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猪MC4R基因G892A位点对生长和繁殖性能的遗传效应分析

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中国畜牧杂志 2014年第19期50卷 5-9页

作者：赵乔辉董文华刘颖程洪青吴圣龙包文斌扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 扬州创日畜牧科技有限公司江苏扬州225009 扬州市种猪繁育工程技术研究中心江苏扬州225009

本研究利用PCR-RFLP方法检测了长白猪、大白猪和杜洛克猪3个品种母猪中MC4R基因G892A位点的遗传多态性,并分析其与部分生长及繁殖性能的关系,以期探究该位点突变是否可以作为猪分子育种的有效遗传标记。结果表明:MC4R基因在3个品种中均... 详细信息

本研究利用PCR-RFLP方法检测了长白猪、大白猪和杜洛克猪3个品种母猪中MC4R基因G892A位点的遗传多态性,并分析其与部分生长及繁殖性能的关系,以期探究该位点突变是否可以作为猪分子育种的有效遗传标记。结果表明:MC4R基因在3个品种中均存在该多态位点;χ2适合性检验表明,该位点在大白猪中偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P基因(型)频率分布显示,在长白猪和杜洛克猪中G等位基因为优势等位基因,而大白猪中A等位基因为优势等位基因;卡方独立性检验表明,3个品种间MC4R基因G892A位点的基因型分布表现为差异极显著(P遗传多样性分析表明,3个品种的PIC值均高于0.25,表现为中度多态;最小二乘法分析表明,MC4R基因G892A位点突变对大白猪、长白猪的所测性状指标影响不显著。但是在杜洛克猪中,AA基因型个体初生重显著高于AG基因型个体(P基因型个体与AA、AG基因型个体差异不显著。AG基因型个体校正背膘厚显著厚于AA基因型个体(P基因型个体差异不显著。GG基因型个体总产仔数显著高于AG和AA基因型个体(P基因型个体具有较好的繁殖性能,总体上GG基因型为有利基因型。

关键词： MC4R基因多态性生长性能繁殖性能猪

郏县红牛全基因组测序分析及关键基因SNP分子标记在育种的应用研究

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中国牛业科学 2021年第5期47卷 5-8页

作者：张顺进张花菊王红利李志钢张子敬刘贤李书岐王二耀茹宝瑞雷初朝陈宏黄永震西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100 平顶山市畜牧技术推广站河南平顶山467000 郏县畜牧局河南郏县467100 河南省农业科学院畜牧兽医研究所郑州450002 河南省畜牧总站郑州450008 平顶山瑞宝红牛有限公司河南平顶山467021

为了更好地扩展对郏县红牛基因组变异的研究,开发更多有效的分子标记,达到促进郏县红牛的进一步选育改良的目标。本研究对30头郏县红牛进行了全基因组重测序,分析了郏县红牛的基因组变异情况,并结合查阅文献筛选影响重要经济性状的遗传... 详细信息

为了更好地扩展对郏县红牛基因组变异的研究,开发更多有效的分子标记,达到促进郏县红牛的进一步选育改良的目标。本研究对30头郏县红牛进行了全基因组重测序,分析了郏县红牛的基因组变异情况,并结合查阅文献筛选影响重要经济性状的遗传变异,检测这些变异在郏县红牛群体中的分布情况。并同时通过实验在3头郏县红牛中加以验证,为郏县红牛的保种与淘汰提供一定的理论依据。

关键词：郏县红牛全基因组分子标记开发利用

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主要家畜生长发育相关基因研究进展

湖北农业科学 2022年第1期61卷 18-21,84页

作者：王大会黄殷琦安清明宋兴亚雷初朝陈宏黄永震铜仁学院农林工程与规划学院贵州铜仁554300 西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100

为从基因分子水平提高家畜生长发育性能,了解调节家畜生长发育的相关基因,提高家畜优势育种水平,综述了近年来主要家畜生长发育相关基因的研究进展,总结了当前存在的问题,也对其应用前景进行了展望。

关键词：家畜生长发育基因研究进展

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中国南阳黄牛HDAC1基因SNP检测及与生长性状的相关性分析

