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云南怒江番茄种植新区番茄病毒检测及病毒种传特性

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植物保护 2024年第1期50卷 272-279页

作者：刘玉莹熊志琦苏晓霞王田田吴阔郑宽瑜张仲凯云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室昆明650205 云南大学资源植物研究院昆明650504

病毒病对番茄生产造成严重危害,近年来在番茄种植新区发生严重,疑似为种子带毒传播。本研究通过对云南省怒江州番茄种植新区的番茄病毒病样品采用RNA-seq高通量测序,RT-PCR验证的方法检测病毒种类;对番茄病果种子进行超薄切片制样透射... 详细信息

病毒病对番茄生产造成严重危害,近年来在番茄种植新区发生严重,疑似为种子带毒传播。本研究通过对云南省怒江州番茄种植新区的番茄病毒病样品采用RNA-seq高通量测序,RT-PCR验证的方法检测病毒种类;对番茄病果种子进行超薄切片制样透射电子显微镜观察,将病果种子播种后对种苗进行RT-PCR带毒检测。结果表明,RNA-seq高通量测序及RT-PCR检测到的病毒有番茄环纹斑点病毒(tomato zonate spot orthotospovirus, TZSV)、番茄黄斑驳相关病毒(tomato yellow mottle-associated virus, TYMaV)、辣椒脉斑驳病毒(chili veinal mottle virus, ChiVMV)、南方番茄病毒(southern tomato virus, STV)。透射电镜观察到种胚细胞及胚乳细胞中分布典型的正番茄斑萎病毒属Orthotospovirus病毒粒体。病果种子播种28 d后的种苗具有病毒病症状,通过RT-PCR检出TZSV、ChiVMV、STV,检出率分别为60%、100%、80%。上述研究结果为TZSV通过种子传播提供了有利的证据,并为源头防控番茄病毒病提供了依据。

关键词：番茄番茄病毒病毒检测 RNA-seq 种传病毒

乙烯利对甘蔗叶鞘离区细胞形态变化及其脱叶性的影响

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植物生理学报 2024年第10期 1579-1587页

作者：胡鑫王田田刘少春郭家文刀静梅高欣欣李如丹刘高源云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

利用乙烯利处理难脱叶和易脱叶甘蔗(Saccharum spp. hybrids)品种,研究分析了形态学完全展开叶以下第3、5、7叶叶鞘离区细胞形态与脱叶性的变化关系。结果表明:乙烯利处理后,两个甘蔗品种第3、5、7叶位离区组织细胞截面积变大,细胞密度... 详细信息

利用乙烯利处理难脱叶和易脱叶甘蔗(Saccharum spp. hybrids)品种,研究分析了形态学完全展开叶以下第3、5、7叶叶鞘离区细胞形态与脱叶性的变化关系。结果表明:乙烯利处理后,两个甘蔗品种第3、5、7叶位离区组织细胞截面积变大,细胞密度变小,表皮细胞排列变松散,且离区细胞壁空心点和断裂点增加。乙烯利处理后20 d时,甘蔗品种‘GT02-467’第3、5、7叶和‘YZ03-194’第5叶的离区乙烯释放速率均显著高于对照。乙烯利处理后35和60 d,‘GT02-467’的自然脱叶率分别比对照高5.8%和5.3%,‘YZ03-194’的自然脱叶率比对照高9.8%和10.7%。本研究从叶鞘离区细胞形态生理水平上明确了乙烯利对甘蔗脱叶性的促进作用,为进一步深入研究乙烯利调控甘蔗脱叶生理机制提供参考。

关键词：乙烯利甘蔗叶鞘离区细胞形态脱叶性

番茄褐色皱纹果病毒（ToBRFV）云南建水分离物鉴定及全基因组序列分析

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植物病理学报 2024年

作者：肖雨晴吕高莹李树军陈永对苏晓霞杨李源滨周晓罡余大朝王田田郑宽瑜张仲凯云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室云南神谷科技股份有限公司

