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基于改进神经辐射场的植物表型参数测量方法

农业工程学报 2024年第17期 188-196页

作者：李添天戴倩谢元澄南京农业大学人工智能学院

为解决传统植物表型测量存在的破坏性、主观性强以及三维测量设备成本高，使用场景受限等问题，提出了一种基于改进后的神经辐射场（neural radiance field,NeRF）方法——L-NeRF的植物表型参数测量方法。通过从多视角收集图像数据，利... 详细信息

为解决传统植物表型测量存在的破坏性、主观性强以及三维测量设备成本高，使用场景受限等问题，提出了一种基于改进后的神经辐射场（neural radiance field,NeRF）方法——L-NeRF的植物表型参数测量方法。通过从多视角收集图像数据，利用L-NeRF技术进行三维重建，非破坏性地获取了植物的关键表型参数，如株高、叶宽和叶长。以墨西哥四叶草(Prosopis juliflora)为研究对象，在室内环境下进行试验，结果表明，该方法在叶宽、叶长与株高的测量上显示出较高的精确度，决定系数分别达到0.903 7、0.782 7和0.851 6。此外，相较于现有的运动结构恢复（structure from motion,SFM）视觉重建方法，在采用L-NeRF技术时，在重建时间上平均减少了约30%，在模型精度上的标准差减少了约45%。试验结果不仅验证了L-NeRF技术在植物表型参数测量中的有效性和实用性，也展示了其在提升研究效率和精度方面的潜力。后续研究将探索收集更多植物品种的数据，以提高该方法的适用性。

关键词：植物点云方法植物表型组学神经辐射场三维重建

市场需求、文化选择与技术革新:14—17世纪蓝靛在中国的发展

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中国农史 2024年第1期43卷 67-82页

作者：王颖包平南京农业大学中华农业文明研究院江苏南京210095

14-17世纪,纵跨元明清三朝,无论政权如何更替,都未改变蓝靛色作为官方服饰的主要颜色,蓝靛也逐渐成为重要的农业经济作物之一,其背后的原因主要有三。第一,市民消费拉动了蓝靛市场。因为蓝靛染成的青蓝色系棉布及蓝印花布兼具美观与实... 详细信息

14-17世纪,纵跨元明清三朝,无论政权如何更替,都未改变蓝靛色作为官方服饰的主要颜色,蓝靛也逐渐成为重要的农业经济作物之一,其背后的原因主要有三。第一,市民消费拉动了蓝靛市场。因为蓝靛染成的青蓝色系棉布及蓝印花布兼具美观与实用功能,符合市民需求。市民阶层壮大,棉纺织及印染技术改进,使得蓝靛色棉织物在服饰消费中占比扩大。第二,蓝靛色服饰所蕴含的文化认同对蓝靛消费具有促进作用,主要表现为礼制象征、文人审美、风俗习惯等方面,这些进一步巩固了蓝靛在植物染料消费中的重要地位。第三,明以后,较成熟的中国传统种蓝制靛染色技术系统的形成,涵盖了蓝草的生产与加工,蓝靛的制作与染色,主要表现在明代高产高效的制靛技术的革新、“标缸”体系与复杂套色染技术体系的完善、蓝草种植加工体系的区域化,这些在技术层面上解决了蓝靛的市场供给问题。总之,本文以市场为导向,以文化认同为基础,以完备的生产加工及应用技术体系为支撑,解读蓝靛在14-17世纪逐步成为中国产销之首的传统植物染料的原因。

关键词：消费市场文化认同制靛染色技术蓝靛生产

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果树芽变机制研究进展

园艺学报 2024年第7期51卷 1547-1564页

作者：黄奕琦朱玉琴杜肇轩徐丰陈小怡杨国顺许延帅湖南农业大学园艺学院长沙410128 南京农业大学园艺学院南京210095

芽变主要是芽分生组织细胞中的遗传物质发生改变,在果树上经常发生,大多数的芽变为劣变,少数为优变。芽变研究一般从表型和生理指标的比较着手,后续结合分子机制进行研究。对分子机制的检测手段主要有SSR等分子标记检测、转座子的插入... 详细信息

