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VE-cad-Fc功能化透明质酸水凝胶的制备与表征

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天津大学学报（自然科学与工程技术版） 2019年第1期52卷 33-39页

作者：杨军谢敬辉高超刘开政南开大学生命科学学院天津300071 南开大学生物活性材料教育部重点实验室天津300071

为了提高透明质酸水凝胶的生物学功能,本研究利用两步迈克尔加成反应及点击化学反应制备了人血管内皮钙黏素融合蛋白(VE-cad-Fc)功能化的透明质酸水凝胶,并进一步研究了其对人脐带间充质干细胞(h UC-MSCs)的影响.核磁共振光谱检测及凝... 详细信息

为了提高透明质酸水凝胶的生物学功能,本研究利用两步迈克尔加成反应及点击化学反应制备了人血管内皮钙黏素融合蛋白(VE-cad-Fc)功能化的透明质酸水凝胶,并进一步研究了其对人脐带间充质干细胞(h UC-MSCs)的影响.核磁共振光谱检测及凝胶时间检测显示,透明质酸主链丙烯酰肼取代率为16%,,融合蛋白功能化透明质酸以DTT交联的凝胶化时间约为30,***检测显示水凝胶中化学键合Fc结构域特异性结合多肽可以显著提高融合蛋白的长期负载稳定性.2D/3D细胞黏附、增殖与活细胞染色实验结果显示,水凝胶中利用Fc结构域固定融合蛋白显著改善人脐带间充质干细胞的黏附、增殖,且促进水凝胶中hUC-MSCs的长期克隆化生长.作为一种细胞培养基质(2D/3D培养),这种融合蛋白功能化的水凝胶材料在组织工程、再生医学等领域将有非常广阔的应用前景.

关键词：水凝胶透明质酸人脐带间充质干细胞细胞黏附细胞增殖

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基于SQL Server的蛋白质二级结构预测样本集数据库的构建

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高技术通讯 2006年第6期16卷 619-623页

作者：张宁吴捷宋卓张涛南开大学生命科学学院生物活性材料教育部重点实验室天津300071

基于SQL Server数据库管理系统，将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来，建立了数据库DataSet，并配置了一个IIS服务器以方便网络查询。该数据库将蛋白质二级结构预测样本集有效地组织起来，实现了规范化、结构化... 详细信息

基于SQL Server数据库管理系统，将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来，建立了数据库DataSet，并配置了一个IIS服务器以方便网络查询。该数据库将蛋白质二级结构预测样本集有效地组织起来，实现了规范化、结构化统一管理，便于存储、检索和分析数据，减少错误的发生。通过该数据库可以提取供蛋白质二级结构预测研究的样本、序列转换、变换编码以及分析评价预测结果等，取代许多传统编程处理文本文件的繁琐工作，大大提高效率，促进工作的开展。

关键词：数据库蛋白质二级结构预测样本集 SQL Server 生物信息学

缓释双生长因子三层支架体内长期促骨软骨缺损再生的研究

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天津大学学报（自然科学与工程技术版） 2023年第6期56卷 588-594页

作者：董云生黄佳星肖慧王雅菁王茜霖王淑芳南开大学生命科学学院天津300071 南开大学生物活性材料教育部重点实验室天津300071

外伤或关节使用过度或重度关节炎都会导致关节表面的软骨以及软骨下骨形成难以恢复的损伤.尽管目前临床上的治疗技术在某些方面取得成功,但仍存在治疗的局限性,如自体移植存在供区并发症、移植的组织不完全整合和易降解、骨髓刺激会产... 详细信息

