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海洋哺乳动物微生物组研究进展

微生物学报 2024年第12期64卷 4727-4745页

作者：郭丹媛杨子文李文均中山大学生命科学学院水产动物疫病防控与健康养殖全国重点实验室广东广州510275 南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海) 广东珠海519000

海洋哺乳动物主要包括生活在水里的鲸类、基本生活在水里的海牛类以及水陆两栖的鳍足类,均为珍稀的国家二级及以上保护动物。微生物在哺乳动物体内起到营养吸收、辅助消化过程以及增强免疫功能的作用,是宿主体内不可或缺的一部分,而作... 详细信息

海洋哺乳动物主要包括生活在水里的鲸类、基本生活在水里的海牛类以及水陆两栖的鳍足类,均为珍稀的国家二级及以上保护动物。微生物在哺乳动物体内起到营养吸收、辅助消化过程以及增强免疫功能的作用,是宿主体内不可或缺的一部分,而作为适应海洋环境的特殊哺乳动物类群,海洋哺乳动物的生存环境和食性的特殊性导致其体内微生物群落与陆生哺乳动物有显著差异。正是这种差异性导致我们对研究较多的陆地哺乳动物微生物的很多认识无法简单地套入海洋哺乳动物中。因此,深入了解海洋哺乳动物的微生物群落结构和功能对于了解海洋哺乳动物与环境的互作关系以及提高其保育工作的水平至关重要。本文对近年来海洋哺乳动物微生物组研究的进展进行了总结,并探讨了相关技术方法以及未来研究中值得关注的科学问题。

关键词：海洋哺乳动物微生物影响因素

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中国井冈山生态系统多样性

生态学报 2012年第20期32卷 6326-6333页

作者：陈宝明林真光李贞廖文波周婷陈春泉彭少麟中山大学生命科学学院/有害生物控制与资源利用国家重点实验室广州510275 中山大学地理科学与规划学院广州510275 井冈山管理局吉安343600

从不同尺度对井冈山生态系统进行了研究分析,并论述生态系统与生物物种多样性的关系,为井冈山生态环境保护与管理提供依据。研究发现,井冈山拥有IUCN/SSC一级生境类型9个,几乎涵盖了除海洋以外的所有生境类型,反映出井冈山生境类型非常... 详细信息

从不同尺度对井冈山生态系统进行了研究分析,并论述生态系统与生物物种多样性的关系,为井冈山生态环境保护与管理提供依据。研究发现,井冈山拥有IUCN/SSC一级生境类型9个,几乎涵盖了除海洋以外的所有生境类型,反映出井冈山生境类型非常丰富。井冈山一级生境中的面积最大的森林是井冈山自然生态系统类型及植被类型的重要基础;灌丛、草地及水域等次要的生境类型,提高了生态系统类型的复杂性和复合性。井冈山的一级生境类型是其生态系统分类的宏观基础,生境类型的丰富程度与生态系统类型的多样性密切相关。根据起源、地貌、生境和属性,以及结构和功能对井冈山生态系统类型进行逐级划分。调查发现,井冈山生态系统类型共有53类,其中自然生态系统21类(包括类型多样的森林生态系统、草地生态系统、静水生态系统等),人工生态系统14类(包括类型多样的人工湿地生态系统、人工林生态系统、农业自然复合生态系统等),复合生态系统18类(包括类型多样的人工复合生态系统、半自然复合生态系统等)。将生态系统只分到四级水平,四级以下还有丰富的生态系统类型。井冈山植物群落可分14个植被型,90个群系,180个群丛。与周围遗产地相比,井冈山的群系数量最多,与面积更大的三清山和武夷山相比,井冈山植被群系数量接近它们的3倍,表现出极其丰富的植被多样性。井冈山物种极其丰富,维管束植物和两栖动物最多,其昆虫数量仅次于武夷山,鸟类数量仅次于丹霞山。井冈山植物物种数最高。虽然井冈山总体空间(分布面积)有限,但这种分化出的丰富的生态位空间使井冈山在有限面积的植被上容纳更多的生物物种成为可能。

关键词：生境生态系统群落生物多样性

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赤魟亲环素A的融合表达、纯化及活性特征

中国现代医学杂志 2004年第11期14卷 67-70页

作者：涂洪斌朱俊杰张强彭立胜钟肖芬陈慧萍姜孝玉杨文利广州医学院实验医学研究中心肿瘤研究所广东广州510182 中山大学生命科学学院生物化学系海洋生物功能基因组开放实验室广东广州510275

