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黑龙江漠河和伊春林区蚂蚁物种多样性和分布格局研究

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内蒙古农业大学学报(自然科学版) 2024年

作者：邓方超徐正会褚姣娇冷雪艳赵元昊周雪英许国莲西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室

黑龙江地区蚂蚁物种多样性资源缺乏深入的调查和群落结构分析，亟待开展相关研究。采用搜索调查法获取了黑龙江省漠河县和伊春市的蚂蚁群落调查的标本和数据，采用多样性测定方法和采获频数法分别研究了该地区的物种多样性和分布格局。... 详细信息

黑龙江地区蚂蚁物种多样性资源缺乏深入的调查和群落结构分析，亟待开展相关研究。采用搜索调查法获取了黑龙江省漠河县和伊春市的蚂蚁群落调查的标本和数据，采用多样性测定方法和采获频数法分别研究了该地区的物种多样性和分布格局。在漠河和伊春林区合计采集蚂蚁标本3 259头，经分类鉴定有3亚科7属15种，角结红蚁Myrmica angulinodis Ruzsky、莱曼蚁Formica lemani Bondroit为黑龙江省新记录种。在该地区各类生境中，针阔混交林的蚂蚁物种最丰富。日本弓背蚁Camponotus japonicus Mayr、丝光蚁Formica fusca Linnaeus和角结红蚁Myrmica angulinodis Ruzsky是漠河和伊春林区生态适应幅度最宽的物种，而北方蚁Formica aquilonia Yarrow、红头林蚁Formica truncorum Fabricius、亚光盗蚁Harpagoxenus sublaevis Nylander和西伯利亚臭蚁Dolichoderus sibiricus Emery是该地区较稀有的物种。本研究为东北林区蚂蚁多样性保护和利用提供了重要参考。

关键词：膜翅目蚁科物种多样性分布格局黑龙江省

牛樟芝中Cys2His2型锌指蛋白鉴定及表达分析

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分子植物育种 2023年

作者：陈娇娇王毅张颖郑元云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

Cys2His2型锌指蛋白作为关键调节因子参与真菌生长发育以及次级代谢等过程。本研究利用本地BLAST软件对牛樟芝全基因组的蛋白序列进行全基因组比对，鉴定出10个牛樟芝Cys2His2转录因子编码基因。通过生物信息学手段分析Cys2His2转录因... 详细信息

Cys2His2型锌指蛋白作为关键调节因子参与真菌生长发育以及次级代谢等过程。本研究利用本地BLAST软件对牛樟芝全基因组的蛋白序列进行全基因组比对，鉴定出10个牛樟芝Cys2His2转录因子编码基因。通过生物信息学手段分析Cys2His2转录因子的结构和功能，并通过转录组测序分析Cys2His2转录因子在不同培养条件下牛樟芝菌丝体的表达情况。结果显示：10个Cys2His2转录因子氨基酸数量在254 (Cys2His2-6)～1 095 (Cys2His2-8)之间，理论等电点pI值平均为7.96，均为亲水性蛋白，Cys2His2-1和Cys2His2-8定位于细胞核、Cys2His2-5和Cys2His2-10定位于细胞质、Cys2His2-2和Cys2His2-4定位于液泡，二级结构主要为无规则卷曲。Cys2His2-5、Cys2His2-10和brlA聚为一枝，其bootstrap值为80。在牛樟粉末(NZZ-NF)、Tritonx-100 (NZZ-T)、牛樟粉末和Tritonx-100 (NZZ-NFT)、阴香粉末(NZZ-YF)、阴香粉末和Tritonx-100 (NZZ-YFT)、乔松粉末(NZZ-QF)、孔雀柏粉末(NZZ-KF)、杨木屑和玉米粉(NZZ-YY)、薏仁(NZZ-YR)、玉米面(NZZ-YM) 10种培养条件下培养的牛樟芝菌丝体中，有2个转录因子(Cys2His2-1和Cys2His2-8)表达，均在NZZ-YY培养牛樟芝菌丝体表达量较高；Cys2His2-1在NZZ-NF培养牛樟芝菌丝体中呈高表达水平；Cys2His2-8在NZZ-YR培养牛樟芝菌丝体中显著表达。

