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肺栓塞患者DNA甲基化联合基因表达差异分析

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中华急诊医学杂志 2024年第2期33卷 242-247页

作者：曹嘉芮李伟曹国磊何丽丽牛海文李晓晗罗琴新疆医科大学附属肿瘤医院重症医学科乌鲁木齐830011 新疆医科大学附属肿瘤医院日间病房二病区乌鲁木齐830011 新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸神经内科乌鲁木齐830011 惠州市第六人民医院消化内科惠州516200

目的通过整合生物信息学分析筛选与肺栓塞相关的遗传和表观遗传表达差异。方法以2019年就诊与新疆医科大学第三附属医院肺栓塞患者及健康体检者4例作为研究对象,利用高通量测序技术及甲基化芯片技术检测、筛选并整合外周血差异基因组和... 详细信息

目的通过整合生物信息学分析筛选与肺栓塞相关的遗传和表观遗传表达差异。方法以2019年就诊与新疆医科大学第三附属医院肺栓塞患者及健康体检者4例作为研究对象,利用高通量测序技术及甲基化芯片技术检测、筛选并整合外周血差异基因组和表观基因组数据来识别致肺栓塞发病的甲基化驱动基因及差异表达基因,行GO及KEGG富集分析。结果将肺栓塞组和健康对照组间DNA甲基化和基因表达数据进行共表达分析,基因上游区域差异甲基化与基因表达呈负相关,其中共筛选出基因上游区域显著甲基化基因有8个,采用独立样本的T检验及Pearson相关性分析,肺栓塞组中TSS1500显著甲基化基因有6个,分别为TSPO2、C1QA、AQP1、TNFSF9、MiA、STAB1,对应基因的差异表达倍数log2FC分别是1.298,1.629,1.024,2.746,2.539,1.060,基因表达与基因甲基化之间的相关度分别是-0.908,-0.900,-0.824,-0.784,-0.783,-0.779,两组间甲基化差异分别是-0.049,-0.053,-0.048,-0.057,-0.050,-0.053(P区域显著甲基化基因有3个,分别为TSPO2,SLCP9A3,SiGLEC1,基因表达差异倍数log2FC分别是1.298,-2.252,1.866,基因表达与基因甲基化之间的相关度分别是-0.860,-0.774,-0.739,两组间甲基化差异分别是-0.051,0.027,-0.048(P区域有TSPO2、C1QA、AQP1、TNFSF9、MiA、STAB1、SiGLEC1共7个基因呈现低甲基化高表达状态。SLC9A3基因呈现高甲基化低表达。GO功能分析中,在补体活化、免疫反应、激活蛋白级联等得到显著富集。在KEGG信号通路中,免疫系统、细菌感染以及信号分子及相互作用方面得到显著富集,从而调控肺栓塞的发生。结论基于DNA甲基化和基因表达的联合分析,发现了肺栓塞发生发展的新思路,后续可进行更加深入的研究。

关键词：肺栓塞 DNA甲基化基因表达联合分析

CPB2为晚期肺腺癌EGFR-T790M耐药基因突变的潜在生物标志物

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实用肿瘤杂志 2024年第3期39卷 242-251页

作者：王为民韩志刚俞婷婷新疆医科大学附属肿瘤医院肺内科一病区新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830000

目的通过平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)定量蛋白组学技术验证晚期肺腺癌患者表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)-T790M耐药突变的生物标志物。方法纳入2018年1月至2018年12月就诊于新疆医科... 详细信息

