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马铃薯StbZIP10基因生物信息学及其锌胁迫下的表达分析

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农业生物技术学报 2023年第11期31卷 2221-2230页

作者：刘昊天赵婧唐勋赵贵宾朱永永张宁司怀军甘肃农业大学生命科学技术学院/省部共建干旱生境作物学国家重点实验室甘肃省农业信息中心甘肃省农业技术推广总站

锌在植物生长和发育的许多方面发挥作用。但过量的锌和缺锌均会导致生理生化紊乱，形成锌胁迫。碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP)转录因子在调控植物生长发育、响应胁迫应答方面具有重要作用。本研究以马铃薯(Solanum tubero... 详细信息

锌在植物生长和发育的许多方面发挥作用。但过量的锌和缺锌均会导致生理生化紊乱，形成锌胁迫。碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP)转录因子在调控植物生长发育、响应胁迫应答方面具有重要作用。本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)品种’Atlantic’为材料，克隆得到StbZIP10基因(GenBank No. XM＿006359636.1)，该基因全长1 653 bp,CDS长为819 bp，共编码272个氨基酸。生物信息学分析表明，StbZIP10是相对分子质量为29.68 kD的疏水性跨膜蛋白，具有典型的bZIP保守结构域。亚细胞定位结果显示，StbZIP10蛋白主要在细胞核和细胞膜上表达。利用qRT-PCR对马铃薯StbZIP10基因进行组织特异性表达分析，结果表明，StbZIP10基因在马铃薯根中表达量最高，叶中表达量最低，并且各组织之间表达量存在显著性差异。在缺锌条件下，马铃薯’Atlantic’和’陇薯7号’品种中StbZIP10的表达模式相同，都为根部表达量最高。在缺锌处理下，StbZIP10在两品种中的表达水平均有提升，但在品种’陇薯7号’的表达量显著高于’Atlantic’(P<0.05)，且3个时间段内趋势基本相同。本研究为进一步阐明StbZIP10基因功能提供了基础资料。

关键词：锌胁迫马铃薯 StbZIP10 生物信息学亚细胞定位

转化有机废弃物的亮斑扁角水虻虫粉饲喂斑马鱼和大鼠的安全性研究

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华中农业大学学报 2022年第4期41卷 56-63页

作者：于均帅代娜聂啟玉蔡珉敏张吉斌范明霞农业微生物学国家重点实验室/华中农业大学生命科学技术学院武汉430070 武汉大学人民医院武汉430060 农业农村部微生物产品质量监督检验测试中心武汉430070

为对亮斑扁角水虻转化不同物料获得的虫粉的安全性作出评估,探究饲喂亮斑扁角水虻转化不同有机废弃物获得的虫粉后斑马鱼和大鼠生理、生化和组织病理指标的差异。将斑马鱼和大鼠均分为4组:①对照组(斑马鱼对照组,CK1:投喂绿藻粉;大鼠对... 详细信息

为对亮斑扁角水虻转化不同物料获得的虫粉的安全性作出评估,探究饲喂亮斑扁角水虻转化不同有机废弃物获得的虫粉后斑马鱼和大鼠生理、生化和组织病理指标的差异。将斑马鱼和大鼠均分为4组:①对照组(斑马鱼对照组,CK1:投喂绿藻粉;大鼠对照组,CK2:投喂常规鼠饲料);②鸡粪饲养组(鸡粪组,A组):投喂鸡粪饲养的亮斑扁角水虻虫粉;③餐厨垃圾饲养组(餐余组,B组):投喂餐厨垃圾饲养的亮斑扁角水虻虫粉;④农副产品饲料饲养组(饲料组,C组):投喂农副产品饲料饲养的亮斑扁角水虻虫粉。斑马鱼孵化后喂养15 d、大鼠喂养28 d后测生理、生化和组织病理指标。结果显示,除鸡粪组外其他各组对斑马鱼生理、生化指标并无显著影响;对照组、餐余组和饲料组水虻虫粉对斑马鱼和大鼠组织病理无显著影响;各组水虻虫粉对大鼠的生理生化指标虽有个别显著影响但均维持在正常值。结果表明,完全以亮斑扁角水虻转化餐厨垃圾和农副产品饲料获得的虫粉可作为高营养的斑马鱼开口饲料和大鼠短期饲养的饲料。

关键词：亮斑扁角水虻虫粉动物饲料安全性斑马鱼大鼠有机废弃物

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盐碱胁迫下扁吻鱼幼鱼耐受性分析

新疆农业科学 2023年第6期60卷 1540-1547页

作者：王新月訾方泽葛建民陈生熬姚娜肖青艾尼瓦尔·依布拉音塔里木大学生命科学与技术学院/塔里木珍稀鱼类研究中心新疆阿拉尔843300 华中农业大学水产学院武汉430070 新疆阿克苏地区农业农村局新疆阿克苏843300