番茄褐色皱纹果病毒（tomato brown rugose fruit virus,To BRFV）近年来在全球番茄产区快速发生蔓延，造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似To BRFV感染的症状，并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似To BRFV感... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒（tomato brown rugose fruit virus,To BRFV）近年来在全球番茄产区快速发生蔓延，造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似To BRFV感染的症状，并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似To BRFV感染的番茄果实样品进行电子显微镜观察及RT-PCR检测鉴定，并进一步对分离株进行全基因组测序分析，构建系统进化树分析其与其它To BRFV分离株的进化关系。结果表明，从感病的番茄果实上发现杆状病毒粒体，大小约18nm×300nm，具有烟草花叶病毒属病毒的典型形态特征；用To BRFV特异性检测引物进行RT-PCR扩增得到591bp目的片段，经NCBIblast比对，与To BRFV具有最高一致率（达99%以上），将该分离株命名为To BRFV-2022-JS(GenBank登录号：OR593752)。测序发现ToBRFV-2022-JS基因组全长6 386 nt，具有4个ORFs，分别编码126 kDa和183 kDa复制酶，30 kDa运动蛋白MP和17.5 kDa外壳蛋白CP。进化树分析显示该分离株与To BRFV银川分离株（GenBank登录号：OR500698.1）的亲缘关系最近，核苷酸序列一致率为99.73%。上述结果表明云南建水番茄果实受到To BRFV感染。该结果为To BRFV在云南番茄产区的监测与防控提供了依据。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒云南建水番茄果实病毒基因组系统进化分析

复合侵染云南西番莲的两种菜豆金色花叶病毒属病毒的分子鉴定及序列分析

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植物保护 2024年第5期50卷 42-55页

作者：钟静李婷婷赵丽玲侯跃叶素珍谢勉丁铭云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650223 云南省德宏州芒市农业技术推广中心芒市678400

西番莲Passiflora caerulea是我国南部省区广泛种植的一种热带果树。本研究于2020年6月从云南省德宏州西番莲种植区采集到4份疑似感染菜豆金色花叶病毒属病毒的西番莲样品,利用PCR扩增、克隆、测序以及生物信息学分析等方法,明确了西番... 详细信息

西番莲Passiflora caerulea是我国南部省区广泛种植的一种热带果树。本研究于2020年6月从云南省德宏州西番莲种植区采集到4份疑似感染菜豆金色花叶病毒属病毒的西番莲样品,利用PCR扩增、克隆、测序以及生物信息学分析等方法,明确了西番莲样品受菜豆金色花叶病毒属病毒侵染。对4份西番莲样品进行菜豆金色花叶病毒属病毒全基因组扩增,从中共获得5条菜豆金色花叶病毒属病毒全基因组序列,分别命名为YN7292-6、YN7293-12、YN7293-4、YN7294-16和YN7295-25,均具有菜豆金色花叶病毒属单组分病毒的典型结构,编码7个开放阅读框(open reading frame,ORF);其中YN7292-6、YN7293-12、YN7294-16及YN7295-25与一品红曲叶病毒(Euphorbia leaf curl virus,EuLCuV)的不同分离物的核苷酸相似性均高于99.05%,为EuLCuV的不同分离物;而YN7293-4则与分离自江西西番莲样品的广东番木瓜曲叶病毒(papaya leaf curl Guangdong virus,PaLCuGdV)分离物GNPF1(GenBank登录号:MK673114.1)的核苷酸相似性最高,为99.70%,为PaLCuGdV的一个分离物;重组分析发现,2个分离物EuLCuV-YN7293-12和PaLCuGdV-YN7293-4均为重组病毒。本研究首次在云南省发现EuLCuV和PaLCuGdV这2种菜豆金色花叶病毒属病毒复合侵染西番莲,为有效预防和控制西番莲病毒病害的发生和传播提供理论依据。

关键词：广东番木瓜曲叶病毒一品红曲叶病毒西番莲复合侵染重组

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46份甜荞种质萌发期耐盐资源评价与筛选

种子 2024年第5期43卷 1-6+98页

作者：李春花加央多拉吴晗孙墨可马飞跃梁秀雪李晗张曼田娟王艳青任长忠吉林省白城市农业科学院云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

盐渍化土壤是我国农业发展的重要后备土壤资源，而筛选耐盐种质是盐渍化农业应用的重要基础。本研究用浓度18‰的NaCl溶液对46份萌发期甜荞种子进行胁迫处理，通过测定发芽率、发芽势、发芽指数以及相对盐害率指标，对甜荞种质进行萌发... 详细信息

