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多级特征增强的图表示学习模型

计算机工程与应用 2023年第11期59卷 131-140页

作者：冯耀孔兵周丽华包崇明王崇云云南大学信息学院昆明650500 云南大学软件学院昆明650500 云南大学生态与环境学院昆明650504

针对图数据的表示学习在推荐系统、链接预测等图下游任务已展现出重要的研究价值。然而目前主流的方法存在一些缺陷:图卷积网络的固定传播模式限制节点表示的语义表达能力,以及编码器-解码器结构中的正则化重建阻碍学习节点间的差异化特... 详细信息

针对图数据的表示学习在推荐系统、链接预测等图下游任务已展现出重要的研究价值。然而目前主流的方法存在一些缺陷:图卷积网络的固定传播模式限制节点表示的语义表达能力,以及编码器-解码器结构中的正则化重建阻碍学习节点间的差异化特征,这些都可能导致节点表示不能很好适应图下游任务。为此,基于互信息最大化理论提出一种多级特征增强的图表示学习模型,能以无监督的方式生成高质量的节点表示。模型使用提取器保留节点原始属性中的差异化特征,利用注意力聚合器维持编码空间中节点分布的局部相关性和全局差异性,应用深度图信息最大化策略统一全局编码规则。实验结果证明,在几个基准图数据集上该模型在直推式学习和归纳式学习下的编码表现均超过了所有的主流对比基线。

关键词：图表示学习互信息最大化无监督学习直推式学习归纳式学习

基于优化的MaxEnt模型预测中国高山栎组植物的历史、现状与未来分布变化

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生态学报 2023年

作者：王晓帆段雨萱金露露王崇云彭明春李云王旭红马云飞云南大学生态与环境学院云南大学生态学与地植物学研究所

气候变化影响着植物物种的地理分布,预测物种潜在适生区对认识其地理分布特征及发挥其生态价值与经济价值具有重要意义。以高山栎组植物为研究对象,运用R语言ENMeval数据包调整调控倍频(RM)和特征组合(FC)优化的MaxEnt模型和ArcGIS软件... 详细信息

气候变化影响着植物物种的地理分布,预测物种潜在适生区对认识其地理分布特征及发挥其生态价值与经济价值具有重要意义。以高山栎组植物为研究对象,运用R语言ENMeval数据包调整调控倍频(RM)和特征组合(FC)优化的MaxEnt模型和ArcGIS软件,基于160条高山栎组植物分布点记录和22个环境因子进行潜在适生区预测,探讨影响其地理分布的主要环境因子,同时预测其在末次间冰期(Last interglacial,LIG)、末次盛冰期(Last glacial maximum,LGM)、全新世中期(Mid Holocene,MH)、当代(Current)、2041—2060年(2050年)和2061—2080年(2070年)3种不同CO2浓度排放路径下潜在适生区的空间分布格局及其质心变化趋势。结果表明:最优模型参数RM=2.5,FC=LQHPT时,MaxEnt模型复杂度和过拟合程度最低,模型预测准确性极高,AUC=0.960±0.15。综合刀切法贡献率、置换贡献率和单因子响应曲线可知影响其地理分布的主要环境因子是气温季节性变动系数(bio4)、高程(dem)、年降水量(bio12)和等温性(bio3),其适宜范围分别为435—625、1792—3978m、670—1050mm和41.5—50.3,累计贡献率高达81.6%,其中温度是影响高山栎组植物最重要的环境因子。当前气候条件下,高山栎组植物总适生区面积62.37×104km2,高适生区面积10.47×104km2,占总适生区面积的16.79%,集中分布于川滇横断山地区、滇中高原北部、藏东南以及黔西部分地区。各个时期间高山栎组植物的适生区面积差异较大,当代潜在适生区面积最小且破碎化最严重,可能由于气候变化及人类影响所致。未来各个时期潜在分布区面积均有增大的趋势,但RCP8.5情景下面积相较于其他情景有所降低,表明全球气候变暖背景下不利于高山栎组植物的长期生长。同时,质心分析表明未来气候条件下其分布有向低海拔和低纬度迁移的趋势。

关键词：潜在适生区气候变化 MaxEnt模型高山栎组

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中国西南四种常见松树火适应性状比较

生态学报 2023年第3期43卷 1064-1072页

作者：苏文华司宏敏张辉红张光飞周睿郭晓荣杨琼云南大学生态学与地植物学研究所昆明650091 云南大学生态与环境学院昆明650091

野火对松属植物的进化和分布有重要的影响。在与野火长期抗争中,松属植物形成了一系列性状提高在易火生境中的适合度,维持种群生存与繁衍。西南地区是中国野火高发区,作为这一地区特有松树,云南松、思茅松和高山松具有一些典型的火适应... 详细信息

