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β_(2)肾上腺素受体在erastin诱导的前列腺细胞铁死亡和自噬中的作用及其机制

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解放军医学杂志 2024年第5期49卷 570-577页

作者：黄燕萍张咪曾燕陈津滢陈芳芳吴诗锜徐晨重庆医科大学生命科学研究院重庆400016

目的探讨β2肾上腺素受体(ADRB2)在铁死亡激活剂erastin(Era)诱导的前列腺癌细胞铁死亡、自噬中的作用及可能的分子机制。方法取慢病毒或对照感染的PC-3细胞,设置sh-NC组(正常培养)、sh-NC+Era组(10μmol/L Era处理24 h)、sh-ADRB2组(... 详细信息

目的探讨β2肾上腺素受体(ADRB2)在铁死亡激活剂erastin(Era)诱导的前列腺癌细胞铁死亡、自噬中的作用及可能的分子机制。方法取慢病毒或对照感染的PC-3细胞,设置sh-NC组(正常培养)、sh-NC+Era组(10μmol/L Era处理24 h)、sh-ADRB2组(正常培养)与sh-ADRB2+Era组(10μmol/L Era处理24 h)。采用CCK-8法检测铁死亡激活剂Era和铁死亡抑制剂ferrostatin-1(Fer-1)处理后的细胞存活率,透射电镜观察细胞形态变化,丙二醛(MDA)检测试剂盒检测MDA含量,铁离子比色法检测铁离子含量。Western blotting检测胱氨酸谷氨酸转运体(XCT)、铁蛋白重链1(FTH1)、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX4)、p62、LC3、c-Jun N-末端激酶(JNK)、c-Jun、p-c-Jun蛋白表达水平。注射ADRB2敲低的PC-3稳转株,构建裸鼠成瘤模型并用Era处理,分为sh-NC组、sh-NC+Era组、sh-ADRB2组与sh-ADRB2+Era组,每组4只。隔天记录瘤体体积及最终瘤体重量,并采用免疫组化检测ADRB2、JNK、c-Jun、p-c-Jun的表达情况。结果Era处理后PC-3细胞存活率下降(P<0.01),加用Fer-1处理后PC-3细胞存活率恢复(P<0.01)。透射电镜下可见,Era处理后PC-3细胞发生铁死亡和自噬形态学改变,MDA和铁离子含量增高(P<0.05或P<0.01);敲低ADRB2并用Era处理后PC-3细胞存活率进一步下降(P<0.05),MDA和铁离子含量进一步升高(P<0.01),FTH1、XCT、GPX4和LC3蛋白表达水平降低(P<0.05或P<0.01),p62蛋白和JNK通路相关基因JNK、c-Jun、p-c-Jun蛋白表达水平升高(P<0.01);JNK抑制剂处理后,FTH1、XCT和LC3表达水平升高,p62表达水平降低(P<0.01)。PC-3裸鼠模型中,sh-ADRB2+Era组瘤体体积明显小于sh-NC+Era组和sh-ADRB2组(P<0.05或P<0.01);免疫组化检测结果显示,与sh-NC组比较,sh-ADRB2组ADRB2蛋白表达水平降低(P<0.05),JNK、c-Jun和p-c-Jun蛋白表达水平升高(P<0.01);与sh-NC+Era组比较,sh-ADRB2+Era组ADRB2蛋白表达水平降低,JNK、c-Jun和p-c-Jun蛋白表达水平升高(P<0.05)。结论ADRB2可能通过JNK/c-Jun通路调控前列腺癌细胞中Era诱导的铁死亡和自噬。

关键词：前列腺癌 β_(2)肾上腺素受体铁死亡自噬

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蛋白质计算中的机器学习

物理学报 2024年第6期73卷 95-107页

作者：张嘉晖中国科学技术大学生命科学学院合肥230027

蛋白质计算一直以来都是科学领域中的重要课题,而近年来其与机器学习的结合,更是极大地推进了相关学科的发展.本综述主要讨论了机器学习在四个重要的蛋白质计算领域内的研究进展,这四个领域包括:分子动力学模拟、结构预测、性质预测和... 详细信息