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江苏农业科学 2018年第16期46卷 25-30页

作者：杨颖陆江李湘萍佘纳唐核心石德顺吕祁峰徐照学广西大学动物科学技术学院广西南宁530004 上海交通大学附属上海市第九人民医院上海200002 湖北医药学院麻醉学研究所及附属太和医院麻醉科湖北十堰442000 河南省畜牧研究所河南郑州476800

采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术,以15头南阳黄牛为样本,探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3'-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性。结果显示,南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小,纯合子CC型频率比例... 详细信息

采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术,以15头南阳黄牛为样本,探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3'-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性。结果显示,南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小,纯合子CC型频率比例最大;C等位基因占多数。南阳黄牛HDAC1基因第5外显子没有多态性位点;第11外显子在第110 bp处存在A/G突变位点,为同义突变。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区存在2个突变:199 bp处的T/C多态性位点,其中TT型基因型频率> TG型;以及49 bp处的A/C多态性位点,其中AA型基因型频率> AC型。南阳黄牛HDAC1基因第11外显子基因多态性位点与其生长性状关联分析显示:AG和AA基因型群体中腰角宽、体长有显著性差异(P 基因型比AG基因型群体在日增质量水平有显著提高(P 基因型群体中差异不显著。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3'-UTR非翻译区T/C(199 bp)处位点多态性与生长性状关联性分析发现,各性状在不同基因型群体的均值均无显著差异;A/G(49 bp)处位点多态性与其生长性状关联分析表明:AC和AA基因型群体中在体高、尻长、十字部高和日增质量经济性状上差异显著(P 基因片段中的一些SNP位点差异或多态性有关,这些SNP位点可以考虑为潜在的南阳黄牛分子育种目标位点。

关键词：南阳黄牛 HDAC1基因单核苷酸多态性生长性状

转录组测序技术在绵山羊育种中的应用研究进展

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西北民族大学学报（自然科学版） 2017年第3期38卷 48-52页

作者：路婉茹徐红伟臧荣鑫陈兴丽西北民族大学生命科学与工程学院甘肃兰州730030 西北民族大学实验中心甘肃兰州730030

转录组测序技术已广泛应用于生命科学的各个领域.羊作为被最早驯化的家养动物之一,在人类日常生活中有着不可取代的作用.文章主要从绵山羊肉品质、毛绒生长、泌乳等方面应用转录组测序进行了阐述,为今后绵山羊的分子育种工作提供参考.

关键词：绵山羊转录组测序差异表达基因

内蒙古绒山羊KAP9.2基因遗传多态性及其与生长性状的关联分析

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中国畜牧兽医 2022年第11期49卷 4270-4278页

作者：王聪亮付琪巨敏莹白晶晶李新曙宋晓越李陇平蓝贤勇屈雷张磊朱海鲸榆林学院陕西省绒山羊工程技术研究中心榆林719000 西北农林科技大学动物科技学院杨凌712100 陕西省“四主体一联合”肉羊工程技术校企联合研究中心神木719318 陕西浩丽绒山羊科技发展有限公司子洲718499 榆林市畜牧兽医服务中心榆林719000

【目的】探究内蒙古绒山羊KAP基因家族角蛋白相关蛋白9.2(KAP9.2)基因插入/缺失(insertion/deletion,InDel)突变及其与生长性状的关系,以期为内蒙古绒山羊分子育种提供理论基础。【方法】选取606只雌性阿拉善型内蒙古绒山羊为研究对象,... 详细信息