野火对松属植物的进化和分布有重要的影响。在与野火长期抗争中,松属植物形成了一系列性状提高在易火生境中的适合度,维持种群生存与繁衍。西南地区是中国野火高发区,作为这一地区特有松树,云南松、思茅松和高山松具有一些典型的火适应性状,如厚树皮。以这3种松树和东部常见的马尾松为研究对象,比较4种松树的火适应对策。结果表明:4种松树的火适应性状存在一定的差异。与火适应相关的13项性状主成分分析显示,4个种在空间上总体是分离的,也表现出一些重叠。其中云南松火适应生活史对策是火耐受型和火依赖型的中间类型,适应会发生林冠火的生境。高山松、思茅松和马尾松都是火耐受型,通过快速高生长、厚树皮等性状适应生境不同频度的地表火。四种松树火适应对策与分布区火险基本相符。表明野火在这一区域广泛存在,并对植物进化和森林格局有重要影响。野火在西南地区松属分布和种群维持中的生态作用应被给予足够重视。

关键词：松树火适应对策生态分化分布格局中国西南

基于^(1)H-NMR及GC-MS的中国块菌及其共生云南松的代谢物分析

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菌物学报 2022年第1期41卷 105-123页

作者：周雪袁鹏宇安霜陈鹏至陈幽幽杨晓敏李宗菊云南大学生态与环境学院云南昆明650500 云南大学生命科学学院云南昆明650500

采用代谢组学技术研究中国块菌(云南黑松露)及其共生云南松的小分子活性代谢产物。运用核磁共振(^(1)H-NMR)和气相质谱(GC-MS)两种技术,分析新鲜中国块菌成熟子实体及松根的代谢成分;将^(1)H-NMR及GC-MS数据导入SMICA-P软件进行多元统... 详细信息

采用代谢组学技术研究中国块菌(云南黑松露)及其共生云南松的小分子活性代谢产物。运用核磁共振(^(1)H-NMR)和气相质谱(GC-MS)两种技术,分析新鲜中国块菌成熟子实体及松根的代谢成分;将^(1)H-NMR及GC-MS数据导入SMICA-P软件进行多元统计分析,比较二者的差异代谢物。在块菌子实体及松根中分别共检测到了苏氨酸、甘露二糖、延胡索酸、茶碱和表儿茶素等64个及45个化合物,其中松醇、1-环己烯-1-甲酸、谷氨酸、海藻糖、甜菜碱等25种物质具有显著差异,这些差异物质以碳代谢及氮代谢为主。两种方法互为补充,扩大了检测范围。本研究为探明中国块菌与其共生松树的共生机理,为今后中国块菌相关药物的开发及人工培养的研究提供了理论依据。

关键词：中国块菌云南松松根核磁共振气相色谱质谱联用代谢物

代谢组分析亚洲兰茂牛肝菌原基发育的潜在调控物质

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菌物学报 2023年第5期42卷 1185-1202页

作者：杨晓敏崔凤仙詹晓坤袁鹏宇张曦予陈鹏至陈幽幽安霜周雪刘佳艳吕为李宗菊云南大学生命科学学院云南昆明650500 云南大学生态学与环境学院云南昆明650500

亚洲兰茂牛肝菌Lanmaoaasiatica为云南珍稀的食药用真菌,属于外生菌根类真菌,在纯培养基上其部分菌丝能扭结形成原基。为了揭示调控原基发育的潜在物质,本研究运用核磁共振(1H-NMR)、气相质谱(GC-MS)和液相质谱(LC-MS)3种代谢组学技术,... 详细信息

亚洲兰茂牛肝菌Lanmaoaasiatica为云南珍稀的食药用真菌,属于外生菌根类真菌,在纯培养基上其部分菌丝能扭结形成原基。为了揭示调控原基发育的潜在物质,本研究运用核磁共振(1H-NMR)、气相质谱(GC-MS)和液相质谱(LC-MS)3种代谢组学技术,结合SMICA-P软件,定性及定量分析了纯培养35 d后菌丝体与原基的差异物质。结果表明,菌丝体与原基比较,3种方法共检测到谷氨酸、天冬氨酸、色氨酸、4-氨基丁酸、甜菜碱和海藻糖等96个显著或极显著上调的差异物质;调控通路分析表明,这些差异物质在原基发育中可能涉及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸、精氨酸和脯氨酸、丁酸等22个通路;KEGG富集分析表明,谷氨酸涉及P<0.05的所有调控通路,推测谷氨酸在原基发育中起着重要的调控作用;在培养基中加入0.16 g/L谷氨酸可促进原基的萌发与生长。上述研究为亚洲兰茂牛肝菌的人工繁育技术研发奠定了基础。

关键词：兰茂牛肝菌菌丝体原基核磁共振气相质谱液相质谱差异物质

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类不平衡数据的EM聚类过采样算法

计算机科学与探索 2023年第1期17卷 228-237页

作者：谢子鹏包崇明周丽华王崇云孔兵云南大学信息学院昆明650504 云南大学软件学院昆明650504 云南大学生态学与环境学院昆明650504

针对分类任务中的不平衡数据集造成的分类性能低下的问题,提出了类不平衡数据的EM聚类过采样算法,通过过采样提高少数类样本数量,从根本上解决数据不平衡问题。首先,算法采用聚类技术,通过欧式距离衡量样本间的相似度,选取每个聚类簇的... 详细信息

