禾谷炭疽菌中糖苷水解酶互作蛋白找寻及遗传关系预测分析

作     者：薄淑文 韩长志 

作者机构：云南省森林灾害预警与控制重点实验室 西南林业大学生物多样性保护学院 

出 版 物：《福建农林大学学报(自然科学版)》 (Journal of Fujian Agriculture and Forestry University(Natural Science Edition))

年 卷 期：2023年

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项（YNWR-QNBJ-2020-188） 国家自然科学基金项目（31960314） 云南省研究生导师团队建设项目“森林病理学硕士生导师团队”（2022100） 

主　　题：禾谷炭疽菌 糖苷水解酶 蛋白互作 协同作用 

摘      要：糖苷水解酶（GH）作为植物病原菌侵染、破坏植物细胞壁的重要酶类，在其致病过程中发挥着重要作用。为了解禾谷炭疽菌GH蛋白之间的互作机制，本研究基于前期所获的禾谷炭疽菌GH蛋白，通过STRING网络在线分析不同GH蛋白之间的互作关系，利用ProtComp v 9.0在线分析GH蛋白的亚细胞定位，通过ClustalX和MEGA 11软件对GH蛋白进行多重比对和构建系统进化树，，并选取互作关系多的蛋白通过GRAMM在线软件进行分子对接。结果显示，禾谷炭疽菌中89个GH蛋白之间的互作表现为三大类的聚集关系，其中，I类聚集了34个GH蛋白，II类聚集了33个GH蛋白，III类聚集了22个GH蛋白。这些GH蛋白之间有3种互作情况，即不同亚类GH蛋白之间的互作、同一亚类中不同GH蛋白之间的互作以及不存在互作关系；85个GH蛋白定位于细胞外（分泌），仅4个GH蛋白定位于细胞核、内质网、细胞质膜。系统发育树分为四大类，有一些GH亚家族蛋白只存在于一类中，也有一些GH亚家族蛋白同时存在于两类及两类以上中；分子对接发现，互作蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸残基位点，蛋白之间可通过氢键相互作用。