【目的】探究内蒙古绒山羊KAP基因家族角蛋白相关蛋白9.2(KAP9.2)基因插入/缺失(insertion/deletion,InDel)突变及其与生长性状的关系,以期为内蒙古绒山羊分子育种提供理论基础。【方法】选取606只雌性阿拉善型内蒙古绒山羊为研究对象,采集耳组织提取DNA并测定其体重及体高、体长和胸围等体尺数据,利用琼脂糖凝胶电泳方法与直接测序技术检测KAP 9.2基因的InDel突变,检测遗传多样性指标,利用SPSS 23.0软件分析突变位点与生长性状的关联性。【结果】在内蒙古绒山羊KAP9.2基因外显子区存在30 bp的InDel突变,产生II、ID和DD 3种基因型。多态信息含量(PIC)显示,该位点在育成羊群体中属于中度多态(0.250.05);在整个群体中,属于低度多态(PIC部高有显著影响(P部群体中,此突变对体长和十字部高有显著影响(P基因InDel突变对阿拉善型内蒙古绒山羊多个生长性状有显著或极显著影响,可作为内蒙古绒山羊优良性状选育的分子标记。

关键词： KAP9.2基因内蒙古绒山羊插入/缺失(InDel) 生长性状

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ARPC2基因对鸡白痢沙门氏菌易感性的影响

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ARPC2基因对鸡白痢沙门氏菌易感性的影响

作者：苏亚北广东海洋大学

学位级别：硕士

鸡白痢是一种可以引起鸡发生急性全身病变的疾病,雏鸡的死亡率可以达80%以上,对养鸡业造成巨大损失,但其致病机制尚不明确。肌动蛋白通过聚合或分解引起细胞骨架的重新排列,在病原菌入侵过程中发挥关键作用。ARPC2是ARP2/3肌动蛋白复合... 详细信息

鸡白痢是一种可以引起鸡发生急性全身病变的疾病,雏鸡的死亡率可以达80%以上,对养鸡业造成巨大损失,但其致病机制尚不明确。肌动蛋白通过聚合或分解引起细胞骨架的重新排列,在病原菌入侵过程中发挥关键作用。ARPC2是ARP2/3肌动蛋白复合物的一个亚基,在维持复合物的稳定性中发挥着关键作用。本课题组前期对鸡进行全基因组分析定位影响鸡白痢沙门氏菌易感性的基因组区域,预测ARPC2基因是感染鸡白痢沙门氏菌相关的候选基因。本实验以ARPC2基因为研究对象,利用PCR、RT-q PCR等分子生物学技术和生物信息学预测初步了解该基因的结构和功能,在鸡巨噬细胞中通过过表达和干扰探讨该基因在感染鸡白痢沙门氏菌中的调控作用。通过群体多态性的研究方法检测3’UTR及3’侧翼区的SNP位点对患病程度差异的影响,为ARPC2基因在抗鸡白痢沙门氏菌病育种中提供参考依据,同时为其它抗病基因功能的研究提供一定的借鉴。本研究的主要结果如下:以来自广东省农业科学院动物科学研究所AH资源群体鸡脾脏组织的c DNA样品为样本,利用RT-q PCR技术得到ARPC2基因在不同组织的表达情况,结果显示ARPC2基因在鸡的组织中广泛表达,其中在脾脏和肺脏表达量最高,且ARPC2基因在脾脏的表达量与鸡白痢的检测结果极显著相关(P学分析表明ARPC2编码300个氨基酸,对分子质量为34401.22k D,理论等电点为6.84,摩尔消光系数为19370。没有信号肽存在,是一种非分泌蛋白。整体表现为亲水性,一共有82个磷酸化位点。主要存在于细胞质和细胞核。其二级结构和三级结构预测都显示,主要组成为α-螺旋,还有少量β-折叠,以不规则卷曲为主。本研究成功构建ARPC2基因的过表达载体和干扰抑制si RNA,并分别转染被LPS刺激后的鸡巨噬细胞。通过CCK8检测细胞增殖,结果显示ARPC2基因过表达后抑制细胞增殖,抑制APRC2基因表达则促进细胞增殖;通过IL-6,TNF-α和IFN-γ的相对表达量来检测ARPC2基因在炎症发生中的作用,在过表达ARPC2基因后,炎症因子显著升高,而抑制ARPC2基因,炎症因子无显著变化。位于3’侧翼的位点g.18375G>A与鸡白痢沙门氏菌易感性极显著关联(P基因型更为易感,且该位点与出雏损失率也显著关联(PA与鸡白痢易感性也显著关联(P基因影响鸡对白痢沙门氏菌的易感性,该基因的g.18375G>A位点可以作为一种鸡白痢抗病育种的分子标记。