外伤或关节使用过度或重度关节炎都会导致关节表面的软骨以及软骨下骨形成难以恢复的损伤.尽管目前临床上的治疗技术在某些方面取得成功,但仍存在治疗的局限性,如自体移植存在供区并发症、移植的组织不完全整合和易降解、骨髓刺激会产生纤维软骨、质量不佳等.为提高骨软骨缺损的治疗效果,前期研究制备了局部缓释生长因子rhBMP-2和rhTGF-β3的丝素蛋白/脱软骨细胞外基质/纳米羟基磷灰石复合三层支架,并在兔子体内短期植入后获得良好的骨软骨修复效果,但并未进行长期体内研究.本研究在兔子双膝滑车沟处建立直径5mm、深度3mm的缺损,并将具有局部缓释生长因子rhBMP-2和rhTGF-β3的复合三层支架进行缺损区植入,且以天然膝关节滑车沟处骨软骨为对照组,修复34周后通过大体观察、组织学染色、免疫组织化学染色、Micro-CT扫描以及力学测定,评价支架对骨软骨缺损长期的修复情况.大体观察、组织学染色、免疫组织学染色扫描结果表明,支架组再生软骨具有与天然组相似的表面平整度和完整度、细胞排列形态以及黏多糖含量;但Ⅱ型胶原染色和软骨纳米压痕结果表明,支架组再生软骨Ⅱ型胶原含量以及力学性能明显低于天然软骨.Micro-CT扫描以及力学结果表明,支架组再生软骨下骨具有与天然软骨下骨相似的结构以及力学强度((48.98±12.7091)MPa).因此,具有局部缓释生长因子rhBMP-2和rhTGF-β3的丝素蛋白复合三层支架在体内长期促进骨软骨再生方面具有显著的优势.

关键词：缓释支架生长因子骨软骨修复体内研究组织工程

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基于SQL Server的脑电数据库的构建

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高技术通讯 2006年第12期16卷 1289-1293页

作者：张宁吴捷杨卓张涛南开大学生命科学学院生物活性材料教育部重点实验室天津300071

基于SQL Server 2000，构建了一个脑电数据库系统，并配置了一个IIS（Imemet Information Services）服务器以方便网络查询（http：//202．113．232．103：8088／neurodb／）。以临床脑电数据为例，该数据库不仅存储了病例信息，还将脑... 详细信息

基于SQL Server 2000，构建了一个脑电数据库系统，并配置了一个IIS（Imemet Information Services）服务器以方便网络查询（http：//202．113．232．103：8088／neurodb／）。以临床脑电数据为例，该数据库不仅存储了病例信息，还将脑电数据及其注释结构化和规范化为数据库的表的形式。这与通常采用的文本文件的存储方式不同，它能够充分发挥关系型数据库的强大优势，为存储、检索和分析数据带来最大程度的方便和灵活性，减少错误的发生。与此同时，为数据库还开发了一个相关软件，用于展示脑电图。软件中集成了多种算法，可直接进行数据分析。论文介绍了该数据库的设计、相关软件的开发，并列举了一些数据库的应用。

关键词：脑电图数据库 SQL Server

层层自组装制备基于多壁碳纳米管的胆碱生物传感器

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分析化学 2008年第6期36卷 827-830页

作者：秦霞王艳艳赵紫霞王新胜李莎于敏黄楠苗智颖陈强南开大学生命科学学学院生物活性材料教育部重点实验室南开大学生命科学学学院生物活性材料教育部重点实验室天津300071

以经混酸处理的多壁碳纳米管(MWCNTs)修饰铂(Pt)电极,在此基础上固定(PAA/PVS)3复合膜,采用层层自组装技术将高分子聚电解质PDDA与胆碱氧化酶交替组装在已修饰的电极上,构建了电流型胆碱生物传感器。实验结果表明,MWCNTs的引入使电极对H... 详细信息