关键词：牛樟芝 Cys His 转录因子转录组分析蛋白理化性质分析

核桃炭疽病菌中GH互作蛋白找寻及遗传关系分析

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福建农林大学学报(自然科学版) 2023年

作者：张凯强韩长志云南省森林灾害预警与控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院

植物病原真菌中的糖苷水解酶（GH）是参与破坏植物细胞壁的重要酶类，在其致病过程中发挥着重要作用。基于前期所获得的胶孢炭疽菌Cg1中20个GH蛋白，通过STRING网络在线分析与其相似性较高的两个炭疽菌种——胶孢炭疽菌Cg-14和果生炭疽... 详细信息

植物病原真菌中的糖苷水解酶（GH）是参与破坏植物细胞壁的重要酶类，在其致病过程中发挥着重要作用。基于前期所获得的胶孢炭疽菌Cg1中20个GH蛋白，通过STRING网络在线分析与其相似性较高的两个炭疽菌种——胶孢炭疽菌Cg-14和果生炭疽菌Nara gc5相关蛋白的互作关系。结果发现，两个炭疽菌菌株GH蛋白的互作情况极为相似。其中：GH5的互作蛋白数量最多，且GH5、GH6、GH7、GH11之间均存在明显互作关系；GH28亚家族中两个蛋白之间互作但不与其他GH亚家族蛋白互作；与单独GH蛋白存在互作关系的其他类蛋白多参与多糖催化、碳水化合物代谢等过程。此外，利用生物信息学分析工具对上述蛋白进行了分子对接、亚细胞定位及遗传关系分析。结果发现：不同蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸位点；仅归属于GH72亚家族的3个蛋白定位于质膜，其余蛋白均定位于细胞外；胶孢炭疽菌Cg1、Cg-14以及果生炭疽菌Nara gc5中GH蛋白明显分为四大类。其中：GH43亚家族中的3个蛋白分属于不同分支，亲缘关系较远；GH5中的3个蛋白有两个属于同一分支，另一个单独在一个分支；而GH7、GH11、GH28亚家族内部的蛋白均属于同一分支。本研究结果可为深入研究核桃炭疽病菌中GH家族蛋白的协同作用机制提供参考。

关键词：胶孢炭疽菌果生炭疽菌互作蛋白生物信息学分析遗传关系

禾谷炭疽菌中糖苷水解酶互作蛋白找寻及遗传关系预测分析

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福建农林大学学报(自然科学版) 2023年

作者：薄淑文韩长志云南省森林灾害预警与控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院

糖苷水解酶（GH）作为植物病原菌侵染、破坏植物细胞壁的重要酶类，在其致病过程中发挥着重要作用。为了解禾谷炭疽菌GH蛋白之间的互作机制，本研究基于前期所获的禾谷炭疽菌GH蛋白，通过STRING网络在线分析不同GH蛋白之间的互作关系，... 详细信息

