猪卵巢circ_mmp16的鉴定及功能初探

作     者：张锫文 潘宇恒 肖茜 顾洋 林许韬 邹冉 谢淑艳 沈林園 张辉 朱砺 ZHANG Peiwen;PAN Yuheng;XIAO Qian;GU Yang;LIN Xutao;ZOU Ran;XIE Shuyan;SHEN Linyuan;ZHANG Hui;ZHU Li

作者机构：四川农业大学动物科学技术学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室四川成都611130 四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室四川成都611130 四川省动物疫病预防控制中心四川成都611130 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2024年第60卷第6期

页      面：113-120页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家重点研发计划“农业生物种质资源挖掘与创新利用”重点专项资助(2021YFD1200801) 四川省科技计划(2021ZDZX0008、2021YFYZ0007、2021YFYZ0030、scsztd-2022-08-09) 国家现代农业产业技术体系(CARS-35) 

主　　题：卵巢颗粒细胞 环状RNA 生物信息学分析 细胞增殖 

摘      要：猪卵泡颗粒细胞的增殖能力与繁殖性状密切相关,本研究旨在鉴定猪卵巢组织的circ_mmp16及其调控网络,并对其潜在的调控功能进行分析。运用miRanda、RNA hybird等软件对circ_mmp16靶向调控的miRNA及靶基因进行生物信息学分析。结果显示,circ_mmp16是存在于哺乳动物中并且物种间保守的环状RNA,由基质金属蛋白酶16(Matrix Metallopeptidase 16,Mmp16)的2~4号外显子组成。此外,circ_mmp16可作为ssc-miR-217、ssc-miR-124a、ssc-miR-16等26个miRNA的竞争性内源RNA调控下游靶基因。通过对circ_mmp16-miRNA调控网络的靶基因进行GO和KEGG分析发现,Wnt信号通路、钙离子的转运、谷胱甘肽代谢以及花生四烯酸的代谢都与卵巢功能相关。组织表达谱分析发现circ_mmp16在骨骼肌中表达量最高,在卵巢中的表达量仅次于骨骼肌。在猪卵巢颗粒细胞水平上发现circ_mmp16具有促进细胞周期标志基因表达的作用,并能促进GPX3、GPX4谷胱甘肽合成标志基因的表达。综上,circ_mmp16作为调节多个miRNA的竞争性内源RNA,可能通过促进卵巢颗粒细胞的增殖以及抗氧化应激的能力起到保护卵巢颗粒细胞的作用,为进一步揭示颗粒细胞参与调控猪卵泡发育和闭锁提供基础数据。