以经混酸处理的多壁碳纳米管(MWCNTs)修饰铂(Pt)电极,在此基础上固定(PAA/PVS)3复合膜,采用层层自组装技术将高分子聚电解质PDDA与胆碱氧化酶交替组装在已修饰的电极上,构建了电流型胆碱生物传感器。实验结果表明,MWCNTs的引入使电极对H2O2的催化电流明显增大,制成的酶电极可以有效控制酶量的使用,酶膜组装层数为8时最优,对胆碱的线性响应范围为5×10-7～1×10-4mol/L;灵敏度为12.53μA/mmol;响应时间为7.60s;检出限为2×10-7mol/L(S/N=3)。传感器的抗干扰能力强,稳定性好,30d时的响应电流值仍保持最初的89.5%。3次平行实验的RSD为3.64%。

关键词：碳纳米管聚电解质胆碱生物传感器层层自组装技术

聚乙烯醇固定化的微球菌AD3对除草剂阿特拉津的生物降解

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离子交换与吸附 2006年第5期22卷 416-422页

作者：李颖李婧温雪松蔡宝立生物活性材料教育部重点实验室(南开大学) 南开大学生命科学学院微生物学系

从农药厂的工业废水和污泥的混合物中分离到高效降解除草剂阿特拉津的藤黄微球菌(Micrococcusluteus)AD3菌株。以聚乙烯醇(PVA)为包埋材料进行AD3菌株的固定化,对影响固定化细胞降解阿特拉津的因素(如阿特拉津浓度、温度、pH)和操作稳... 详细信息

从农药厂的工业废水和污泥的混合物中分离到高效降解除草剂阿特拉津的藤黄微球菌(Micrococcusluteus)AD3菌株。以聚乙烯醇(PVA)为包埋材料进行AD3菌株的固定化,对影响固定化细胞降解阿特拉津的因素(如阿特拉津浓度、温度、pH)和操作稳定性进行了研究。结果表明,在最适条件下(30℃、pH7.2、阿特拉津浓度500mg/L)固定化细胞的阿特拉津降解速度明显高于游离细胞。固定化细胞在低温、低pH和高阿特拉津浓度条件下的阿特拉津降解率,以及贮存和操作稳定性,也明显好于游离细胞。固定化细胞在15℃、pH7.2、阿特拉津浓度为500mg/L的条件下培养72h以后,阿特拉津降解率为90%,在相同条件下游离细胞的降解率仅为35%。固定化细胞在pH5.0、30℃、阿特拉津浓度为500mg/L的条件下培养72h以后,降解率为96%,在相同条件下游离细胞的降解率仅为40%。固定化细胞能够快速降解1000mg/L的阿特拉津,而游离细胞则不能。稳定性实验表明,固定化细胞重复使用30次以后其降解活力没有明显降低。

关键词：除草剂阿特拉津生物降解藤黄微球菌AD3 固定化细菌聚乙烯醇

层层自组装技术制备PDDA-多壁碳纳米管-胆碱生物传感器

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分析化学 2010年第3期38卷 337-341页

作者：陈丽丽王会才秦霞王新胜赵紫霞苗智颖赵薇单苗苗陈强南开大学生命科学学院生物活性材料教育部重点实验室

以PDDA分散多壁碳纳米管(MWCNTs),制得PDDA-MWCNTs悬浮液,采用层层自组装技术将PDDA-MWCNTs与胆碱氧化酶(ChOx)交替组装在铂(Pt)电极上,最后滴加Nafion制备抗干扰膜,构建了电流型胆碱生物传感器。实验结果表明,构建的复合酶膜(PDDA-MWCN... 详细信息

以PDDA分散多壁碳纳米管(MWCNTs),制得PDDA-MWCNTs悬浮液,采用层层自组装技术将PDDA-MWCNTs与胆碱氧化酶(ChOx)交替组装在铂(Pt)电极上,最后滴加Nafion制备抗干扰膜,构建了电流型胆碱生物传感器。实验结果表明,构建的复合酶膜(PDDA-MWCNTs/ChOx)n对底物胆碱的催化电流随着组装层数增多而明显增大,酶膜组装6层时最优。此传感器在5×10-6～2.5×10-4mol/L浓度范围内对胆碱有良好线性范围,响应时间为6.6s;灵敏度为21.97μA/mmol;检出限为2×10-6mol/L(S/N=3),RSD<5%,且传感器抗干扰能力强、稳定性好。

