大豆中验证其有效性,结果 43个具有多态性,多态性率为56.16%。利用25个多态性InDel标记对192份大豆种质资源(包含64份菜用大豆、65份春大豆、36份夏大豆、19份地方品种、8份野生大豆)进行遗传多样性分析,每个标记的信息多样性值PIC在0.17~0.46之间,平均为0.35。通过聚类分析,192份大豆被划分成24个亚群,成功将不同类型大豆划分到不同亚群。其中菜用大豆主要划分到第3#亚群,相似系数为0.66;少许划分到第1#亚群,相似系数为0.71。上述结果表明我国菜用大豆遗传背景较窄,今后菜用大豆杂交育种中应选择相似系数小的材料作为亲本以丰富遗传背景。另外,将这25个InDel标记用于13个杂交组合的F1真实性鉴定,结果与F1表型鉴定吻合,表明开发的InDel标记能有效鉴定不同杂交组合F1真实性。本研究所开发的多态性InDel标记在大豆遗传多样性分析、杂交种纯度鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位和分子标记辅助选择育种等方面具有很好的应用前景。

关键词：大豆基因组重测序 InDel标记遗传多样性分析 F1代真实性鉴定

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不同产区花生青枯病菌遗传多样性的分析

基因组学与应用生物学 2018年第3期37卷 1349-1355页

作者：华丽霞何炼蒋秋平曾华兰叶鹏盛韦树谷黄玲代顺冬四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所

花生青枯病是一种重要的毁灭性病害。本研究将菌落PCR引入到花生青枯菌的鉴定及基因组研究工作中，通过菌落PCR直接对四川省内不同花生产区收集得到的花生青枯病菌进行菌株鉴定并对供试菌株的重要功能基因phcA、hrp以及kcp进行遗传多样... 详细信息

花生青枯病是一种重要的毁灭性病害。本研究将菌落PCR引入到花生青枯菌的鉴定及基因组研究工作中，通过菌落PCR直接对四川省内不同花生产区收集得到的花生青枯病菌进行菌株鉴定并对供试菌株的重要功能基因phcA、hrp以及kcp进行遗传多样性的比较分析。结果表明，菌落PCR能快速有效地扩增得到不同片段大小的目标片段，通过菌落PCR产物的直接测序并进行序列比对，发现来源于不同生态环境、不同花生品种的青枯病菌株其重要的功能基因在序列上不存在差异，表明这些重要的功能基因具有高度保守的特性。菌落PCR省去了菌株的再培养以及DNA的提取等繁琐过程，不仅可实现对花生青枯菌高通量的分子鉴定，还可快速地开展基因克隆及基因组学方面的研究工作，在花生青枯菌的筛选、鉴定以及植物检疫方面具有较强的应用性，在花生青枯菌的基因组研究中具有重要的应用价值。

关键词：花生青枯病菌落PCR 遗传多样性分泌系统

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豆类炭疽病病原物种类及其发生研究进展

微生物学通报 2021年第11期48卷 4296-4305页

作者：刘勇叶鹏盛曾华兰孙小芳何炼华丽霞蒋秋平何晓敏王明娟张敏四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所四川成都610300

炭疽病是重要的世界性植物病害,造成大豆、绿豆等品质变劣,产量损失严重。本文综述了国内外大豆炭疽病的发生情况、炭疽菌种类及其特征,为了解该病的流行病学和科学防治提供理论依据。

关键词：大豆炭疽病病原菌分生孢子

免疫亲和净化-光化学衍生液相色谱检测不同样品中的黄曲霉毒素

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中国农业科技导报 2020年第7期22卷 181-187页

作者：华丽霞曾华兰蒋秋平何炼叶鹏盛张小军韦树谷张小红张敏王明娟何晓敏陈超四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所成都610300

黄曲霉毒素(aflatoxin,AFT)是一类具有高毒性的真菌毒素,常见的有AFTB 1、AFTB 2、AFTG 1、AFTG 2。对黄曲霉毒素进行快速、准确的检测是保障食品安全的重要技术手段。利用免疫亲和净化结合光化学柱后衍生液相色谱的方法对油脂类、坚果... 详细信息

