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马铃薯连作与复合型种植对土壤微生态效应的研究进展

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云南农业大学学报（自然科学版） 2016年第3期31卷 536-542页

作者：陈以相陈建斌任静王海宁云南农业大学植物保护学院云南昆明650201 云南农业大学国家农科专业基础实验教学示范中心云南昆明650201

连作障碍是马铃薯产业可持续发展亟待解决的问题,本文从土壤营养、土壤酶活、土壤微生物、根系分泌物4个方面综述了马铃薯连作障碍的研究现状,并阐述了作物复合型种植对土壤连作障碍的缓解作用。连作障碍可能是作物-土壤系统内部诸多因... 详细信息

连作障碍是马铃薯产业可持续发展亟待解决的问题,本文从土壤营养、土壤酶活、土壤微生物、根系分泌物4个方面综述了马铃薯连作障碍的研究现状,并阐述了作物复合型种植对土壤连作障碍的缓解作用。连作障碍可能是作物-土壤系统内部诸多因子综合作用的结果,单一因子的论述很难清楚解释其形成的原因,探究多因素复合影响机制有其必要性及意义,持续的研究有利于做出较合理的解释。复合型种植是一种有效缓解马铃薯连作障碍的调控技术。今后该领域的研究应注重多学科联合、完善研究方法、扩展研究领域,才能系统揭示连作障碍形成机理。

关键词：马铃薯连作复合型种植土壤微生态

槟榔江水牛OXCT1基因的分子特征及组织表达谱分析

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中国畜牧兽医 2019年第6期46卷 1576-1584页

作者：何情刘琴哈福张永云苗永旺云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心昆明650201

本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1(3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1)基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列(GenBank登录号:XM006076397)为参考序列,采用Primer... 详细信息

本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1(3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1)基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列(GenBank登录号:XM006076397)为参考序列,采用Primer Premier 5.0软件设计引物序列,以提取的槟榔江水牛基因组DNA为模板,PCR扩增获得槟榔江水牛OXCT1基因mRNA序列,扩增产物经测序后利用ORF Finder软件进行开放阅读框识别,获得水牛OXCT1基因CDS区全序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,槟榔江水牛OXCT1基因CDS序列全长1 563 bp,编码520个氨基酸,蛋白分子式为C2509H4041N687O746S23,分子质量为56.50 ku,理论等电点(pI)为8.69,不稳定系数为27.49,平均疏水性(GRAVY)为-0.097,该蛋白属弱亲水性蛋白。OXCT1蛋白无信号肽和跨膜结构,属于线粒体膜蛋白;包含pcaJscoBfam和AtoD 2个保守结构域,且具有5个功能活性位点。槟榔江水牛与普通牛、藏羚羊等5个物种的OXCT1氨基酸序列同源性≥97%。对槟榔江水牛13个组织进行表达谱分析表明,在泌乳期,OXCT1基因在乳腺中表达量最高,在肾脏、垂体、脂肪、大脑、皮肤和肌肉中不表达;在非泌乳期,OXCT1基因在除脂肪以外的其他12个组织中都有表达。OXCT1基因在槟榔江水牛泌乳期乳腺组织中表达量最高,推测其可能参与了水牛的乳脂合成调控事件。本研究结果可为深入了解乳脂合成代谢及其调控机制提供依据。

关键词：槟榔江水牛 OXCT1基因克隆生物信息学组织表达谱

版纳微型猪近交系SLA-DOA基因克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析

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中国免疫学杂志 2017年第6期33卷 873-878页

作者：王配王淑燕霍金龙李罗刚张永云李卫真朱宏涛姚茂东云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室昆明650201 云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院昆明650201

目的:克隆版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)白细胞抗原DO座位alpha亚基(SLA-DOA)的编码序列,并对其19个重要组织mRNA表达作半定量分析。方法:RT-PCR方法获得SLA-DOA的全长cDNA序列;半定量RTPCR方法分析其在BMI重要组织... 详细信息

目的:克隆版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)白细胞抗原DO座位alpha亚基(SLA-DOA)的编码序列,并对其19个重要组织mRNA表达作半定量分析。方法:RT-PCR方法获得SLA-DOA的全长cDNA序列;半定量RTPCR方法分析其在BMI重要组织的mRNA表达谱,并运用生物信息学对其核酸及蛋白序列进行分析,构建系统进化树。结果:BMI SLA-DOA cDNA长度为1 079 bp,编码250个氨基酸,蛋白质分子量为27.81 k D,等电点为6.48;位于猪7号染色体,由4个外显子和3个内含子构成;其mRNA高表达于淋巴结和胃,低表达于心脏、皮肤和十二指肠,在其他14种组织中不表达;SLA-DOA蛋白存在1个信号肽,1个跨膜螺旋,3个保守域,4个O连接的糖基化位点,18个磷酸化位点,位于细胞质的概率是94.1%;系统进化分析表明,在所选择的6个物种中,BMI(猪)与牛的亲缘关系最近。结论:本研究成功克隆了版纳微型猪近交系SLA-DOA基因并进行了生物信息学功能分析和多种组织表达分析,为版纳微型猪近交系的异种器官移植研究奠定基础。