蛋白质计算一直以来都是科学领域中的重要课题,而近年来其与机器学习的结合,更是极大地推进了相关学科的发展.本综述主要讨论了机器学习在四个重要的蛋白质计算领域内的研究进展,这四个领域包括:分子动力学模拟、结构预测、性质预测和分子设计.分子动力学模拟依赖于力场参数,准确的力场参数是分子动力学模拟的必需品,而机器学习可以帮助研究者得到更加准确的力场参数.在分子动力学模拟中,机器学习也可以从复杂的体系中以较小的代价计算出所需求解的自由能.结构预测一般是给定蛋白质序列预测其结构.结构预测复杂度高、数据量大,而这恰恰是机器学习所擅长的.在机器学习的协助下,近年来科研人员已经在单个蛋白质三维结构预测上取得了不错的成果.性质预测则是指通过给定的已知蛋白质信息,推断其可能拥有的性质,这对于蛋白质的研究也是至关重要的.更具挑战性的是分子设计,虽然近年来机器学习在蛋白质设计上取得突破,但这一领域还有很大空间值得探索.本综述将针对以上四点分别展开论述,并对蛋白质计算中的机器学习研究进行展望.

关键词：蛋白质机器学习分子动力学模拟结构预测性质预测分子设计

木犀草素通过AKT-mTOR通路诱导人卵巢癌A2780细胞凋亡和自噬的研究

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海南医学院学报 2024年

作者：徐如敏曹雨蝶连晓芙蔡烨石世杰张帅张静蚌埠医科大学生命科学学院

目的：探讨木犀草素对人卵巢癌A2780细胞的作用，并揭示其可能机制。方法：通过CCK-8检测木犀草素对A2780细胞活力的影响，确定加药浓度；克隆斑、划痕和Transwell实验检测木犀草素对A2780细胞增殖和转移能力的影响；并使用流式细胞术... 详细信息

目的：探讨木犀草素对人卵巢癌A2780细胞的作用，并揭示其可能机制。方法：通过CCK-8检测木犀草素对A2780细胞活力的影响，确定加药浓度；克隆斑、划痕和Transwell实验检测木犀草素对A2780细胞增殖和转移能力的影响；并使用流式细胞术检测木犀草素作用下细胞凋亡水平的变化；凋亡、自噬及AKT-mTOR信号通路相关蛋白的表达情况则通过Western blotting实验检测。结果：木犀草素抑制了A2780细胞活力、增殖和转移的能力；流式细胞术结果表明木犀草素呈浓度依赖性诱导A2780细胞凋亡；且自噬相关蛋白LC3-II/LC3-Ⅰ比例增加，P62表达下降，P-AKT、P-mTOR与抗凋亡蛋白Bcl-2表达水平降低。结论：木犀草素通过AKT-mTOR信号通路诱导人卵巢癌A2780细胞凋亡和自噬，从而抑制卵巢癌细胞恶性进展。

关键词：木犀草素卵巢癌 AKT-mTOR 凋亡自噬

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疟原虫有性生殖传播阻断疫苗的研究进展

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2024年第3期42卷 399-406页

作者：王蓉徐洁朱晓彤中国医科大学第二临床学院辽宁沈阳110122 中国医科大学药学院辽宁沈阳110122 中国医科大学免疫学教研室辽宁沈阳110122

疟疾仍是一项重大的全球卫生挑战。现阶段由于药物和相关技术的应用,一定程度上减少了疾病的负担,但发病率和死亡率仍然非常高。随着耐药性的广泛出现,亟需探索和研制新的防疟根本策略,有效控制和阻断疟疾的传播。针对有性生殖阶段的传... 详细信息

疟疾仍是一项重大的全球卫生挑战。现阶段由于药物和相关技术的应用,一定程度上减少了疾病的负担,但发病率和死亡率仍然非常高。随着耐药性的广泛出现,亟需探索和研制新的防疟根本策略,有效控制和阻断疟疾的传播。针对有性生殖阶段的传播阻断疫苗(TBV)是一个很好的选择,其旨在控制疟原虫从人类宿主传播到蚊媒媒介。TBV的研制受到了国内外研究者的重视,被认为是防治疟疾的新技术之一。本文总结了TBV的研究和开发,以及候选抗原的发现和进展,为TBV的进一步研究提供理论参考。

关键词：疟疾疟原虫传播阻断疫苗候选抗原

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柴胡皂苷A抗抑郁的靶点识别及作用研究

天然产物研究与开发 2024年第1期36卷 44-51页

作者：任历邵钰婷秦书华杨文强刘莹锦州医科大学基础医学院锦州121000 昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650500 锦州医科大学生命科学研究院锦州121000