黄曲霉毒素(aflatoxin,AFT)是一类具有高毒性的真菌毒素,常见的有AFTB 1、AFTB 2、AFTG 1、AFTG 2。对黄曲霉毒素进行快速、准确的检测是保障食品安全的重要技术手段。利用免疫亲和净化结合光化学柱后衍生液相色谱的方法对油脂类、坚果类及黄曲霉菌株培养物3种类型样品中的AFTB 1、AFTB 2、AFTG 1及AFTG 2进行定性定量分析,探索该方法对不同类型样品的净化及检测效果。结果表明:免疫亲和柱对3种类型样品的净化效果良好,能特异性对黄曲霉毒素进行吸附,没有明显的干扰峰。经过光化学衍生反应装置衍生后,4种黄曲霉毒素在25 min内得到良好的基线分离,AFTB 1、AFTG 1在0.1~40.0 ng·mL^-1的范围内有良好的线性关系,AFTB 2、AFTG 2在0.03~12.0 ng·mL^-1的范围内有良好的线性关系。利用免疫亲和净化-光化学衍生液相色谱法不仅能准确检测出油脂类及坚果类样品中的黄曲霉毒素,还能用于监测黄曲霉菌株的产毒情况及毒素积累规律,可为黄曲霉毒素的研究与防控提供重要技术支撑。

关键词：黄曲霉毒素免疫亲和光化学衍生液相色谱食品安全

41份绿豆种质资源遗传多样性分析及抗病性鉴定

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科技导报 2023年第16期41卷 89-99页

作者：刘勇叶鹏盛韦树谷曾华兰代顺冬赖佳黄玲孙小芳盛玉珍四川省农业科学院经济作物研究所成都610300

以2个年度3个试点田间试验数据为基础,对全国10个省区收集到的具有代表性的41份绿豆种质资源的主要农艺性状进行了评价,并分析了这些资源的表型遗传多样性和病毒病、白粉病抗性水平。结果表明:41份绿豆种质资源遗传多样性丰富,遗传多样... 详细信息

以2个年度3个试点田间试验数据为基础,对全国10个省区收集到的具有代表性的41份绿豆种质资源的主要农艺性状进行了评价,并分析了这些资源的表型遗传多样性和病毒病、白粉病抗性水平。结果表明:41份绿豆种质资源遗传多样性丰富,遗传多样性指数为0.321~2.039,数量性状的遗传多样性明显高于质量性状。数量性状中,百粒重的多样性指数最高,荚长的多样性指数最低;质量性状中,花色的多样性指数最高,成熟荚色的多样性指数最低。聚类分析将41份种质资源聚为5大类群,第I类群主要为矮秆、直立以及早熟资源,可作为育种优异亲本材料;第II类群主要是大籽粒材料,可作为改良绿豆籽粒大小的材料加以利用;第III类群主要是黑籽粒材料,可作为特色育种材料加以利用;第IV类群和第V类群主要为抗病材料,可作为挖掘病毒病和白粉病抗病基因的亲本材料。经病毒病抗性鉴定,从41份种质资源中筛选出中抗资源9份,抗病资源4份;经白粉病抗性鉴定,从41份种质资源中筛选出中抗资源11份,抗病资源4份,高抗资源1份。通过对质量性状和数量性状进行主成分分析,5个主成分因子对表型变异的累计贡献率达到了71.95%。

关键词：绿豆种质资源遗传多样性病毒病抗性白粉病抗性

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气吸式绿豆密植精量排种器的优化与试验

中国农业大学学报 2023年第9期28卷 147-157页

作者：韩丹丹王清颜君坤何彬吕小荣代顺冬陈霖四川农业大学机电学院四川雅安625014 四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所成都610300

针对绿豆作物在高密植条件下播种单粒率低的问题,采用单因素试验和三因素五水平二次正交旋转中心组合试验设计方法,以‘川渝绿1号’绿豆品种为研究对象,以工作压力、型孔直径和型孔数量为试验因素,以合格指数、重播指数、漏播指数为评... 详细信息