目的探讨赤鱼工亲环素A基因(dsCypA)的生物学功能。方法构建硫氧还蛋白基因融合表达体系PETTRX-dsCypA,低温诱导表达的融合蛋白dsCypA-TRX,利用金属螯合亲和层析纯化后,经蛋白酶切割和进一步纯化,得到高纯度成熟重组dsCypA,测定其酶活... 详细信息

目的探讨赤鱼工亲环素A基因(dsCypA)的生物学功能。方法构建硫氧还蛋白基因融合表达体系PETTRX-dsCypA,低温诱导表达的融合蛋白dsCypA-TRX,利用金属螯合亲和层析纯化后,经蛋白酶切割和进一步纯化,得到高纯度成熟重组dsCypA,测定其酶活性。结果重组dsCypA具有与人CypA相近的肽基脯氨酸顺反异构酶活性,这在鱼类CypA中是首次报道。结论dsCypA的功能克隆可能部分地解释赤鱼工尾刺中药应用的分子生物学机制,也为从比较生物学的角度,深入开展CypA基因的结构与功能关系研究奠定了基础。

关键词：赤魟亲环素A 融合表达酶活性

低盐在短时间内对绿潮浒苔(Ulva prolifera)氮磷吸收的动态影响

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海洋与湖沼 2018年第5期49卷 975-982页

作者：朱明刘峰陈璐刘兆普淮海工学院海洋生命与水产学院连云港222005 中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室青岛266071 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室青岛266237 上海师范大学生命与环境科学学院植物种质资源开发中心上海200234 南京农业大学资源与环境科学学院南京210095

我国黄海出现的绿潮发源于黄海南部苏北辐射沙洲紫菜养殖区,苏北沙洲区濒临的沿岸河网众多,来自沿岸径流的淡水携带大量氮磷等营养盐间歇性入海,导致海水的富营养化并伴随着盐度的周期性波动。本研究通过模拟实验研究低盐度(15和5)对浒... 详细信息

我国黄海出现的绿潮发源于黄海南部苏北辐射沙洲紫菜养殖区,苏北沙洲区濒临的沿岸河网众多,来自沿岸径流的淡水携带大量氮磷等营养盐间歇性入海,导致海水的富营养化并伴随着盐度的周期性波动。本研究通过模拟实验研究低盐度(15和5)对浒苔吸收氮盐(NO_3~–-N和NH_4^+-N)和磷盐(PO_4^(3–)-P)的影响,主要发现:与盐度30相比,在低盐度(15和5)时,浒苔对NO_3~–-N的1h最大吸收速率(V_(max))和亲和力(V_(max)/Ks)分别提高280%和350%左右,半饱和常数(Ks)下降15%左右,并能够维持对NO_3~–-N的高效吸收(24h);盐度15和5时,浒苔对NH_4^+-N的1h最大吸收速率(V_(max))分别提高40%和200%,亲和力(V_(max)/Ks)分别提高20%和180%, Ks分别提高15%和30%,但是盐度降低对NH_4^+-N的长效吸收产生负面影响,甚至在盐度5条件下出现吸收高浓度NH_4^+-N后再释放的现象;与盐度30相似,盐度15条件下浒苔能够快速吸收PO_4^(3–)-P,而盐度5则导致藻细胞内的PO_4^(3–)-P在早期阶段快速流失,并在后期不能有效吸收PO_4^(3–)-P。本实验的结果表明,降低盐度有利于浒苔对氮源的快速吸收,在盐度15下浒苔能够实现对硝酸盐和磷盐的高效吸收。

关键词：绿潮浒苔盐度营养盐吸收速率

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深海稀土分布规律与成矿作用

地质通报 2021年第2期40卷 195-208页

作者：石学法毕东杰黄牧于淼罗一鸣周天成张兆祺刘季花自然资源部第一海洋研究所/海洋地质与成矿作用重点实验室山东青岛266061 青岛海洋试点国家实验室海洋地质过程与环境功能实验室山东青岛266037 中山大学海洋科学学院广东珠海519082 桂林理工大学地球科学学院/广西隐伏金属矿产勘察重点实验室广西桂林541004

深海稀土是近年发现的一种富集中-重稀土的新型海洋矿产资源,其资源量远超陆地稀土储量,具有重要的潜在应用价值。中国是继日本之后在国际上第二个开展深海稀土调查研究的国家,2011年以来,先后在中印度洋海盆、东南太平洋和西太平洋深... 详细信息

