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猪卵巢circ_mmp16的鉴定及功能初探

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中国畜牧杂志 2024年第6期60卷 113-120页

作者：张锫文潘宇恒肖茜顾洋林许韬邹冉谢淑艳沈林園张辉朱砺四川农业大学动物科学技术学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室四川成都611130 四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室四川成都611130 四川省动物疫病预防控制中心四川成都611130

猪卵泡颗粒细胞的增殖能力与繁殖性状密切相关,本研究旨在鉴定猪卵巢组织的circ_mmp16及其调控网络,并对其潜在的调控功能进行分析。运用miRanda、RNA hybird等软件对circ_mmp16靶向调控的miRNA及靶基因进行生物信息学分析。结果显示,ci... 详细信息

猪卵泡颗粒细胞的增殖能力与繁殖性状密切相关,本研究旨在鉴定猪卵巢组织的circ_mmp16及其调控网络,并对其潜在的调控功能进行分析。运用miRanda、RNA hybird等软件对circ_mmp16靶向调控的miRNA及靶基因进行生物信息学分析。结果显示,circ_mmp16是存在于哺乳动物中并且物种间保守的环状RNA,由基质金属蛋白酶16(Matrix Metallopeptidase 16,Mmp16)的2~4号外显子组成。此外,circ_mmp16可作为ssc-miR-217、ssc-miR-124a、ssc-miR-16等26个miRNA的竞争性内源RNA调控下游靶基因。通过对circ_mmp16-miRNA调控网络的靶基因进行GO和KEGG分析发现,Wnt信号通路、钙离子的转运、谷胱甘肽代谢以及花生四烯酸的代谢都与卵巢功能相关。组织表达谱分析发现circ_mmp16在骨骼肌中表达量最高,在卵巢中的表达量仅次于骨骼肌。在猪卵巢颗粒细胞水平上发现circ_mmp16具有促进细胞周期标志基因表达的作用,并能促进GPX3、GPX4谷胱甘肽合成标志基因的表达。综上,circ_mmp16作为调节多个miRNA的竞争性内源RNA,可能通过促进卵巢颗粒细胞的增殖以及抗氧化应激的能力起到保护卵巢颗粒细胞的作用,为进一步揭示颗粒细胞参与调控猪卵泡发育和闭锁提供基础数据。

关键词：卵巢颗粒细胞环状RNA 生物信息学分析细胞增殖

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固相萃取-超高效液相色谱-三重四极杆/线性离子阱质谱法检测水中大环内酯类抗生素

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分析科学学报 2024年第3期40卷 293-299页

作者：范素素蔡萌方烨渟王丽婕石健南通大学分析测试中心江苏南通226019 南通大学化学化工学院江苏南通226019

采用固相萃取-超高效液相色谱-三重四极杆线性离子阱质谱技术(SPE-UPLC-QTRAP MS)建立了环境水样中阿奇霉素、林可霉素、克林霉素、红霉素及替米考星5种大环内酯类抗生素的检测方法。调节水样pH为10后经HLB固相萃取柱净化、富集,然后用K... 详细信息

采用固相萃取-超高效液相色谱-三重四极杆线性离子阱质谱技术(SPE-UPLC-QTRAP MS)建立了环境水样中阿奇霉素、林可霉素、克林霉素、红霉素及替米考星5种大环内酯类抗生素的检测方法。调节水样pH为10后经HLB固相萃取柱净化、富集,然后用Kinetex F5色谱柱进行分离,用0.1%甲酸水溶液和0.1%甲酸乙腈溶液进行洗脱,采用电喷雾正离子源(ESI+),多反应监测(MRM)-信息依赖采集(IDA)-增强子离子(EPI)扫描模式对样品进行检测,用多反应监测(MRM)进行定量,增强子离子(EPI)谱图库辅助定性。结果表明:5种大环内酯类抗生素线性关系良好,相关系数均大于0.9992;检出限为0.01~0.30μg·L^(-1),定量限为0.10~0.50μg·L^(-1);3种不同浓度的水样加标回收率为71.60%~111.05%,相对标准偏差均在10%以内,EPI谱库比对纯度值均大于90%。该方法将传统的MRM扫描模式结合EPI谱图库检索,实现了同时定性和定量分析,对未知物准确定性定量检测提供了重要参考。

