检索结果-南通市图书馆

基于简化基因组技术的云南蓝果树群体遗传分析

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植物研究 2019年第6期39卷 899-907页

作者：张珊珊康洪梅杨文忠云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多... 详细信息

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多样性。经过遗传变异检测,本次研究中共获得SNP位点98498个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率0.05筛选以后,得到有效SNP位点6309个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对云南蓝果树完成了群体的遗传分析,其中:系统进化树分析将云南蓝果树划分为3大类,研究分析了云南蓝果树各分类的私人等位基因数目(Private)、平均观测杂合度(H o)、平均期望杂合度(H e)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(F IS)5个遗传多样性参数;群体结构和主成分分析进一步证明了,云南蓝果树现存植株之间亲缘关系较远,遗传多样性差异较大,具有很高的遗传资源保存价值。本研究结果将为基于遗传管理的云南蓝果树就地保护、遗传资源保存和种群重建等保护工程提供科学依据。

关键词：云南蓝果树简化基因组测序 SNP 群体遗传分析遗传管理

土壤水分和光强对景东翅子树幼苗生长及光合特性的影响

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植物研究 2022年第3期42卷 502-511页

作者：张珊珊袁春明云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

以1年生极小种群野生植物景东翅子树(Pterospermum kingtungense)实生苗为研究对象,通过双因子室内受控试验,设置6个土壤水分梯度(100%、90%、80%、60%、40%、30%田间持水量)和4个光强梯度(100%、75%、50%、25%自然光照),研究土壤水分... 详细信息

以1年生极小种群野生植物景东翅子树(Pterospermum kingtungense)实生苗为研究对象,通过双因子室内受控试验,设置6个土壤水分梯度(100%、90%、80%、60%、40%、30%田间持水量)和4个光强梯度(100%、75%、50%、25%自然光照),研究土壤水分和光强对其幼苗生长(地上部分生物量、地下部分生物量、叶片数量和株高)及光合特性[净光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)、胞间二氧化碳摩尔分数(Ci)、气孔限制值(Ls)和瞬时水分利用效率(WUE)]的影响。结果表明:(1)随着土壤水分的减少,景东翅子树幼苗的生长及光合指标呈现先升高后降低的趋势,一般会在田间持水能力W2(32.11%)或W3(28.54%)处理下达到峰值,W6(10.70%)条件下的生长状况最差。(2)随着光强的降低,除了Ls外,景东翅子树幼苗的4个生长指标及5个光合特性指标均表现出先增加后减少的趋势,且均在光强为L2(75%自然光照)或L3(50%自然光照)条件下表现最佳。(3)不同土壤水分和不同光强的综合评价得分显示,W2土壤水分和L2光强下的综合评价得分分别最高,证明适量的土壤水分环境和适度遮荫最适于景东翅子树幼苗的生长及其光合作用。(4)二元线性回归分析结果表明,土壤水分和光强这2个自变量分别对景东翅子树幼苗的生长和光合指标有较强的影响。研究结果可为景东翅子树的幼苗培育及其种群恢复与重建提供理论依据。

关键词：景东翅子树土壤水分光强天然更新

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云南蓝果树对种子萌发及幼苗生长的自毒效应

林业科学研究 2014年第4期27卷 502-507页

作者：张珊珊向振勇康洪梅杨文忠国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

云南蓝果树为中国特有极度濒危一级保护植物,为探讨云南蓝果树濒危机理并进行有效保护,通过野外原位实验和室内受控实验相结合的方法,研究云南蓝果树对种子萌发及幼苗生长是否有自毒效应。结果表明:野外条件下,云南蓝果树的种子萌发受... 详细信息

云南蓝果树为中国特有极度濒危一级保护植物,为探讨云南蓝果树濒危机理并进行有效保护,通过野外原位实验和室内受控实验相结合的方法,研究云南蓝果树对种子萌发及幼苗生长是否有自毒效应。结果表明:野外条件下,云南蓝果树的种子萌发受野外枯枝落叶和自身种皮的显著抑制;室内受控实验发现,云南蓝果树的根、茎、叶和种皮浸提液对种子萌发都有不同程度的显著抑制作用,其中,根的抑制作用最强(80.90%),种皮的抑制作用最弱(13.59%),而且云南蓝果树的根、茎、叶浸提液和根际土壤对幼苗生长(株高、叶片数和生物量)也表现出显著的抑制作用。