中药柴胡具有改善抑郁患者临床治疗效果的作用,柴胡皂苷A(saikosaponin A,SSA)是柴胡主要药效成分,本研究以SSA为研究对象,利用慢性不可预知性温和应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)模型小鼠悬尾(tail suspension test,TST... 详细信息

中药柴胡具有改善抑郁患者临床治疗效果的作用,柴胡皂苷A(saikosaponin A,SSA)是柴胡主要药效成分,本研究以SSA为研究对象,利用慢性不可预知性温和应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)模型小鼠悬尾(tail suspension test,TST)和强迫游泳实验(forced swimming test,FST)明确SSA的抗抑郁作用。利用计算机分子对接技术分析并验证SSA的作用靶点,并利用细胞热转移测定实验(cellular thermal shift assay,CETSA)和药物亲和力靶稳定性实验(drug affinity responsive target stability,DARTS)验证SSA的靶标;采用Western blotting等技术研究SSA的抗抑郁作用机制。CUMS模型TST和FST结果表明,与模型组相比,SSA能够显著缩短小鼠的不动时间,表明SSA具有显著的抗抑郁作用。计算机分子对接证明了SSA与催产素受体(oxytocin receptor,OXTR)结合效果较好,表明SSA抗抑郁的作用靶点可能是OXTR。CETSA结果表明在一系列温度梯度处理下,SSA能够明显延缓OXTR的热变性;DARTS实验结果表明,在一系列酶浓度梯度处理下,SSA能够显著降低OXTR对蛋白质水解的敏感性,表明SSA抗抑郁的作用靶点是OXTR。此外,SSA对OXTR下游的ERK通路没有激活作用。本研究表明SSA发挥抗抑郁作用的靶点可能为OXTR,为抑郁症等精神疾病的临床研究治疗和新药开发提供必要的理论与参考依据。

关键词：抑郁症柴胡皂苷A 催产素受体细胞热转移测定实验慢性不可预知性温和应激模型

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虾源肌球蛋白抗原表位的计算机辅助计算

吉林大学学报（理学版） 2024年第5期62卷 1267-1273页

作者：时月明张哲刘剑兰刘明皓中国医科大学附属第四医院沈阳110032 中国医科大学医学人文学院沈阳110122 吉林大学生命科学学院长春130012

利用在线软件和线下软件对来源于刀额新对虾(Metapenaeus ensis)的过敏原Met e1的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位进行预测、筛选以及辅助计算.首先,通过uniprot蛋白数据库获取Met e1蛋白质氨基酸序列;其次,用ExPASY ProtParam, SignalP-5... 详细信息

利用在线软件和线下软件对来源于刀额新对虾(Metapenaeus ensis)的过敏原Met e1的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位进行预测、筛选以及辅助计算.首先,通过uniprot蛋白数据库获取Met e1蛋白质氨基酸序列;其次,用ExPASY ProtParam, SignalP-5.0 Server和TMHMM Server v.2.0在线工具对Met e1的理化性质、信号肽与跨膜区域进行分析,用PSIPRED在线工具、 SOPMA在线工具和DNAstar软件联合预测计算Met e1二级结构,用Swiss model在线软件预测计算Met e1三级结构;再次,用DNAStar线下软件和IEDB在线软件综合预测计算线性B细胞表位,用IEDB在线软件预测计算CD4+T细胞表位和CD8+T细胞表位;最后将所得结果进行B细胞表位和T细胞表的筛选.结果表明:Met e1蛋白的B细胞表位为15~28, 45~49, 92~95, 125~130, 150~153, 255~258位氨基酸;T细胞表位为78~84, 223~232位氨基酸.