关键词：猪白细胞抗原DO座位alpha亚基版纳微型猪近交系组织表达生物信息学

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《动物生物化学》开放性实验的探究

家畜生态学报 2012年第4期33卷 125-128页

作者：张永云赵素梅高士争李卫真彭少丹丁联成云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心云南昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201

针对动物生物化学实验传统教学模式的不足,结合实验教学改革和实验室开放平台的建设,对开放性实验的开展进行了一些探索,建立了课内和课外多种开放性实验模式。开放性实验的开展对激发学生的学习兴趣,培养学生的创新能力和实践能力具有... 详细信息

针对动物生物化学实验传统教学模式的不足,结合实验教学改革和实验室开放平台的建设,对开放性实验的开展进行了一些探索,建立了课内和课外多种开放性实验模式。开放性实验的开展对激发学生的学习兴趣,培养学生的创新能力和实践能力具有良好的效果,对提高实验教学质量具有积极的作用。

关键词：生物化学开放性实验探究

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动物生物化学实验教学改革探索与实践

实验技术与管理 2011年第10期28卷 117-121页

作者：张永云高士争赵素梅李卫真云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心云南昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201

针对当前动物生化实验教学内容、教学方法和教学模式中存在的问题,从更新实验内容,改革实验教学手段、教学模式和考试方法、强调课程的实践训练等几方面对课程教学进行全面的探索。将基础性实验、综合性实验和设计性实验3个层次有机地... 详细信息

针对当前动物生化实验教学内容、教学方法和教学模式中存在的问题,从更新实验内容,改革实验教学手段、教学模式和考试方法、强调课程的实践训练等几方面对课程教学进行全面的探索。将基础性实验、综合性实验和设计性实验3个层次有机地结合起来,形成由浅入深、从易到难的递进式分阶段教学模式。经过改革,学生对实验课的学习由被动接受变为主动探究,在培养学生的创新能力和实践能力方面具有重要意义。

关键词：动物生物化学实验实验教学改革探索

水牛胃型LYZ c基因多态性及功能生物信息学分析

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华北农学报 2017年第6期32卷 113-120页

作者：范新阳张永云邱立华陈涛周芳廷哈福苗永旺云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心云南昆明650201 云南省德宏州芒市畜牧站云南芒市678400

胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合... 详细信息

胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了比较基因组学和生物信息学分析。在水牛群体内共发现9个SNP位点,分别为c.87G>T、c.196G>A、c.228G>A、c.336G>C、c.351T>C、c.396C>T、c.423C>T、c.424G>A和c.438C>G,其中SNP87、SNP196、SNP336和SNP351仅存在于河流型水牛中,其他5个SNP为河流型和沼泽型水牛共享;SNP196和SNP424为异义替换,引起p.G66S和p.V142I氨基酸替换,但它们对水牛LYZ c的功能没有影响。在水牛胃型LYZ c基因中,共定义7种单倍型,确定了3种LYZ c变异体,其中变异体Buffalo1、Buffalo 2为两类水牛共享,Buffalo 3为河流型水牛独有。水牛这3种变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致。水牛与普通牛胃型LYZ c蛋白的上述特征也极相似,但水牛胃型LYZ c的等电点比普通牛更低。结果揭示水牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。

关键词：水牛胃型LYZ c基因前肠发酵序列分析生物信息学分析

河流型与沼泽型水牛CSN3基因密码子使用特征分析

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云南农业大学学报（自然科学版） 2017年第2期32卷 238-245页

作者：范新阳邱立华罗国祥张永云滕晓红苗永旺云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南省大理州家畜繁育指导站云南大理671000 云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心云南昆明650201