糖苷水解酶（GH）作为植物病原菌侵染、破坏植物细胞壁的重要酶类，在其致病过程中发挥着重要作用。为了解禾谷炭疽菌GH蛋白之间的互作机制，本研究基于前期所获的禾谷炭疽菌GH蛋白，通过STRING网络在线分析不同GH蛋白之间的互作关系，利用ProtComp v 9.0在线分析GH蛋白的亚细胞定位，通过ClustalX和MEGA 11软件对GH蛋白进行多重比对和构建系统进化树，，并选取互作关系多的蛋白通过GRAMM在线软件进行分子对接。结果显示，禾谷炭疽菌中89个GH蛋白之间的互作表现为三大类的聚集关系，其中，I类聚集了34个GH蛋白，II类聚集了33个GH蛋白，III类聚集了22个GH蛋白。这些GH蛋白之间有3种互作情况，即不同亚类GH蛋白之间的互作、同一亚类中不同GH蛋白之间的互作以及不存在互作关系；85个GH蛋白定位于细胞外（分泌），仅4个GH蛋白定位于细胞核、内质网、细胞质膜。系统发育树分为四大类，有一些GH亚家族蛋白只存在于一类中，也有一些GH亚家族蛋白同时存在于两类及两类以上中；分子对接发现，互作蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸残基位点，蛋白之间可通过氢键相互作用。

关键词：禾谷炭疽菌糖苷水解酶蛋白互作协同作用

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苹果内生促生真菌筛选及其促生特性

果树学报 2023年第4期40卷 735-746页

作者：刘娟娟郑娇高成林刘虹杉张东华刘丽云南省高校森林灾害预警控制重点实验室·西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224

【目的】从苹果不同部位内生真菌中筛选具有促生潜力的菌株,为开发苹果益生真菌储备菌种资源,为探究苹果内生真菌与宿主互利共生关系提供试验基础。【方法】采用组织分离法获得内生真菌,基于ITS序列鉴定到属种;筛选、比较菌株产IAA、铁... 详细信息

【目的】从苹果不同部位内生真菌中筛选具有促生潜力的菌株,为开发苹果益生真菌储备菌种资源,为探究苹果内生真菌与宿主互利共生关系提供试验基础。【方法】采用组织分离法获得内生真菌,基于ITS序列鉴定到属种;筛选、比较菌株产IAA、铁载体等促生能力;回接潜力菌株于苹果组培苗,50 d后观察组培苗生长情况。【结果】共分离获得内生真菌51株鉴定为29种。促生潜力筛选后,选取IAA含量高、兼具促生功能多的5株菌(LG06、PG06、LG12、LY09、PJ09)回接苹果组培苗。结果表明其中4株内生真菌对苹果组培苗的促生效果明显,与对照相比,菌株PG06的叶片数量、叶绿素含量、叶片总氮含量增高最多(p实验依据。

关键词：苹果内生真菌促生组培苗

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小菜蛾幼虫生防菌株毒力测定及产毒条件优化

山东农业科学 2024年第5期56卷 132-137页

作者：张梓月芦俊佳杨明国马云强田芸菁勾朝金刘勉西南林业大学园林园艺学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为丰富小菜蛾(Plutella xylostella)生物防治的微生物资源,本研究选用粉红粘帚霉(Clonostachys rosea)、淡紫拟青霉(Purpureocillium lilacinum)和02号生赤壳属(Bionectria sp.)三种具有较好生防效果的菌株开展其对小菜蛾幼虫毒力的菌... 详细信息

为丰富小菜蛾(Plutella xylostella)生物防治的微生物资源,本研究选用粉红粘帚霉(Clonostachys rosea)、淡紫拟青霉(Purpureocillium lilacinum)和02号生赤壳属(Bionectria sp.)三种具有较好生防效果的菌株开展其对小菜蛾幼虫毒力的菌株筛选试验,同时对选出的高毒力菌株进行毒力测定和产毒条件优化。结果表明,三种菌株对小菜蛾幼虫都具有防治效果,其中以粉红粘帚霉的生防毒力最强。毒力测定显示,粉红粘帚霉的半致死时间(LT_(50))为30.88 h,半致死浓度(LC_(50))为4.365×10^(4)个孢子/mL。从产毒条件优化结果看出,粉红粘帚霉产毒的最适培养基为萨氏葡萄糖琼脂酵母膏(SDAY),最适pH值为6,最适培养时间为7 d。综上表明,粉红粘帚霉对小菜蛾幼虫具有毒力高、致病速度快等特点,具有较大的生防潜力,可作为防治小菜蛾的优良生防真菌。

