木霉菌T23胶毒素合成基因的生物信息学分析与克隆
Bioinformatic Analysis and Cloning of Gliotoxin Biosynthetic Gene Cluster of Trichoderma T23作者机构:四川省农业科学院经济作物育种栽培研究所成都610300
出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)
年 卷 期:2019年第38卷第3期
页 面:1079-1086页
核心收录:
基 金:"十三五"国家重点研发专项(2017YFD0201103) 四川省财政创新能力提升工程青年基金(2015QNJJ-003) 四川省科技厅应用基础研究项目(2015JY0106) 国家自然科学基金(31701830)共同资助
摘 要:胶毒素是生防木霉菌重要的次生代谢产物之一。本研究以生防木霉菌T23为供试材料,旨在通过生物信息学技术及表达分析,挖掘木霉菌T23中胶毒素合成候选基因,探索木霉菌胶毒素合成的分子调控机制,可为新型生物农药的开发及应用提供理论依据。研究表明,木霉菌T23中胶毒素合成候选基因簇全长28 kb,簇内包含了8个基因,分别与烟曲霉胶毒素合成基因簇内的gliP、gliC、gliN、gliK、gliI、gliG、gliF、gliM高度同源。提取培养2 d、3 d、4 d、5 d的木霉菌T23菌丝的RNA,通过半定量RT-PCR技术探索各候选基因在木霉菌T23不同生长时期的表达情况,显示各基因在不同生长时期均有表达,属于组成型表达基因。成功克隆得到木霉菌T23中的gliP-T23基因并完成基因结构分析,该基因全长6 339 bp,由4个外显子和3个内含子组成,为后续的基因功能验证提供基础。