关键词：大环内酯类抗生素固相萃取线性离子阱液质联用残留检测

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太湖县花凉亭水库流域地下水水化学特征及水质评价

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环境科学 2024年

作者：刘海黄健敏宋阳赵国红王旭东魏伟四川农业大学建筑与城乡规划学院安徽省公益性地质调查管理中心

以太湖县花凉亭水库流域为研究对象，采集了42组井水样品和20组泉水样品测定了主要水化学指标，综合运用数理统计、Piper图、Gibbs图、离子比值和因子分析等方法研究了研究区井水和泉水的特征及控制因素，基于熵权质量指数(EWQI)评价了... 详细信息

以太湖县花凉亭水库流域为研究对象，采集了42组井水样品和20组泉水样品测定了主要水化学指标，综合运用数理统计、Piper图、Gibbs图、离子比值和因子分析等方法研究了研究区井水和泉水的特征及控制因素，基于熵权质量指数(EWQI)评价了井水和泉水的水质，根据健康风险评价模型(HHRA)对井水和泉水的NO3-的潜在风险进行了评估。结果表明，研究区井水和泉水整体呈弱碱性，优势阳离子和阴离子分别为Na2+、Ca2+和HCO3-，水化学类型主要为HCO3-Na·Ca型；井水和泉水形成主要受岩石风化作用和阳离子交替吸附作用控制，井水和泉水中Ca2+、Mg2+和HCO3-的主要来源碳酸岩盐溶解，农业活动、生活污水排放等导致Na+、Cl-和NO3-的富集；研究区井水和泉水水质整体较好，为良好～优良等级，健康风险评价表现为男人、女人和儿童均具有较低的非致癌风险，但儿童的健康风险明显高于成人。研究成果可为花凉亭水库流域地下水资源可持续开发利用和保护提供参考。

关键词：水化学特征水岩作用熵权质量指数健康风险花凉亭水库

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基于改进YOLOv7的草莓成熟度检测方法

四川农业大学学报 2024年第3期42卷 561-571页

作者：李红丹帅璐宇徐雪环蒲海波四川农业大学信息工程学院四川雅安625000 四川省雅安市数字农业工程技术研究中心四川雅安625000

【目的】为实现自然环境下草莓及其成熟度的高效准确检测,设计了一款改进的YOLOv7的草莓成熟度检测模型。【方法】模型采用YOLOv7作为基础网络对草莓成熟度进行检测。首先,使用PConv卷积替换原Head部分的3×3卷积以提高检测速度。其次,... 详细信息

【目的】为实现自然环境下草莓及其成熟度的高效准确检测,设计了一款改进的YOLOv7的草莓成熟度检测模型。【方法】模型采用YOLOv7作为基础网络对草莓成熟度进行检测。首先,使用PConv卷积替换原Head部分的3×3卷积以提高检测速度。其次,在部分特征层添加CBAM注意力机制提高模型关注重要信息的能力;再将原本上采样中简单的双线性插值算子替换为CARAFE,增加模型对草莓果实细节的感知能力。最后,利用迁移学习实现草莓数据集的训练和微调。【结果】改进前的模型mAP50为85.6%,改进后的模型mAP50为87.7%,参数量从原来的9.14×10^(6)下降为7.32×10^(6),GFLOPs下降为19.8,提高了检测速度。【结论】改进后的模型在草莓及其成熟度的检测中具有更高的检测精度和速度,可以在实际应用场景中实现草莓果实的生长监测。

关键词：目标检测 YOLOv7 迁移学习草莓成熟度分类

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煤气化渣及燃煤固废种植基质对紫花苜蓿生长影响试验

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洁净煤技术 2024年第S1期 446-455页

作者：刘雨姗周杨雨航王霞苏万里李亦易甘书雨卓锦德中国农业大学北京低碳清洁能源研究院宁夏煤业有限责任公司宁夏国信润达分析测试中心(有限公司)

为了探究煤气化及燃煤固废制备种植基质可行性，以宁夏回族自治区宁东能源基地煤气化产生的气化细渣和气化粗渣、燃煤产生的粉煤灰及炉渣制备种植基质，采用盆栽法，比较其与3种土壤(砂土、壤土及黏土)对紫花苜蓿成苗和生长的影响。分... 详细信息