关键词：云南蓝果树极度濒危种自毒效应种子萌发幼苗生长

土壤含水量对极小种群毛枝五针松幼苗抗氧化活性的影响

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热带亚热带植物学报 2016年第2期24卷 182-188页

作者：康洪梅张珊珊杨文忠方波云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为探究水分对毛枝五针松（Pinuswangii）幼苗生理特性的影响，对不同土壤含水量下幼苗松针的抗氧化活性进行了研究。结果表明，土壤含水量为田问持水量的40％～80％时，其POD、SOD和CAT活性较强；随着处理时间的延长，细胞质膜渗透性减... 详细信息

为探究水分对毛枝五针松（Pinuswangii）幼苗生理特性的影响，对不同土壤含水量下幼苗松针的抗氧化活性进行了研究。结果表明，土壤含水量为田问持水量的40％～80％时，其POD、SOD和CAT活性较强；随着处理时间的延长，细胞质膜渗透性减弱，抗逆性变弱；脯氨酸、可溶性糖和蛋白质含量均以20％～40％的田问持水量较高；处理30d后丙二醛含量随着土壤含水量的增加而提高，在土壤含水量为田问持水量的40％时，丙二醛含量最低，抗逆性最强。因此，人工培育幼苗时，土壤水分过多的时间尽量不要超过30d，控制土壤水分为田问最大持水量的30％～50％，这样能提高幼苗存活率。

关键词：毛枝五针松土壤含水量幼苗生理特性

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应用简化基因组技术对富民枳遗传多样性检测

东北林业大学学报 2020年第4期48卷 36-41页

作者：张珊珊陈剑杨文忠国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650201

富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最... 详细信息

富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率0.05筛选以后,得到有效SNP位点41 077个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对富民枳完成了群体的遗传多样性分析,研究分析了富民枳天然种群和回归种群的私人等位基因数目、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(FIS)5个遗传多样性参数。结果表明,富民枳现存植株的遗传多样性较高,具有很高的遗传资源保存价值,但是回归种群的Ho值、He值、π值分别为0.398 3、0.291和0.330 6,分别仅是天然种群遗传多样性的87%、78%和73%,并未达到90%以上遗传多样性的标准。

关键词：富民枳简化基因组测序遗传多样性分析遗传管理

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云南蓝果树种子休眠与萌发特性

林业科学研究 2013年第3期26卷 384-388页

作者：袁瑞玲向振勇杨文忠张珊珊国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201

云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）又名毛叶紫树，为蓝果树科蓝果树属落叶大乔木，主要生长于热带北缘季雨林，阳光较充足的溪边沟谷地段，为中国热带北缘的特有种[1]，是国家一级保护植物[2]，IUCN极度濒危种[3]，目前仅在云南省西... 详细信息

云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）又名毛叶紫树，为蓝果树科蓝果树属落叶大乔木，主要生长于热带北缘季雨林，阳光较充足的溪边沟谷地段，为中国热带北缘的特有种[1]，是国家一级保护植物[2]，IUCN极度濒危种[3]，目前仅在云南省西双版纳州景洪市普文镇发现2个天然种群（共8株）和1个人工种群（18株）HJ。野外考察发现，云南蓝果树天然种群植株生长良好，现存8株中的3株挂果丰硕，但林下无幼苗和幼树，自然繁殖更新能力严重衰退，种子散落后不能萌发是导致云南蓝果树天然更新困难的关键因素。

关键词：云南蓝果树极度濒危种子休眠萌发特性

基于ISSR遗传多样性分析的云南蓝果树保护措施探索

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植物遗传资源学报 2015年第3期16卷 664-669页

作者：向振勇张珊珊杨文忠康洪梅云南省林业科学院珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室昆明650201

保存种群的遗传多样性和进化潜力是成功拯救保护濒危物种的关键。云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）是国家I级重点保护的极度濒危野生植物,也是国家实施极小种群野生植物保护工程的目的物种。为了制定针对性的保护措施,采用ISSR分子... 详细信息