深海稀土是近年发现的一种富集中-重稀土的新型海洋矿产资源,其资源量远超陆地稀土储量,具有重要的潜在应用价值。中国是继日本之后在国际上第二个开展深海稀土调查研究的国家,2011年以来,先后在中印度洋海盆、东南太平洋和西太平洋深海盆地发现了大面积富稀土沉积区,在全球大洋中初步划分出4个深海稀土成矿带:西太平洋深海稀土成矿带、中—东太平洋深海稀土成矿带、东南太平洋深海稀土成矿带和中印度洋海盆-沃顿海盆深海稀土成矿带。深海富稀土沉积主要发育在深海盆地的沸石粘土和远洋粘土中,属于自生成因;部分发育在洋中脊附近的盆地中,受到热液作用的影响。研究发现,深海粘土中稀土元素主要赋存于生物磷灰石中,海水是稀土元素的主要来源;在早期成岩阶段,稀土元素在深海沉积物中发生转移和重新分配,并最终富集于生物磷灰石中;大水深(CCD面之下)、低沉积速率和强底流活动是深海稀土大规模成矿的主要控制因素。今后需要继续加大深海稀土基础调查,加强深海稀土调查探测技术研发,并开展海陆稀土成矿作用对比研究,揭示深海稀土成矿机制和规律。

关键词：深海稀土分布规律成矿作用控制要素

RNA干扰技术抑制新加坡石斑鱼虹彩病毒感染细胞多肽ICP46与绿色荧光蛋白融合基因的表达

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水产学报 2010年第4期34卷 611-617页

作者：夏立群梁海鹰张红莲秦启伟广东海洋大学水产学院中山大学生命科学学院有害生物控制与资源利用国家重点实验室中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室

新加坡石斑鱼虹彩病毒(singapore grouper iridovirus,SGIV)是一种严重的能引起全身性疾病的病原体,对石斑鱼养殖造成了重大的经济损失。将含有SGIV感染细胞多肽ICP46(infected cell polypeptides 46)基因的真核表达载体pEGFP-ICP46转... 详细信息

新加坡石斑鱼虹彩病毒(singapore grouper iridovirus,SGIV)是一种严重的能引起全身性疾病的病原体,对石斑鱼养殖造成了重大的经济损失。将含有SGIV感染细胞多肽ICP46(infected cell polypeptides 46)基因的真核表达载体pEGFP-ICP46转染到胖头鲤细胞(fathead minnow cells,FHM)中进行融合表达,用荧光显微镜观察到ICP46-GFP融合蛋白主要分布于FHM细胞的细胞质中。根据SGIVICP46的序列,设计并体外化学合成了特异性干扰SGIVICP46的siRNA(siRNA-ICP46),与pEGFP-ICP46共转染到FHM细胞中,通过荧光显微镜观察不同时间点荧光强度的变化。转染后24～48h,实验细胞(共转染siRNA-ICP46和pEGFP-ICP46)和阳性对照细胞(共转染siRNA-GFP和pEGFP-ICP46)中的荧光微弱,发荧光的细胞数量较阴性对照(共转染siRNA-Negative和pEGFP-ICP46)少70%左右,但其后实验细胞和阳性对照细胞的荧光强度开始增强,在转染后72h其与阴性对照组已差别不大。说明体外化学合成的siRNA-ICP46转染后24～48h可有效抑制FHM细胞中外源导入SGIV ICP46基因的表达。

关键词： RNA干扰绿色荧光蛋白石斑鱼虹彩病毒感染细胞多肽ICP46

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鳃的功能组学研究进展和趋势

水产学报 2023年第7期47卷 3-12页

作者：宋朝伟李文笙中山大学生命科学学院中山大学水生经济动物研究所有害生物控制与资源利用国家重点实验室广东省水生经济动物良种繁育重点实验室广东省重要经济鱼类健康养殖工程技术研究中心

鳃是水生动物主要的呼吸器官。虽然部分水生动物的鳃结构不同(如鱼和虾蟹)，但其主要功能均为气体交换和渗透压调节等。本文旨在对近年来鳃的功能组学的主要研究结果进行归纳和总结，特别是不同的环境因子(重金属的污染物、寄生虫和细... 详细信息

鳃是水生动物主要的呼吸器官。虽然部分水生动物的鳃结构不同(如鱼和虾蟹)，但其主要功能均为气体交换和渗透压调节等。本文旨在对近年来鳃的功能组学的主要研究结果进行归纳和总结，特别是不同的环境因子(重金属的污染物、寄生虫和细菌、盐度、亚硝酸盐等)胁迫下水生动物鳃的转录组测序分析，以及鳃在不同环境因子胁迫下的蛋白组学和代谢组学的研究，揭示环境因子改变对水生动物鳃相关的基因表达变化、生理生化状态变化、分子通路和生理功能的影响，从而为鱼类的健康养殖提供新的思路和方向。