关键词：小菜蛾幼虫生防菌株筛选毒力测定粉红粘帚霉产毒条件优化

核桃炭疽病菌中GH互作蛋白找寻及遗传关系分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2024年第2期53卷 199-205页

作者：张凯强韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】植物病原真菌中的糖苷水解酶(GH)是参与破坏植物细胞壁的重要酶类,在真菌致病过程中发挥着重要作用。了解核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作蛋白及其遗传关系,可为深入研究该病菌中GH家族蛋白的协同作用机制提供参考。【方法】基于前... 详细信息

【目的】植物病原真菌中的糖苷水解酶(GH)是参与破坏植物细胞壁的重要酶类,在真菌致病过程中发挥着重要作用。了解核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作蛋白及其遗传关系,可为深入研究该病菌中GH家族蛋白的协同作用机制提供参考。【方法】基于前期所获得的胶孢炭疽菌Cg1中20个GH蛋白,通过STRING网络在线分析与其相似性较高的两个炭疽菌种——胶孢炭疽菌Cg-14和果生炭疽菌Nara gc5相关蛋白的互作关系;同时,利用生物信息学分析工具对这些蛋白进行了分子对接、亚细胞定位及遗传关系分析。【结果】两个炭疽菌菌株GH蛋白的互作情况极为相似。其中:GH5的互作蛋白数量最多,且GH5、GH6、GH7、GH11之间均存在明显互作关系;GH28亚家族中两个蛋白之间互作但不与其他GH亚家族蛋白互作;与单独GH蛋白存在互作关系的其他类蛋白多参与多糖催化、碳水化合物代谢等过程。不同蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸位点;仅GH72亚家族中的3个蛋白定位于质膜,其余蛋白均定位于细胞外;胶孢炭疽菌Cg1、Cg-14以及果生炭疽菌Nara gc5中GH蛋白明显分为四大类。其中:GH43亚家族中的3个蛋白分属于不同分支,亲缘关系较远;GH5中的3个蛋白有两个属于同一分支,另一个单独在一个分支;而GH7、GH11、GH28亚家族内部的蛋白均属于同一分支。【结论】核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作关系主要有3种,即不同GH蛋白之间的互作、同一GH亚家族中不同蛋白之间的互作以及单独的GH蛋白。其中,大部分GH蛋白定位于细胞外,且大多数GH亚家族中不同蛋白之间的亲缘关系较近,仅有小部分亲缘关系较远。

关键词：胶孢炭疽菌果生炭疽菌互作蛋白生物信息学分析遗传关系

添加猴樟基质对牛樟芝生长及生理生化特性的影响

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福建农业学报 2022年第12期37卷 1586-1594页

作者：黄兴连宝元朵杨志娟陈小涛郑元西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】明确添加猴樟Cinnamomum bodinieri基质对牛樟芝Antrodia cinnamomea生长及生理生化特性的影响,并筛选出适宜的猴樟茎、叶浓度。【方法】比较分析在牛樟芝基础培养基中添加质量浓度分别为0.125、0.25、0.5、1、2、4、8、16、32... 详细信息