盐渍化土壤是我国农业发展的重要后备土壤资源，而筛选耐盐种质是盐渍化农业应用的重要基础。本研究用浓度18‰的NaCl溶液对46份萌发期甜荞种子进行胁迫处理，通过测定发芽率、发芽势、发芽指数以及相对盐害率指标，对甜荞种质进行萌发期耐盐评价与筛选。结果表明，盐胁迫下甜荞萌发期指标遗传多样性丰富，变异系数在48.95%～75.01%之间；聚类分析结果表明，46份甜荞种质可划分为耐盐、中耐盐、不耐盐(敏感、高敏感)三大类群，同时筛选出耐盐种质3份、高敏感种质2份。

关键词：甜荞萌发期耐盐性种质资源

云南烟草产区辣椒脉斑驳病毒的调查及其遗传多样性分析

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植物保护 2024年第2期50卷 192-201,218页

作者：陈越韩天华马文广钟静尹跃艳赵丽玲李婷婷丁铭云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650205 云南省农业科学院高山经济植物研究所丽江674100 云南省烟草公司丽江市公司丽江674100

明确辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV)在云南6个州(市)烟草生产区的分布、遗传多样性和群体遗传结构,对病害的防控预警具有重要意义。本研究以2022年采集自云南6个州(市)不同烟草产区的96份疑似感染ChiVMV的烟草样品... 详细信息

明确辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV)在云南6个州(市)烟草生产区的分布、遗传多样性和群体遗传结构,对病害的防控预警具有重要意义。本研究以2022年采集自云南6个州(市)不同烟草产区的96份疑似感染ChiVMV的烟草样品为试验材料,利用电子显微镜负染色观察和分子生物学方法对病毒进行检测和鉴定,获得21个ChiVMV云南烟草分离物的cp基因序列。利用SDT、MEGA、RDP、DnaSP及Arlequin等生物学软件对21个云南烟草分离物及NCBI上下载的38个来自不同国家、地区及寄主的ChiVMV分离物cp基因序列的系统进化、遗传多样性和群体遗传结构特征进行分析。结果显示,从云南6个州(市)烟草生产区采集的96份烟草样品中,ChiVMV检出率为51.04%;序列比对发现,本研究获得的cp基因与NCBI中38个ChiVMV分离物cp基因的核苷酸一致性在84.1%以上;系统发育分析发现,59个ChiVMV分离物按照地理位置的远近被划分为4个分支,聚类结果具有明显的地理分布特征,而与寄主植物无关;遗传多样性和遗传分化分析表明,4个地理种群的ChiVMV cp基因遗传多样性水平均较高,中国种群与印度、泰国和其他国家种群间发生了很大的遗传分化且差异显著(P<0.05);遗传力分析显示,基因交流、遗传漂变和基因的负选择压力是ChiVMV分离物适应性进化的重要方式。

关键词：辣椒脉斑驳病毒云南遗传多样性遗传结构 cp基因

硒对云南白灵芝生长、品质及DNA甲基化特征的影响

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山东农业科学 2024年第3期56卷 106-114页

作者：姚春馨梁明泰刘家迅王晖陈霞田果廷云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室云南昆明650205 云南省农业科学院园艺作物研究所云南昆明650205

采用田间覆土栽培试验,设置6个Se浓度(0、50、100、200、300、400μg/g)处理,分别记为CK、Se50、Se100、Se200、Se300、Se400,研究外源硒对云南白灵芝生长发育、重金属积累、生物活性成分含量及其DNA甲基化特征的影响。结果表明,与CK相... 详细信息

采用田间覆土栽培试验,设置6个Se浓度(0、50、100、200、300、400μg/g)处理,分别记为CK、Se50、Se100、Se200、Se300、Se400,研究外源硒对云南白灵芝生长发育、重金属积累、生物活性成分含量及其DNA甲基化特征的影响。结果表明,与CK相比,外源Se对子实体柄长和菌盖大小(横径、纵径)无显著影响,但能显著降低菌盖厚度;随着Se施用水平提高,菌丝生长速率和子实体硒含量均呈先增后降的趋势,生物量呈先降后增再降的趋势。子实体重金属含量(As、Cd、Pb、Hg)随Se浓度增加呈持续降低趋势,线性分析也表明,重金属含量与Se施用浓度均呈显著负相关。施Se增加了子实体多糖、粗蛋白、黄酮及总氨基酸含量,其中,多糖、黄酮含量在Se400处理下最高,总氨基酸、粗蛋白含量分别在Se200、Se300处理下最高。HPLC测定分析表明,与CK相比,Se300提高了灵芝酸A、灵芝酸DM、灵芝酸F及灵芝酮三醇为主的三萜酸组分,其总三萜酸含量较其他处理提高2.93%~25.54%。敏感扩增多态性分析(MSAP)结果显示,Se300较CK、Se400相比具有较高的未甲基化位点比例和较低的甲基化位点比例。综上,施用外源硒可促进早期菌丝生长,提高子实体生物量累积,改善子实体重金属安全性能和生物活性成分品质,改变DNA甲基化比例,且以300μg/g施用浓度的整体效果最佳,其子实体产量较对照显著提高11.36%。