【目的】研究塔里木河水系特有鱼类适应生物学,评估扁吻鱼幼鱼机体抗逆性能,分析其濒危机制,为扁吻鱼的苗种培育和驯化养殖提供参考。【方法】基于实验室生态学方法,测定扁吻鱼幼鱼盐碱耐受性及进行行为学分析。【结果】在pH值(7.78±0.... 详细信息

【目的】研究塔里木河水系特有鱼类适应生物学,评估扁吻鱼幼鱼机体抗逆性能,分析其濒危机制,为扁吻鱼的苗种培育和驯化养殖提供参考。【方法】基于实验室生态学方法,测定扁吻鱼幼鱼盐碱耐受性及进行行为学分析。【结果】在pH值(7.78±0.09)、温度(21±1)℃条件下,扁吻鱼对照组幼鱼无明显应激反应,活动平缓,呼吸正常,对外界刺激(光、声音等)有正常反应,未出现死亡个体。实验组幼鱼初始接触实验水体应激过强,随盐碱浓度梯度升高,游动急躁,挣扎撺动,继而死亡,碱度浓度梯度下的行为特征与盐度实验类似。扁吻鱼幼鱼24、48、72、96 h的氯化钠(NaCl)盐度半致死浓度(LC_(50))分别为14.3021、13.7214、13.6144、13.5332 g/L,安全浓度(SC)为3.7891 g/L;碳酸氢钠(NaHCO_(3))碱度半致死浓度(LC_(50))分别为51.8561、39.5025、32.9515、31.7779 mmol/L,安全浓度(SC)为11.8508 mmol/L。【结论】盐碱胁迫下扁吻鱼幼鱼的安全浓度(SC)分别为3.7891 g/L、11.8508 mmol/L,与曾栖息水体环境理化指标相比,扁吻鱼受碱度较大胁迫,栖息水体盐碱的持续升高极大影响其生态位和栖息生境的选择致其濒危。

关键词：扁吻鱼幼鱼盐碱胁迫耐受性行为学

“微生物学”课程作业设计及评价体系的改革实践

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微生物学通报 2018年第3期45卷 473-479页

作者：陈雯莉胡胜聂海玲华中农业大学生命科学技术学院湖北武汉430070

本文介绍了华中农业大学微生物学教研室2015–2017年在国家精品资源共享课"微生物学"教学过程中进行的作业设计和评价体系的改革实践。该项目主要由塔式题目设计、二元评价体系、档案纪录及评价反馈机制3个部分组成。其中每章作业题按"... 详细信息

本文介绍了华中农业大学微生物学教研室2015–2017年在国家精品资源共享课"微生物学"教学过程中进行的作业设计和评价体系的改革实践。该项目主要由塔式题目设计、二元评价体系、档案纪录及评价反馈机制3个部分组成。其中每章作业题按"3道基础题+2道发散题+1道固定题+1份知识拓展"的塔式设计,作业的批改与评价同时采用两套体系,一套为ABCD体系,以对错标准评分,强调知识掌握与运用。一套为M(Model)体系,以独立思考精神和科研思维能力为评定标准,树立典范,鼓励思考和创新。批改后的作业及时发回学生本人,作业上有整体的和每一题的二元评价。项目实施过程中建立档案,详细记录每一个学生作业完成情况并及时反馈。信息反馈包括作业整体概况通报、作业逐题点评和模范作业推荐。特别是通过表扬并上传模范作业的扫描件来鼓励和肯定优秀的学生答案,激励每一位学生进步。总之,三年来这些改革措施能让教师清楚了解学生对课程学习与掌握的情况,有助于注重培养学生的独立思考能力和科学创新精神,鼓励学生的个性化发展和团队协作交流,便于因材施教,在实践中取得了良好的教学效果,受到师生的一致好评。

关键词：微生物学作业设计评价体系教学改革

紫红链霉菌2917磷脂酶A_2基因的克隆及序列分析

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武汉大学学报（理学版） 2002年第4期48卷 500-506页

作者：李维琳华中农业大学生命科学技术学院湖北武汉430072

用探针从紫红链霉菌 2 917基因组文库中克隆出磷脂酶A2 基因 ,经双向测序 ,确定了其基因的全序列 ,并由此推导出其氨基酸序列将此序列与其他来源的磷脂酶A2 基因序列进行了比较研究 ,结果显示 ,与天蓝色链霉菌A3(2 )中磷脂酶A2 的同... 详细信息