【目的】明确添加猴樟Cinnamomum bodinieri基质对牛樟芝Antrodia cinnamomea生长及生理生化特性的影响,并筛选出适宜的猴樟茎、叶浓度。【方法】比较分析在牛樟芝基础培养基中添加质量浓度分别为0.125、0.25、0.5、1、2、4、8、16、32、64 g·L^(-1)的猴樟嫩枝、嫩叶、枝叶混合物时,牛樟芝的生长特性、生物量、SOD活性和总三萜(TT)含量的差异。【结果】在PDA培养基中添加质量浓度分别为0.5~4 g·L^(-1)、2~8 g·L^(-1)、1~4 g·L^(-1)、4~16 g·L^(-1)的猴樟嫩枝基质,牛樟芝相应表现出生长特性较优、生物量、SOD活性和TT含量较高的优势,并显著高于对照水平;在PDA培养基中添加猴樟嫩叶基质质量浓度为1~2 g·L^(-1)时,其生长特性较优,SOD活性较高,当添加量为2~4 g·L^(-1)时,其生物量和TT含量较高;在PDA培养基中添加猴樟枝叶混合物基质质量浓度分别为2~4 g·L^(-1)、1~4 g·L(^(-1))、0.125~1 g·L^(-1)、4~8 g·L^(-1)时,其相应表现为生长特性较优、生物量、SOD活性和TT含量较高的优势。【结论】研究结果表明,总体来说,在PDA培养基中添加猴樟基质均能促进牛樟芝菌丝体、生物量、SOD活性和总三萜含量的提高,其中猴樟嫩叶基质2 g·L^(-1)对菌丝体和生物量的提高最显著、猴樟嫩枝1 g·L^(-1)或嫩叶基质2 g·L^(-1)对菌丝体SOD活性的促进效果最显著;猴樟嫩枝基质8 g·L^(-1),对菌丝体总三萜含量的促进效果最显著,达到23.73 mg·g^(-1),较对照组提高了81.77%。该结果是樟属植物对牛樟芝培养的补充,为牛樟芝的规模化生产和开发利用提供了理论依据。

关键词：牛樟芝猴樟皿式培养生长特性总三萜超氧化物歧化酶

苹果砧木T337不同组织内生菌群落及其功能预测

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江苏农业科学 2022年第14期50卷 144-154页

作者：程欢张东华张俊忠刘丽西南林业大学保护生物学学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

应用高通量测序技术分析苹果砧木T337根部、枝部、叶部的内生菌群落并利用PICRUSt进行功能预测。从苹果砧木T337不同部位的内生细菌中共获得的有效序列聚类为11386个操作分类单元(OTUs)。从内生真菌中获得的有效序列聚类为2718个OTUs。... 详细信息

应用高通量测序技术分析苹果砧木T337根部、枝部、叶部的内生菌群落并利用PICRUSt进行功能预测。从苹果砧木T337不同部位的内生细菌中共获得的有效序列聚类为11386个操作分类单元(OTUs)。从内生真菌中获得的有效序列聚类为2718个OTUs。α-多样性分析结果表明,各指数均为根部显著高于枝部、叶部,枝部、叶部间的差异则不显著;从内生真菌多样性上看,除辛普森(Simpson)指数表现为根部、叶部显著高于枝部外,其他指数均表现为根>叶>枝。物种丰度分析结果表明,在门水平上,T337根部的最优细菌门为放线菌门(Actinobacteria),枝部、叶部的最优细菌门为变形菌门(Proteobacteria);在属水平上,T337根部、枝部、叶部最具优势的内生细菌分别为变形菌门的鞘氨醇单胞属(Sphingomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、甲基杆菌属(Methylobacterium);根部的特有菌属最多,有187个,枝部有5个,叶部有6个。T337根部、枝部、叶部都存在大量未归类的内生细菌(占比分别为35.885%、50.185%、59.884%)。根、枝、叶3个部位最优势真菌门均为子囊菌门(Ascomycota),内生真菌优势属分别为子囊菌门的亚隔孢属(Didymella)、Knufia(尚无统一的中文名)和壳针孢属(Septoria)。根部内生真菌的特有属有121个,枝部样品的特有属有7个,叶部样品的特有属有35个。根、枝、叶中也存在大量未归类的内生真菌(占比分别为41.031%、82.036%、39.467%)。功能预测结果显示,苹果砧木T337内生细菌群落功能与植物组织部位发挥的功能一致,可为进一步挖掘与植物营养生长相关微生物提供参考。

关键词：苹果砧木T337 高通量测序内生微生物功能预测 α-多样性分析