关键词：白灵芝硒农艺性状重金属含量品质 DNA甲基化

青蒿中番茄斑萎病毒和烟草花叶病毒的分子鉴定及相关序列分析

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植物保护 2024年第1期50卷 244-255页

作者：钟静李婷婷韩天华李学卫尹跃艳陈越马文广丁铭云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650223 云南省烟草公司丽江市公司丽江674100 云南省农业科学院高山经济植物研究所丽江674199

番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus, TSWV)和烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus, TMV)是2种重要的植物病原病毒,对多种经济作物的产量和品质均造成严重影响。2021年-2022年,在云南省丽江市烟草种植区不同烟区采集叶片黄化、皱缩... 详细信息

番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus, TSWV)和烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus, TMV)是2种重要的植物病原病毒,对多种经济作物的产量和品质均造成严重影响。2021年-2022年,在云南省丽江市烟草种植区不同烟区采集叶片黄化、皱缩以及无症状的青蒿Artemisia caruifolia样品共计14份,利用免疫金标速测卡和RT-PCR对其病原病毒进行检测。利用免疫金标速测卡检测结果显示,在所检样品中有9份样品检测出TSWV,检出率为64.28%,有3份样品检测出TMV,检出率为21.43%,2种病毒复合侵染的检出率同样为21.43%;利用RT-PCR对复合侵染的3份样品进行分子检测,结果显示,在3份复合侵染青蒿样品中获得3条TSWV N基因序列、3条TMV cp基因序列和2条TMV RdRp部分序列。TSWV青蒿分离物与分离自云南的TSWV-2分离物相似性最高,为99.6%;TMV青蒿分离物与分离自辽宁的TMV-Shenyang分离物和分离自云南的TMV-Yongren-1相似性最高,均大于99.4%。这是首次发现TSWV和TMV 2种不同属病毒复合侵染青蒿。

关键词：番茄斑萎病毒烟草花叶病毒青蒿复合侵染

云南金荞麦叶斑病病原菌的鉴定及其生物学特性

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湖南农业大学学报（自然科学版） 2024年第3期50卷 69-75页

作者：卢文洁尹桂芳隆文杰李程鹏孙道旺王莉花云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南昆明650205 云南省农业生物技术重点实验室云南昆明650205 农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室云南昆明650205

从云南省嵩明县试验基地采集金荞麦叶斑病病叶,采用组织分离法分离培养病原菌,根据柯赫氏法则测定病原菌的致病性,观察病原菌形态学特征,并与ITS、TUB2系统发育分析相结合鉴定病原菌,测定病原菌的生物学特性。结果表明:云南金荞麦叶斑... 详细信息

从云南省嵩明县试验基地采集金荞麦叶斑病病叶,采用组织分离法分离培养病原菌,根据柯赫氏法则测定病原菌的致病性,观察病原菌形态学特征,并与ITS、TUB2系统发育分析相结合鉴定病原菌,测定病原菌的生物学特性。结果表明:云南金荞麦叶斑病病原菌代表菌株GY3的孢子形态与拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis)真菌相似,菌株GY3的rDNA–ITS及TUB2联合序列与小孢拟盘多毛孢(***)2个菌株(ZK1–1、ZK5–5)的序列聚在同一分支,鉴定认为金荞麦叶斑病的病原菌为小孢拟盘多毛孢(***);病原菌生物学特性测定结果表明,GY3菌丝生长最适培养基为PDA,以PDA培养基培养GY3,菌丝生长最适pH为7,最适温度为25℃,菌丝的致死温度为50℃(水浴10min),连续光照最有利于菌丝生长,菌丝生长的最适的碳源和氮源分别为葡萄糖和蛋白胨。

关键词：金荞麦叶斑病病原菌鉴定小孢拟盘多毛孢生物学特性云南