本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基... 详细信息

本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基因密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果表明:两种类型水牛CSN3基因密码子使用特征相似,河流型水牛CSN3基因共有26个偏好使用的密码子,而沼泽型水牛共有27个;其中,两类水牛偏好性较强的密码子均为GUU、UCA、AGU、CCA、AGG、GGU和GGA(RSCU≥2),河流型水牛对Asp的两种密码子GAU、GAC没有使用偏好性,而沼泽型水牛偏好使用GAC;河流型水牛编码Asp和Cys的同义密码子RSCU值为1,而沼泽型水牛只有编码Cys的同义密码子RSCU值为1。研究发现,所有物种CSN3基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但不同物种之间偏好使用密码子种类和数目均有差异。在密码子使用频率上,水牛CSN3基因与其他牛科物种的差异小于与小鼠、人的差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型与沼泽型水牛亲缘关系最近,聚为一类,然后依次与其他牛、绵羊、小鼠和人等物种相聚。

关键词：河流型水牛沼泽型水牛牛科物种 CSN3基因密码子偏好性聚类分析

河流型与沼泽型水牛FSHR基因密码子偏好性分析

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黑龙江畜牧兽医 2018年第3期 28-34页

作者：周芳廷张永云钱林东李卫真袁峰滕晓红苗永旺云南农业大学动物科学技术学院云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心云南农业职业技术学院农业与生物技术学院

为了确定河流型与沼泽型水牛促卵泡素受体(FSHR)基因密码子的使用模式,试验采用PCR产物直接测序法对9头河流型水牛、15头沼泽型水牛、6头大额牛和6头中甸牦牛的FSHR基因编码区序列进行了群体变异检测和单倍型划分,并结合已发表的普通牛... 详细信息

为了确定河流型与沼泽型水牛促卵泡素受体(FSHR)基因密码子的使用模式,试验采用PCR产物直接测序法对9头河流型水牛、15头沼泽型水牛、6头大额牛和6头中甸牦牛的FSHR基因编码区序列进行了群体变异检测和单倍型划分,并结合已发表的普通牛、野牛、山羊、绵羊、人和黑猩猩的同源序列,对河流型与沼泽型水牛FSHR基因密码子使用的偏好性及与其他物种的差异进行了探讨。结果表明:两类水牛FSHR基因的密码子使用特征较为相似,河流型与沼泽型水牛分别有28个和27个偏好使用的密码子,对于编码Pro的4个密码子CCC、CCA、CCU和CCG而言,河流型水牛偏好使用CCC和CCA,而沼泽型水牛偏好使用CCC。水牛与其他物种共同偏好使用的密码子有20种,均偏好使用以G/C结尾的密码子。基于密码子的同义密码子相对使用度(RSCU)构建的聚类树显示河流型水牛与沼泽型水牛先聚为一类,再与大额牛、牦牛聚为一类,普通牛与山羊、绵羊和野牛聚为一类,人和黑猩猩聚为一类,揭示聚为一类的物种间在密码子使用上的偏好性较相似。

关键词：河流型水牛沼泽型水牛促卵泡素受体(FSHR)基因密码子偏好性 RSCU 聚类分析

阴沟肠杆菌MY01的鉴定及防治水稻细菌性条斑病研究

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植物病理学报 2020年第4期50卷 471-478页

作者：王彦芳杨俊代真林魏兰芳姬广海云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室昆明650201 云南农业大学农科专业基础实验教学中心昆明650201

肠杆菌属(Enterobacter sp.)作为有益微生物的重要菌种,不仅对一些植物的生长起着促进作用,而且在有害生物防治方面起着重要的作用。本研究采用Biolog微生物生理生化分析、共培养等手段,对阴沟肠杆菌MY01、抗生素溶杆菌13-6与水稻细菌... 详细信息

肠杆菌属(Enterobacter sp.)作为有益微生物的重要菌种,不仅对一些植物的生长起着促进作用,而且在有害生物防治方面起着重要的作用。本研究采用Biolog微生物生理生化分析、共培养等手段,对阴沟肠杆菌MY01、抗生素溶杆菌13-6与水稻细菌性条斑病菌RS105的营养和空间竞争能力、定殖特性以及对水稻幼苗的促生作用、条斑病的生防效果进行测定,明确阴沟肠杆菌与抗生素溶杆菌对水稻条斑病的协同生防作用。结果显示MY01生长迅速且能利用大部分碳源,营养竞争能力较强,可限制其他细菌生长。温室喷雾接种时,MY01与13-6对水稻条斑病的防效相近,且MY01可增强13-6对水稻条斑病的相对防效,防效高达93.44%。阴沟肠杆菌MY01作为一种潜在的生防菌株,对水稻条斑病具有一定防效,且促进抗生素溶杆菌13-6对水稻条斑病的防治。

关键词：水稻条斑病抗生素溶杆菌阴沟肠杆菌生物防治