目的通过平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)定量蛋白组学技术验证晚期肺腺癌患者表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)-T790M耐药突变的生物标志物。方法纳入2018年1月至2018年12月就诊于新疆医科大学附属肿瘤医院的口服EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKi)吉非替尼的具有EGFR19del或EGFR 21 L858R基因突变的晚期肺腺癌患者44例。在患者疾病进展后行组织活检,使用下一代测序(next generation sequencing,NGS)方法检测出EGFR-T790M突变患者24例,非EGFR-T790M突变20例。提取44例患者的血清蛋白,通过SDS-PADE进行质量评估,两组分别得到10例质量合格血清蛋白样本。质量合格的血清蛋白样品分别进行丝氨酸蛋白酶酶解,通过PRM方法进行纳米液相色谱-串联质谱分析法(nanometer liquid chromatography-tandem mass spectrometry,nanoLC-MS/MS)检测。运行Skyline软件进行数据分析,得出与EGFR-T790M突变相关的差异表达蛋白。将基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库的各节点映射,进行功能富集分析,并利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库提供的绘图模块进行差异表达蛋白表达含量渲染,采用STRiNG数据库构建差异表达蛋白的蛋白互作(protein-protein interaction,PPi)网络,寻找关键差异表达蛋白。结果通过PRM方法确定14种与晚期肺腺癌EGFRT790M突变相关的差异表达蛋白。GO富集分析显示,这些差异表达蛋白在参与细胞组分方面,主要构成细胞外区域的部分;在发挥的分子功能方面,主要为抗原结合、作用于L氨基酸肽的肽酶活性和免疫球蛋白受体结合。KEGG富集通路分析显示,补体和凝血级联反应差异表达蛋白富集指数最高。该通路上的差异蛋白为凝血因子Ⅹ(coagulation factorⅩ,F10)、F9、纤溶酶原(plasminogen,PLG)和羧肽酶B2(carboxypeptidase B2,CPB2)。其中F10为上调蛋白,其余为下调蛋白。PPi网络构建分析显示,CBP2为差异表达蛋白中的关键节点。结论 CBP2是晚期肺腺癌EGFR-T790M耐药突变发生的潜在生物标志物。

关键词：晚期肺腺癌 EGFR-T790M 蛋白组学差异性蛋白

原发性肝癌转化及围手术期治疗中国专家共识(2024版)

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中华消化外科杂志 2024年第4期23卷 492-513页

作者：中国抗癌协会肝癌专业委员会转化治疗协作组樊嘉白雪莉毕新宇纪元英卫东黎功刘嵘刘秀峰饶圣祥沈顺利施国明唐浩文王嘉倍王征吴志峰谢青徐立曾昭冲张岚张伟赵明朱小东不详复旦大学附属中山医院、复旦大学肝癌研究所上海200032 浙江大学医学院附属第一医院肝胆胰外科浙江省胰腺病研究重点实验室国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肝胆外科复旦大学附属中山医院病理科中国科学技术大学附属第一医院肝脏外科清华大学附属北京清华长庚医院肝胆胰中心复旦大学附属中山医院介入治疗科东部战区总医院秦淮医疗区肿瘤科复旦大学附属中山医院放射科中山大学附属第一医院肝胆胰外科中心复旦大学附属中山医院肝肿瘤外科复旦大学肝癌研究所解放军总医院肝胆胰外科医学部中国科学技术大学附属第一医院肝胆外科复旦大学附属中山医院放疗科复旦大学附属中山医院肿瘤防治中心上海交通大学医学院附属瑞金医院感染科中山大学肿瘤防治中心肝脏外科复旦大学附属中山医院肝肿瘤内科天津医科大学肿瘤医院肝胆肿瘤科中山大学肿瘤防治中心微创介入治疗科华南国家重点实验室

我国目前仍有超过一半的肝癌患者在初诊时即为中晚期,丧失手术切除机会,而部分可手术患者术后复发转移率高,导致患者总体生存较差.随着外科手术技术的革新、系统治疗和局部治疗手段的丰富和进步,通过多模式综合治疗策略为肿瘤转化提供... 详细信息

我国目前仍有超过一半的肝癌患者在初诊时即为中晚期,丧失手术切除机会,而部分可手术患者术后复发转移率高,导致患者总体生存较差.随着外科手术技术的革新、系统治疗和局部治疗手段的丰富和进步,通过多模式综合治疗策略为肿瘤转化提供可能、使患者获得手术切除机会,同时有效降低术后复发转移率,从而实现患者长期生存获益.此外,近年来研究者对转化及围手术期治疗过程中手术时机的选择、病灶评估、疗效预测、并发症处理等方面进行了进一步有益探索.在原有共识的基础上修订并更新形成《原发性肝癌转化及围手术期治疗中国专家共识(2024版)》,提出了在肝癌转化治疗和围手术期治疗领域的治疗策略和实施过程需要解决的问题,以期为推动该领域研究和临床实践奠定基础.