针对绿豆作物在高密植条件下播种单粒率低的问题,采用单因素试验和三因素五水平二次正交旋转中心组合试验设计方法,以‘川渝绿1号’绿豆品种为研究对象,以工作压力、型孔直径和型孔数量为试验因素,以合格指数、重播指数、漏播指数为评价指标,对本研究所设计的气吸式绿豆密植精量排种器的结构参数和工作参数以及排种器对作业速度和绿豆品种的适应性进行研究。结果表明:1)工作压力6.234 kPa、型孔直径2.255 mm、型孔数量60个为最优参数组合,此时排种器合格指数为98.75%、重播指数0.58%、漏播指数0.67%,满足设计要求;2)以最优参数组合进行速度适应性试验,作业速度≤7 km/h时,排种器合格指数均>97%、重播指数97.5%、重播指数<1%、漏播指数<2%,满足密植条件下绿豆精量播种的技术要求,且具有良好的品种适应性,可以为绿豆密植精量排种器的设计提供参考。

关键词：绿豆气吸式密植排种器优化

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赶黄草的转录组测序及分析

中草药 2017年第21期48卷 4507-4514页

作者：袁灿彭芳钟文娟牟方生戢沛城龚一耘蒲德强叶霄黄海燕杨晓张超四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所四川成都610300

目的获得赶黄草Penthorum chinense转录基因参考序列和表达量信息,探索赶黄草药用活性成分生物合成的遗传基础,为赶黄草的重要功能基因研究提供参考。方法采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术,对赶黄草进行转录组测序,对获得的数据... 详细信息

目的获得赶黄草Penthorum chinense转录基因参考序列和表达量信息,探索赶黄草药用活性成分生物合成的遗传基础,为赶黄草的重要功能基因研究提供参考。方法采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术,对赶黄草进行转录组测序,对获得的数据进行过滤组装,对得到的unigene进行比对注释,同时对本研究获得赶黄草活性成分合成相关代谢通路基因进行分析。结果共获得了40 005 442条有效的短读序,通过de novo拼接得到42 306个unigene,开放阅读框(ORF)分析共计得到518个ORF,其中75个ORF具有转录因子结构域。通过KEGG分析,检测到33、32、59、68个unigene分别参与黄酮类生物合成、固醇类生物合成、萜类骨架生物合成和羧酸代谢。结论本研究发现的这些基因对赶黄草遗传改良和药用活性物质的生物合成路径相关基因研究有着重要意义。

关键词：赶黄草转录组槲皮素黄酮类固醇类萜类

木霉菌T23胶毒素合成基因的生物信息学分析与克隆

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基因组学与应用生物学 2019年第3期38卷 1079-1086页

作者：华丽霞何炼蒋秋平曾华兰叶鹏盛张敏刘朝辉韦树谷四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所成都610300

胶毒素是生防木霉菌重要的次生代谢产物之一。本研究以生防木霉菌T23为供试材料,旨在通过生物信息学技术及表达分析,挖掘木霉菌T23中胶毒素合成候选基因,探索木霉菌胶毒素合成的分子调控机制,可为新型生物农药的开发及应用提供理论依据... 详细信息

胶毒素是生防木霉菌重要的次生代谢产物之一。本研究以生防木霉菌T23为供试材料,旨在通过生物信息学技术及表达分析,挖掘木霉菌T23中胶毒素合成候选基因,探索木霉菌胶毒素合成的分子调控机制,可为新型生物农药的开发及应用提供理论依据。研究表明,木霉菌T23中胶毒素合成候选基因簇全长28 kb,簇内包含了8个基因,分别与烟曲霉胶毒素合成基因簇内的gliP、gliC、gliN、gliK、gliI、gliG、gliF、gliM高度同源。提取培养2 d、3 d、4 d、5 d的木霉菌T23菌丝的RNA,通过半定量RT-PCR技术探索各候选基因在木霉菌T23不同生长时期的表达情况,显示各基因在不同生长时期均有表达,属于组成型表达基因。成功克隆得到木霉菌T23中的gliP-T23基因并完成基因结构分析,该基因全长6 339 bp,由4个外显子和3个内含子组成,为后续的基因功能验证提供基础。

关键词：生物防治木霉菌胶毒素基因克隆生物信息学