保存种群的遗传多样性和进化潜力是成功拯救保护濒危物种的关键。云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）是国家I级重点保护的极度濒危野生植物,也是国家实施极小种群野生植物保护工程的目的物种。为了制定针对性的保护措施,采用ISSR分子标记方法对64株极度濒危物种云南蓝果树子代个体进行遗传多样性分析。从100条引物中筛选出12条ISSR引物,共扩增出77个稳定、清晰的条带。其中58个为多态性条带,物种水平上的多态性条带百分率（PPL）变动范围为50.00%-87.50%,平均值为（74.65±0.01）%;等位基因观察值（Na）为1.7532;有效等位基因观察值（Ne）为1.5804;Nei＇s基因多样性指数（He）为0.3206,多态性信息含量指数（PIC）变动范围为0.15-0.44,平均值为0.27±0.01;Shannon＇s遗传多样性信息指数（I）随着样本数的增加而升高,但当样本数达到24及以上时,Shannon＇s指数的数值基本不再变化。基于遗传多样性分析结果,从地质历史原因和人为干扰因素等方面对云南蓝果树的濒危机制进行了探析,并提出了有针对性的云南蓝果树保护措施。

关键词：云南蓝果树 ISSR标记遗传多样性濒危机制科学保护

云南松与旱冬瓜混交林林地土壤养分及细根、叶片养分特征

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东北林业大学学报 2011年第3期39卷 69-71页

作者：杨卫付玉嫔祁荣频徐亮尹艾萍吴涛国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650204

为了探讨云南松与旱冬瓜混交对养分的利用情况,对云南松纯林、云南松与旱冬瓜混交林分、旱冬瓜纯林3种林分类型进行了林地土壤及叶片、根系养分质量分数的测定分析。结果表明:云南松与旱冬瓜混交林地土壤表层土的有机质、有效磷、水解... 详细信息

为了探讨云南松与旱冬瓜混交对养分的利用情况,对云南松纯林、云南松与旱冬瓜混交林分、旱冬瓜纯林3种林分类型进行了林地土壤及叶片、根系养分质量分数的测定分析。结果表明:云南松与旱冬瓜混交林地土壤表层土的有机质、有效磷、水解氮、有效钾、全氮、全磷、全钾、交换性钙、镁离子等肥力指标都比纯林高,pH值也发生了变化,介于云南松纯林与旱冬瓜纯林林地土壤的pH值之间,为4.93～5.15。云南松与旱冬瓜混交提高了2树种细根的养分质量分数,提高了云南松叶片的养分质量分数,云南松叶片的m(N)∶m(P)云南松与旱冬瓜混交提高了林地土壤养分质量分数,尤其是有效养分的质量分数,对改良土壤和防止地力衰退具有重要的作用。

关键词：云南松旱冬瓜混交林土壤养分养分特征

牛樟芝非还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析

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中草药 2018年第20期49卷 4870-4876页

作者：原晓龙华梅陈剑陈中华王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650204 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650204 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204

目的获得牛樟芝聚酮合酶基因(Ac PKS1)全长,对其进行生物学分析并分析该基因在不同培养基上的表达差异。方法通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,通过设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆得... 详细信息

目的获得牛樟芝聚酮合酶基因(Ac PKS1)全长,对其进行生物学分析并分析该基因在不同培养基上的表达差异。方法通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,通过设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆得到Ac PKS1基因全长,并对该基因进行生物信息学分析及在不同培养基上的表达谱分析。结果 Ac PKS1全长6 348 bp,含有6个内含子和7个外显子,外显子编码2 115个氨基酸;通过生物信息学分析,推测该基因为真菌I型非还原型PKS,结构域为SAT-KS-PT-ACP-ACP-TE,系统树分析显示Ac PKS1与其他未知功能的聚酮合酶(PKS)聚为一支,说明Ac PKS1可能是一种新的聚酮化合物环化方式;表达谱分析表明,葡萄糖为Ac PKS1基因表达的必要条件,且葡萄糖含量与Ac PKS基因表达量呈正相关。结论本研究为Ac PKS1功能鉴定以及牛樟芝基因资源利用奠定基础。

关键词：牛樟芝聚酮合酶生物信息学分析表达谱 AcPKS1