关键词： Met e1蛋白质 B细胞表位 T细胞表位抗原表位筛选

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腹膜透析患者贫血现状及其影响因素

中华肾脏病杂志 2024年第4期40卷 330-334页

作者：郭亚东殷淑惠徐天华杜银科姚丽中国医科大学公共卫生学院沈阳110000 中国医科大学附属第一医院肾内科沈阳110001

贫血是腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)患者罹患心血管疾病、治疗效果较差及死亡的重要影响因素,但相比血液透析患者,关注PD患者贫血的相关临床研究和流行病学调查较少。PD患者贫血影响因素众多且复杂,但各因素在具体影响程度及方向... 详细信息

贫血是腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)患者罹患心血管疾病、治疗效果较差及死亡的重要影响因素,但相比血液透析患者,关注PD患者贫血的相关临床研究和流行病学调查较少。PD患者贫血影响因素众多且复杂,但各因素在具体影响程度及方向上缺乏有力的证据,进一步了解其贫血影响因素,更有利于针对性纠正贫血状况。该文综述PD患者贫血的流行病学现状,以及贫血的影响因素包括生理因素、治疗因素、营养因素及其他因素4个方面,以期为PD患者贫血治疗和相关研究提供参考。

关键词：肾功能不全慢性腹膜透析贫血流行病学影响因素

GRP78-c-Src信号通路介导周期性牵张力作用下牙周膜成纤维细胞成骨分化的机制研究

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华西口腔医学杂志 2024年第3期42卷 304-312页

作者：胡静崔智华黄克强苏荣健赵颂锦州医科大学生命科学研究院公共实验平台锦州121001 中国医科大学口腔医学院附属口腔医院种植中心沈阳110002 锦州医科大学附属口腔医院正畸科锦州121001 锦州医科大学基础医学院锦州121001

目的探讨在周期性牵张力作用下葡萄糖调节蛋白78(GRP78)对牙周膜成纤维细胞成骨分化的影响,并阐述其机制。方法应用FlexCell 5000细胞应力装置模拟牙齿正畸受力环境;应用流式细胞术细胞分选技术获得牙周膜成纤维细胞GRP78高表达细胞和GR... 详细信息

目的探讨在周期性牵张力作用下葡萄糖调节蛋白78(GRP78)对牙周膜成纤维细胞成骨分化的影响,并阐述其机制。方法应用FlexCell 5000细胞应力装置模拟牙齿正畸受力环境;应用流式细胞术细胞分选技术获得牙周膜成纤维细胞GRP78高表达细胞和GRP78低表达细胞;采用基因转染技术敲减GRP78、c-Src的表达以及过表达c-Src;蛋白质印迹实验检测成骨转录因子Runt相关基因2(RUNX2)、锌指结构转录因子(Osterix)以及成骨标志蛋白骨钙蛋白(OCN)、骨桥蛋白(OPN)的表达;免疫共沉淀实验检测GRP78与c-Src激酶的相互作用;茜素红染色实验检测细胞矿化结节的形成。结果GRP78在牙周膜成纤维细胞呈异质性表达,流式分选实验获得GRP78高表达和GRP78低表达细胞。周期性牵张力处理后,与GRP78低表达细胞相比,GRP78高表达细胞成骨分化能力及c-Src激酶磷酸化水平均升高,差异具有统计学意义(P<0.05);GRP78与c-Src激酶存在相互作用;与对照组相比,过表达c-Src组细胞成骨分化能力升高(P<0.05),sic-Src组细胞成骨分化能力降低(P<0.05)。结论GRP78通过与c-Src激酶相互作用并上调其表达,进而促进周期性牵张力诱导的牙周膜成纤维细胞成骨分化。

关键词：周期性牵张力成骨分化牙周膜成纤维细胞葡萄糖调节蛋白78

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机器学习在非酒精性脂肪肝预测中的应用

中国卫生统计 2024年第2期41卷 316-318页

作者：蔡偌欣马亚楠闻德亮中国医科大学健康科学研究院 110122 中国医科大学公共卫生学院

非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是全球最常见的慢性肝病,普通成人NAFLD患病率在6.3%~45%,我国内地一般人群中患病率为29.81%,在肥胖和2型糖尿病人群中发病率更高,会高达90%。通过运用典型机器学习算法来构建... 详细信息

非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是全球最常见的慢性肝病,普通成人NAFLD患病率在6.3%~45%,我国内地一般人群中患病率为29.81%,在肥胖和2型糖尿病人群中发病率更高,会高达90%。通过运用典型机器学习算法来构建非酒精性脂肪肝的风险预测模型,在肝病研究领域中是比较先进的。本文所归纳的7种典型机器学习算法在数据挖掘领域中是比较成熟且稳定的,在各项数据研究当中,基于预测结果的准确率,验证了各个模型的有效性和可行性,为脂肪肝疾病预测提供了基于数据科学的研究方法。

关键词：非酒精性脂肪肝机器学习预测模型