芽变主要是芽分生组织细胞中的遗传物质发生改变,在果树上经常发生,大多数的芽变为劣变,少数为优变。芽变研究一般从表型和生理指标的比较着手,后续结合分子机制进行研究。对分子机制的检测手段主要有SSR等分子标记检测、转座子的插入缺失检测、In Del突变检测、DNA甲基化检测、高通量测序检测、MITE序列检测等,比较分析芽变与对照差异位点。通过对不同果树果实色泽、成熟期、树形等主要特征变异类型进行归纳总结,分析芽变发生性状变异机制,以期为解析果树芽变发生的分子机制及后续的分子标记辅助育种提供参考。

关键词：果树芽变分子机制

一株新型鸭呼肠孤病毒的分离及抗体检测的间接ELISA建立

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畜牧兽医学报 2024年

作者：徐晨晨马旭杰宋素泉闫丽萍南京农业大学动物医学院

新型鸭呼肠孤病毒（Novel duck reovirus， NDRV）能造成多品种雏鸭肝、脾的出血坏死，并造成免疫抑制，给我国的水禽养殖业造成了严重经济损失，但市场上仍无商品化检测试剂盒。基于此，本研究通过蚀斑纯化从临床病料中成功分离到一株... 详细信息

新型鸭呼肠孤病毒（Novel duck reovirus， NDRV）能造成多品种雏鸭肝、脾的出血坏死，并造成免疫抑制，给我国的水禽养殖业造成了严重经济损失，但市场上仍无商品化检测试剂盒。基于此，本研究通过蚀斑纯化从临床病料中成功分离到一株纯净的新型鸭呼肠孤病毒（命名为E232株），并以原核表达的σC蛋白为包被原建立了能够检测NDRV血清抗体的间接ELISA。遗传进化分析结果显示，E232株属于NDRV，且与其他NDRV毒株的核苷酸同源性为96.4%～98.9%。动物回归试验结果表明，E232株发病率达到100%，发病雏鸭的脾出现严重肿胀、出血、坏死，泄殖腔排毒量和咽部排毒量均在感染后第5天达到高峰。建立的间接ELISA具有良好的特异性，与其他鸭病病原阳性血清均无交叉反应；检测NDRV阳性血清最低检出效价为1:6 400，批内重复变异系数为1.53%～7.24%，批间重复变异系数为1.84%～8.30%，检测236份临床血清样品的阳性率为80.93%。综上，本研究E232株的成功分离，丰富了我国NDRV流行病学信息库；间接ELISA的成功建立，为临床NDRV防控提供了良好的技术手段。

关键词：新型鸭呼肠孤病毒分离鉴定 σC蛋白间接ELISA

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农村普惠金融服务点对农户信贷行为的影响

南开经济研究 2024年第2期 215-232页

作者：张凡李渊张龙耀南京农业大学金融学院 210095

为打通金融服务“最后一公里”,各地不断推进农村普惠金融服务点建设,将金融服务触角延伸至村庄。本文基于2020—2021年中国土地经济调查数据,利用断点回归模型(RD)探究了农村普惠金融服务点对农户信贷行为的影响。通过研究发现,农村普... 详细信息

为打通金融服务“最后一公里”,各地不断推进农村普惠金融服务点建设,将金融服务触角延伸至村庄。本文基于2020—2021年中国土地经济调查数据,利用断点回归模型(RD)探究了农村普惠金融服务点对农户信贷行为的影响。通过研究发现,农村普惠金融服务点提升了农户信贷获得概率和扩大了信贷规模,并且提高了农户正规信贷占比,缓解了家庭面临的正规信贷约束。农村普惠金融服务点凭借扎根农村的制度优势,通过提高农户的金融产品信息完全程度和金融素养,提高了其信贷(尤其是正规信贷)获取率。进一步分析发现,农村普惠金融服务点降低了农户信贷违约概率,增强其信用意识;此外,农村普惠金融服务点增加了农户生活性借贷规模,但未能扩大生产性信贷的规模。可见,完善农村金融服务应是政府解决农户融资难和融资贵等问题的重要政策手段。