关键词：水生动物鳃转录组学蛋白组学代谢组学

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Akt在中华绒螯蟹免疫中的功能

水产学报 2023年第9期47卷 175-183页

作者：许青松李兵杨冰慧马金龙洋雯曲琛大连民族大学生命科学学院生物技术与资源利用教育部重点实验室大连海洋大学水产与生命学院

Akt作为PI3K-AKT信号通路的核心分子，在细胞增殖、代谢、发育和存活等过程中发挥重要作用。本研究采用特异性引物及PCR技术，克隆获得了中华绒螯蟹Akt基因(EsAkt)并进行生物信息学分析，实时定量PCR技术检测了EsAkt在中华绒螯蟹不同组... 详细信息

Akt作为PI3K-AKT信号通路的核心分子，在细胞增殖、代谢、发育和存活等过程中发挥重要作用。本研究采用特异性引物及PCR技术，克隆获得了中华绒螯蟹Akt基因(EsAkt)并进行生物信息学分析，实时定量PCR技术检测了EsAkt在中华绒螯蟹不同组织和不同免疫刺激后的表达水平，免疫荧光技术检测了EsAkt蛋白的细胞定位，双链RNA干扰技术分析了EsAkt干扰后凋亡基因的变化。结果显示，EsAkt分子包含PH结构域、中心催化结构域(S＿TKc)和羧基端疏水结构域(S＿TK＿X) 3个保守的结构域。EsAkt在所有被检测的组织中呈现组成型表达，且在免疫相关组织(如肝胰腺、鳃和血淋巴细胞)中的表达量显着高于胃和肠道。EsAkt蛋白主要以弥散状的形式分布在细胞质中。中华绒螯蟹注射脂多糖(LPS)和嗜水气单胞菌后，显著诱导EsAkt转录本的表达，LPS免疫刺激12 h后，EsAkt响应达到峰值，为对照组的4.35倍，刺激48 h后，EsAkt的mRNA表达水平有所降低，但仍是对照组2.62倍。嗜水气单胞菌免疫刺激6 h后，EsAkt响应达到峰值，为对照组的9.05倍，刺激48 h后，EsAkt的mRNA表达量回落到正常水平。双链RNA干扰EsAkt后，EsAkt的mRNA表达量为对照组的0.38倍，而凋亡相关基因EsCaspase-3-like表达水平显著上调，为对照组的2.69倍。研究表明，EsAkt基因在中华绒螯蟹免疫中发挥重要作用，参与了机体对细菌引起的免疫应激过程。本研究丰富了中华绒螯蟹PI3K-AKT信号通路研究的基本资料，为进一步研究甲壳动物免疫防御机制奠定了基础。

关键词：中华绒螯蟹蛋白激酶B 基因表达免疫细胞凋亡

棕点石斑鱼(♀)×清水石斑鱼(♂)杂交子代与亲本表型比较及遗传特征分析

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水生生物学报 2024年第3期48卷 444-453页

作者：王同方明宇杨扬宋乐玲蔡春有蒙子宁刘晓春中山大学生命科学学院有害生物控制与资源利用国家重点实验室广东省水生经济动物良种繁育重点实验室广州510006 海南晨海水产有限公司三亚572000 南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海) 珠海519080

以棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)为母本、清水石斑鱼(***)为父本,开展了杂交育种试验,成功获得杂交子一代。由于棕点石斑鱼与清水石斑鱼外型相似,其杂交子代也与亲本难以区分,为探究双亲本与杂交子代表型差异和遗传差异,研究... 详细信息

以棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)为母本、清水石斑鱼(***)为父本,开展了杂交育种试验,成功获得杂交子一代。由于棕点石斑鱼与清水石斑鱼外型相似,其杂交子代也与亲本难以区分,为探究双亲本与杂交子代表型差异和遗传差异,研究利用外部形态数据及外型框架参数进行比较分析,同时使用微卫星标记对双亲本及杂交子代的遗传特征进行分析。在外部形态结构的探究中,杂交子代可量性状及外形框架更偏向于母本棕点石斑鱼。在遗传特征的分析中,采用ddRAD-seq技术在棕点石斑鱼上获得6266个微卫星标记,筛选出7对可以在双亲本及杂交子代中稳定扩增且遗传多样性较高的微卫星引物,其中,6对引物可以在部分群体中扩增出特异性条带以区分3个群体。通过分析,7个微卫星标记位点在杂交子代群体中的平均观测杂合度(H_(o))为0.891,平均期望杂合度(H_(e))为0.768,平均多态信息含量(PIC)为0.717,三者均高于双亲本,表明杂交子代在遗传信息的多样性方面有一定的提高。研究结果可为棕点石斑鱼、清水石斑鱼及两者杂交子代的鉴别提供方法,并为杂交石斑鱼的培育提供一定的理论基础。

关键词：杂交育种表型微卫星标记棕点石斑鱼清水石斑鱼