关键词：肝肿瘤转化治疗围手术期治疗共识中国

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打好晚期胃癌诊疗“组合拳”

中华胃肠外科杂志 2024年第2期27卷 196-204页

作者：练磊殷实肖健彭俊生中山大学附属第六医院普通外科(胃外科) 广州510655 广东省结直肠盆底疾病研究重点实验室广州510655 广州市黄埔区中六生物医学创新研究院广州510799 南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)肿瘤内科广州510100

胃癌发病率位居世界恶性肿瘤榜第5位,死亡率为第4位,其在我国的突出特点是中晚期患者占比较高,其中又有约40%的患者处于晚期阶段。晚期胃癌预后较差,平均生存时间约1年。对于晚期胃癌,其诊断方式(腹腔镜探查、分子图谱、人工智能)仍在... 详细信息

胃癌发病率位居世界恶性肿瘤榜第5位,死亡率为第4位,其在我国的突出特点是中晚期患者占比较高,其中又有约40%的患者处于晚期阶段。晚期胃癌预后较差,平均生存时间约1年。对于晚期胃癌,其诊断方式(腹腔镜探查、分子图谱、人工智能)仍在不断完善,而治疗仍以化疗为主。随着医学日新月异的发展,外科手术在晚期胃癌中的作用日益凸显。因此,作为胃肿瘤外科医生,应思考如何根据不同的病理分期和肿瘤的异质性,采用手术、化疗、靶向治疗、免疫治疗、介入治疗等“组合拳”进行“打击”,多学科的专家一起,共同提高晚期患者的生存率和生活质量。本文主要从外科医生角度,探讨晚期胃癌诊疗策略的制定。

关键词：胃肿瘤,晚期远处转移诊断腔镜探查转化治疗异质性

局限期小细胞肺癌患者生存及发生脑转移的影响因素分析

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国际呼吸杂志 2024年第3期44卷 294-304页

作者：阿丽亚·奥斯曼刘俊远帕提古力·阿尔西丁新疆医科大学附属肿瘤医院肺内科(一病区) 乌鲁木齐830011

目的分析局限期小细胞肺癌(LS-SCLC)患者生存及发生脑转移的影响因素。方法本研究为队列研究。采用非随机抽样的方法选取2016年2月至2020年1月就诊于新疆医科大学附属肿瘤医院接受化疗联合放疗的112例LS-SCLC患者。记录所有患者的性别,... 详细信息

目的分析局限期小细胞肺癌(LS-SCLC)患者生存及发生脑转移的影响因素。方法本研究为队列研究。采用非随机抽样的方法选取2016年2月至2020年1月就诊于新疆医科大学附属肿瘤医院接受化疗联合放疗的112例LS-SCLC患者。记录所有患者的性别,年龄,吸烟史,美国东部肿瘤协作组(ECOG)评分,治疗方式[同步放化疗(CCRT)、序贯放化疗(SCRT)],接受预防性颅脑照射(PCi)情况,近期疗效[完全缓解(CR)、部分缓解(PR)、疾病稳定(SD)、疾病进展(PD)],不良反应(放射性食管炎、放射性肺炎)和脑转移情况。随访时间从细胞学或组织病理学确认为LS-SCLC起始,直至患者发生脑转移或死亡,或者最后一次随访结束。随访截止日期为2022年11月30日。研究的主要终点为LS-SCLC患者的无进展生存期(PFS)、总生存期(OS)和无脑转移生存期(BMFS)。根据是否有脑转移分为脑转移组(42例)和无脑转移组(70例)。通过Kaplan-Meier法绘制生存曲线,并行Log-rank检验比较LS-SCLC患者的生存曲线。采用单因素和多因素Cox回归模型分析LS-SCLC患者OS和BMFS的影响因素。结果所有患者的年龄为55(48,65)岁,42例(37.50%)患者发生脑转移,78例(69.64%)患者接受PCi。无脑转移组和脑转移组患者性别、吸烟史和放射性食管炎比较差异均有统计学意义(χ^(2)值分别为4.66、8.86、6.42,均P期疗效(CR、PR、SD、PD)、PCi、放射性肺炎比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。全组患者中CR 5例(4.46%),PR 69例(61.61%),SD 36例(32.14%),PD 2例(1.79%)。CR+PR患者共74例,缓解率为66.07%。至随访结束,共70例(62.50%)患者死亡,PFS为22.0(12.5,32.0)个月,1年、3年和5年无进展生存率分别为80.1%、24.6%、2.7%;OS为35.0(25.1,45.0)个月,1年、3年和5年总生存率分别为80.4%、48.3%、27.1%;BMFS为(54.5±4.0)个月,1年、3年和5年无脑转移生存率分别为78.4%、57.7%、52.0%。吸烟史、ECOG评分、治疗方式、PCi、放射性肺炎和放射性食管炎是LS-SCLC患者OS的影响因素(χ^(2)值分别为26.95、6.53、9.73、6.06、5.45、5.12,均Pi:1.697~5.109;HR=1.897,95%Ci:1.091~3.300),CCRT、PCi是影响LS-SCLC患者OS的独立保护因素(HR=0.537,95%Ci:0.301~0.957;HR=0.553,95%Ci:0.327~0.936);有吸烟史、有放射性肺炎和有放射性食管炎为影响LS-SCLC患者BMFS的独立危险因素(HR=2.965,95%Ci:1.333~6.594;HR=1.965,95%Ci:1.022~3.777;HR=2.614,95%Ci:1.399~4.884)。结论有吸烟史和放射性食管炎为影响LS-SCLC患者OS的独立危险因素,CCRT、PCi是影响LS-SCLC患者OS的独立保护因素。有吸烟史、有放射性肺炎和有放射性食管炎为影响LS-SCLC患者BMFS的独立危险因素。

