云南烟草产区辣椒脉斑驳病毒的调查及其遗传多样性分析

作     者：陈越 韩天华 马文广 钟静 尹跃艳 赵丽玲 李婷婷 丁铭 CHEN Yue;HAN Tianhua;MA Wenguang;ZHONG Jing;YIN Yueyan;ZHAO Liling;LI Tingting;DING Ming

作者机构：云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650205 云南省农业科学院高山经济植物研究所丽江674100 云南省烟草公司丽江市公司丽江674100 

出 版 物：《植物保护》 (Plant Protection)

年 卷 期：2024年第50卷第2期

页      面：192-201,218页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：云南省种子种业联合实验室项目(202205AR070001-02) 中国烟草总公司云南省公司科技计划(2021530000242016) 

主　　题：辣椒脉斑驳病毒 云南 遗传多样性 遗传结构 cp基因 

摘      要：明确辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV)在云南6个州(市)烟草生产区的分布、遗传多样性和群体遗传结构,对病害的防控预警具有重要意义。本研究以2022年采集自云南6个州(市)不同烟草产区的96份疑似感染ChiVMV的烟草样品为试验材料,利用电子显微镜负染色观察和分子生物学方法对病毒进行检测和鉴定,获得21个ChiVMV云南烟草分离物的cp基因序列。利用SDT、MEGA、RDP、DnaSP及Arlequin等生物学软件对21个云南烟草分离物及NCBI上下载的38个来自不同国家、地区及寄主的ChiVMV分离物cp基因序列的系统进化、遗传多样性和群体遗传结构特征进行分析。结果显示,从云南6个州(市)烟草生产区采集的96份烟草样品中,ChiVMV检出率为51.04%;序列比对发现,本研究获得的cp基因与NCBI中38个ChiVMV分离物cp基因的核苷酸一致性在84.1%以上;系统发育分析发现,59个ChiVMV分离物按照地理位置的远近被划分为4个分支,聚类结果具有明显的地理分布特征,而与寄主植物无关;遗传多样性和遗传分化分析表明,4个地理种群的ChiVMV cp基因遗传多样性水平均较高,中国种群与印度、泰国和其他国家种群间发生了很大的遗传分化且差异显著(P0.05);遗传力分析显示,基因交流、遗传漂变和基因的负选择压力是ChiVMV分离物适应性进化的重要方式。