用探针从紫红链霉菌 2 917基因组文库中克隆出磷脂酶A2 基因 ,经双向测序 ,确定了其基因的全序列 ,并由此推导出其氨基酸序列将此序列与其他来源的磷脂酶A2 基因序列进行了比较研究 ,结果显示 ,与天蓝色链霉菌A3(2 )中磷脂酶A2 的同源性为 98% ;与蛇毒的磷脂酶A2 的同源性小于 10 % ,但有类似的质子传递系统、Ca2 + 结合环以及疏水通道等结构这个基因的克隆为磷脂酶A2 结构与功能的研究提供更多的信息 ,也为利用重组微生物生产磷脂酶A2

关键词：紫红链霉菌2917 磷脂酶A2 序列分析

鼠衣原体感染L929细胞致宿主死亡方式的研究

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中华微生物学和免疫学杂志 2017年第7期37卷 502-507页

作者：陈丽香于辛刘雪李顺赵秀云周晓辉复旦大学附属公共卫生临床中心 201508 华中农业大学生命科学技术学院武汉430070

目的对鼠衣原体感染L929细胞48h后细胞发生死亡的方式（凋亡、自噬、坏死）进行初步探讨。方法以感染复数（multiplicity of infection，MOI）为0．85的鼠衣原体感染小鼠成纤维细胞L929，48h后利用荧光显微镜观察DAPI染色情况；应用Prop... 详细信息

目的对鼠衣原体感染L929细胞48h后细胞发生死亡的方式（凋亡、自噬、坏死）进行初步探讨。方法以感染复数（multiplicity of infection，MOI）为0．85的鼠衣原体感染小鼠成纤维细胞L929，48h后利用荧光显微镜观察DAPI染色情况；应用Propidium Iodide（PI）与AnnexinV染色后流式细胞术分析细胞的凋亡．坏死情况；转染GFP—LC3质粒后荧光显微镜观察LC3表达．Western blot检测LC3蛋白分析细胞自噬情况。结果鼠衣原体感染L929细胞48h后，表现为DAPI染色无凋亡时细胞核碎裂特征，PI与AnnexinV染色后流式分析表明细胞坏死增多，转染***3后，与未感染对照相比．鼠衣原体感染组可见荧光弥散状变为点状分布：Westernblot分析可发现鼠衣原体感染的L929细胞LC31蛋白向LC3Ⅱ蛋白转化增强。结论鼠衣原体感染48h后L929细胞主要发生细胞坏死而非细胞凋亡，并伴有细胞自噬现象。

关键词：衣原体 L929细胞凋亡坏死自噬

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农药的化学信息学分析

农药学学报 2012年第5期14卷 482-488页

作者：尤春胡奔吴萍孔德信华中农业大学生命科学技术学院生物信息中心武汉430070 华中农业大学理学院武汉430070 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室武汉430070

从大英农作物生产研究会e-农药手册(The e-Pesticide Manual V5.0)中提取了1 478个各类农药,利用化学信息学方法对比了农药与临床药物在物理化学性质、分子骨架等方面的差异,分析了二者在化学空间中的分布特点。结果表明:农药具有相对... 详细信息

从大英农作物生产研究会e-农药手册(The e-Pesticide Manual V5.0)中提取了1 478个各类农药,利用化学信息学方法对比了农药与临床药物在物理化学性质、分子骨架等方面的差异,分析了二者在化学空间中的分布特点。结果表明:农药具有相对较低的相对分子质量和较高的脂溶性,其F、Cl、P等元素含量明显高于临床药物;在分子骨架和化学空间分布上二者也有着显著差异。因此,在将医药研发的技术应用到农药研发时,应根据农药的特点适当调整设计或计算参数。

关键词：农药临床药物化学空间分子骨架描述符

独岛枝芽胞杆菌MCCC 1A00493产生的4-乙烯基苯酚鉴定和作用南方根结线虫特性研究

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微生物学报 2022年第1期62卷 346-356页

作者：黄典余豪陈稳程万里邵宗泽张吉斌华中农业大学生命科学技术学院微生物农药国家工程研究中心农业微生物学国家重点实验室湖北武汉430070 自然资源部第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

【目的】根结线虫危害严重,难防难控,前期研究发现一株深海来源的独岛枝芽胞杆菌(Virgibacillus dokdonensis)MCCC 1A00493对南方根结线虫具有良好的体外拮抗效果,本研究分离鉴定菌株发酵液中杀线虫活性物质,对其作用线虫的多种模式进... 详细信息