关键词：小细胞肺癌危险因素脑转移放射治疗生存

抗微管相关蛋白1B抗体阳性相关神经系统副肿瘤综合征1例报告

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中国临床医学 2024年第3期31卷 514-516页

作者：张玲贾佳史妍慧赵轶邱炜斌范薇上海市徐汇区中心医院复旦大学附属中山医院徐汇医院神经内科上海200237 复旦大学附属中山医院神经内科上海200032

神经系统副肿瘤综合征(paraneoplastic neurological syndrome,PNS)是癌症的远隔效应,可影响神经系统的各个部分,发病通常由免疫机制介导。随着抗体生物标志物的发现不断增多,PNS的发现率也逐渐升高,每300例癌症患者中有1例为PNS[1]。2... 详细信息

神经系统副肿瘤综合征(paraneoplastic neurological syndrome,PNS)是癌症的远隔效应,可影响神经系统的各个部分,发病通常由免疫机制介导。随着抗体生物标志物的发现不断增多,PNS的发现率也逐渐升高,每300例癌症患者中有1例为PNS[1]。2021年7月,国际专家组[2]提出了PNS最新诊断标准及新的诊断评分系统,重新定义PNS常见临床表型,并将其分为高风险表型、中风险表型;同时对抗体进行危险分层,将抗微管相关蛋白1B(microtubule associated protein 1B,MAP1B)抗体作为“高风险抗体”,认为其与肿瘤发生有强相关性。但是,目前抗MAP1B抗体引起PNS的病例报道及相关研究尚较少。现报告1例MAP1B抗体相关PNS病例。

关键词：微管相关蛋白1B 神经系统副肿瘤抗浦肯野细胞抗体2型

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ABCB4基因缺陷病的临床研究进展

临床内科杂志 2024年第4期41卷 225-230页

作者：曾涛崇雨田李新华中山大学附属第三医院感染性疾病科广州510630

ABCB4基因编码的多药耐药3(MDR3)蛋白可将磷脂易位至胆汁中,与胆汁分泌和排泄密切相关。ABCB4基因缺陷病包含一组异质性疾病,主要是由于ABCB4基因突变导致MDR3蛋白功能障碍,进而导致毛细胆管堵塞,胆盐毒性去垢作用损伤肝细胞及胆管上皮... 详细信息

ABCB4基因编码的多药耐药3(MDR3)蛋白可将磷脂易位至胆汁中,与胆汁分泌和排泄密切相关。ABCB4基因缺陷病包含一组异质性疾病,主要是由于ABCB4基因突变导致MDR3蛋白功能障碍,进而导致毛细胆管堵塞,胆盐毒性去垢作用损伤肝细胞及胆管上皮细胞。ABCB4基因缺陷病的疾病谱广、遗传模式及临床表现多样,可从无症状或仅有谷氨酰转肽酶(GGT)增高到失代偿性肝硬化甚至肝衰竭,且临床表型常难以与胆道结石、原发性胆汁性肝硬化(PBC)及原发性硬化性胆管炎(PSC)等常见疾病区分,易被临床医师误诊、漏诊。近期多项研究表明ABCB4基因突变患者发生恶性肿瘤的风险增加,更增加了该疾病的复杂性。本文总结ABCB4基因缺陷病的临床特征及近年来的诊疗进展,旨在提高临床医师对ABCB4基因缺陷病的认识。