为了探究煤气化及燃煤固废制备种植基质可行性，以宁夏回族自治区宁东能源基地煤气化产生的气化细渣和气化粗渣、燃煤产生的粉煤灰及炉渣制备种植基质，采用盆栽法，比较其与3种土壤(砂土、壤土及黏土)对紫花苜蓿成苗和生长的影响。分析种植前后土壤和基质的物理化学性质变化。结果表明，砂土有利于紫花苜蓿种子萌发及生长；粉煤灰板结严重影响出苗；气化细渣孔隙度较小以及磷含量过高造成了出苗率低和苗株枯黄。出苗率以砂土最高，其次是炉渣、然后是气化粗渣、壤土及黏土。气化粗渣和砂土除有机质含量及磷含量差异较大外，其他物化性质相似，二者培养的紫花苜蓿株高根长的数值接近且最大。炉渣种植紫花苜蓿的株高及根长低于气化粗渣和砂土。研究表明，气化粗渣和炉渣与砂土类似，可作为土壤基质用于牧草种植，对宁夏矿区土壤修复及煤基固废利用具有重要意义。

关键词：气化渣煤基固废紫花苜蓿(Medicago sativa L.) 土壤修复

梅病毒A新疆蟠桃分离物的全基因组序列分析与侵染性克隆构建

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中国农业科学 2024年第19期 3810-3822页

作者：任彩霞刘琳刘升学卜方迪向本春郑银英崔百明石河子大学生命科学学院石河子大学分析测试中心石河子大学农学院

【目的】梅病毒A(mume virus A,MuVA)是新发现的感染桃树的病毒，其全基因组序列分析研究甚少，国内尚无报道。本研究旨在探明MuVA在我国新疆蟠桃中的感染情况，分析MuVA pp分离物的基因组、系统进化及致病性，为MuVA的防治提供科学依... 详细信息

【目的】梅病毒A(mume virus A,MuVA)是新发现的感染桃树的病毒，其全基因组序列分析研究甚少，国内尚无报道。本研究旨在探明MuVA在我国新疆蟠桃中的感染情况，分析MuVA pp分离物的基因组、系统进化及致病性，为MuVA的防治提供科学依据。【方法】使用RT-PCR方法对田间蟠桃样品进行MuVA检测，采用5′/3′cDNA末端快速扩增（RACE）技术确定MuVA pp分离物的全基因组序列，并运用生物信息学软件分析MuVA pp分离物的基因组序列特征和系统进化关系。利用Gibson组装策略构建该分离物的基因组全长cDNA克隆，并通过农杆菌介导的方法对其侵染性进行接种测试。【结果】RT-PCR检测结果表明，30份疑似病毒病样本中有10份感染了MuVA，不同蟠桃品种感染率由高到低分别为‘七月蟠’（4/9）、‘八一蟠桃’（5/13）、‘中熟八一’（1/8）;MuVA pp分离物基因组全长为7 647 nt，基因组由5′非翻译区（5′UTR）、3′UTR和两个重叠的开放阅读框（ORF）组成，编码甲基转移酶（Met）、RNA解旋酶（Hel）、RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）、外壳蛋白（CP）和运动蛋白（MP）；序列分析结果显示，MuVA pp分离物与已报道的MuVA pm14分离物基因组的核苷酸和多聚蛋白氨基酸序列一致性分别为80.8%和82.7%，两者的多聚蛋白存在406个氨基酸残基的差异，分布在Met(21个)、Hel(29个)、RdRp(19个)、CP(18个)和其他（319个）。与MuVA pm14分离物显著不同的是5′UTR，核苷酸序列一致性仅为74.6%，编码的蛋白质中，MP变异最大，氨基酸一致性为80.9%,RdRp最保守，氨基酸一致性最高，为94.0%；系统发育分析结果显示，MuVA pp分离物与MuVA pm14分离物的亲缘关系最近，且MuVA有宿主和地理特异性的趋势，李子分离物与梅分离物聚集成簇，而桃分离物单独成支；构建的pCB301-MuVA侵染性克隆可以系统侵染苋色藜，并未引起症状，导致三生烟接种叶产生过敏性坏死，但不能引起系统侵染，也不能侵染昆诺藜、心叶烟、西方烟、本氏烟、番茄、黄瓜和南瓜。【结论】成功获得了蟠桃MuVA pp分离物的全基因组序列，其基因组为单链正义RNA，大小为7 647 nt，不含3′端poly(A)尾，编码两个ORF；通过摩擦接种证实MuVA不能侵染草本植物；构建了具有侵染活性的MuVA pp分离物的全长c DNA侵染性克隆载体pCB301-MuVA，可系统侵染苋色藜，且无明显症状，导致三生烟接种叶产生过敏性坏死，未引起系统侵染，这为进一步研究MuVA的致病分子机理提供了参考依据。

关键词：梅病毒A RT-PCR 基因组结构进化分析侵染性鉴定

推动欠发达地区农业产业发展的内在逻辑、现实困境与推进策略

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农业现代化研究 2024年第3期45卷 345-354页