【目的】根结线虫危害严重,难防难控,前期研究发现一株深海来源的独岛枝芽胞杆菌(Virgibacillus dokdonensis)MCCC 1A00493对南方根结线虫具有良好的体外拮抗效果,本研究分离鉴定菌株发酵液中杀线虫活性物质,对其作用线虫的多种模式进行研究,为菌株有效控制植物病原线虫的应用奠定理论基础。【方法】采用硅胶柱层析和半制备高效液相色谱对独岛枝芽胞杆菌发酵上清液中的杀线虫活性物质进行分离纯化,采用液相色谱质谱联用、核磁共振对纯化物进行结构鉴定;并对其趋避、诱杀、熏杀和卵孵化抑制活性进行检测。【结果】结构鉴定确定独岛枝芽胞杆菌MCCC 1A00493发酵液中分离的杀线虫活性物质为4-乙烯基苯酚。4-乙烯基苯酚对线虫具有触杀、熏杀、卵孵化抑制和高浓度驱避低浓度引诱活性,15μg/mL 4-乙烯基苯酚72 h触杀线虫校正死亡率为71.23%±9.06%;20 mg/mL 4-乙烯基苯酚24 h熏杀线虫死亡率达100%;100μg/mL 4-乙烯基苯酚作用线虫卵10 d后,卵孵化抑制率达66.2%;在琼脂平板上,10 mg/mL的4-乙烯基苯酚对线虫有驱避作用,1 mg/mL的4-乙烯基苯酚对线虫有引诱作用;在Pluronic凝胶中,25 mg/mL的4-乙烯基苯酚驱避线虫,5 mg/mL和10 mg/mL的4-乙烯基苯酚引诱并杀死线虫。【结论】首次报道4-乙烯基苯酚对植物病原线虫具有多种作用模式,尤其是高浓度下对根结线虫具有趋避作用而低浓度下具有诱杀作用的新特性。因此,4-乙烯基苯酚可以作为一种潜在的生物杀线虫剂。

关键词：南方根结线虫独岛枝芽胞杆菌 4-乙烯基苯酚杀线虫活性作用模式

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天气雷达空中生态监测

信号处理 2024年第1期40卷 94-113页

作者：胡程崔铠王锐龙腾吴东丽吴孔明北京理工大学雷达技术研究院北京100081 嵌入式实时信息处理技术北京市重点实验室北京100081 北京理工大学前沿技术研究院山东济南250300 北京理工大学计算机学院北京100081 中国气象局气象探测中心北京100081 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193

每年数以亿计的昆虫、候鸟和蝙蝠等空中动物在全球范围内远距离迁飞,显著影响空中生态系统的结构和功能。随着全球气候和环境的不断变化,空中生态环境也在迅速恶化,对人类的生命和健康构成了严重威胁。为了保护空中生态环境,首要任务是... 详细信息

每年数以亿计的昆虫、候鸟和蝙蝠等空中动物在全球范围内远距离迁飞,显著影响空中生态系统的结构和功能。随着全球气候和环境的不断变化,空中生态环境也在迅速恶化,对人类的生命和健康构成了严重威胁。为了保护空中生态环境,首要任务是对其进行有效监测。天气雷达具有大范围、全天时、全天候监测能力,可覆盖百千千米空间尺度,是监测和研究宏观空中生态的有效工具。十余年来,天气雷达空中生态监测领域取得了突破性的进展,极大提高了对空中迁飞动物的探测能力,可有效弥补传统监测手段存在的覆盖范围小和时间分辨率低等技术局限。天气雷达已在全球范围内的生物多样性保护、迁飞性虫害监测、疫源疫病传播防控等重大空中生态议题中发挥着日益重要的作用,有效填补了宏观生态研究空白。目前,美国、欧洲和中国分别建立了全球三大天气雷达网,为空中生态研究提供了重要的基础设施和数据支持。本文详细阐述了当前全球天气雷达空中生态监测的科学研究进展,以及通过天气雷达揭示的空中动物迁飞科学规律。然后,对天气雷达生态监测中迁飞动物的电磁散射建模、雷达回波提取、群体参数反演、雷达观测验证实验,以及宏观迁飞模型等关键技术进行了梳理和总结,并详细介绍了中国天气雷达空中生态监测的进展情况。最后,对未来发展方向进行了展望,指出针对中国当前农业迁飞性害虫和鸟类宏观迁飞等重大监测需求,需要在扩维探测、多参反演、多源预测等方面深入研究和探索,以进一步解读重大动物迁飞事件、分析宏观迁飞规律、揭示空中生态对气候变化的响应。

关键词：空中生态天气雷达雷达回波提取参数反演迁飞预测