针对分类任务中的不平衡数据集造成的分类性能低下的问题,提出了类不平衡数据的EM聚类过采样算法,通过过采样提高少数类样本数量,从根本上解决数据不平衡问题。首先,算法采用聚类技术,通过欧式距离衡量样本间的相似度,选取每个聚类簇的中心点作为过采样点,一定程度解决了样本的重要程度不够的问题;其次,通过直接在少数类样本空间上进行采样,可较好解决SMOTE、Cluster-SMOTE等方法对聚类空间没有针对性的问题;同时,通过对少数类样本数量的30%进行过采样,有效解决基于Cluster聚类的欠采样盲目追求两类样本数量平衡和SMOTE等算法没有明确采样率的问题。在公开的24个类不平衡数据集上进行了实验,验证了方法的有效性。

关键词：分类任务不平衡数据集类不平衡过采样聚类

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云南玉龙雪山两栖动物多样性时空格局的观测

生态与农村环境学报 2020年第6期36卷 726-730页

作者：姚冲学王智红梁良吕婷黄元陈明勇云南大学生态与环境学院云南昆明650091

2018年6和8月采用样线法对云南玉龙雪山两栖动物多样性进行2次观测。设置11条样线,共记录到1143只个体,包括成体、亚成体和幼体,鉴定出2目6科8属8种。个体数量在不同季节相差较大,6和8月分别记录到705和438只。各条观测样线两栖动物物... 详细信息

2018年6和8月采用样线法对云南玉龙雪山两栖动物多样性进行2次观测。设置11条样线,共记录到1143只个体,包括成体、亚成体和幼体,鉴定出2目6科8属8种。个体数量在不同季节相差较大,6和8月分别记录到705和438只。各条观测样线两栖动物物种数和个体数受平均水温、气温和人为干扰强度等因素的影响明显,表现为平均水温和气温越高、人类干扰强度越弱,物种数及个体数越多。不同生境下两栖动物物种数和个体数不同,人工水渠物种数最多,河流物种数最少。这些结果表明,生境类型、水温、气温和人类干扰是影响两栖类物种多样性的重要生态因子。

关键词：玉龙雪山两栖动物物种多样性时空格局

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湖泊水动力变化对沉水植物影响研究综述

生态学报 2022年

作者：吕兴菊任婧高登成殷丽萍窦嘉顺李航解明丽潘瑛云南大学生态与环境学院暨云南大学生态与环境学院大理州洱海湖泊研究院联合工作站云南省生态环境监测中心

随着全球气候变化加剧及水利工程的快速发展，湖泊水动力状况发生了显著变化。通过影响湖泊水体和沉积物理化性质，水动力变化可以作用于沉水植物生存、生长与分布等方面。在长期适应进化过程中，沉水植物演化出了一系列有效的适应策略...

随着全球气候变化加剧及水利工程的快速发展，湖泊水动力状况发生了显著变化。通过影响湖泊水体和沉积物理化性质，水动力变化可以作用于沉水植物生存、生长与分布等方面。在长期适应进化过程中，沉水植物演化出了一系列有效的适应策略，能一定程度上克服水动力变化的负面影响。但当前湖泊水动力变化程度远超沉水植物适应上限，湖泊沉水植物消退已成为全球普遍现象。了解沉水植物适应水动力条件的过程有助于揭示湖泊沉水植被退化机制，为未来沉水植物的保护和恢复提供借鉴。因此，本文系统综述当前湖泊水动力变化成因，水动力变化对沉水植物的不利影响及沉水植物适应策略，包括：繁殖对策、形态学对策、生理对策等。同时，综述当前研究进展，今后还需大力加强沉水植物解剖学及物种忍耐力差异方面的研究。

关键词：

中国石竹科蝇子草属一新记录种——硬骨草叶蝇子草

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西北植物学报 2022年第5期42卷 884-887页

作者：杨凤叶婧怡王焕冲云南大学生命科学学院昆明650091 云南大学生态与环境学院昆明650091

报道了中国石竹科蝇子草属一新记录种——硬骨草叶蝇子草(Silene holosteifolia Bocquet et Chater),并根据标本首次提供了该物种完整的形态描述和线描图。硬骨草叶蝇子草先前发现于尼泊尔和不丹,现发现于中国西藏自治区日喀则市的吉隆... 详细信息

报道了中国石竹科蝇子草属一新记录种——硬骨草叶蝇子草(Silene holosteifolia Bocquet et Chater),并根据标本首次提供了该物种完整的形态描述和线描图。硬骨草叶蝇子草先前发现于尼泊尔和不丹,现发现于中国西藏自治区日喀则市的吉隆和聂拉木两县境内。硬骨草叶蝇子草与花脉蝇子草(S.multifurcata C.L.Tang)形态上最为相近,主要区别在于硬骨草叶蝇子草的花常单生,苞片卵状披针形,花萼钟形或圆球形,且纵脉黑色,在萼齿处脉端不连合,花瓣黄绿色,多次分裂,流苏状,裂片近线形,花柱3。凭证标本存于中国科学院植物研究所植物标本馆、昆明植物所标本馆和美国史密森学会。

关键词：硬骨草叶蝇子草中国新记录蝇子草属囊萼组