作者：黄增高鸣四川农业大学管理学院四川成都611100 农业农村部农村经济研究中心北京100810

推动欠发达地区农业产业发展一直是经济社会发展的重要议题,也是实现乡村产业振兴的关键方向,对于构建新发展格局、缩小地区差距、实现共同富裕具有重要意义。本研究在梳理推动欠发达地区农业产业发展的内在逻辑基础上,结合各地的统计数... 详细信息

推动欠发达地区农业产业发展一直是经济社会发展的重要议题,也是实现乡村产业振兴的关键方向,对于构建新发展格局、缩小地区差距、实现共同富裕具有重要意义。本研究在梳理推动欠发达地区农业产业发展的内在逻辑基础上,结合各地的统计数据,对中国农业产业的发展现状进行了深入剖析。研究发现,尽管改革开放以来中国农业产业发展成效显著,但欠发达地区仍面临着抗风险能力不足、产业同质化、结构效益不佳、农民增收机制不完善等困境和挑战,迫切需要探索新的发展路径。基于对欠发达地区农业产业发展的深刻认知,本文提出了当前及未来一段时期内的发展目标,包括增强农业综合生产能力、深化农业结构调整、丰富乡村经济业态。总体上,应在供给侧提升产业水平,在市场端拓宽农产品流通渠道,在制度层面加大政策支持力度。重点工作包括加强农业基础设施建设、创新金融投融资模式、推动农业保险全覆盖。

关键词：农业产业欠发达地区产业振兴内在逻辑发展路径推进策略

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政府培训对洪灾风险区农户防灾减灾意愿与行为影响研究

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灾害学 2024年

作者：王智张枫琬刘邵权徐定德中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所中国科学院大学四川农业大学管理学院四川农业大学管理学院四川省农村发展研究中心

面对洪灾威胁，采取有效的防灾减灾行为能够保障农户的生命财产安全，而政府培训是促进农户主动采取防灾减灾行为的重要举措。本研究以四川省洪灾风险区540户农户为调查对象，实证检验了政府培训、培训广度对农户采取防灾减灾行为的影... 详细信息

面对洪灾威胁，采取有效的防灾减灾行为能够保障农户的生命财产安全，而政府培训是促进农户主动采取防灾减灾行为的重要举措。本研究以四川省洪灾风险区540户农户为调查对象，实证检验了政府培训、培训广度对农户采取防灾减灾行为的影响以及农户防灾减灾意愿的中介效应。结果表明，随着农户参与政府培训以及培训广度的增加，其越有可能采取防灾减灾行为，政府培训及培训广度每增加一个单位，农户采取防灾减灾行为的可能性相应增加10.68%和4.19%。农户拥有谋生技能状况和受灾经历会对其采取防灾减灾行为造成正向显著影响。农户防灾减灾意愿在政府培训、培训广度影响农户采取防灾减灾行为方面发挥了中介效应，中介效应占比分别为15.17%和12.29%。

关键词：洪灾风险政府培训防灾减灾意愿和行为中介效应

利用GWAS和DNA甲基化共定位鉴定猪肉质性状的候选基因

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畜牧兽医学报 2024年第5期55卷 1945-1957页

作者：崔晟頔王凯赵真坚陈栋申琦余杨王俊戈陈子旸禹世欣陈佳苗王翔枫唐国庆四川农业大学动物科技学院猪禽种业全国重点实验室成都611130 四川农业大学动物科技学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室成都611130 四川农业大学“畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室” 成都611130 新希望六和股份有限公司成都625014

为了更深入地了解肉质性状的遗传基础,本研究使用基于基因型填充的测序数据进行了GWAS分析并与之前的发表的EWAS结果进行共定位分析。该研究发现了515个全基因组水平显著的SNPs位点和4 134个达建议显著阈值的SNPs位点,这些位点共涉及40... 详细信息

为了更深入地了解肉质性状的遗传基础,本研究使用基于基因型填充的测序数据进行了GWAS分析并与之前的发表的EWAS结果进行共定位分析。该研究发现了515个全基因组水平显著的SNPs位点和4 134个达建议显著阈值的SNPs位点,这些位点共涉及406个基因,其中包括262个蛋白质编码基因,最终确定了6个可能与肉质性状相关的重要候选基因。同时,与EWAS的结果进行比较,发现有12个显著的CpG位点与显著SNP位点存在重叠。通过这些研究可以为改善猪肉品质的育种工作提供更坚实的理论基础和数据支持。

关键词：全基因组关联分析 SNPs 肉质性状

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