关键词：多壁碳纳米管聚二烯丙基二甲基氯化铵胆碱生物传感器层层自组装技术

新型免疫磁性微球的制备及其在α-2b干扰素分离纯化中的应用

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离子交换与吸附 2006年第2期22卷 112-119页

作者：曹宇陈家琪王深琪杨文博白钢南开大学生命科学学院微生物学系生物活性材料教育部重点实验室南开大学生命科学学院微生物学系生物活性材料教育部重点实验室天津300071

采用琼脂糖、纤维素和聚乙烯醇3种材料制备表面带有活性羟基的新型磁性微球,对其性能进行了表征并探讨其致敏条件。通过性能的比较,选择纤维素磁性微球作为分离纯化载体,并建立α-2b干扰素的免疫磁性分离方法。通过对α-2b干扰素发酵菌... 详细信息

采用琼脂糖、纤维素和聚乙烯醇3种材料制备表面带有活性羟基的新型磁性微球,对其性能进行了表征并探讨其致敏条件。通过性能的比较,选择纤维素磁性微球作为分离纯化载体,并建立α-2b干扰素的免疫磁性分离方法。通过对α-2b干扰素发酵菌体裂解液的预处理、上样量和稀释倍数以及洗脱条件进行考察,确立免疫磁性分离条件,用于α-2b干扰素的一步分离纯化,其活性回收率达到88%,平均比活性为1.5×108IU/mg,纯度大于99%。实验结果表明,纤维素磁性微球作为性能优良的新型磁性载体,更适于目的蛋白的免疫磁性分离。

关键词：免疫磁性微球 α-2b干扰素免疫磁性分离

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大麦响应条纹病菌毒素胁迫的转录组分析

甘肃农业大学学报 2024年

作者：王燕绣司二静郭铭姚立蓉汪军成李葆春马小乐王化俊孟亚雄甘肃农业大学农学院甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室

【目的】由条纹病菌引起的大麦条纹病是大麦种植中的主要病害之一，为深入探究大麦对大麦条纹病菌毒素胁迫响应的分子机制，从分子水平探索大麦受大麦条纹病菌毒素胁迫后的转录水平变化情况。【方法】本研究以高抗的大麦材料甘啤2号为... 详细信息

【目的】由条纹病菌引起的大麦条纹病是大麦种植中的主要病害之一，为深入探究大麦对大麦条纹病菌毒素胁迫响应的分子机制，从分子水平探索大麦受大麦条纹病菌毒素胁迫后的转录水平变化情况。【方法】本研究以高抗的大麦材料甘啤2号为研究对象，利用转录组测序技术分析大麦在受条纹病菌毒素胁迫72 h后的差异表达基因。【结果】结果表明，毒素胁迫72 h后，共检测出99个显著差异表达基因，其中有16个基因上调表达，83个基因下调表达；GO功能注释表明，涉及单一有机体过程、代谢过程、催化活性等的差异表达基因占比最多；KEGG富集分析表明，差异表达基因主要富集于苯丙类生物合成、类黄酮生物合成、氰基氨基酸代谢、MAPK植物信号传导途径、植物激素信号传导、植物-病原体相互作用等代谢通路。为验证RNA-seq数据的准确性，选取10个差异表达基因进行qRT-PCR表达量检测，发现基因表达量变化趋势均与转录组测序结果相一致。【结论】获得了大麦响应条纹病菌毒素侵染的差异表达基因，其主要富集于代谢过程、应激反应及信号转导等条目中，这些基因的相互协同是调控大麦对条纹病菌毒素产生防御反应的重要机制。

关键词：大麦大麦条纹病毒素转录组差异表达基因代谢途径