关键词：农村普惠金融服务点正规信贷非正规信贷断点回归

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金属β-内酰胺酶GOB-54的发现与表征

食品与发酵工业 2024年

作者：章升霞王绍琛吕云斌冯治洋南京农业大学食品科技学院

该文旨在从土壤中挖掘新型β-内酰胺类抗生素耐药基因，分析耐药机制，做好临床预警，为开发新型β-内酰胺类药物提供信息。章升霞利用功能筛选策略，从土壤宏基因组文库中筛选获得阳性克隆，通过亚克隆构建和序列测定，得到耐药基因序... 详细信息

该文旨在从土壤中挖掘新型β-内酰胺类抗生素耐药基因，分析耐药机制，做好临床预警，为开发新型β-内酰胺类药物提供信息。章升霞利用功能筛选策略，从土壤宏基因组文库中筛选获得阳性克隆，通过亚克隆构建和序列测定，得到耐药基因序列。利用序列比对、系统发育树分析、三维结构建模等生物信息学方法对耐药基因进行分析。使用微量肉汤稀释法评估β-内酰胺酶的耐药活性，利用生化实验分析酶水解抗生素的能力。鉴定出一个β-内酰胺抗生素耐药基因，与已知的β-内酰胺酶基因最高只有52.30%氨基酸序列一致性，命名为gob-54，编码β-内酰胺酶GOB-54。SWISS-MODEL三维建模发现GOB-54与临床来源的GOB-18具有高度相似的结构。动力学参数表明在所测试的β-内酰胺抗生素中，GOB-54对哌拉西林具有最高的亲和力和催化活性，动力学参数Km和Kcat/Km分别为121.82 μmol/L和49.15 L/(mmol·s)。本研究利用功能宏基因组学方法挖掘出土壤来源的β-内酰胺抗生素耐药基因gob-54，编码广谱β-内酰胺酶GOB-54，为临床上监测和防控β-内酰胺类抗生素耐药基因的传播提供借鉴。

关键词： β-内酰胺酶土壤微生物功能宏基因组学抗生素耐药基因

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碾米度对稻米理化和营养特性的影响

南京农业大学学报 2024年

作者：李卓霖唐筱驰朱颖杜茜韩伍思瑾胡娇娇谢翀李丹丹杨润强南京农业大学食品科技学院

[目的]本文旨在明确不同碾米度对稻米营养品质的影响，为优化稻米加工条件提供数据支撑。[方法]以江苏主栽的3个品种糙米（‘南粳9108’‘镇糯29号’‘丝苗杂优’）为研究对象，采用分层碾米工艺，制备了不同碾米度（0%、2%、4%、6%、8%... 详细信息

[目的]本文旨在明确不同碾米度对稻米营养品质的影响，为优化稻米加工条件提供数据支撑。[方法]以江苏主栽的3个品种糙米（‘南粳9108’‘镇糯29号’‘丝苗杂优’）为研究对象，采用分层碾米工艺，制备了不同碾米度（0%、2%、4%、6%、8%、10%、12%）的稻米，研究了碾米度对不同品种稻米留胚率、蛋白质、灰分、γ-氨基丁酸（GABA）、总酚含量的影响。[结果]随着碾米度的增加，3种稻米留胚率、灰分含量均逐渐减少；其中‘镇糯29号’的蛋白质、GABA、总酚含量均呈先升高后下降趋势，‘南粳9108’与‘丝苗杂优’的蛋白质、GABA、总酚含量均随碾米度增加呈下降趋势。3种稻米在碾米度为6%时营养物质损失较少，相较于糙米，3种稻米留胚率降低5.45%～23.47%，灰分含量降低0.38%～0.74%，GABA含量降低7.83 ～11.31 mg·100 g-1，‘南粳9108’与‘丝苗杂优’在碾米度为6%时蛋白质含量较糙米中分别降低1.61%、0.43%，总酚含量分别降低19.91、11.57 mg·100 g-1；而‘镇糯29号’在碾米度为6%时其蛋白质与总酚含量较糙米增加，分别增加了0.79%、16.49 mg·100 g-1。[结论]糙米中营养物质与功能性成分多分布在麸皮层与胚芽，随着碾磨程度的增加，3种稻米的营养成分均有不同程度的减少。稻米适度加工可以保留较多的胚与糊粉层，改进稻米的综合品质。建议‘南粳9108’‘镇糯29号’‘丝苗杂优’加工时采用6%的碾米度，在此碾米度下稻米的感官品质得到提升，同时较好地保留了基本营养物质和功能性成分。