关键词： ARPC2基因巨噬细胞鸡白痢沙门氏菌

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鱼类MHCII类基因及其研究进展

广东农业科学 2012年第3期39卷 141-145页

作者：庞纪彩高风英卢迈新朱华平可小丽黄樟翰中国水产科学研究院珠江水产研究所广东广州510380 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)是广泛存在于脊椎动物体内,与免疫相关并编码免疫蛋白受体的基因群。在鱼类中,由于其高度的多态性,使其在遗传、进化以及抗病育种等方面备受青睐。从MHC II类基因的分子结... 详细信息

主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)是广泛存在于脊椎动物体内,与免疫相关并编码免疫蛋白受体的基因群。在鱼类中,由于其高度的多态性,使其在遗传、进化以及抗病育种等方面备受青睐。从MHC II类基因的分子结构与功能、克隆及组织分布、遗传特征及基因多态性与抗病力的关系以及MHC II类基因在鱼类研究中的应用进行综述,并对鱼类MHCⅡ类基因未来的研究重点进行展望。

关键词：鱼类 MHCII基因免疫抗病育种

鸡let-7b前体区SNP及其与生长肉用性状的关联分析

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鸡let-7b前体区SNP及其与生长肉用性状的关联分析

作者：岳孝亭佛山科学技术学院

学位级别：硕士

Micro RNA是一类约有22个左右核苷酸的内源性非编码功能RNA,通过与靶基因的m RNA 3′非编码区完全互补配对或不完全互补配对而调控基因表达。每个mi RNA都可能有若干个靶基因,而位于mi RNA基因序列上的单核苷酸多态性(Single Nucleotide... 详细信息

Micro RNA是一类约有22个左右核苷酸的内源性非编码功能RNA,通过与靶基因的m RNA 3′非编码区完全互补配对或不完全互补配对而调控基因表达。每个mi RNA都可能有若干个靶基因,而位于mi RNA基因序列上的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)能够改变其加工过程或其对靶基因的选择进而影响该mi RNA功能的发挥,因此鉴定与揭示mi RNA SNP的功能与作用显得尤为重要。本研究的主要目的是探究位于let-7b前体区的单核苷酸多态性与鸡的生长、屠体和肉质等性状的关联分析,揭示let-7b的生物学功能以及SNP对let-7b表达的影响。本研究应用生物信息学方法和测序法筛选出鸡let-7b前体区存在的SNP,以华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室的杏花鸡×隐性白洛克F2代全同胞家系为研究材料,通过直接DNA测序法筛选出位于资源群let-7b前体基因的SNP并进行基因分型,与该资源群的生长、屠体、肉质等经济性状进行关联分析初步揭示SNP的功能;通过构建let-7b不同单倍型的let-7b过表达载体并转染鸡原代成肌细胞,通过荧光定量PCR检测含不同单倍型的let-7b过表达载体对let-7b成熟体表达量的影响。本研究主要得到以下结果:1.获得let-7b前体区序列,通过混池测序结果分析和基因型频率检测,得出4个SNP位点,g.270G>A、g.526G>A、g.678T>C、g.710G>C。2.将SNP位点数据与杏花×隐性白F2代资源群的屠体、生长、体尺及肉质性状数据进行关联分析,g.270G>A与宰前活重、翅重、腿肌粗蛋白含量存在显著关联(PA与腿肌肉重存在显著关联(PC与腿胸比、腿肌PH、56d胫长存在极显著关联(PC与77d胫直径存在极显著关联(P组质粒,转染至鸡原代成肌细胞,测定不同单倍型let-7b成熟体表达量,其中AGCC单倍型转染后let-7b成熟序列相对表达量2.362,AACC单倍型为3.188,GATC单倍型为3.649,GACG单倍型为3.052,GACC单倍型为2.977,pc DNA3.1空载体为1.054。

关键词： miRNA let-7b SNP 表达载体