关键词： ABCB4 多药耐药3 胆汁淤积进行性家族性肝内胆汁淤积3型低磷脂相关胆石症综合征

骨髓间充质干细胞移植联合自拟中药治疗失代偿期肝硬化患者效果研究

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实用肝脏病杂志 2024年第4期27卷 567-570页

作者：艾孜江·艾买提阿布都西库尔·阿布都米吉提迪丽努尔·阿卜杜热合曼吴源泉中山大学附属喀什第一人民医院普通外科/肝胆血管外科新疆维吾尔自治区喀什市844000 中山大学附属喀什第一人民医院肝胆胰腺外科新疆维吾尔自治区喀什市844000

目的探讨骨髓间充质干细胞(BMSCs)移植术联合自拟中药治疗失代偿期肝硬化患者的效果。方法2017年6月~2022年10月我院收治的93例失代偿期肝硬化患者,随机分为A组、B组和C组,每组31例。给予A组常规内科综合治疗,在此基础上,给予B组自体BM... 详细信息

目的探讨骨髓间充质干细胞(BMSCs)移植术联合自拟中药治疗失代偿期肝硬化患者的效果。方法2017年6月~2022年10月我院收治的93例失代偿期肝硬化患者,随机分为A组、B组和C组,每组31例。给予A组常规内科综合治疗,在此基础上,给予B组自体BMSCs移植术治疗,C组在BMSCs移植术后,给予自拟中药治疗,三组均治疗观察6个月。采用放射免疫分析法检测血清透明质酸(HA)、iV型胶原(CiV)、层粘连蛋白(LN)和iii型前胶原(PiiiP)水平;采用ELiSA法检测血清白细胞介素-6(iL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平;分别采用黄嘌呤氧化酶法和硫代巴比妥法检测血清超氧化物歧化酶(SOD)和丙二醛(MDA)水平。结果在治疗6个月末,C组Child-Pugh评分和肝硬度测量(LSM)分别为(7.2±1.2)分和(9.0±0.6)kPa,显著低于B组【分别为(8.0±1.1)分和(9.3±0.5)kPa,PiL-6、TNF-α和MDA水平分别为(104.6±16.7)ng/L、(192.7±19.8)ng/L和(4.1±0.9)μmol/L,显著低于B组【分别为(114.3±15.3)ng/L、(210.9±22.8)ng/L和(5.0±1.3)μmol/L,P期肝硬化患者可改善肝功能指标,可能与抑制了炎性反应和缓解了氧化应激反应有关。

关键词：肝硬化骨髓间充质干细胞移植术中药治疗

胃癌患者家庭照顾者预期性悲伤与照顾负担的现状及相关性

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国际护理学杂志 2023年第7期42卷 1180-1183页

作者：丘淑芬陈岁花中山大学附属肿瘤医院内科六区/i期病区二区广州510000

目的:探讨胃癌患者家庭照顾者预期性悲伤与照顾负担的现状并分析其相关性。方法:选取2018年2月至2020年10月在中山大学附属肿瘤医院治疗的胃癌患者的135例家庭照顾者作为研究对象,调查其预期性悲伤程度及照顾负担程度,采用Spearman秩相... 详细信息

目的:探讨胃癌患者家庭照顾者预期性悲伤与照顾负担的现状并分析其相关性。方法:选取2018年2月至2020年10月在中山大学附属肿瘤医院治疗的胃癌患者的135例家庭照顾者作为研究对象,调查其预期性悲伤程度及照顾负担程度,采用Spearman秩相关分析法对两者相关性进行分析。结果:胃癌患者家庭照顾者预期性悲伤最低分为51分,最高分为125分,平均(79.26±15.58)分,以失去的感觉维度条目均分最高(3.71±0.67)分,易怒维度条目均分最低(2.29±0.63)分,其照顾负担最低分为15分,最高分为66分,平均(35.76±9.89)分,且个人负担高于责任负担,Spearman秩相关分析显示,胃癌患者家庭照顾者预期性悲伤与照顾负担呈正相关关系,总相关系数为0.454。结论:大多数胃癌患者家庭照顾者存在预期性悲伤,且伴有中等程度的照顾负担,同时,胃癌患者家庭照顾者预期性悲伤与照顾负担呈正相关关系,因此,在临床工作中,医护人员应对胃癌患者采取积极治疗的同时,加强对患者家庭照顾者开展有效的健康指导,通过缓解预期性悲伤程度,降低其照顾负担及压力,避免不良情况的发生。

关键词：胃癌家庭照顾者预期性悲伤照顾负担