关键词：稻米糙米碾米度理化特性 γ-氨基丁酸酚类物质

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大豆致敏原表位与降敏加工：现状与未来

南京农业大学学报 2024年

作者：芮昕郭欣冉南京农业大学食品科技学院

大豆是我国传统优质植物蛋白来源，然而，大豆过敏是制约其蛋白安全品质的瓶颈问题。大豆蛋白特定结构（致敏原表位）是诱发食物过敏的主要原因，表位的识别与定位是探索大豆过敏机制和靶向开发加工低（无）敏性大豆食品的关键，也是建... 详细信息

大豆是我国传统优质植物蛋白来源，然而，大豆过敏是制约其蛋白安全品质的瓶颈问题。大豆蛋白特定结构（致敏原表位）是诱发食物过敏的主要原因，表位的识别与定位是探索大豆过敏机制和靶向开发加工低（无）敏性大豆食品的关键，也是建立大豆精准降敏技术“构—效”关系的核心。本文围绕大豆致敏原结构与表位，对大豆致敏原结构及表位在常见加工过程、胃肠道消化过程中的变化进行了综述，对表位层面研究相对较少的大豆致敏原摄入及对小肠微环境影响、口服免疫耐受两方面开展了探讨与展望。本文旨在为低敏大豆加工“构—效”关系的建立及未来大豆降敏加工的发展提供参考。

关键词：大豆致敏原蛋白致敏原表位加工技术胃肠道消化蛋白摄入口服耐受

基于THz成像和集成学习的番茄根长表型提取及预测

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农业工程学报 2024年第18期 176-183页

作者：罗慧刘星语韦骁吴嘉仪余赟卢伟南京农业大学人工智能学院

为检测番茄根系表型，该研究基于THz(Terahertz)成像和集成学习提出一种根系检测技术。首先，对20天生长过程中番茄根系进行多次THz成像。其次，对最优重构后的根系THz伪彩色图去除根系重叠和主根区域的噪声数据。再次，采用Rosenfeld... 详细信息

为检测番茄根系表型，该研究基于THz(Terahertz)成像和集成学习提出一种根系检测技术。首先，对20天生长过程中番茄根系进行多次THz成像。其次，对最优重构后的根系THz伪彩色图去除根系重叠和主根区域的噪声数据。再次，采用Rosenfeld细化算法和滑动窗口遍历法计算根系长度。最后，提取根系有效区域中THz时域光谱和折射率光谱，由Stacking集成模型对番茄根长进行预测。由THz成像计算的番茄根长结果误差小，平均相对误差仅为4.16%；由THz时域数据预测的根长与计算得到的根长之间最大决定系数为0.999，最小均方根误差为0.743 cm；由折射率光谱数据预测根长的最大决定系数为0.998，最小均方根误差为0.976 cm。该方法不仅能根据THz图像准确地计算出番茄根系的长度，还能由番茄根系的THz光谱有效地预测番茄根长表型，该研究为根系表型检测方法提供了理论依据。

关键词：番茄 THz成像根系表型 Stacking集成学习